| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159898757
Identifier: 159898757
GI number: 159898757
Start: 2852132
End: 2855365
Strand: Direct
Name: 159898757
Synonym: Haur_2236
Alternate gene names: NA
Gene position: 2852132-2855365 (Clockwise)
Preceding gene: 159898756
Following gene: 159898759
Centisome position: 44.94
GC content: 50.0
Gene sequence:
>3234_bases ATGAATCTTGATCACCTATTGGCTGAGTTCGAGCAATTAAGCTATGCCCAACGGATCAAACGCATGGTGCAACTTGGCCA ACGAGCCAGCAATAATCCGCAAATTAGCCAATTAATTGAACAATTAGCCCACAGCCCCAGTATCTACCAACGCCGATTGG CCTTATTTAGTTGCTATGGCAGCCACAATAGCAGCCTCATTCGTCAATTTATCGACGATCCAGCGCAATCACTAGTTCAA CTCGCGATCAAATTAATTGCGGTGTATGGCAGCGATGCCGATGTTGAAGCCAGTTTGCAACAGCTCGCCCCAGCCTTATG GCGCAGCATGCTCAAATTATTAAGCCAACAGCAACGCTTCGGATTGATCGATACATTTTTAGCGACACTTGAGCCAGCGC AACTGCCACGCTACCATATTTTTGGCTCACAAGCCTATTACAATCAACACCAAACTGCGATTATCACAAGCCTGCAACCC CAAGCATGGAGCCATTTCGCCCGTTTCAAGCCGCAAGCAGCTGCCGAAGCCCTAGCAATCGTCTTACAAAATGGCGACCT CAGCATTTGGCATAAACAGGGCATTTTCAATCAAGCGTTGCCCGAACTCGCCAAGGATTACCCAGATCAAGCACTTGCGC TGGTAGAAATAGCGTTGAATCAACAAATATCCTTAAAATCCATGCCGTTGCAAAAGTTAGCCTATCGCCGACCGCAAGCA ATTGCCGATCTGATTATTCAACACCAGCAAGCAGGCGCGATCAAATGGGGCAACTTACTGAAGAAATTAAGCTTGGAGCA CGTGTTACGGCTGGCTGAGCTGAATCTTTTGCCACGGCCAGCCTTATGGCTTGGCAACACGCCGCTTGAATATCGATCAG CTATCTATGCCGCTCATTATCGCCAATGGTATCAAGATGATGAACAACAATTGCGGTTGCGTGAAGATGCACTCTGGCAG GCCTTACCACGCCAAGAGCGCCAGTACGAGGCTCGACGAGTGCAGCAGATACCAAGTTTAGACTTTGATCTGCGTTTGAA TATTCGCCATGCCGCCTATTTGCCTTGGGACGAGGCTTGGGAAACCTTGCAACCAGCGCTCAAACATAGCGATGCCGACT ATCGCGGCGAAGCACTTGCCGCATTAATCAACATTGTGCGCTATCAGCCCGAACAAGCCCAAGCCGCCTTAGATCTCATG CAGACTCGGCGCAACGAACAAGATCCAGTACGGGTACAGATGCTCACCGCCTTGAGCGAACTCCCAGCGCGGCGTTGGCA AACCGAACACCTGCCCAGCATCGAGCAGATTATTAGCGCTAGCCTTGATGCGCGTGATTGCTCAGATGCCAGCATTCGCT TATTGCAACGCTGGCTCAGCAAATTGCTGGCGGTGCATCCACAGGCCAGTATCAGATTAATTGGCCAAATTAGCCGTGAA CGAGGCAAGATGTTTGTGCAAAGCCATGGCCGCAAACTCAACGCCAGCGAAGCTCAAGCCTTATGCGCCGTGCTCTTGCC AATTATGCAGCACTGGGAGCGCCGTCAACAAATCGAAGATATCTTGAGCATTGTCAATTTTATTGGCAAAGCGATTAAAG CTGTGCCTGAATTATTGACGCTGCTTGAGCAAATTGCCGATCAACAGCTCGATTGGGCCGCCAGCCGCGCCTTGCGCAGC TTACATCGTTTCGCTCGCAGCAGATTCAACCAAGCCGTGCCACGGCTGCTTGCCAACGACCCAAGTTGGATCACCCAGCC ATTGGTACACAATTTTGTACATAGCAAACGCCAGGATTTGCTCACGCCATTTTTGCCAGTCCAACGCTACAAAGGCAAAT TCAGCACTGGCAAATCGTCCTATCTTCTGCCAATTCAACGTGGGTTTGAGCGATGGACAACCAAGCAGCAACAACTATAT GCTCAAGCGCTGATCAAACAAACCGAGCAAACCGACCATCAGCACCCACATTTGGTCGAGTATGCCCAGCGTTTGGCCTA CCTCAGCGAAGTCGCGCCAACCCGCTTGATTGAATTGGCCCAACTTGATGCGCCAATTGTGGTCTTGCGCGATAAGGCGA TCGAGGCTTTGAGCCGCCGCGAAACCAGTGATGGCGTGGCAACCCTGATCGAAGCTTTGGACGATGCCCGAGCACGCGTG GCAATTTATGCTTTACGGCGGGTTTTGCTGCGCATGCCAATCGACCAAGCCTTGGCAATTTTGCGCAACGTACCAAGCAC CAAAATCACGGTGGCCAAAGAAACTCTACGGCTGATCGGCGATCTCAAAAACCAAGCGGCCTATCAAGAGTTATTACGCT GGAGCACGCTGGAACTACATCACGATGTCTGGATTGCCTTGGTCCATGCGCTGAATAATTATATTAATCAAGTCGAAACC TGGGCAATTTTTGAACGCTTGCTTAACCATGACGAACCAACCGTCGTCGAGAGTCTCACGACAATTTCGCTAGCAGGCCA AACACCAAGCATGCTGCCCCAACTGCTGCAACTGTTCAAAGCATTAATTGAGCATCCCAACCTTGAGGTGCGCAAAGCAG CAATCGGTCGCTGTTACTATTTTTATGGTATCGATACCCAGCGAGTTTTGGTTGAACCATTGACCAAGGCTCTGACTTCA GGGATTGAGAAGCTGCGAGATTTTGCGGTTACCGCGCTTATTAATGTCTATGGAATTAAGGATATAGCGGTTATTACTAA AATTGTGCACGCCAATTTAGCAAATCGGGCTGTTATCAACGCAGTGATGAGCAGGCTCAATAGCCAGGTACGATTCGGGC AAACGTCCCATGCAGCAGCAAACGCAGTTATTGCCGAACTAGCCCATGACCGATTAACTACTCGTTTGCAAATTCAATTA GCGGGGCTTTACTACGAAGAGCAAGCATGGTTTAACTTTATACAACAGCTGCGCCAACAAGCTTTGTTGAATGTTGATAA TTTTCGGGCAGTGTTGGAAGTGATGGAAAACGGCACAAATACCATTTGGGTTGGCCGACCTGAGCACCTTGAAAGCTACT TCTACCAAGCCAGCGATCCCTATCTGCGGCGCATCGGTTTGGCGGCTTTTTGCTTCAAAACCAAACGCAGGGGTTGGCAT CCTGCCGATTATCAACGGTTAGCTGAATATCAGGCCGACCCCGATGAACTCGTAGCAGCGGCGGCTCAATTTATCTTTGC GCCGCAACCTGACGCTGCAAAGCCCGCCAAATAG
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1077; Mature: 1077
Protein sequence:
>1077_residues MNLDHLLAEFEQLSYAQRIKRMVQLGQRASNNPQISQLIEQLAHSPSIYQRRLALFSCYGSHNSSLIRQFIDDPAQSLVQ LAIKLIAVYGSDADVEASLQQLAPALWRSMLKLLSQQQRFGLIDTFLATLEPAQLPRYHIFGSQAYYNQHQTAIITSLQP QAWSHFARFKPQAAAEALAIVLQNGDLSIWHKQGIFNQALPELAKDYPDQALALVEIALNQQISLKSMPLQKLAYRRPQA IADLIIQHQQAGAIKWGNLLKKLSLEHVLRLAELNLLPRPALWLGNTPLEYRSAIYAAHYRQWYQDDEQQLRLREDALWQ ALPRQERQYEARRVQQIPSLDFDLRLNIRHAAYLPWDEAWETLQPALKHSDADYRGEALAALINIVRYQPEQAQAALDLM QTRRNEQDPVRVQMLTALSELPARRWQTEHLPSIEQIISASLDARDCSDASIRLLQRWLSKLLAVHPQASIRLIGQISRE RGKMFVQSHGRKLNASEAQALCAVLLPIMQHWERRQQIEDILSIVNFIGKAIKAVPELLTLLEQIADQQLDWAASRALRS LHRFARSRFNQAVPRLLANDPSWITQPLVHNFVHSKRQDLLTPFLPVQRYKGKFSTGKSSYLLPIQRGFERWTTKQQQLY AQALIKQTEQTDHQHPHLVEYAQRLAYLSEVAPTRLIELAQLDAPIVVLRDKAIEALSRRETSDGVATLIEALDDARARV AIYALRRVLLRMPIDQALAILRNVPSTKITVAKETLRLIGDLKNQAAYQELLRWSTLELHHDVWIALVHALNNYINQVET WAIFERLLNHDEPTVVESLTTISLAGQTPSMLPQLLQLFKALIEHPNLEVRKAAIGRCYYFYGIDTQRVLVEPLTKALTS GIEKLRDFAVTALINVYGIKDIAVITKIVHANLANRAVINAVMSRLNSQVRFGQTSHAAANAVIAELAHDRLTTRLQIQL AGLYYEEQAWFNFIQQLRQQALLNVDNFRAVLEVMENGTNTIWVGRPEHLESYFYQASDPYLRRIGLAAFCFKTKRRGWH PADYQRLAEYQADPDELVAAAAQFIFAPQPDAAKPAK
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 123041; Mature: 123041
Theoretical pI: Translated: 9.42; Mature: 9.42
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNLDHLLAEFEQLSYAQRIKRMVQLGQRASNNPQISQLIEQLAHSPSIYQRRLALFSCYG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC SHNSSLIRQFIDDPAQSLVQLAIKLIAVYGSDADVEASLQQLAPALWRSMLKLLSQQQRF CCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLIDTFLATLEPAQLPRYHIFGSQAYYNQHQTAIITSLQPQAWSHFARFKPQAAAEALAI CHHHHHHHHCCHHHCCCEEEECCHHHHCCCCHHEEECCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH VLQNGDLSIWHKQGIFNQALPELAKDYPDQALALVEIALNQQISLKSMPLQKLAYRRPQA HHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHCCHHH IADLIIQHQQAGAIKWGNLLKKLSLEHVLRLAELNLLPRPALWLGNTPLEYRSAIYAAHY HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH RQWYQDDEQQLRLREDALWQALPRQERQYEARRVQQIPSLDFDLRLNIRHAAYLPWDEAW HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHCCCCHHHHH ETLQPALKHSDADYRGEALAALINIVRYQPEQAQAALDLMQTRRNEQDPVRVQMLTALSE HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LPARRWQTEHLPSIEQIISASLDARDCSDASIRLLQRWLSKLLAVHPQASIRLIGQISRE HHHHHCCHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH RGKMFVQSHGRKLNASEAQALCAVLLPIMQHWERRQQIEDILSIVNFIGKAIKAVPELLT HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLEQIADQQLDWAASRALRSLHRFARSRFNQAVPRLLANDPSWITQPLVHNFVHSKRQDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTPFLPVQRYKGKFSTGKSSYLLPIQRGFERWTTKQQQLYAQALIKQTEQTDHQHPHLVE HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH YAQRLAYLSEVAPTRLIELAQLDAPIVVLRDKAIEALSRRETSDGVATLIEALDDARARV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AIYALRRVLLRMPIDQALAILRNVPSTKITVAKETLRLIGDLKNQAAYQELLRWSTLELH HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HDVWIALVHALNNYINQVETWAIFERLLNHDEPTVVESLTTISLAGQTPSMLPQLLQLFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHH ALIEHPNLEVRKAAIGRCYYFYGIDTQRVLVEPLTKALTSGIEKLRDFAVTALINVYGIK HHHCCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH DIAVITKIVHANLANRAVINAVMSRLNSQVRFGQTSHAAANAVIAELAHDRLTTRLQIQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE AGLYYEEQAWFNFIQQLRQQALLNVDNFRAVLEVMENGTNTIWVGRPEHLESYFYQASDP ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCH YLRRIGLAAFCFKTKRRGWHPADYQRLAEYQADPDELVAAAAQFIFAPQPDAAKPAK HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNLDHLLAEFEQLSYAQRIKRMVQLGQRASNNPQISQLIEQLAHSPSIYQRRLALFSCYG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC SHNSSLIRQFIDDPAQSLVQLAIKLIAVYGSDADVEASLQQLAPALWRSMLKLLSQQQRF CCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLIDTFLATLEPAQLPRYHIFGSQAYYNQHQTAIITSLQPQAWSHFARFKPQAAAEALAI CHHHHHHHHCCHHHCCCEEEECCHHHHCCCCHHEEECCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH VLQNGDLSIWHKQGIFNQALPELAKDYPDQALALVEIALNQQISLKSMPLQKLAYRRPQA HHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHCCHHH IADLIIQHQQAGAIKWGNLLKKLSLEHVLRLAELNLLPRPALWLGNTPLEYRSAIYAAHY HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH RQWYQDDEQQLRLREDALWQALPRQERQYEARRVQQIPSLDFDLRLNIRHAAYLPWDEAW HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHCCCCHHHHH ETLQPALKHSDADYRGEALAALINIVRYQPEQAQAALDLMQTRRNEQDPVRVQMLTALSE HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LPARRWQTEHLPSIEQIISASLDARDCSDASIRLLQRWLSKLLAVHPQASIRLIGQISRE HHHHHCCHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH RGKMFVQSHGRKLNASEAQALCAVLLPIMQHWERRQQIEDILSIVNFIGKAIKAVPELLT HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLEQIADQQLDWAASRALRSLHRFARSRFNQAVPRLLANDPSWITQPLVHNFVHSKRQDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTPFLPVQRYKGKFSTGKSSYLLPIQRGFERWTTKQQQLYAQALIKQTEQTDHQHPHLVE HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH YAQRLAYLSEVAPTRLIELAQLDAPIVVLRDKAIEALSRRETSDGVATLIEALDDARARV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AIYALRRVLLRMPIDQALAILRNVPSTKITVAKETLRLIGDLKNQAAYQELLRWSTLELH HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HDVWIALVHALNNYINQVETWAIFERLLNHDEPTVVESLTTISLAGQTPSMLPQLLQLFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHH ALIEHPNLEVRKAAIGRCYYFYGIDTQRVLVEPLTKALTSGIEKLRDFAVTALINVYGIK HHHCCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH DIAVITKIVHANLANRAVINAVMSRLNSQVRFGQTSHAAANAVIAELAHDRLTTRLQIQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE AGLYYEEQAWFNFIQQLRQQALLNVDNFRAVLEVMENGTNTIWVGRPEHLESYFYQASDP ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCH YLRRIGLAAFCFKTKRRGWHPADYQRLAEYQADPDELVAAAAQFIFAPQPDAAKPAK HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA