Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159900460

Identifier: 159900460

GI number: 159900460

Start: 4943862

End: 4946678

Strand: Reverse

Name: 159900460

Synonym: Haur_3945

Alternate gene names: NA

Gene position: 4946678-4943862 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159900461

Following gene: 159900459

Centisome position: 77.94

GC content: 52.08

Gene sequence:

>2817_bases
ATGCAGTTGATTCTTGGTTTGCTCTTAGCCCCAGTTCTGCTTTATCTGCCTGGCCTCGTGTGGGGGCGCTTTGGTCATCG
CAGCAGCGATTGGCTTGATCGTCAGTTTGAACGCATGACGGTGAGTGCGCTGTGGACAGGTTGGTGGGGCTTGGTATTAG
CAAGCCTTGGCTGGTTTAGTTTGCTGCATTTGGTGCTTGGCACGGCGCTTTTTTGTGGTGTAGGCTGGTGGCTGAGCCAC
AAATTTGGCCTAGCGCCACTCGAAACCAGCGAGGCTCGCCCTGTTTGGGAGCGTTGGCTGTTTATTCTTGGCTTGCTCAT
TTTTGCGGCAATCGTGGCTCGCCCGTTTGAGACAGTGCTTGGTGGGCGTGATGCTGGGGTTTACACAGTTACAGGCTTTG
CGATTGAGCGCACAGGCAGCATTGTGCAAGATGAAGCTTTGGTTGCCGAGATTGTGCGAGCAATGAATTACAACGACCGC
AATCTCTCTGAGCCAGCCAAACAAGCCTATAGCAATTTGCTTGGCAAACAAGATCCTGAGCGTTTTTTGAGCACGCGTTT
TCATCAGCCCAGCTTTTTTATGACCGAGCAATCGGCGGCGGCGGGCAAATCATACCCCAATAACTTTCACCTTTACCCAA
CTTGGATCGCCATCTGGACGAGCTTGTTTGGTTTGTATGGCGGTTTGCTGGCCACGGGCTATTTGGGTTGGCTAGGTGCG
TGGAGCGTAGCCATGGTTGGGCGGCGAGTCGTCAGTGGTAAGGCTAGCGCTTGGATGGGCGTTTTAGCTTTAGGCTTGCT
TAGCCTGAACAGCCTGCAAATTTGGTTTAGCCGCTACTCGACTGCCGAAGCAGGAGCGCAGTGGACTGTGTGGGGCGGCT
TGGCCATGTGGGCCGCCTATAGCCAAACCGCGCCTGATCAGCGCAGCACCCGCCGGAACTTGTGGTATGCCGCGTTGTGT
GGCTTGGCGATTGGTCAACTGGCGCTCATGCGGCTTGAATTTTACTTTGGGGTCTTTCCAATTGTCTTGTATTTGGGCGC
GGCCCTGATTCGCCGCCGCTGGCGTATGGGCGAAACCGCTATGCTGCTCGGTTTTGGCCTGATGATGGTCCATGCCGCCA
TCCACATCAGCACCATTGGCTGGCTCTACTTTATGAATAATACTTGGGGCAAATTCCAAGATTTTGCGATTATCTCGCGC
TTGGTGCACCCCTTCTATCCACCATTGTTGCAAGATATTCGCGGCAACAACTCCAAAGCTTGGATTTTAGAGAGCACCAG
TCGTTTAGCACTTGAATTGGGTATAGTTCTGCTTGGTTTATTCGCACTTTGGGCCTTGTGTCGTTTTCCGCGTTTGCTGA
ATTGGGTTGAAGCGCAAACCCAACATTGGCAACGCTGGTTGTTAGGCGGCGTAGCTGTGGGCTTGGTCTTGCTGGCAGCT
TATGCCTATTTTATTCGGCCACAGCATCTTTCAAGCGCGGCACTTCTGCATCCAATTGAGCATGCCAGCACCTGGAATAG
CTATATCGGTGGGATTTTGCCGATTCCTGATGTTAAGCCACGCCAAACAGCAATCGCCTATGGCAATATGGTGCGGCTGG
GTTGGTATTTTTCGCCCTTGGGCATTGGCTTGGGCATCGCAGGTTTGGCGCTGTGGATTTGGCGCGACATGAATCGCAGT
TCGTGGCTGATTTTGCTGTTGGGTATTTTGTATGGTGCGTTTAGCGTCAATGATTCGTATGGCACTGCCGACCAAACCTA
CATTTATATTGCGCGGCGCTTTATTCCAGGGGCGGTGCCAATGCTTACCTTGGGCATGGCATGGCTCTTATCCAAGGGCA
TGATTCAATCGCGCTGGCTTTGGCGGGCAGCAAGTGGCGGGGCGGCAACCGCGATGCTGCTGTTTTTTGCAGCAACTGGC
TGGCGCACGATTGCCCATGTTGAATATCAAGGTGCGCTAGCTGCTCTGACCGAGCTAGCCAACCAAACTGAGCCAAATGC
GATTGTGCTCATGCGTGGTGGCGACCGTGATTCCTCGACCAATATTGCTACGCCAATGCACTATTTGTTTGATCGTGATT
ATTTGGTGGCCTACAGCGACGATCCCACGCCCTATCGCGATTTATTGGCTCAGCAAGTGCGCAATTGGCAAGCCCAAGGC
CGCCCAGTCTATGTGATGCTTGGTTCACGTGGTGGCATGCTTAATTTACCTGGCTTTCGCTACGAAAATGTTGCGCTATT
TGACCTACCATTAAAAGAATGGCAACAACTGCAATTGCAAAAGCCCTTTACGGCGGGCGACATTCGTTTTACCTATCGCA
TCTATCGGCTTGTGCCTGATAGTGCGCCGATCGTTGGCCAGCAAATCATTGCGATTGATGATTATCGTTGGCAGCATAGT
GGCATAAATCCGGTTGAAACCAACCCCAAGACTGGCCAACGTTATGCTTGGACTGCTGGAAACGCCAATTGGGTTATGCC
AGCAGTTGGTACTAGCTCAAACTTGACCTTTAGTGTAGGATTAGGGTTAGTACCACCATCGCTCGTAAACCAGCCAGTTG
AGCTTTGTTTAAGTGCTAGCTATCTGATCAAACAGCCGATTCGTCAGTCATTGGGTTGTCAACAACTGAGCAGCAGCGAG
CCAACCACATTAACCTGGCAACTACCAGCCTTGCCAGAGCACGATTGGCTCTTGCAATTGAGCCTCAGTCGAACGTGGAC
ACCCAATGATTATGCCACCGAATACCCCAGCCCACCTAACGATGCCCGCAGCCTTGGAATTCAATGGAGTGGCATAGTCT
GGCAGATTGATCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCGTTATAGCGAGGCTTTTGGTTCGTTCAACGAAGAGAATCAAGTATAATCGCTGCTGTTTGCTCAACTATTTAGCCCG
AGCGTTGTGAAGGAAGCGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGCGTAGGCTAATTCTTAAACAAAAATTGGTACTATCGCACTATAGGCTAATCGACATTGACTTGTGTATACTGACCTT
GAGCTCCAAACGTGGAACGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 938; Mature: 938

Protein sequence:

>938_residues
MQLILGLLLAPVLLYLPGLVWGRFGHRSSDWLDRQFERMTVSALWTGWWGLVLASLGWFSLLHLVLGTALFCGVGWWLSH
KFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVLGGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDR
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PTTLTWQLPALPEHDWLLQLSLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ

Sequences:

>Translated_938_residues
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KFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVLGGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDR
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PTTLTWQLPALPEHDWLLQLSLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ
>Mature_938_residues
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GINPVETNPKTGQRYAWTAGNANWVMPAVGTSSNLTFSVGLGLVPPSLVNQPVELCLSASYLIKQPIRQSLGCQQLSSSE
PTTLTWQLPALPEHDWLLQLSLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105129; Mature: 105129

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQLILGLLLAPVLLYLPGLVWGRFGHRSSDWLDRQFERMTVSALWTGWWGLVLASLGWFS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLHLVLGTALFCGVGWWLSHKFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGRDAGVYTVTGFAIERTGSIVQDEALVAEIVRAMNYNDRNLSEPAKQAYSNLLGKQDPE
CCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH
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CCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCCCCCEEEEEC
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CCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEE
SLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ
EECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEECCEEEEECC
>Mature Secondary Structure
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LLHLVLGTALFCGVGWWLSHKFGLAPLETSEARPVWERWLFILGLLIFAAIVARPFETVL
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SLSRTWTPNDYATEYPSPPNDARSLGIQWSGIVWQIDQ
EECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEECCEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA