| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159900460
Identifier: 159900460
GI number: 159900460
Start: 4943862
End: 4946678
Strand: Reverse
Name: 159900460
Synonym: Haur_3945
Alternate gene names: NA
Gene position: 4946678-4943862 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159900461
Following gene: 159900459
Centisome position: 77.94
GC content: 52.08
Gene sequence:
>2817_bases ATGCAGTTGATTCTTGGTTTGCTCTTAGCCCCAGTTCTGCTTTATCTGCCTGGCCTCGTGTGGGGGCGCTTTGGTCATCG CAGCAGCGATTGGCTTGATCGTCAGTTTGAACGCATGACGGTGAGTGCGCTGTGGACAGGTTGGTGGGGCTTGGTATTAG CAAGCCTTGGCTGGTTTAGTTTGCTGCATTTGGTGCTTGGCACGGCGCTTTTTTGTGGTGTAGGCTGGTGGCTGAGCCAC AAATTTGGCCTAGCGCCACTCGAAACCAGCGAGGCTCGCCCTGTTTGGGAGCGTTGGCTGTTTATTCTTGGCTTGCTCAT TTTTGCGGCAATCGTGGCTCGCCCGTTTGAGACAGTGCTTGGTGGGCGTGATGCTGGGGTTTACACAGTTACAGGCTTTG CGATTGAGCGCACAGGCAGCATTGTGCAAGATGAAGCTTTGGTTGCCGAGATTGTGCGAGCAATGAATTACAACGACCGC AATCTCTCTGAGCCAGCCAAACAAGCCTATAGCAATTTGCTTGGCAAACAAGATCCTGAGCGTTTTTTGAGCACGCGTTT TCATCAGCCCAGCTTTTTTATGACCGAGCAATCGGCGGCGGCGGGCAAATCATACCCCAATAACTTTCACCTTTACCCAA CTTGGATCGCCATCTGGACGAGCTTGTTTGGTTTGTATGGCGGTTTGCTGGCCACGGGCTATTTGGGTTGGCTAGGTGCG TGGAGCGTAGCCATGGTTGGGCGGCGAGTCGTCAGTGGTAAGGCTAGCGCTTGGATGGGCGTTTTAGCTTTAGGCTTGCT TAGCCTGAACAGCCTGCAAATTTGGTTTAGCCGCTACTCGACTGCCGAAGCAGGAGCGCAGTGGACTGTGTGGGGCGGCT TGGCCATGTGGGCCGCCTATAGCCAAACCGCGCCTGATCAGCGCAGCACCCGCCGGAACTTGTGGTATGCCGCGTTGTGT GGCTTGGCGATTGGTCAACTGGCGCTCATGCGGCTTGAATTTTACTTTGGGGTCTTTCCAATTGTCTTGTATTTGGGCGC GGCCCTGATTCGCCGCCGCTGGCGTATGGGCGAAACCGCTATGCTGCTCGGTTTTGGCCTGATGATGGTCCATGCCGCCA TCCACATCAGCACCATTGGCTGGCTCTACTTTATGAATAATACTTGGGGCAAATTCCAAGATTTTGCGATTATCTCGCGC TTGGTGCACCCCTTCTATCCACCATTGTTGCAAGATATTCGCGGCAACAACTCCAAAGCTTGGATTTTAGAGAGCACCAG TCGTTTAGCACTTGAATTGGGTATAGTTCTGCTTGGTTTATTCGCACTTTGGGCCTTGTGTCGTTTTCCGCGTTTGCTGA ATTGGGTTGAAGCGCAAACCCAACATTGGCAACGCTGGTTGTTAGGCGGCGTAGCTGTGGGCTTGGTCTTGCTGGCAGCT TATGCCTATTTTATTCGGCCACAGCATCTTTCAAGCGCGGCACTTCTGCATCCAATTGAGCATGCCAGCACCTGGAATAG CTATATCGGTGGGATTTTGCCGATTCCTGATGTTAAGCCACGCCAAACAGCAATCGCCTATGGCAATATGGTGCGGCTGG GTTGGTATTTTTCGCCCTTGGGCATTGGCTTGGGCATCGCAGGTTTGGCGCTGTGGATTTGGCGCGACATGAATCGCAGT TCGTGGCTGATTTTGCTGTTGGGTATTTTGTATGGTGCGTTTAGCGTCAATGATTCGTATGGCACTGCCGACCAAACCTA CATTTATATTGCGCGGCGCTTTATTCCAGGGGCGGTGCCAATGCTTACCTTGGGCATGGCATGGCTCTTATCCAAGGGCA TGATTCAATCGCGCTGGCTTTGGCGGGCAGCAAGTGGCGGGGCGGCAACCGCGATGCTGCTGTTTTTTGCAGCAACTGGC TGGCGCACGATTGCCCATGTTGAATATCAAGGTGCGCTAGCTGCTCTGACCGAGCTAGCCAACCAAACTGAGCCAAATGC GATTGTGCTCATGCGTGGTGGCGACCGTGATTCCTCGACCAATATTGCTACGCCAATGCACTATTTGTTTGATCGTGATT ATTTGGTGGCCTACAGCGACGATCCCACGCCCTATCGCGATTTATTGGCTCAGCAAGTGCGCAATTGGCAAGCCCAAGGC CGCCCAGTCTATGTGATGCTTGGTTCACGTGGTGGCATGCTTAATTTACCTGGCTTTCGCTACGAAAATGTTGCGCTATT TGACCTACCATTAAAAGAATGGCAACAACTGCAATTGCAAAAGCCCTTTACGGCGGGCGACATTCGTTTTACCTATCGCA TCTATCGGCTTGTGCCTGATAGTGCGCCGATCGTTGGCCAGCAAATCATTGCGATTGATGATTATCGTTGGCAGCATAGT GGCATAAATCCGGTTGAAACCAACCCCAAGACTGGCCAACGTTATGCTTGGACTGCTGGAAACGCCAATTGGGTTATGCC AGCAGTTGGTACTAGCTCAAACTTGACCTTTAGTGTAGGATTAGGGTTAGTACCACCATCGCTCGTAAACCAGCCAGTTG AGCTTTGTTTAAGTGCTAGCTATCTGATCAAACAGCCGATTCGTCAGTCATTGGGTTGTCAACAACTGAGCAGCAGCGAG CCAACCACATTAACCTGGCAACTACCAGCCTTGCCAGAGCACGATTGGCTCTTGCAATTGAGCCTCAGTCGAACGTGGAC ACCCAATGATTATGCCACCGAATACCCCAGCCCACCTAACGATGCCCGCAGCCTTGGAATTCAATGGAGTGGCATAGTCT GGCAGATTGATCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCGTTATAGCGAGGCTTTTGGTTCGTTCAACGAAGAGAATCAAGTATAATCGCTGCTGTTTGCTCAACTATTTAGCCCG AGCGTTGTGAAGGAAGCGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGCGTAGGCTAATTCTTAAACAAAAATTGGTACTATCGCACTATAGGCTAATCGACATTGACTTGTGTATACTGACCTT GAGCTCCAAACGTGGAACGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 938; Mature: 938
Protein sequence:
>938_residues MQLILGLLLAPVLLYLPGLVWGRFGHRSSDWLDRQFERMTVSALWTGWWGLVLASLGWFSLLHLVLGTALFCGVGWWLSH KFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVLGGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDR NLSEPAKQAYSNLLGKQDPERFLSTRFHQPSFFMTEQSAAAGKSYPNNFHLYPTWIAIWTSLFGLYGGLLATGYLGWLGA WSVAMVGRRVVSGKASAWMGVLALGLLSLNSLQIWFSRYSTAEAGAQWTVWGGLAMWAAYSQTAPDQRSTRRNLWYAALC GLAIGQLALMRLEFYFGVFPIVLYLGAALIRRRWRMGETAMLLGFGLMMVHAAIHISTIGWLYFMNNTWGKFQDFAIISR LVHPFYPPLLQDIRGNNSKAWILESTSRLALELGIVLLGLFALWALCRFPRLLNWVEAQTQHWQRWLLGGVAVGLVLLAA YAYFIRPQHLSSAALLHPIEHASTWNSYIGGILPIPDVKPRQTAIAYGNMVRLGWYFSPLGIGLGIAGLALWIWRDMNRS SWLILLLGILYGAFSVNDSYGTADQTYIYIARRFIPGAVPMLTLGMAWLLSKGMIQSRWLWRAASGGAATAMLLFFAATG WRTIAHVEYQGALAALTELANQTEPNAIVLMRGGDRDSSTNIATPMHYLFDRDYLVAYSDDPTPYRDLLAQQVRNWQAQG RPVYVMLGSRGGMLNLPGFRYENVALFDLPLKEWQQLQLQKPFTAGDIRFTYRIYRLVPDSAPIVGQQIIAIDDYRWQHS GINPVETNPKTGQRYAWTAGNANWVMPAVGTSSNLTFSVGLGLVPPSLVNQPVELCLSASYLIKQPIRQSLGCQQLSSSE PTTLTWQLPALPEHDWLLQLSLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ
Sequences:
>Translated_938_residues MQLILGLLLAPVLLYLPGLVWGRFGHRSSDWLDRQFERMTVSALWTGWWGLVLASLGWFSLLHLVLGTALFCGVGWWLSH KFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVLGGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDR NLSEPAKQAYSNLLGKQDPERFLSTRFHQPSFFMTEQSAAAGKSYPNNFHLYPTWIAIWTSLFGLYGGLLATGYLGWLGA WSVAMVGRRVVSGKASAWMGVLALGLLSLNSLQIWFSRYSTAEAGAQWTVWGGLAMWAAYSQTAPDQRSTRRNLWYAALC GLAIGQLALMRLEFYFGVFPIVLYLGAALIRRRWRMGETAMLLGFGLMMVHAAIHISTIGWLYFMNNTWGKFQDFAIISR LVHPFYPPLLQDIRGNNSKAWILESTSRLALELGIVLLGLFALWALCRFPRLLNWVEAQTQHWQRWLLGGVAVGLVLLAA YAYFIRPQHLSSAALLHPIEHASTWNSYIGGILPIPDVKPRQTAIAYGNMVRLGWYFSPLGIGLGIAGLALWIWRDMNRS SWLILLLGILYGAFSVNDSYGTADQTYIYIARRFIPGAVPMLTLGMAWLLSKGMIQSRWLWRAASGGAATAMLLFFAATG WRTIAHVEYQGALAALTELANQTEPNAIVLMRGGDRDSSTNIATPMHYLFDRDYLVAYSDDPTPYRDLLAQQVRNWQAQG RPVYVMLGSRGGMLNLPGFRYENVALFDLPLKEWQQLQLQKPFTAGDIRFTYRIYRLVPDSAPIVGQQIIAIDDYRWQHS GINPVETNPKTGQRYAWTAGNANWVMPAVGTSSNLTFSVGLGLVPPSLVNQPVELCLSASYLIKQPIRQSLGCQQLSSSE PTTLTWQLPALPEHDWLLQLSLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ >Mature_938_residues MQLILGLLLAPVLLYLPGLVWGRFGHRSSDWLDRQFERMTVSALWTGWWGLVLASLGWFSLLHLVLGTALFCGVGWWLSH KFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVLGGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDR NLSEPAKQAYSNLLGKQDPERFLSTRFHQPSFFMTEQSAAAGKSYPNNFHLYPTWIAIWTSLFGLYGGLLATGYLGWLGA WSVAMVGRRVVSGKASAWMGVLALGLLSLNSLQIWFSRYSTAEAGAQWTVWGGLAMWAAYSQTAPDQRSTRRNLWYAALC GLAIGQLALMRLEFYFGVFPIVLYLGAALIRRRWRMGETAMLLGFGLMMVHAAIHISTIGWLYFMNNTWGKFQDFAIISR LVHPFYPPLLQDIRGNNSKAWILESTSRLALELGIVLLGLFALWALCRFPRLLNWVEAQTQHWQRWLLGGVAVGLVLLAA YAYFIRPQHLSSAALLHPIEHASTWNSYIGGILPIPDVKPRQTAIAYGNMVRLGWYFSPLGIGLGIAGLALWIWRDMNRS SWLILLLGILYGAFSVNDSYGTADQTYIYIARRFIPGAVPMLTLGMAWLLSKGMIQSRWLWRAASGGAATAMLLFFAATG WRTIAHVEYQGALAALTELANQTEPNAIVLMRGGDRDSSTNIATPMHYLFDRDYLVAYSDDPTPYRDLLAQQVRNWQAQG RPVYVMLGSRGGMLNLPGFRYENVALFDLPLKEWQQLQLQKPFTAGDIRFTYRIYRLVPDSAPIVGQQIIAIDDYRWQHS GINPVETNPKTGQRYAWTAGNANWVMPAVGTSSNLTFSVGLGLVPPSLVNQPVELCLSASYLIKQPIRQSLGCQQLSSSE PTTLTWQLPALPEHDWLLQLSLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 105129; Mature: 105129
Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQLILGLLLAPVLLYLPGLVWGRFGHRSSDWLDRQFERMTVSALWTGWWGLVLASLGWFS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLHLVLGTALFCGVGWWLSHKFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDRNLSEPAKQAYSNLLGKQDPE CCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH RFLSTRFHQPSFFMTEQSAAAGKSYPNNFHLYPTWIAIWTSLFGLYGGLLATGYLGWLGA HHHHHCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WSVAMVGRRVVSGKASAWMGVLALGLLSLNSLQIWFSRYSTAEAGAQWTVWGGLAMWAAY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCEEEEHHHHHHHHH SQTAPDQRSTRRNLWYAALCGLAIGQLALMRLEFYFGVFPIVLYLGAALIRRRWRMGETA HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH MLLGFGLMMVHAAIHISTIGWLYFMNNTWGKFQDFAIISRLVHPFYPPLLQDIRGNNSKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCE WILESTSRLALELGIVLLGLFALWALCRFPRLLNWVEAQTQHWQRWLLGGVAVGLVLLAA EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YAYFIRPQHLSSAALLHPIEHASTWNSYIGGILPIPDVKPRQTAIAYGNMVRLGWYFSPL HHHHHCHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCEEEEEEEHHHH GIGLGIAGLALWIWRDMNRSSWLILLLGILYGAFSVNDSYGTADQTYIYIARRFIPGAVP HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHEEHHHHHCCCCHH MLTLGMAWLLSKGMIQSRWLWRAASGGAATAMLLFFAATGWRTIAHVEYQGALAALTELA HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH NQTEPNAIVLMRGGDRDSSTNIATPMHYLFDRDYLVAYSDDPTPYRDLLAQQVRNWQAQG HCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC RPVYVMLGSRGGMLNLPGFRYENVALFDLPLKEWQQLQLQKPFTAGDIRFTYRIYRLVPD CEEEEEECCCCCEECCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCC SAPIVGQQIIAIDDYRWQHSGINPVETNPKTGQRYAWTAGNANWVMPAVGTSSNLTFSVG CCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCCCCCEEEEEC LGLVPPSLVNQPVELCLSASYLIKQPIRQSLGCQQLSSSEPTTLTWQLPALPEHDWLLQL CCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEE SLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ EECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEECCEEEEECC >Mature Secondary Structure MQLILGLLLAPVLLYLPGLVWGRFGHRSSDWLDRQFERMTVSALWTGWWGLVLASLGWFS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLHLVLGTALFCGVGWWLSHKFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDRNLSEPAKQAYSNLLGKQDPE CCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH RFLSTRFHQPSFFMTEQSAAAGKSYPNNFHLYPTWIAIWTSLFGLYGGLLATGYLGWLGA HHHHHCCCCCCEEEECCHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WSVAMVGRRVVSGKASAWMGVLALGLLSLNSLQIWFSRYSTAEAGAQWTVWGGLAMWAAY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCEEEEHHHHHHHHH SQTAPDQRSTRRNLWYAALCGLAIGQLALMRLEFYFGVFPIVLYLGAALIRRRWRMGETA HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH MLLGFGLMMVHAAIHISTIGWLYFMNNTWGKFQDFAIISRLVHPFYPPLLQDIRGNNSKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCE WILESTSRLALELGIVLLGLFALWALCRFPRLLNWVEAQTQHWQRWLLGGVAVGLVLLAA EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YAYFIRPQHLSSAALLHPIEHASTWNSYIGGILPIPDVKPRQTAIAYGNMVRLGWYFSPL HHHHHCHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCEEEEEEEHHHH GIGLGIAGLALWIWRDMNRSSWLILLLGILYGAFSVNDSYGTADQTYIYIARRFIPGAVP HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHEEHHHHHCCCCHH MLTLGMAWLLSKGMIQSRWLWRAASGGAATAMLLFFAATGWRTIAHVEYQGALAALTELA HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH NQTEPNAIVLMRGGDRDSSTNIATPMHYLFDRDYLVAYSDDPTPYRDLLAQQVRNWQAQG HCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC RPVYVMLGSRGGMLNLPGFRYENVALFDLPLKEWQQLQLQKPFTAGDIRFTYRIYRLVPD CEEEEEECCCCCEECCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCC SAPIVGQQIIAIDDYRWQHSGINPVETNPKTGQRYAWTAGNANWVMPAVGTSSNLTFSVG CCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCCCCCEEEEEC LGLVPPSLVNQPVELCLSASYLIKQPIRQSLGCQQLSSSEPTTLTWQLPALPEHDWLLQL CCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEE SLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ EECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEECCEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA