| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159898749
Identifier: 159898749
GI number: 159898749
Start: 2832468
End: 2835413
Strand: Direct
Name: 159898749
Synonym: Haur_2228
Alternate gene names: NA
Gene position: 2832468-2835413 (Clockwise)
Preceding gene: 159898748
Following gene: 159898750
Centisome position: 44.63
GC content: 47.76
Gene sequence:
>2946_bases ATGGATGCGGAATCAACAACCTATGCTGAAGGAGACCCACCCACGGAAGATTCAAGCCAGCTTGATCCGGAGTTTTTAGA TTTATTGCTCGGTAAAGCACCCAACGAGGAAGAAATCTTCGAGCGCTATCGCAAACATATACTCAATGATGGGTTACTTT GCTACAAAAAGACCATTCAGTTTAGCATGACCGAAGGCGGTAAAGCTGGCGAATCGCTATATAGCCATATCTTGAACGGC ATCTTAGTTCTCCAAGATTTACGCTCAATCGTACACCTAACCGACGAAGAAACCAAGGTATTGTTTACAGCCTTTACAAT CCACGATATCAACAAAGTCCAACCCACCGAACAACGCCAGAGCTATCTCGACCTAACCAAACCAAATATTGTCGCTAATG AAATGAGCAAGGTCAAACTCGATGTATTTTTCGATGGCTATGAACCATATCTCAACGATATTATCAGCTTAATGCAACGC CATTCAGGCCATAATTGGACAGGCGTGCAAGCACTAAACTTGAAAAATCAGCCTAAATTTAAATTGCCAATGGAGCGACT TGATCAACTGGTGCTGTTGATGCGGGCAGCTGATGGCATCGATCTATCACACACGCTCGAAGAACAACGCCACAAAGAGC AATTTCTACATTCGATCAACACATTCAGCCCCCAACAATATGCTTTTTGGCGACATCGGGTAGCCGAGCAGCGTGGCAAT CTGACCAACATTATTCATAATGCTGTGGCTGCCGAATTAAGTGAACGCTTTGGGTTAGTGCCACTGTTGTATTACCCCGA TGGAGTAGCCTATCTTAAACTTAAAGCGACGAGCCTTCAGCCTGAGCCAAATCTCTATCCTGCCATTGCCGCACGCGTAG CCAATACAATCAACAGCATGACCAGCGCCGGCTTTCGTGAGTTTATTCGGGCAATCAATATGGGGATTACGGTTGATCGC AAATGCTTAGAACTTAATCTCCCATTTGCCCAAATTCTCGCAGCGATTGACACCATCATTCAGCGCCGCACGGTTAAGGA TGATAAGTTGCAAGCCCTCAGCCAAGCGTCGATCAAACGCACCCGTGATCTGCTGGCTAAACGGCAAGCCAAAACTGCCA ATTCAAACGATCAACGAGCAATCAATCAAGCCATTGAAGTTATGTTAGAACGCGGCCCCGTGCCGCAAACCAATAGCCAG ATGAAGGTCGGCGAGCTTATTCGTACCTACTATATTTTCCTGATCGAGCATTTCGAGCAAGCAATTCCTGACGCTTGGCA GCATATTTACCAATTGCTAGAGCTACCAGCCGAGCGCTGGGCGATTTACGATGGCTTCGATGCTCGTATGGATCGAGCGT ATGCAATTGCTACCGAGATTTCATTAACCGCTGATCAGATTTACCAACGCATTGAAGCTGATGGCGGCAGTTTGATCAAC ACCCAAACCACGCTTGACCCACGACTCCCAACGATCGAAGCGTATTTGAAGCATGTATTGGTGTTCGATGGTCAAGCACG AGCCGCTGGTGATTTCGCCAGCAGCCTACCCAATTATGTGCGTCAAAACTCCAAACAATGTGTCCAATGCAGCCTGCCTA TGCCCACCCAAAAATGGGGTTCGGCCAATGTTCGCTCCGATATCAAAATTCAAATGTTCTCAAATCGGCTGACAGGTGGT CCAGGCGAACCAGTTAAGCATATTTGCGAGGTTTGCTTAATTCAATATTTGGTCGAAAAGCTCAATTATCGCGAGGTCAG TGGCGAACGGACGATCTATTTACACATGTTTCCCTACTCGTTTTTGCCAGCCCCACTGCTTGAAGGGCTACGTGCCACCT TCCGCAGTTTACTCAGCGAGGATAGCATCACCGGAGCGGTGCGCTTGGCGGATGTAAGCAACAGCATGTTGCAGCGCACC CCAACTCTGCGCTTTACGACCCGCACCAAGGCCAATAAACCTCAGCCCTATGGTTTGTATAGCCCGCGCTACAGCGAAAC CCTCGGCGGGTTAATCACCTTACCACTGAATCCTGCTGGCGATACCGATACTGAGCGGTTTCTGTTTGCGTTGCAACATG CCTTATTATTGCACCAGCATTTTGGCTGCAAAGTATTGCTAAGCAATGCTGCCGTACCACCGCTCGATAAAACCGCATTT AGCGACCTATATATCGATTTGACTCCGTTGCAAGCCCGTGGTTTCGTGCGCCAAAACGATTACGAGCATTTTAAACAAGG AACCAAAGAGTCAGGGAGCCTAGCCAAACTCTGGGATCAACTCGATTGGTTGTATCAAATTCGTGAAGTTGTGGCGATGG CCAATGCCGATCCAGTTGTCGATTTTATCGGGGCAATGGCTGATCATCCATTGCGTATTTTTTACTTGGCAGAGAAATAT GCCGAGGCCAAAGCTGGGCATCAAGCTTCAAGCTGGTTGATTCATACGATGTTCAATCCAGTTCAACAGTTAGCCCTTAG TATGGGAGATCGATCAATGGAACAACTTGATTTCTGTCTCAATCGGCTGGCCGAAATTGCTCGCCACGGCAATTTGCGCG GCTCTTCGTGGAAGAAGAGTTCAATGATTACCGCCTTAGATGAAGTATTACGTAAAGTCAATTTACAAAGCGAGGAGTTA ACCCCAGCGGTCTTGCAAGCTGCGGCCATCGAAGACATGTTCCAGCATATTCAACGCACCCGCAATTTACGCGGCTTTAG CGGTGGCAAGAAGCTTCGCGCAGCCTGCGAAGAGTTTGTGCAAGTGTTTTTCAACGATATTTACTATGGGGTATATGCGG GCAAACCAGCCCGTTTGCTCAACCACGAAAAAGTGTTGCGCTCAGCTTATCATTTTTATGTGCAGCAACACTTCCGTGCC AAACCACTCAGCCCCGAAGAAGCCCAAGCCGAAGGTCTCAACGATGATGGCGATGTAACTGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATGGACATCCTGTGTCCGCACGATCATGTATACTTGAAAACAACGATCACAGCAGAACTTTGCAGCCTCTAGTAATGCT ATTGCGTCAAAGGAGGTCGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATTGCAATTAATTAAAGGAGTACCTCAATGAGCATTTTGAATACCTACCAAAACTATTTGATGGATCAATACAATCCC TATCCTCATGGCCGTTTCGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 981; Mature: 981
Protein sequence:
>981_residues MDAESTTYAEGDPPTEDSSQLDPEFLDLLLGKAPNEEEIFERYRKHILNDGLLCYKKTIQFSMTEGGKAGESLYSHILNG ILVLQDLRSIVHLTDEETKVLFTAFTIHDINKVQPTEQRQSYLDLTKPNIVANEMSKVKLDVFFDGYEPYLNDIISLMQR HSGHNWTGVQALNLKNQPKFKLPMERLDQLVLLMRAADGIDLSHTLEEQRHKEQFLHSINTFSPQQYAFWRHRVAEQRGN LTNIIHNAVAAELSERFGLVPLLYYPDGVAYLKLKATSLQPEPNLYPAIAARVANTINSMTSAGFREFIRAINMGITVDR KCLELNLPFAQILAAIDTIIQRRTVKDDKLQALSQASIKRTRDLLAKRQAKTANSNDQRAINQAIEVMLERGPVPQTNSQ MKVGELIRTYYIFLIEHFEQAIPDAWQHIYQLLELPAERWAIYDGFDARMDRAYAIATEISLTADQIYQRIEADGGSLIN TQTTLDPRLPTIEAYLKHVLVFDGQARAAGDFASSLPNYVRQNSKQCVQCSLPMPTQKWGSANVRSDIKIQMFSNRLTGG PGEPVKHICEVCLIQYLVEKLNYREVSGERTIYLHMFPYSFLPAPLLEGLRATFRSLLSEDSITGAVRLADVSNSMLQRT PTLRFTTRTKANKPQPYGLYSPRYSETLGGLITLPLNPAGDTDTERFLFALQHALLLHQHFGCKVLLSNAAVPPLDKTAF SDLYIDLTPLQARGFVRQNDYEHFKQGTKESGSLAKLWDQLDWLYQIREVVAMANADPVVDFIGAMADHPLRIFYLAEKY AEAKAGHQASSWLIHTMFNPVQQLALSMGDRSMEQLDFCLNRLAEIARHGNLRGSSWKKSSMITALDEVLRKVNLQSEEL TPAVLQAAAIEDMFQHIQRTRNLRGFSGGKKLRAACEEFVQVFFNDIYYGVYAGKPARLLNHEKVLRSAYHFYVQQHFRA KPLSPEEAQAEGLNDDGDVTE
Sequences:
>Translated_981_residues MDAESTTYAEGDPPTEDSSQLDPEFLDLLLGKAPNEEEIFERYRKHILNDGLLCYKKTIQFSMTEGGKAGESLYSHILNG ILVLQDLRSIVHLTDEETKVLFTAFTIHDINKVQPTEQRQSYLDLTKPNIVANEMSKVKLDVFFDGYEPYLNDIISLMQR HSGHNWTGVQALNLKNQPKFKLPMERLDQLVLLMRAADGIDLSHTLEEQRHKEQFLHSINTFSPQQYAFWRHRVAEQRGN LTNIIHNAVAAELSERFGLVPLLYYPDGVAYLKLKATSLQPEPNLYPAIAARVANTINSMTSAGFREFIRAINMGITVDR KCLELNLPFAQILAAIDTIIQRRTVKDDKLQALSQASIKRTRDLLAKRQAKTANSNDQRAINQAIEVMLERGPVPQTNSQ MKVGELIRTYYIFLIEHFEQAIPDAWQHIYQLLELPAERWAIYDGFDARMDRAYAIATEISLTADQIYQRIEADGGSLIN TQTTLDPRLPTIEAYLKHVLVFDGQARAAGDFASSLPNYVRQNSKQCVQCSLPMPTQKWGSANVRSDIKIQMFSNRLTGG PGEPVKHICEVCLIQYLVEKLNYREVSGERTIYLHMFPYSFLPAPLLEGLRATFRSLLSEDSITGAVRLADVSNSMLQRT PTLRFTTRTKANKPQPYGLYSPRYSETLGGLITLPLNPAGDTDTERFLFALQHALLLHQHFGCKVLLSNAAVPPLDKTAF SDLYIDLTPLQARGFVRQNDYEHFKQGTKESGSLAKLWDQLDWLYQIREVVAMANADPVVDFIGAMADHPLRIFYLAEKY AEAKAGHQASSWLIHTMFNPVQQLALSMGDRSMEQLDFCLNRLAEIARHGNLRGSSWKKSSMITALDEVLRKVNLQSEEL TPAVLQAAAIEDMFQHIQRTRNLRGFSGGKKLRAACEEFVQVFFNDIYYGVYAGKPARLLNHEKVLRSAYHFYVQQHFRA KPLSPEEAQAEGLNDDGDVTE >Mature_981_residues MDAESTTYAEGDPPTEDSSQLDPEFLDLLLGKAPNEEEIFERYRKHILNDGLLCYKKTIQFSMTEGGKAGESLYSHILNG ILVLQDLRSIVHLTDEETKVLFTAFTIHDINKVQPTEQRQSYLDLTKPNIVANEMSKVKLDVFFDGYEPYLNDIISLMQR HSGHNWTGVQALNLKNQPKFKLPMERLDQLVLLMRAADGIDLSHTLEEQRHKEQFLHSINTFSPQQYAFWRHRVAEQRGN LTNIIHNAVAAELSERFGLVPLLYYPDGVAYLKLKATSLQPEPNLYPAIAARVANTINSMTSAGFREFIRAINMGITVDR KCLELNLPFAQILAAIDTIIQRRTVKDDKLQALSQASIKRTRDLLAKRQAKTANSNDQRAINQAIEVMLERGPVPQTNSQ MKVGELIRTYYIFLIEHFEQAIPDAWQHIYQLLELPAERWAIYDGFDARMDRAYAIATEISLTADQIYQRIEADGGSLIN TQTTLDPRLPTIEAYLKHVLVFDGQARAAGDFASSLPNYVRQNSKQCVQCSLPMPTQKWGSANVRSDIKIQMFSNRLTGG PGEPVKHICEVCLIQYLVEKLNYREVSGERTIYLHMFPYSFLPAPLLEGLRATFRSLLSEDSITGAVRLADVSNSMLQRT PTLRFTTRTKANKPQPYGLYSPRYSETLGGLITLPLNPAGDTDTERFLFALQHALLLHQHFGCKVLLSNAAVPPLDKTAF SDLYIDLTPLQARGFVRQNDYEHFKQGTKESGSLAKLWDQLDWLYQIREVVAMANADPVVDFIGAMADHPLRIFYLAEKY AEAKAGHQASSWLIHTMFNPVQQLALSMGDRSMEQLDFCLNRLAEIARHGNLRGSSWKKSSMITALDEVLRKVNLQSEEL TPAVLQAAAIEDMFQHIQRTRNLRGFSGGKKLRAACEEFVQVFFNDIYYGVYAGKPARLLNHEKVLRSAYHFYVQQHFRA KPLSPEEAQAEGLNDDGDVTE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 111227; Mature: 111227
Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDAESTTYAEGDPPTEDSSQLDPEFLDLLLGKAPNEEEIFERYRKHILNDGLLCYKKTIQ CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHE FSMTEGGKAGESLYSHILNGILVLQDLRSIVHLTDEETKVLFTAFTIHDINKVQPTEQRQ EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHCCCCCCHHHHH SYLDLTKPNIVANEMSKVKLDVFFDGYEPYLNDIISLMQRHSGHNWTGVQALNLKNQPKF HHHCCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCC KLPMERLDQLVLLMRAADGIDLSHTLEEQRHKEQFLHSINTFSPQQYAFWRHRVAEQRGN CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC LTNIIHNAVAAELSERFGLVPLLYYPDGVAYLKLKATSLQPEPNLYPAIAARVANTINSM HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TSAGFREFIRAINMGITVDRKCLELNLPFAQILAAIDTIIQRRTVKDDKLQALSQASIKR HHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH TRDLLAKRQAKTANSNDQRAINQAIEVMLERGPVPQTNSQMKVGELIRTYYIFLIEHFEQ HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIPDAWQHIYQLLELPAERWAIYDGFDARMDRAYAIATEISLTADQIYQRIEADGGSLIN HHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE TQTTLDPRLPTIEAYLKHVLVFDGQARAAGDFASSLPNYVRQNSKQCVQCSLPMPTQKWG CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECCCCCCCCCC SANVRSDIKIQMFSNRLTGGPGEPVKHICEVCLIQYLVEKLNYREVSGERTIYLHMFPYS CCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEEEEECCHH FLPAPLLEGLRATFRSLLSEDSITGAVRLADVSNSMLQRTPTLRFTTRTKANKPQPYGLY HCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCC SPRYSETLGGLITLPLNPAGDTDTERFLFALQHALLLHQHFGCKVLLSNAAVPPLDKTAF CCCHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCHHHH SDLYIDLTPLQARGFVRQNDYEHFKQGTKESGSLAKLWDQLDWLYQIREVVAMANADPVV CCEEEEECCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH DFIGAMADHPLRIFYLAEKYAEAKAGHQASSWLIHTMFNPVQQLALSMGDRSMEQLDFCL HHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH NRLAEIARHGNLRGSSWKKSSMITALDEVLRKVNLQSEELTPAVLQAAAIEDMFQHIQRT HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNLRGFSGGKKLRAACEEFVQVFFNDIYYGVYAGKPARLLNHEKVLRSAYHFYVQQHFRA HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPLSPEEAQAEGLNDDGDVTE CCCCCCHHHHCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MDAESTTYAEGDPPTEDSSQLDPEFLDLLLGKAPNEEEIFERYRKHILNDGLLCYKKTIQ CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHE FSMTEGGKAGESLYSHILNGILVLQDLRSIVHLTDEETKVLFTAFTIHDINKVQPTEQRQ EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHCCCCCCHHHHH SYLDLTKPNIVANEMSKVKLDVFFDGYEPYLNDIISLMQRHSGHNWTGVQALNLKNQPKF HHHCCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCC KLPMERLDQLVLLMRAADGIDLSHTLEEQRHKEQFLHSINTFSPQQYAFWRHRVAEQRGN CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC LTNIIHNAVAAELSERFGLVPLLYYPDGVAYLKLKATSLQPEPNLYPAIAARVANTINSM HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TSAGFREFIRAINMGITVDRKCLELNLPFAQILAAIDTIIQRRTVKDDKLQALSQASIKR HHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH TRDLLAKRQAKTANSNDQRAINQAIEVMLERGPVPQTNSQMKVGELIRTYYIFLIEHFEQ HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIPDAWQHIYQLLELPAERWAIYDGFDARMDRAYAIATEISLTADQIYQRIEADGGSLIN HHHHHHHHHHHHHHCCHHHCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE TQTTLDPRLPTIEAYLKHVLVFDGQARAAGDFASSLPNYVRQNSKQCVQCSLPMPTQKWG CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECCCCCCCCCC SANVRSDIKIQMFSNRLTGGPGEPVKHICEVCLIQYLVEKLNYREVSGERTIYLHMFPYS CCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEEEEECCHH FLPAPLLEGLRATFRSLLSEDSITGAVRLADVSNSMLQRTPTLRFTTRTKANKPQPYGLY HCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCC SPRYSETLGGLITLPLNPAGDTDTERFLFALQHALLLHQHFGCKVLLSNAAVPPLDKTAF CCCHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCHHHH SDLYIDLTPLQARGFVRQNDYEHFKQGTKESGSLAKLWDQLDWLYQIREVVAMANADPVV CCEEEEECCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH DFIGAMADHPLRIFYLAEKYAEAKAGHQASSWLIHTMFNPVQQLALSMGDRSMEQLDFCL HHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH NRLAEIARHGNLRGSSWKKSSMITALDEVLRKVNLQSEELTPAVLQAAAIEDMFQHIQRT HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNLRGFSGGKKLRAACEEFVQVFFNDIYYGVYAGKPARLLNHEKVLRSAYHFYVQQHFRA HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPLSPEEAQAEGLNDDGDVTE CCCCCCHHHHCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA