| Definition | Yersinia pestis Angola, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010159 |
| Length | 4,504,254 |
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The map label for this gene is 162419286
Identifier: 162419286
GI number: 162419286
Start: 1218662
End: 1222255
Strand: Direct
Name: 162419286
Synonym: YpAngola_A1181
Alternate gene names: NA
Gene position: 1218662-1222255 (Clockwise)
Preceding gene: 162418310
Following gene: 162419121
Centisome position: 27.06
GC content: 41.21
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGATGATAAGAGTAACGAGTTAGAGAATATCGCCAACAAGCTAAGAGTTAATCTTTAAAAAAACGTTATTACATCCAA ATTTAATAGGAATAATAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAACGCCGTTACCTCAGTCAACAGGCCCCACAGAGGGCCTGATAGGAGAGCCCTTTATGGAAAACAGTAAACAGCAAGTG GCCGTTGCTCCCTTGTCGCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Insecticidal xin Complex Protein; A Component Of Insecticidal xin Complex; Insecticidal xin Complex Protein TccB; Insecticidal xin Protein; Xin Subunit; Partially A Component Of Insecticidal xin Complex; Xin Complex Protein; Insecticidal xin Protein C-Terminal; Insecticidal xin Complex Protein TcaB; Virulence Plasmid
Number of amino acids: Translated: 1197; Mature: 1196
Protein sequence:
>1197_residues MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAEAISSLQIYINRCVDGEENDL HEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLI SYEKLAQIDTIKELYVENIKTHFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFFVNQGDPNAKEEVENLFLTNG TSIKRIESRLHGYINGHIKILCNDDGISFEIAEKLINGDNGTIGEVKIIENEKIISTINNEKGENKKINLIDKFEIRIFP YNELVASTIVFNRIKPEEKIIDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLNAFNGSYGIYLWELFFHIP LLASMRFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNILPLQQDTAWDKNTLIQATDDPDVIAMQDPMQY KLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNSSHQWENIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLL SYWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGINSSEQIATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSAVIQ FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAI NIRIASAALNGESLVPLGISAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQ KDQADKDIEQLAHQYTSVQEQLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSTRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM AKAALEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEI VTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNGTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGE NTHLAKGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS
Sequences:
>Translated_1197_residues MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAEAISSLQIYINRCVDGEENDL HEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLI SYEKLAQIDTIKELYVENIKTHFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFFVNQGDPNAKEEVENLFLTNG TSIKRIESRLHGYINGHIKILCNDDGISFEIAEKLINGDNGTIGEVKIIENEKIISTINNEKGENKKINLIDKFEIRIFP YNELVASTIVFNRIKPEEKIIDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLNAFNGSYGIYLWELFFHIP LLASMRFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNILPLQQDTAWDKNTLIQATDDPDVIAMQDPMQY KLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNSSHQWENIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLL SYWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGINSSEQIATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSAVIQ FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAI NIRIASAALNGESLVPLGISAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQ KDQADKDIEQLAHQYTSVQEQLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSTRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM AKAALEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEI VTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNGTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGE NTHLAKGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS >Mature_1196_residues PTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAEAISSLQIYINRCVDGEENDLH EKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAADYIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLIS YEKLAQIDTIKELYVENIKTHFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSLY IDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFFVNQGDPNAKEEVENLFLTNGT SIKRIESRLHGYINGHIKILCNDDGISFEIAEKLINGDNGTIGEVKIIENEKIISTINNEKGENKKINLIDKFEIRIFPY NELVASTIVFNRIKPEEKIIDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLNAFNGSYGIYLWELFFHIPL LASMRFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNILPLQQDTAWDKNTLIQATDDPDVIAMQDPMQYK LAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQLLGPRPNLNSSHQWENIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLS YWDKLEIRLYNLRHNLNLDGQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGINSSEQIATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSAVIQF GNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQRRKHYKELLDNGISSDEQLAIN IRIASAALNGESLVPLGISAVLDTAPNVFGLADGGSRWGAISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQK DQADKDIEQLAHQYTSVQEQLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSTRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLMA KAALEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERTVSLAQHYQQLSDHKFNLAEIV TGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNGTLITSLSIKGLNLVEDYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGEN THLAKGCTALAISRGMNDSGQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 136902; Mature: 136771
Theoretical pI: Translated: 5.59; Mature: 5.59
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH AISSLQIYINRCVDGEENDLHEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAAD HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHH YIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLISYEKLAQIDTIKELYVENIK HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH THFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL HEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCEE YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFF EEEECCCCEEECCCCHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHEEEEECCCEEEECCCEEEEECCCE VNQGDPNAKEEVENLFLTNGTSIKRIESRLHGYINGHIKILCNDDGISFEIAEKLINGDN ECCCCCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHCCEECCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCC GTIGEVKIIENEKIISTINNEKGENKKINLIDKFEIRIFPYNELVASTIVFNRIKPEEKI CCEEEEEEECCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH IDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLNAFNGSYGIYLWELFFHIP HHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH LLASMRFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNILPLQQDTAWDKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCC TLIQATDDPDVIAMQDPMQYKLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQ CEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHH LLGPRPNLNSSHQWENIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDKLEIRLYNLRHNLNLD HCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCC GQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGINSSEQIATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSAVIQ CCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQR HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH RKHYKELLDNGISSDEQLAINIRIASAALNGESLVPLGISAVLDTAPNVFGLADGGSRWG HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCH AISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKDQADKDIEQLAHQYTSVQE HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH QLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSTRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM HHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHH AKAALEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERT HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHH VSLAQHYQQLSDHKFNLAEIVTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNGTLITSLSIKGLNLVE HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEEECCCHHHH DYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLAKGCTALAISRGMNDS HCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCCCCC GQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC >Mature Secondary Structure PTSTVLNKINESRRDALVNYYLAKNVSGDEKIKTAEQLYQYLLLDTKIGHEVKTSPIAE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH AISSLQIYINRCVDGEENDLHEKNISTHFSSDNFLHGWNSYNKRYARWAGKEKLMYYAAD HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHH YIDPTLRYNKTELFNTFEQSINNSRLTEKSVKSALQSYLISYEKLAQIDTIKELYVENIK HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH THFFLGKTRESPCQYYWRSGEQLSNDSHHLRWSEWKKVNCNINGTEEKFFINLSWHRSSL HEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCEE YIDWINKFSIRTDKDETTEKYHYNRVYKNDDNTWSELIINMDIGFKLSTSTEVITLPPFF EEEECCCCEEECCCCHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHEEEEECCCEEEECCCEEEEECCCE VNQGDPNAKEEVENLFLTNGTSIKRIESRLHGYINGHIKILCNDDGISFEIAEKLINGDN ECCCCCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHCCEECCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCC GTIGEVKIIENEKIISTINNEKGENKKINLIDKFEIRIFPYNELVASTIVFNRIKPEEKI CCEEEEEEECCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH IDELDDKISLLSPNSLPLKEKFQTSVDELLSYNTQKNNVKLNAFNGSYGIYLWELFFHIP HHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH LLASMRFLNEQRFDLAQHWLKYLFNSAGYRDGNGNLLKEGDNILYWNILPLQQDTAWDKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCC TLIQATDDPDVIAMQDPMQYKLAIFMRTLDLIISQGDQAYRQLERDTLAEAKIHYIQASQ CEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHH LLGPRPNLNSSHQWENIKLAEESRQLENSHFLPPYNELLLSYWDKLEIRLYNLRHNLNLD HCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCC GQPLHLPLFATPVDPKALQRQHGAGNGINSSEQIATAQTSLYRFPLLIERAKSAVSAVIQ CCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGNSLQSVLERQDNEAMTLLFQQQQQKVLQHTKDIQNNNIQVLQASLEATDSLKSAAEQR HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH RKHYKELLDNGISSDEQLAINIRIASAALNGESLVPLGISAVLDTAPNVFGLADGGSRWG HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCH AISQAVGWGMQSMAMALETTAGVRDAKANYSRRAQEWTLQKDQADKDIEQLAHQYTSVQE HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH QLNMAQKQLNLAELEQGHADALYQMQSTRFTGKELYNWMAGRLSGLYFQLFDATQPLCLM HHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHH AKAALEKEVDKAKTDGLFIRSGWNDLYQGLLAGEDLQLNLQKLENVWLMEEQRALEVERT HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHH VSLAQHYQQLSDHKFNLAEIVTGYMAQDKDQKTGNEQDFVELKNGTLITSLSIKGLNLVE HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEEECCCHHHH DYPETMHLGDIRRIKQISVSLPALLGPYQDVQATLDYAGENTHLAKGCTALAISRGMNDS HCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCCCCC GQFLLDFNDGKYLPFEGIDISDKGTLVLRFPNATSKQKLLLQSLSDIILHIRYTIRS CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA