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The map label for this gene is 161508543

Identifier: 161508543

GI number: 161508543

Start: 324830

End: 325996

Strand: Reverse

Name: 161508543

Synonym: USA300HOU_0292

Alternate gene names: NA

Gene position: 325996-324830 (Counterclockwise)

Preceding gene: 161508544

Following gene: 161508542

Centisome position: 11.35

GC content: 31.88

Gene sequence:

>1167_bases
ATGAAAACAATACATTTGTTTCGCATCTACCACTCTTTTTTATTGAAAAAGTGGTATTTGATTATCTATTTACTATTTAT
ATTAGCGGCACTCCTTATTACATTAACGACAATCCAACATGTAACAGAAGATGACAATCATTTTAATATAGGTGTCGTAG
ATAAAGATCAATCAAGTGAAACGAAATTAATCTTAAACTCTATTGGTAAAGGGAGTAACCTAGGAAAAAACGTGAGCATT
AAAGCATATGATGATAAGCAAGCACATACTTTGTTAAAAAAACATAAACTTCAAGGCTATTTTGTTTTTGATAAAGGTAT
GACCAAGGCATTTTATAAACAAGGCGAACTACCAATTTCAGTATATACATATGATCAACAATCCATGAAAAGTGTCGTGC
TATCTCAGCTAACAGATTCTGTTTACCAACGTCTTATGCGATCAATGGGTGGCATCTTAGCTTTTCAAGACTTAGCACCG
AAAGCATCACATTCTGACAGTATCAATGTTATGACTGATTTGCTGATTACAGGATTAAACCGTTCAGGTGCATTTAACTT
AGAACCGATTCATTTATACGATACGGGCAGTTATTATGCAATTACAGGATTTTTAACAACGGTATTCATCTTTGCACTAT
CTTTATTTACAGTTTTGAAAATGAATCAAGATACTGTATTGAAAGCGCGATTGAAAATGTTTCATTTTTCTAAAGAGCGT
TTATTAATCATTCGTACGTTGATTACATGGTTTTATACTATGTTATGGAGTATCGTTGGTGTAGTTTGGATTGTGTTCAG
TATTCCGAATATCTTTGAATTATATAATTGGCCAACGTTAGCCATTCATTTAAGCTATTATGTTACCTTTTTAATACTGT
GGTTATTACTCATCGAACTTTTAACAACAGGCTTGTTGAATAGTATTAGTAAAGTCATATTAGCTATTGTCATCCTGGTG
TTATCTGGTTTAACAATACCTACGATTTTTTTACAACATATAGCAAATGGTGTTTTCAATATTCAACCGTTCGCAGTTGT
AACAAATCAATTGTTAGAAATTATTTTAAACAACTACATTTTAGAACTGCACCCTAGTTTCTATCTTAGCTTCATCGCAC
TTTTGATAATTAATTTAGCTGTATTGGTTTGGAGGTATCGTCAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGAATCAATTTTAAAAAAGGCATCTAAATAACTAAAATATAAAAATAAGATTGGAAGGTCATCTTGCCTTTCAATCTT
ATCATTGGAGGAGTGGTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCCTTATATACAACTTGTTGTGTTCAAGCAATGGTTACAATACATCTTGCTCGTAACAACCATTGTCATCGCACTCGTA
CTTATTGGTATCGGTTACCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 388; Mature: 388

Protein sequence:

>388_residues
MKTIHLFRIYHSFLLKKWYLIIYLLFILAALLITLTTIQHVTEDDNHFNIGVVDKDQSSETKLILNSIGKGSNLGKNVSI
KAYDDKQAHTLLKKHKLQGYFVFDKGMTKAFYKQGELPISVYTYDQQSMKSVVLSQLTDSVYQRLMRSMGGILAFQDLAP
KASHSDSINVMTDLLITGLNRSGAFNLEPIHLYDTGSYYAITGFLTTVFIFALSLFTVLKMNQDTVLKARLKMFHFSKER
LLIIRTLITWFYTMLWSIVGVVWIVFSIPNIFELYNWPTLAIHLSYYVTFLILWLLLIELLTTGLLNSISKVILAIVILV
LSGLTIPTIFLQHIANGVFNIQPFAVVTNQLLEIILNNYILELHPSFYLSFIALLIINLAVLVWRYRQ

Sequences:

>Translated_388_residues
MKTIHLFRIYHSFLLKKWYLIIYLLFILAALLITLTTIQHVTEDDNHFNIGVVDKDQSSETKLILNSIGKGSNLGKNVSI
KAYDDKQAHTLLKKHKLQGYFVFDKGMTKAFYKQGELPISVYTYDQQSMKSVVLSQLTDSVYQRLMRSMGGILAFQDLAP
KASHSDSINVMTDLLITGLNRSGAFNLEPIHLYDTGSYYAITGFLTTVFIFALSLFTVLKMNQDTVLKARLKMFHFSKER
LLIIRTLITWFYTMLWSIVGVVWIVFSIPNIFELYNWPTLAIHLSYYVTFLILWLLLIELLTTGLLNSISKVILAIVILV
LSGLTIPTIFLQHIANGVFNIQPFAVVTNQLLEIILNNYILELHPSFYLSFIALLIINLAVLVWRYRQ
>Mature_388_residues
MKTIHLFRIYHSFLLKKWYLIIYLLFILAALLITLTTIQHVTEDDNHFNIGVVDKDQSSETKLILNSIGKGSNLGKNVSI
KAYDDKQAHTLLKKHKLQGYFVFDKGMTKAFYKQGELPISVYTYDQQSMKSVVLSQLTDSVYQRLMRSMGGILAFQDLAP
KASHSDSINVMTDLLITGLNRSGAFNLEPIHLYDTGSYYAITGFLTTVFIFALSLFTVLKMNQDTVLKARLKMFHFSKER
LLIIRTLITWFYTMLWSIVGVVWIVFSIPNIFELYNWPTLAIHLSYYVTFLILWLLLIELLTTGLLNSISKVILAIVILV
LSGLTIPTIFLQHIANGVFNIQPFAVVTNQLLEIILNNYILELHPSFYLSFIALLIINLAVLVWRYRQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44536; Mature: 44536

Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKTIHLFRIYHSFLLKKWYLIIYLLFILAALLITLTTIQHVTEDDNHFNIGVVDKDQSSE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCH
TKLILNSIGKGSNLGKNVSIKAYDDKQAHTLLKKHKLQGYFVFDKGMTKAFYKQGELPIS
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCCEE
VYTYDQQSMKSVVLSQLTDSVYQRLMRSMGGILAFQDLAPKASHSDSINVMTDLLITGLN
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
RSGAFNLEPIHLYDTGSYYAITGFLTTVFIFALSLFTVLKMNQDTVLKARLKMFHFSKER
CCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHH
LLIIRTLITWFYTMLWSIVGVVWIVFSIPNIFELYNWPTLAIHLSYYVTFLILWLLLIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTTGLLNSISKVILAIVILVLSGLTIPTIFLQHIANGVFNIQPFAVVTNQLLEIILNNYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LELHPSFYLSFIALLIINLAVLVWRYRQ
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKTIHLFRIYHSFLLKKWYLIIYLLFILAALLITLTTIQHVTEDDNHFNIGVVDKDQSSE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCH
TKLILNSIGKGSNLGKNVSIKAYDDKQAHTLLKKHKLQGYFVFDKGMTKAFYKQGELPIS
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCCEE
VYTYDQQSMKSVVLSQLTDSVYQRLMRSMGGILAFQDLAPKASHSDSINVMTDLLITGLN
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
RSGAFNLEPIHLYDTGSYYAITGFLTTVFIFALSLFTVLKMNQDTVLKARLKMFHFSKER
CCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHH
LLIIRTLITWFYTMLWSIVGVVWIVFSIPNIFELYNWPTLAIHLSYYVTFLILWLLLIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTTGLLNSISKVILAIVILVLSGLTIPTIFLQHIANGVFNIQPFAVVTNQLLEIILNNYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LELHPSFYLSFIALLIINLAVLVWRYRQ
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA