| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160873723
Identifier: 160873723
GI number: 160873723
Start: 704100
End: 710693
Strand: Direct
Name: 160873723
Synonym: Sbal195_0601
Alternate gene names: NA
Gene position: 704100-710693 (Clockwise)
Preceding gene: 160873722
Following gene: 160873724
Centisome position: 13.17
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Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases AGCGCCATAATCTATCAGGAGGAATAATTATTCCTAATTTAAACCACTGTTTTTTCAATTTTCGACAGAACCGCATTTAC ATACTCGATATAGGTTAGCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGCTTTAGCAAAGGAGATGTTTTTACTAGCCAGCCCAGAGAGGGCTATAGCTGGAATTACATCTCCTTATTTATGGATA AGGTCACATGTAATGGACAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Insecticidal xin Complex Protein; A Component Of Insecticidal xin Complex; Insecticidal xin Complex Protein TccB; Insecticidal xin Protein; Xin Subunit; Xin Complex Protein; Insecticidal xin Complex Protein TcaB; Partially A Component Of Insecticidal xin Complex; Xin A; Virulence Plasmid
Number of amino acids: Translated: 2197; Mature: 2196
Protein sequence:
>2197_residues MSSTNKKAAIARANPQILSNRYLIDGIKADTDSGYVVKDCVSSLSSPAAYLTALYREARNLHHKGSPQHLDVRRPDLQWL VLSDSNMNGEVSTLALSTEVLTAAIDDPELERLLTLATWPCDLPYHAPFNAICSALTLQGKRASDLNRFLDKQVLDHATE SALGLGIAPALYRLLADNTGKSAKTQRTDGPFNSELPTLPPANNTTGGDSDGEISNQLLALYGTDDLAILAKVETICLAL GISRDRLNQALAFPLFGQRGNACDINNTAFSVTPLRRSVSYINTHNGQDFVCNNGDSLNVLNAKAEALLHDDGAAESLET IIFPVANTNTVRVAIWYPNKVGMTLVVAYEDKKRDIIRLQSDQPQWIHLLLDNQIKRFDIIDHQTHQRIVSGSYTANFLP IDATILIRLGKLLRLMESTQLSPAIIGRVAVSSPTVNLPELDQDTLTALAAVQDLIITCGFSEQNALILAGYDIDDTAPT GQVSQFDSLFNTPPLNGHFFSCNDWDFSFDPADTQSAQQRAVLKRAFGVNDLELYTLSQMLPSEKKYTKLEVISWLYRLS LWASSNDLNPLELYEFSFILFKEYRAADNQRLEQFKTLCSAADWLKEQKLTVAQLKLMTTRQYSCSMTPQLEHFVKSLVL PGLDSSDPKLKDKLAPVIAVAFGISTDAALMLEDWYEQIIKDFAQLEPAELQIVTMERLAYYALNSDIEPSVLTNGVAKS CQILAQLALIIKHWNFSAAELELIAHYPKVLKSNLSSVLPDMSTLQKLSSYHSMVQSVSDADPLLLELKNETLTVDTLAD FLTVSIENLRNAAVAADICIDQSLTFAHVMALCNWMAAAADLNVSVGDVAALCKLTLSDDISTWQRVACGFSAAVAPQKM PAFHEKIDEQLSTALSAWYLANKPDILPEALPWANREDLFSYLLIDNLVSAKVMTSRIAEAIASIQLYVDRCLHGLEEGA DRNYLVGTPFFQGWDSINKRYSQWAAVQQLDYYPENYVDPTLRSQQSFLQKQLAQDLMSGNGMGGDSADVAFRHYLTGLE TLAKIRIISGYHDGKTLDDGYTYFIGIAPNSPQDYYWRRLDQSEQSQKKEDTVANPYFAHSWSGWEKITVPIGNLYRDAI RLVSTKGRLYLAWIEKIQTGTSKGETDKTGIYSWHLKLAWEHINGSWSIPVTVELEKQVNFNKVIIECETFQFYASYNAG HEQLLLMFYNGNSLSPEVLLGNSHVIIVSPMLDIITPSEAEKERIIKNVSFDLGVHEKFHDDNKILHTLQTDVNYGYVAN VTGQNQDFGHLSFTQILEFTVSVTYDLQSHTFILNEYARLVINSPAAEITAQFLDDEIVTAGFTHFAPIEFNRKTTLTIS DFFKRQTKQFSFTIVESFTTPALIAPSQTFKHTLTKNYTVNINSVPISHAEPVYYISPEKSGAMVLRRSNDGRSIRLNSL FGSELVKRVSEGIDNLLTLSTQQLVINDEKMDFNGSYGLYFWELFYYSPLLQAEHLLANRQFDEAERWMNTIFNPQGYIE SGQHTARYWNVLPFLDMKDAIVDCNSIDPDIIAQNDPFHYKVHVLMRRLDLLQAKGDSLYRQLERDTLAEAKQCYLSALN LLGNAPAVAQNATWTDPSLLQAASAKEDIFSPAFNEKFNNYRTIFEQRLFNLRHNLSLDGQALHLTLYAAPADPLELYRT IATPIGMAPALTDRNHPQARYRYPQIAASAKELVAQLCQYGSQLLATLQQRDIETFNSQAQQQVHELMQLSINVQTELVT QAAAQQELLKTQEDTVNKRKVHYDTWLAEGSDSISTKERNAMNLRISSTAFRTSASAVMTAGFMAELAPNIFGLSDGGSK WGSPLFGIAVGMADGVGGALDASATALDTLENYRRRKEQWQLMRYEATQQLLEIAVQQKSAKAASEAAVNQLTYLKMQKQ DFKLQLDFLKTKFSNSALYDWLKGQLSSIYSLAYELAWSRSKMVEASFRWETNMRDKLFLQPFGEDHPHANLLRGERLMA ALQQMDAAYLEWDSRALEVTRTVSLAKEMKSTLGKHSFANLVNSILAGNTDIPQPDGLTISLDGNQLAATIVLEKLKIND DYPNTLGNTRRIKQIGVSLPALIGPYQDVQAVLSYEGSCISLDESCRRIAISHGVDDAGMFQWNFQDNKYLPFEGIAIND KGFLVLSFPNATGKQAELVSSLSDIILHIRYTIRNND
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
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Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
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EC number: NA
Molecular weight: Translated: 245686; Mature: 245555
Theoretical pI: Translated: 5.14; Mature: 5.14
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSSTNKKAAIARANPQILSNRYLIDGIKADTDSGYVVKDCVSSLSSPAAYLTALYREARN CCCCCCCCEEEECCHHHHCCCEEEECEECCCCCCEEHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH LHHKGSPQHLDVRRPDLQWLVLSDSNMNGEVSTLALSTEVLTAAIDDPELERLLTLATWP CCCCCCCCEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHEECCCHHHHHHHHHHCCC CDLPYHAPFNAICSALTLQGKRASDLNRFLDKQVLDHATESALGLGIAPALYRLLADNTG CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCC KSAKTQRTDGPFNSELPTLPPANNTTGGDSDGEISNQLLALYGTDDLAILAKVETICLAL CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH GISRDRLNQALAFPLFGQRGNACDINNTAFSVTPLRRSVSYINTHNGQDFVCNNGDSLNV CCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCEEE LNAKAEALLHDDGAAESLETIIFPVANTNTVRVAIWYPNKVGMTLVVAYEDKKRDIIRLQ ECHHHHHHCCCCCCHHCCEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEE SDQPQWIHLLLDNQIKRFDIIDHQTHQRIVSGSYTANFLPIDATILIRLGKLLRLMESTQ CCCCCEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCC LSPAIIGRVAVSSPTVNLPELDQDTLTALAAVQDLIITCGFSEQNALILAGYDIDDTAPT 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