| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160876902
Identifier: 160876902
GI number: 160876902
Start: 4476128
End: 4477882
Strand: Direct
Name: 160876902
Synonym: Sbal195_3798
Alternate gene names: NA
Gene position: 4476128-4477882 (Clockwise)
Preceding gene: 160876901
Following gene: 160876909
Centisome position: 83.71
GC content: 28.55
Gene sequence:
>1755_bases ATGATCGAACAAGCACTATTCAAGAAATTAATAGACTCTTTGTGGCCAACGATAATAAACAAAGCATCACTTACCAAGAA GTTAAAAAATCTTAATGCTGCCAATGCTTACCTCAGTGCCGCAAATGTAGAAAAAGTAAAAACCATCTGGCAAGTTGACA AAGAAGTTAATCTACACAATTTTTATTATCCAACCCAAATTCAATTAGAAGGAAACAAAATAAAAATAGAAGGACTAAAC TCATTTCCTGATAATGGAAAAATTGTTATTCAAGGAACTGCAGGGCAAGGCAAGTCAATATTAATGAGATACATAACAAG TATCGAACTCAAAAAAGCATCAACTTTACCTATATTTGTAGAGTTAAGGAAAATATCTGAGAAGAAAAGCCTAATAGATC TCATCTTAGACAATTTAAAAGAAATAGGATTAGATATTGATTCATCAGAGTTAGATGCGCTATTTGCAACAGGAAAATGC TCACTATTATTAGATGCTTTTGATGAAATACCTAAATCCTTAGTAAATGAGACGATTACATCAATTGAAAGCATTTGTAA CCAACATTATAGTCTTGCCGTAATAATATCATCAAGACCCAATGCCGAAATACAAAAAAGTACTTTTTTTAGAGTTATAA ATTTAGCGGAGTTATCTCCAGCCGATTTTGAGCCATTATTAGAAAAATTATTTTATTCATCAGAAAACAATATTGCAGAT TTGTTAAAAGCAATCCATTCAAGCGAATCACAAGTAGTCGATGTAATAACAACACCTTTACTACTGACTCTATTAGTAAT CATATATAAGTCATTCAATGAAATACCAAATAATCTGTCTGAGTTTTATGATAAATTATTCACCATTTTATGTTATAGAC ATGATTCAACTAAACCTGGTTTTAAAAGAGAATTTTCAACAGGATTAACTGAGTCACAATTAGCAAAATTATTTGATAGT TTTTGTTTTTGTTGCATGAAGGCAAAAGTATCTTCACTTACAAAAAATGAAGCTATATCTTTAACAAATGAGGCCATAGA GCTTTCAAACTCGAATATTGATAACGCAGAACCATTTTTGAACGACATAACAAAGGTAACATGTTTAGTTGTTGAAGAAG GTTTTGAGTACCATTTTATACATAAAAGTATTCGAGAGTATCATGCGGCACATTACTTAAAAGAACATGCACAAGAAAGA CTAAAAATTGCATTTTACAATCATGCTTCTTTATATTGCGAAAACTACTATCAAGAACTAAAATTCCTTGAAAGTATCGA TGAATACAATTACAAAAAACATTTCCTAGTACCACATATCGATTATATATTCAATACAGCAAACATAGACAAAAATAACA TAAACAAAAATAACGCCATTAACAAAATATTCGAAAATATAAATGTTTTAATTGACGATAACGGGCGTTTATCTGGTATA AGCCATCCAAAATCTGACATTTTAATCAATAACATTTTTAATTTATACCATGATTTGGTTATATTTTTATTTAGAAGTCA TGAGAATAAATTTGCCGCAGGATACAATTTAAATAAACAGGATAAAACCATAAATGAAGATAAAAACCATATAACTAAAG AGTTTTATCTATTAGATTTCATAGAAAAATACAATATGACCGAAAAATTTTCAGAACATACTGAAAAACTATTGAATAAA TTATCAAAAACACAACTTGACGCTATTGAATTTATAGAAAAATCTGACAAAATTATCAAAAAAATAAGTTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTAAATTATCTTCGATTGGTTATAAAGTCGCGAGAAGAATTAAACAATCACTATTGAATGATATAAGTCCTAAACATCA TTAAGTAACTAAGGAAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases CTCTATATTTATGGTATTAAAAGCTAGTATACCTCGCTACTAAACAAAAGTTAGGACAAGCATTACTCGTCACTCAATGA ATACGCCAAATACAGCATTG
Product: NACHT family-like NTPase
Products: NA
Alternate protein names: Signal Transduction Protein
Number of amino acids: Translated: 584; Mature: 584
Protein sequence:
>584_residues MIEQALFKKLIDSLWPTIINKASLTKKLKNLNAANAYLSAANVEKVKTIWQVDKEVNLHNFYYPTQIQLEGNKIKIEGLN SFPDNGKIVIQGTAGQGKSILMRYITSIELKKASTLPIFVELRKISEKKSLIDLILDNLKEIGLDIDSSELDALFATGKC SLLLDAFDEIPKSLVNETITSIESICNQHYSLAVIISSRPNAEIQKSTFFRVINLAELSPADFEPLLEKLFYSSENNIAD LLKAIHSSESQVVDVITTPLLLTLLVIIYKSFNEIPNNLSEFYDKLFTILCYRHDSTKPGFKREFSTGLTESQLAKLFDS FCFCCMKAKVSSLTKNEAISLTNEAIELSNSNIDNAEPFLNDITKVTCLVVEEGFEYHFIHKSIREYHAAHYLKEHAQER LKIAFYNHASLYCENYYQELKFLESIDEYNYKKHFLVPHIDYIFNTANIDKNNINKNNAINKIFENINVLIDDNGRLSGI SHPKSDILINNIFNLYHDLVIFLFRSHENKFAAGYNLNKQDKTINEDKNHITKEFYLLDFIEKYNMTEKFSEHTEKLLNK LSKTQLDAIEFIEKSDKIIKKISF
Sequences:
>Translated_584_residues MIEQALFKKLIDSLWPTIINKASLTKKLKNLNAANAYLSAANVEKVKTIWQVDKEVNLHNFYYPTQIQLEGNKIKIEGLN SFPDNGKIVIQGTAGQGKSILMRYITSIELKKASTLPIFVELRKISEKKSLIDLILDNLKEIGLDIDSSELDALFATGKC SLLLDAFDEIPKSLVNETITSIESICNQHYSLAVIISSRPNAEIQKSTFFRVINLAELSPADFEPLLEKLFYSSENNIAD LLKAIHSSESQVVDVITTPLLLTLLVIIYKSFNEIPNNLSEFYDKLFTILCYRHDSTKPGFKREFSTGLTESQLAKLFDS FCFCCMKAKVSSLTKNEAISLTNEAIELSNSNIDNAEPFLNDITKVTCLVVEEGFEYHFIHKSIREYHAAHYLKEHAQER LKIAFYNHASLYCENYYQELKFLESIDEYNYKKHFLVPHIDYIFNTANIDKNNINKNNAINKIFENINVLIDDNGRLSGI SHPKSDILINNIFNLYHDLVIFLFRSHENKFAAGYNLNKQDKTINEDKNHITKEFYLLDFIEKYNMTEKFSEHTEKLLNK LSKTQLDAIEFIEKSDKIIKKISF >Mature_584_residues MIEQALFKKLIDSLWPTIINKASLTKKLKNLNAANAYLSAANVEKVKTIWQVDKEVNLHNFYYPTQIQLEGNKIKIEGLN SFPDNGKIVIQGTAGQGKSILMRYITSIELKKASTLPIFVELRKISEKKSLIDLILDNLKEIGLDIDSSELDALFATGKC SLLLDAFDEIPKSLVNETITSIESICNQHYSLAVIISSRPNAEIQKSTFFRVINLAELSPADFEPLLEKLFYSSENNIAD LLKAIHSSESQVVDVITTPLLLTLLVIIYKSFNEIPNNLSEFYDKLFTILCYRHDSTKPGFKREFSTGLTESQLAKLFDS FCFCCMKAKVSSLTKNEAISLTNEAIELSNSNIDNAEPFLNDITKVTCLVVEEGFEYHFIHKSIREYHAAHYLKEHAQER LKIAFYNHASLYCENYYQELKFLESIDEYNYKKHFLVPHIDYIFNTANIDKNNINKNNAINKIFENINVLIDDNGRLSGI SHPKSDILINNIFNLYHDLVIFLFRSHENKFAAGYNLNKQDKTINEDKNHITKEFYLLDFIEKYNMTEKFSEHTEKLLNK LSKTQLDAIEFIEKSDKIIKKISF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67099; Mature: 67099
Theoretical pI: Translated: 6.37; Mature: 6.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIEQALFKKLIDSLWPTIINKASLTKKLKNLNAANAYLSAANVEKVKTIWQVDKEVNLHN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE FYYPTQIQLEGNKIKIEGLNSFPDNGKIVIQGTAGQGKSILMRYITSIELKKASTLPIFV EECCEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH ELRKISEKKSLIDLILDNLKEIGLDIDSSELDALFATGKCSLLLDAFDEIPKSLVNETIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIESICNQHYSLAVIISSRPNAEIQKSTFFRVINLAELSPADFEPLLEKLFYSSENNIAD HHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHH LLKAIHSSESQVVDVITTPLLLTLLVIIYKSFNEIPNNLSEFYDKLFTILCYRHDSTKPG HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCC FKREFSTGLTESQLAKLFDSFCFCCMKAKVSSLTKNEAISLTNEAIELSNSNIDNAEPFL CHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH NDITKVTCLVVEEGFEYHFIHKSIREYHAAHYLKEHAQERLKIAFYNHASLYCENYYQEL HHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHH KFLESIDEYNYKKHFLVPHIDYIFNTANIDKNNINKNNAINKIFENINVLIDDNGRLSGI HHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCC SHPKSDILINNIFNLYHDLVIFLFRSHENKFAAGYNLNKQDKTINEDKNHITKEFYLLDF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IEKYNMTEKFSEHTEKLLNKLSKTQLDAIEFIEKSDKIIKKISF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIEQALFKKLIDSLWPTIINKASLTKKLKNLNAANAYLSAANVEKVKTIWQVDKEVNLHN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE FYYPTQIQLEGNKIKIEGLNSFPDNGKIVIQGTAGQGKSILMRYITSIELKKASTLPIFV EECCEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH ELRKISEKKSLIDLILDNLKEIGLDIDSSELDALFATGKCSLLLDAFDEIPKSLVNETIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIESICNQHYSLAVIISSRPNAEIQKSTFFRVINLAELSPADFEPLLEKLFYSSENNIAD HHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHH LLKAIHSSESQVVDVITTPLLLTLLVIIYKSFNEIPNNLSEFYDKLFTILCYRHDSTKPG HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCC FKREFSTGLTESQLAKLFDSFCFCCMKAKVSSLTKNEAISLTNEAIELSNSNIDNAEPFL CHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH NDITKVTCLVVEEGFEYHFIHKSIREYHAAHYLKEHAQERLKIAFYNHASLYCENYYQEL HHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHH KFLESIDEYNYKKHFLVPHIDYIFNTANIDKNNINKNNAINKIFENINVLIDDNGRLSGI HHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCC SHPKSDILINNIFNLYHDLVIFLFRSHENKFAAGYNLNKQDKTINEDKNHITKEFYLLDF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IEKYNMTEKFSEHTEKLLNKLSKTQLDAIEFIEKSDKIIKKISF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA