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The map label for this gene is 161508589

Identifier: 161508589

GI number: 161508589

Start: 370579

End: 371940

Strand: Reverse

Name: 161508589

Synonym: USA300HOU_0339

Alternate gene names: NA

Gene position: 371940-370579 (Counterclockwise)

Preceding gene: 161508591

Following gene: 161508587

Centisome position: 12.95

GC content: 36.05

Gene sequence:

>1362_bases
ATGCATCATACAGTTTTGTGTATTCATTTAAACAAAGGGGTTGCTTTAATGAATCAATATCATTCTAATGCACAACAACC
AAGTGCATGGCGTTTTTTTGTCTATAGTTTAGTGGGCATACTATGTTTCTTTATTCCTTTTACGATTAATGGTAACAACA
CTATTTTCGTCGATCATGTTCATCTAGCCATTCGCTCAATCATAGGTCCACTTATGCCCTATGTTGCACTGATTATGATT
TTAATTGGTACAGCGTTACCAATAGTGAGACGTACTTTTATGACTTCAATCACAAACTTGGTCATTACATTATTTAAAGT
TGCAGGTGCAATGATCGGTATAATGTATGTATTTAAAATCGGTCCATCAATACTATTTAAAGCTAACTATGGTCCGTTTT
TGTTTGAAAAATTAATGATGCCATTAAGTATCTTAATTCCAGTAGGTGCAATTGCGCTTTCTTTATTAGTGGGCTATGGC
TTATTAGAATTTGTCGGTGTTTATATGGAGCCTATTATGAGACCTATTTTTAAAACACCAGGAAAATCCGCTGTCGATGC
AGTGGCTTCGTTTGTCGGCAGTTATTCCTTAGGATTATTGATTACTAATCGTGTCTATAAGCAAGGGATGTACAACAAAC
GAGAAGCCACGATTATTGCGACTGGCTTTTCAACAGTTTCAGCAACTTTTATGATTATCGTTGCTAAAACTTTAGGATTA
ATGCCGCATTGGAATTTATACTTTTGGATAACTTTAGTCATCACATTTGTCGTGACTGCAATTACTGCATGGCTACCGCC
AATCAGCAATGAATCAACAGAATATTATAACGGACAAGAAGGAGAACAAGAAGTTGCTATTGAAGGAAGCAGACTGAAAA
CTGCATATGCAGAGGCGATGAAACAAAATGCATTAACACCATCTCTCGTGAAGAACGTTTGGGACAATTTGAAAGACGGT
TTAGAAATGACTGTTGGTATTTTACCTTCTATATTATCGATTGGTTTTTTAGGACTGATTGTAGCGAACTATACACCATT
CATTGATTGGCTTGGCTATATCTTCTATCCATTTATTTATATTTTCCCAATTGCTGATCAGGCTTTACTAGCAAAAGCGT
CAGCGATTTCTATTGTAGAGATGTTTCTACCATCTTTGTTAGTAACTAAAGCTGCAATGAGTACTAAATTTGTCGTCGGT
GTAGTAAGCGTATCAGCCATTATCTTTTTCTCAGCATTAGTGCCATGTATACTAGCAACTGAAATTAAAATACCTGTCTG
GAAACTCATCATCATTTGGTTTTTACGCGTGGCGTTGTCGCTATTAATCACCATCCCCGTCGCTTTACTTATTTTTGGAT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTAATTTGTATTGGTATGAAAATAATTCAAACTATACAATTATAGTAAGTTTTCAGATTTTTCTAAATTAAAATAATGA
TTCATCTCATTAAGGGGAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTGAAAATAAAATCACTATCATAAACAAACAAAACGAGATGAACCCATTACATTCATTCAGCCACCTAAGATAATTAG
GTGCCTTTAATTAATGATGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF A [H]

Number of amino acids: Translated: 453; Mature: 453

Protein sequence:

>453_residues
MHHTVLCIHLNKGVALMNQYHSNAQQPSAWRFFVYSLVGILCFFIPFTINGNNTIFVDHVHLAIRSIIGPLMPYVALIMI
LIGTALPIVRRTFMTSITNLVITLFKVAGAMIGIMYVFKIGPSILFKANYGPFLFEKLMMPLSILIPVGAIALSLLVGYG
LLEFVGVYMEPIMRPIFKTPGKSAVDAVASFVGSYSLGLLITNRVYKQGMYNKREATIIATGFSTVSATFMIIVAKTLGL
MPHWNLYFWITLVITFVVTAITAWLPPISNESTEYYNGQEGEQEVAIEGSRLKTAYAEAMKQNALTPSLVKNVWDNLKDG
LEMTVGILPSILSIGFLGLIVANYTPFIDWLGYIFYPFIYIFPIADQALLAKASAISIVEMFLPSLLVTKAAMSTKFVVG
VVSVSAIIFFSALVPCILATEIKIPVWKLIIIWFLRVALSLLITIPVALLIFG

Sequences:

>Translated_453_residues
MHHTVLCIHLNKGVALMNQYHSNAQQPSAWRFFVYSLVGILCFFIPFTINGNNTIFVDHVHLAIRSIIGPLMPYVALIMI
LIGTALPIVRRTFMTSITNLVITLFKVAGAMIGIMYVFKIGPSILFKANYGPFLFEKLMMPLSILIPVGAIALSLLVGYG
LLEFVGVYMEPIMRPIFKTPGKSAVDAVASFVGSYSLGLLITNRVYKQGMYNKREATIIATGFSTVSATFMIIVAKTLGL
MPHWNLYFWITLVITFVVTAITAWLPPISNESTEYYNGQEGEQEVAIEGSRLKTAYAEAMKQNALTPSLVKNVWDNLKDG
LEMTVGILPSILSIGFLGLIVANYTPFIDWLGYIFYPFIYIFPIADQALLAKASAISIVEMFLPSLLVTKAAMSTKFVVG
VVSVSAIIFFSALVPCILATEIKIPVWKLIIIWFLRVALSLLITIPVALLIFG
>Mature_453_residues
MHHTVLCIHLNKGVALMNQYHSNAQQPSAWRFFVYSLVGILCFFIPFTINGNNTIFVDHVHLAIRSIIGPLMPYVALIMI
LIGTALPIVRRTFMTSITNLVITLFKVAGAMIGIMYVFKIGPSILFKANYGPFLFEKLMMPLSILIPVGAIALSLLVGYG
LLEFVGVYMEPIMRPIFKTPGKSAVDAVASFVGSYSLGLLITNRVYKQGMYNKREATIIATGFSTVSATFMIIVAKTLGL
MPHWNLYFWITLVITFVVTAITAWLPPISNESTEYYNGQEGEQEVAIEGSRLKTAYAEAMKQNALTPSLVKNVWDNLKDG
LEMTVGILPSILSIGFLGLIVANYTPFIDWLGYIFYPFIYIFPIADQALLAKASAISIVEMFLPSLLVTKAAMSTKFVVG
VVSVSAIIFFSALVPCILATEIKIPVWKLIIIWFLRVALSLLITIPVALLIFG

Specific function: Unknown

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50051; Mature: 50051

Theoretical pI: Translated: 9.49; Mature: 9.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHHTVLCIHLNKGVALMNQYHSNAQQPSAWRFFVYSLVGILCFFIPFTINGNNTIFVDHV
CCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHH
HLAIRSIIGPLMPYVALIMILIGTALPIVRRTFMTSITNLVITLFKVAGAMIGIMYVFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GPSILFKANYGPFLFEKLMMPLSILIPVGAIALSLLVGYGLLEFVGVYMEPIMRPIFKTP
CCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GKSAVDAVASFVGSYSLGLLITNRVYKQGMYNKREATIIATGFSTVSATFMIIVAKTLGL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCC
MPHWNLYFWITLVITFVVTAITAWLPPISNESTEYYNGQEGEQEVAIEGSRLKTAYAEAM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHEECCHHHHHHHHHHH
KQNALTPSLVKNVWDNLKDGLEMTVGILPSILSIGFLGLIVANYTPFIDWLGYIFYPFIY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IFPIADQALLAKASAISIVEMFLPSLLVTKAAMSTKFVVGVVSVSAIIFFSALVPCILAT
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIKIPVWKLIIIWFLRVALSLLITIPVALLIFG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MHHTVLCIHLNKGVALMNQYHSNAQQPSAWRFFVYSLVGILCFFIPFTINGNNTIFVDHV
CCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHH
HLAIRSIIGPLMPYVALIMILIGTALPIVRRTFMTSITNLVITLFKVAGAMIGIMYVFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GPSILFKANYGPFLFEKLMMPLSILIPVGAIALSLLVGYGLLEFVGVYMEPIMRPIFKTP
CCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GKSAVDAVASFVGSYSLGLLITNRVYKQGMYNKREATIIATGFSTVSATFMIIVAKTLGL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCC
MPHWNLYFWITLVITFVVTAITAWLPPISNESTEYYNGQEGEQEVAIEGSRLKTAYAEAM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHEECCHHHHHHHHHHH
KQNALTPSLVKNVWDNLKDGLEMTVGILPSILSIGFLGLIVANYTPFIDWLGYIFYPFIY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IFPIADQALLAKASAISIVEMFLPSLLVTKAAMSTKFVVGVVSVSAIIFFSALVPCILAT
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIKIPVWKLIIIWFLRVALSLLITIPVALLIFG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA