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The map label for this gene is 162447384

Identifier: 162447384

GI number: 162447384

Start: 551436

End: 555146

Strand: Direct

Name: 162447384

Synonym: ACL_0522

Alternate gene names: NA

Gene position: 551436-555146 (Clockwise)

Preceding gene: 162447382

Following gene: 162447385

Centisome position: 36.84

GC content: 30.1

Gene sequence:

>3711_bases
ATGCATAAAAATGAACTATTAGAACAACTAAATGATTTGAGAACTGAACTTAGACTTTCGCATTTTAATAAAACCGGAGA
GCAAATAATCATAATAAGTGATGCTGCTCTTTTTGAGGTGGCTCAAAAAAGACCTCTAAAACTAAATGAGTTTAATGCGA
TTTCTGGTCTTGATACAGATTTTAATAAGAAATATGCCCAGGAATTTATAAGTATTATTAAATCATTTAATCAGTCAAAT
ATAAAGTCCGTTAAAGTATCTAAACAAGCAAGTAAAGTACTACACCACTATAAAGATAGACTCACAAACATGTCTAAAAC
AAATTCCAATCTTTATATGGGACAAATCTATCAAAATCATAGTTTCGATTTAACTTTAATTGAAAATAACTTTGAACTAA
AAGACTATTTAATTAATAATCGCATTAAGAACTTAAAACTTAACTATAGAAGTGATGCCGATGAAAGACATATAACAAAA
CTCTATAGAGAAGTAAATAAGACCCAAATAGAAACAGGTAGTTATAACCTTTATATTGCTTACCCTTATGTGGAAGGTAT
CTTTAGTAAGGATAAGTTTCCGATTAAAGCACCACTACTTTATTTTCCTGTAAAAATTGAGCGAACCCTTCGTACATTTA
CATTAAAAAAAGATAGTGAAAGAGATGTTATTTTTAATAGAGACTTATTGTTGATTACATCTAAAATGGAAAAATCATCC
ATGGATTTTAACGCACCTGAAGTCACAGATTTCAATGAAAAAGTACTTCATGAGGTTGTTATCCCATTCTACGAAAAACA
TGGCATATCCATTGATGTAGATTCAAAACACATAGAGTTCATCTCTTTTAAAAATGAATTGAAAGAAGATTTTGTAAAGG
TTCATCGTCCTAAGTTTAAACTACAACCTTATGCAACGTTATCAAGATTTCAACTCTACTCATCCAGTATTCAAAAAGAC
ATGGAACGTATCTTATCTTCTAAACAGTATAATGATCTGCTTGAAGGTTTAATCGATGAAACGAACCTTTTTAAGCAAGA
AGTATCTAAACCTATGGAAATATCAGGTGAACCCATTCATGAAGATAAAATCAGCTATATAAACGATTTAAACTTCAGTC
AAGAACGTGTCATTGATTTACTAAATGATGAGAAGAAAATTGTCATATGGGGTCCACCGGGTACCGGTAAAAGTCAAACC
ATCACCTCATTAATTGCATCCAGTATTTTAAAGGGTGAAAATGTCTTAGTGGTCTCCGAAAAAAAGGTTGCTCTAGATGT
TATTTACTCTAGATTAAAAAAAGCATCGAAATATGCCATGTTTATTGATGATGCAGAAAATAAACAAGATTTTTATTATA
AATTAAATCATTTTCTAGAACCGGAACCACCTGTTCGTACACTCAATAATGATATCTATGCCTTAGAATCGGAAATTAAA
AGACAATTAAATGATATGGAAAAATCACTTCAATTACTTTACGGGCACACATTTGAAAATAAGCCTGTATTTGAACTCTT
TTCTAGATATATTAAGGATAAAGACATTAAACTTCACTTAACACCTTATGATGTACATAAGATGTTTCATGAAGTCTATA
AAAAACCAAGTTTTCAAATGATTGAGGCACTAGAAAAAACTTTCGATAATGATGCACACCTTAAACGTATGATGGATTTA
GATTGGTACTTAGAAAAGTATCCAGTGCTACAAAAATTAGAAACAAAAATACCAAGAAGCCAAAAACTGATGTTTGATCA
AATGCATGAAAAGTATCTTCAGCTAAAAACAACCTATCAAAGATCAGGTATCTTTAAAAGAAGCAAACTTAAGAAAACAT
TTATAAAAACATACATCGATGAAATAACTTATTTAAGTGTCAAAAAAAGTATCAGAAAGAAGTATTTAAATCAATTATTT
GTGGATGATAGATTACATAGTTATGTCTTTGAAAATATGAACCGTTTAAATAAATTAATGACGATTTATCAAACGCTAAA
ACCGTTTGAAAAAACGTTCTTAAAGATAATGCATTCACATCCAAAAGTAAAAGGTATAGATGAAAATTATAAACTAAGAA
CTTATATTTTTGAAGCTTATTATTCAGGCTTTATTGAGGTCTTTAAGTCTGAACACCAAAAACATTTATATATCTTTGAT
AATTATCAAGAAAAGGTTGATAAGATTAAAGAAATCATGCATCAAAAAATGTTGGTTACTAATGAATCGTTTGAAATGGA
ACTTTATAAACATGCACTTAATTTAAATAATACAAAACGTATTATGGATATTAAAAGAGTGTTTGATTTGACGAATAAAC
CAAGCATTAAGTCTTTTATAGAAACCTTCCAACTAGAAATGAAAAGTCACATCAGGTTATGGATGATGACACCAGAAGTG
GTATCAGCTATTTTACCCTTAGAACACGGTATGTTTGATTTAGTTATCTTTGATGAGGCAAGCCAAATGTATGTAGAAAA
AGGTATACCTGCAATTTATAGAGCTAAAAAAGTTGTTATTGCAGGAGACCCTAAACAACTTAGACCAAGTAGTTTAGGTA
CAGGTAGAACAGATGAACTGGATGAGTTTTATGAAGATGATGTCTTTAAAGAAGTATCGTTAGATGCTAAAAGTTTATTA
GACCTTGCAAGATACCGCTTTAAAGAAGCACTACTAAATTATCACTACCGCTCGACGTATGAGGAATTAATCGCGTTTTC
TAACCACGCATTTTATGATGCCAAGTTAATGATTTCACCAAATCAAAAAAAGGCGGTTGAACCACCGATTGAATATATAT
ATGTTAAAGATGGTATGTTTGAAAATAGAAGAAATAAAAAAGAAGCAACTAAAGTTGTTGAAGTGATTAAAAAGATACTA
AGAACAAGACAACATAATGAATCCATTGGTGTGATTACATTTAATAGTACTCAAAGAGATGCTATTGAAAATGCAATCGA
TCAAGAACTCTTTAAAAAAGGAACATATCAAAAAGCGTTTGAACAAGAACTGTTTAGAAAAGAAGACGGTGAAGATAAAT
CATTATTCGTTAAAAATATTGAAAACGTTCAAGGTGATGAAAGAGATATCATAATTTTTTCAATGGGATATGCTAAAAAC
AGCCAAGGACAAGTGATGAGACGATTTGGGTGGCTTAACCATGATGGCGGACAAAACAGGCTTAATGTGGCTATTACACG
CGCCAAACAAAAGATTTATTTCATATCTAGTTTGTATCCGGAAGAATTTAAAGTAGAAGACTTAAGTTCGACTGGTCCAA
AGTTATTAAAAGATTTTATGAGATATTGTTACTATGTTTCAAATGAAAACGAGGCACTTGCTAAAGAGGTATTAAATCAT
TTACATAGTACAGAGATTGAAACCAGAAATATGCTTATAACACATATGGTAGATGATGTTAAGAAGCGTTTAGAAAGATT
AGGGTTTGACGTTGATTTAAATGTTGGTATTGGTAAATATAAAATCAATCTAGCAATTAAAGATGATAAACAAAAAGCCT
ATAAGTTAGGTATCTTAACAGATGTAGGTCTAAATGATTTAAATGCAAGGCGAGATTTACTACATCAAGAAAAATACTTA
GAGTCTAGGGGATGGACCGTATATAGATTGTTAGAATCGAATTGGTATACAGATCCTAATAAAGAGTTAAAACAAATTAA
AGATTTAATGAAAATAGAAAAGAGTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTCTTATTATAATATAAAATTGTCTCTATTCAAAAGTATTTGATTTTAATCTTGGTTATATCATGTTAAAATGGCA
ATAGGTAGGTGAGAATCGTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACATGAAACCTGTATTTATATATATTTATGTTGTGGTGTGGATATTTATATCACTCATTACCTATGTAGCTTATTTAAT
GGATAAAGAACGTGCAAAAA

Product: helicase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1236; Mature: 1236

Protein sequence:

>1236_residues
MHKNELLEQLNDLRTELRLSHFNKTGEQIIIISDAALFEVAQKRPLKLNEFNAISGLDTDFNKKYAQEFISIIKSFNQSN
IKSVKVSKQASKVLHHYKDRLTNMSKTNSNLYMGQIYQNHSFDLTLIENNFELKDYLINNRIKNLKLNYRSDADERHITK
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MDFNAPEVTDFNEKVLHEVVIPFYEKHGISIDVDSKHIEFISFKNELKEDFVKVHRPKFKLQPYATLSRFQLYSSSIQKD
MERILSSKQYNDLLEGLIDETNLFKQEVSKPMEISGEPIHEDKISYINDLNFSQERVIDLLNDEKKIVIWGPPGTGKSQT
ITSLIASSILKGENVLVVSEKKVALDVIYSRLKKASKYAMFIDDAENKQDFYYKLNHFLEPEPPVRTLNNDIYALESEIK
RQLNDMEKSLQLLYGHTFENKPVFELFSRYIKDKDIKLHLTPYDVHKMFHEVYKKPSFQMIEALEKTFDNDAHLKRMMDL
DWYLEKYPVLQKLETKIPRSQKLMFDQMHEKYLQLKTTYQRSGIFKRSKLKKTFIKTYIDEITYLSVKKSIRKKYLNQLF
VDDRLHSYVFENMNRLNKLMTIYQTLKPFEKTFLKIMHSHPKVKGIDENYKLRTYIFEAYYSGFIEVFKSEHQKHLYIFD
NYQEKVDKIKEIMHQKMLVTNESFEMELYKHALNLNNTKRIMDIKRVFDLTNKPSIKSFIETFQLEMKSHIRLWMMTPEV
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DLARYRFKEALLNYHYRSTYEELIAFSNHAFYDAKLMISPNQKKAVEPPIEYIYVKDGMFENRRNKKEATKVVEVIKKIL
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LHSTEIETRNMLITHMVDDVKKRLERLGFDVDLNVGIGKYKINLAIKDDKQKAYKLGILTDVGLNDLNARRDLLHQEKYL
ESRGWTVYRLLESNWYTDPNKELKQIKDLMKIEKSN

Sequences:

>Translated_1236_residues
MHKNELLEQLNDLRTELRLSHFNKTGEQIIIISDAALFEVAQKRPLKLNEFNAISGLDTDFNKKYAQEFISIIKSFNQSN
IKSVKVSKQASKVLHHYKDRLTNMSKTNSNLYMGQIYQNHSFDLTLIENNFELKDYLINNRIKNLKLNYRSDADERHITK
LYREVNKTQIETGSYNLYIAYPYVEGIFSKDKFPIKAPLLYFPVKIERTLRTFTLKKDSERDVIFNRDLLLITSKMEKSS
MDFNAPEVTDFNEKVLHEVVIPFYEKHGISIDVDSKHIEFISFKNELKEDFVKVHRPKFKLQPYATLSRFQLYSSSIQKD
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RQLNDMEKSLQLLYGHTFENKPVFELFSRYIKDKDIKLHLTPYDVHKMFHEVYKKPSFQMIEALEKTFDNDAHLKRMMDL
DWYLEKYPVLQKLETKIPRSQKLMFDQMHEKYLQLKTTYQRSGIFKRSKLKKTFIKTYIDEITYLSVKKSIRKKYLNQLF
VDDRLHSYVFENMNRLNKLMTIYQTLKPFEKTFLKIMHSHPKVKGIDENYKLRTYIFEAYYSGFIEVFKSEHQKHLYIFD
NYQEKVDKIKEIMHQKMLVTNESFEMELYKHALNLNNTKRIMDIKRVFDLTNKPSIKSFIETFQLEMKSHIRLWMMTPEV
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DLARYRFKEALLNYHYRSTYEELIAFSNHAFYDAKLMISPNQKKAVEPPIEYIYVKDGMFENRRNKKEATKVVEVIKKIL
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SQGQVMRRFGWLNHDGGQNRLNVAITRAKQKIYFISSLYPEEFKVEDLSSTGPKLLKDFMRYCYYVSNENEALAKEVLNH
LHSTEIETRNMLITHMVDDVKKRLERLGFDVDLNVGIGKYKINLAIKDDKQKAYKLGILTDVGLNDLNARRDLLHQEKYL
ESRGWTVYRLLESNWYTDPNKELKQIKDLMKIEKSN
>Mature_1236_residues
MHKNELLEQLNDLRTELRLSHFNKTGEQIIIISDAALFEVAQKRPLKLNEFNAISGLDTDFNKKYAQEFISIIKSFNQSN
IKSVKVSKQASKVLHHYKDRLTNMSKTNSNLYMGQIYQNHSFDLTLIENNFELKDYLINNRIKNLKLNYRSDADERHITK
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NYQEKVDKIKEIMHQKMLVTNESFEMELYKHALNLNNTKRIMDIKRVFDLTNKPSIKSFIETFQLEMKSHIRLWMMTPEV
VSAILPLEHGMFDLVIFDEASQMYVEKGIPAIYRAKKVVIAGDPKQLRPSSLGTGRTDELDEFYEDDVFKEVSLDAKSLL
DLARYRFKEALLNYHYRSTYEELIAFSNHAFYDAKLMISPNQKKAVEPPIEYIYVKDGMFENRRNKKEATKVVEVIKKIL
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LHSTEIETRNMLITHMVDDVKKRLERLGFDVDLNVGIGKYKINLAIKDDKQKAYKLGILTDVGLNDLNARRDLLHQEKYL
ESRGWTVYRLLESNWYTDPNKELKQIKDLMKIEKSN

Specific function: Unknown

COG id: COG1112

COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the DNA2/NAM7 helicase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 146064; Mature: 146064

Theoretical pI: Translated: 9.31; Mature: 9.31

Prosite motif: PS50967 HRDC

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHKNELLEQLNDLRTELRLSHFNKTGEQIIIISDAALFEVAQKRPLKLNEFNAISGLDTD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
FNKKYAQEFISIIKSFNQSNIKSVKVSKQASKVLHHYKDRLTNMSKTNSNLYMGQIYQNH
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCC
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CEEEEEEECCCCHHHHHHHCCHHCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEE
YPYVEGIFSKDKFPIKAPLLYFPVKIERTLRTFTLKKDSERDVIFNRDLLLITSKMEKSS
EHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCEEEEEEHHHHCC
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CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
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RQLNDMEKSLQLLYGHTFENKPVFELFSRYIKDKDIKLHLTPYDVHKMFHEVYKKPSFQM
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
NYQEKVDKIKEIMHQKMLVTNESFEMELYKHALNLNNTKRIMDIKRVFDLTNKPSIKSFI
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ETFQLEMKSHIRLWMMTPEVVSAILPLEHGMFDLVIFDEASQMYVEKGIPAIYRAKKVVI
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EELIAFSNHAFYDAKLMISPNQKKAVEPPIEYIYVKDGMFENRRNKKEATKVVEVIKKIL
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ENVQGDERDIIIFSMGYAKNSQGQVMRRFGWLNHDGGQNRLNVAITRAKQKIYFISSLYP
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EEFKVEDLSSTGPKLLKDFMRYCYYVSNENEALAKEVLNHLHSTEIETRNMLITHMVDDV
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHCCCCEEEECCCCEEEEEEEEECCCHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ESRGWTVYRLLESNWYTDPNKELKQIKDLMKIEKSN
HHCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
FNKKYAQEFISIIKSFNQSNIKSVKVSKQASKVLHHYKDRLTNMSKTNSNLYMGQIYQNH
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCC
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CEEEEEEECCCCHHHHHHHCCHHCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEE
YPYVEGIFSKDKFPIKAPLLYFPVKIERTLRTFTLKKDSERDVIFNRDLLLITSKMEKSS
EHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCEEEEEEHHHHCC
MDFNAPEVTDFNEKVLHEVVIPFYEKHGISIDVDSKHIEFISFKNELKEDFVKVHRPKFK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
EDKISYINDLNFSQERVIDLLNDEKKIVIWGPPGTGKSQTITSLIASSILKGENVLVVSE
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
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IEALEKTFDNDAHLKRMMDLDWYLEKYPVLQKLETKIPRSQKLMFDQMHEKYLQLKTTYQ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HHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ENVQGDERDIIIFSMGYAKNSQGQVMRRFGWLNHDGGQNRLNVAITRAKQKIYFISSLYP
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EEFKVEDLSSTGPKLLKDFMRYCYYVSNENEALAKEVLNHLHSTEIETRNMLITHMVDDV
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KKRLERLGFDVDLNVGIGKYKINLAIKDDKQKAYKLGILTDVGLNDLNARRDLLHQEKYL
HHHHHHCCCCEEEECCCCEEEEEEEEECCCHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ESRGWTVYRLLESNWYTDPNKELKQIKDLMKIEKSN
HHCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8948633 [H]