Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 161509905

Identifier: 161509905

GI number: 161509905

Start: 1794140

End: 1795642

Strand: Reverse

Name: 161509905

Synonym: USA300HOU_1678

Alternate gene names: NA

Gene position: 1795642-1794140 (Counterclockwise)

Preceding gene: 161509906

Following gene: 161509904

Centisome position: 62.5

GC content: 28.68

Gene sequence:

>1503_bases
TTGAGGATTAGCAAAGTGAAAACAATTCAATTACACAAGACAACTTTGATATTAATTGCGATATTATTGTTTTATACTTT
TATGGGTATCTTACTACCACTCATGCACGATGATTTACAATGGTTTAGCAATTATAATACTGATATTTTAAAAGTAGGAT
TTGCATCACTTAATGGTCGCTATATCGGAAATATCTTTGAAATTATAGCTGTACATGTAAGCTGGTTACGTTGGCTTTCA
TATGGCCTCATTAGTATGGGCATCATTTGGATGATTATGCACATTACACGTTGTAAAGCGTGGACAAGCTATTATTTGTT
AGCATTTTCTTTAATGTTAATTTTACCAAGTGCTATTTATGCAGATACATATGGCTGGTTTGCAGGATTTTATAATTATG
CGACATCAACACTAATTTCACTCTTTATTATTTATTATTGTATTAATGCAATTATATATAAAGAAAAGCAGCCGGTAAGT
GTTACTGTACTATTCTATGTTTTATGCTTCTTCGGTCAATTATTTATGGAGAATGTGACATTATTCCACTGTATCATTTT
AATTTTAGCTTTTCTGTATGAATTTACTGCAAATCGAACACTTAATTATAAATTATTGTTTTCATTTATGATTGCTACTA
TAGGTACAATCATTATGTTTTCCAATCCAAATTATCGCAAAATTTTATTTGAAGGATCAGAATATCAACAAGTTTCAAAT
AATCAAGGTATCTTTTCAAAATTTGCAGAAATGATATCAACGTCACTTCCATATGGTGTCATTTTCAGTCAGATTATAAT
TTTAAGTATGATTGCAGCGCTTATTATTTATCTACTGCTTAGAAGTGATCGGTATGTACATTTAACAATATTAAAGCGTC
GTATCATTATGATAGGATTTATCACTTTACCGCTTTATTATTTACTATTTTACAATCAGTTTTTATTAAATAAAAATACA
GATATTGGATTGGTTGGTTTTGTGAACGTAATTGTATGTGGTTACTTTGCGTTTTCGATATTTGTAGGTATTTATTTGTC
TATTAATGATCGTAAAACACAAATCACTTTATATTCCTTACTTATTGCAATATGTGTTTCGGCGTCGACACTAGTCATTG
TTACTCCAATAGAACCAGGTAATTTTTTGATTGTTTATACGATACATGTAATCATTTTAATTATTTTATTAAAAGAATTT
CGGAAATATAAGTCAATCAATGTTAATTTTATTAAAGGTGCATCACTAGTTTTAGCTGTGATATATCTTAGTGCATTTAT
TTATGTTCATTATGAACATGAAAAAAGAGTTCAGTTATTAAAACAACAAATTAAAGATCATCCACGACAAGAGGTTTATA
CAGTGGAATCATTGCCGTTTGAACATTATATGCATCATCCGTCACCAATCAATAAAAATTACCAAGAGTGGTTTAATAAT
TATGAAGAATTACCGAAAATGACCAAAGTTAAATATATTCCATTTGGTTCAGACGATTCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAATTTGATTGAGGAAACATGCATAGGTGAAAATTAGAAATACATTAAAAATATTGAATTAATTTTTCGACCTACAAGT
TGAGGAAAATTTAACTAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTATTCTTACCTATAAAAATTTAAAATAGCAGCATAAAAATATTAAAAAGTAGACATAATCATGAAATGATAATGTGCA
TCTCAAAAGTTGGACTTTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 500; Mature: 500

Protein sequence:

>500_residues
MRISKVKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPLMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNIFEIIAVHVSWLRWLS
YGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVS
VTVLFYVLCFFGQLFMENVTLFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSN
NQGIFSKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPLYYLLFYNQFLLNKNT
DIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEF
RKYKSINVNFIKGASLVLAVIYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNN
YEELPKMTKVKYIPFGSDDS

Sequences:

>Translated_500_residues
MRISKVKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPLMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNIFEIIAVHVSWLRWLS
YGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVS
VTVLFYVLCFFGQLFMENVTLFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSN
NQGIFSKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPLYYLLFYNQFLLNKNT
DIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEF
RKYKSINVNFIKGASLVLAVIYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNN
YEELPKMTKVKYIPFGSDDS
>Mature_500_residues
MRISKVKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPLMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNIFEIIAVHVSWLRWLS
YGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVS
VTVLFYVLCFFGQLFMENVTLFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSN
NQGIFSKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPLYYLLFYNQFLLNKNT
DIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEF
RKYKSINVNFIKGASLVLAVIYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNN
YEELPKMTKVKYIPFGSDDS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58281; Mature: 58281

Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRISKVKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPLMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGR
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHCCCC
YIGNIFEIIAVHVSWLRWLSYGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLFYVLCFFGQLFMENVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHCC
NQGIFSKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGF
CCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
ITLPLYYLLFYNQFLLNKNTDIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHH
LIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKSINVNFIKGASLVLAV
HHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHH
IYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNN
HHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH
YEELPKMTKVKYIPFGSDDS
HHHCCHHHCEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRISKVKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPLMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGR
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHCCCC
YIGNIFEIIAVHVSWLRWLSYGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLFYVLCFFGQLFMENVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHCC
NQGIFSKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGF
CCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
ITLPLYYLLFYNQFLLNKNTDIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHH
LIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKSINVNFIKGASLVLAV
HHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHH
IYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNN
HHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH
YEELPKMTKVKYIPFGSDDS
HHHCCHHHCEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA