| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159899057
Identifier: 159899057
GI number: 159899057
Start: 3244886
End: 3252676
Strand: Reverse
Name: 159899057
Synonym: Haur_2538
Alternate gene names: NA
Gene position: 3252676-3244886 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159899058
Following gene: 159899056
Centisome position: 51.25
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Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: TPR repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: Glycosyl Transferase Family; Tetratricopeptide Repeat-Containing Protein; YYY Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 2596; Mature: 2595
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG5427
COG function: function code S; Uncharacterized membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 286962; Mature: 286830
Theoretical pI: Translated: 9.54; Mature: 9.54
Prosite motif: PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPRFAALRALGRRFPDLISLLCLLGILWMAWGVRSIHRADWDGYAPLIHPDEYYLKDAIT CCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCC PNLRVPDSFWSYLTTECEIVLNDQGVAQLKNARNPEEPDVSKQRPTATSGCNSLNPRTVD CCCCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC RGYVYGSLPVATVRYLTEKFYPEIEPDQLTSRTIAVVGRSVSSIADLISIVILFLLGRTL CCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NSRRIGLLAGFCFAWSPALIQHAHFFVVDGQAAMYGLLTLYASTRLAQSRRWWSSLLNTI CCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FAGAALALAVSCKITLAPLGGVIAIAAMVAYWHNPAYLRGDHSPAAIFQRLLWSGIYALP HHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FAVLAFLVMWFTLRFSMPDAFNGFWFEERFVNAIANASATSSGEVDAPSSHQWAGRSNYT HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH YELTNMIRWGMGVPLGVAAWLGWLAFGIALWRSESRQRLLGLLPIWLWTGIYFFWQGGLM HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE IKPMRYLLPIYGPLILFAAWGLISLVDWARREGTPLLFRKVPLHGLAVGLTSMVAIVTLL 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