Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159898652

Identifier: 159898652

GI number: 159898652

Start: 2673973

End: 2676378

Strand: Reverse

Name: 159898652

Synonym: Haur_2131

Alternate gene names: NA

Gene position: 2676378-2673973 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159898653

Following gene: 159898651

Centisome position: 42.17

GC content: 45.05

Gene sequence:

>2406_bases
ATGGATACTATTGAACAGCAGCTTGAATTGTTGCCGCGCTTGTGGCGCTATAGCCTGCTGCGCACCAGCCTCACGGCCCA
TGCCGATCGTTGGCCTGATGAACTCTATGTTATGTTGGCAATCATTGGACGTTTACCAGAGGCCTTGGCACAGATTAATG
TTTGCGCTTATCCAGAACGTCAAGTGCTTGCTTGGGCGCGAGTGATTAAATACGCCGAGCCGCAGGTTCAATTACAGCTT
TTGCAGCGCATCGAGCATTCGATTCGTTCTATCCGTGATCCTGAAGATCAGACCTTTGCTTTGTCGTGTCTTGGCCTGGC
CTATGCTGAGGCTGGTATTCCTAATGCGACCTATCCAATCTATCAAGTTATTGATCGGCCTAATCTAACGGTTCAAGGGT
TGTTGCTGCAGGCAAATAGGTTGGCTAGCCAAGGTTTGTCTGACCAAGCGTATTTACTTTTTGATGAACTATTCATGACG
ATTTTCGCCATGCCTCAGTACGAGCAATTGTACCAATTAATGTTGCTTGTTCAGAGCGCCAAGCGTGCTGGGTATAATTC
GCTTTGTGAGCGGATTATTCAGAGCCTCTATGTTCCGCACGAAGCCCCTACGTTCAACTCGGCAATTCAGGAGCTTGCTA
AAGCCTATGCGGCATATGGTGATTTTGCCGTTGCCCATCAGGCGATTCAATTGATTAAACAGCCGCGCAGTTTTATCCAT
GCGGCCCGGCAAGTGGCGGTGATTGCCTGTGAAAAACAAATCCATACCCATACAGCAAGTTTGCTACAAGCAGCCCATGA
ACGTGTTAAGCAGCTTGAGGATATTGATGAACACATTTATCTGTTGGGACAACTAGCCATCCCTGCACGGCAAGCTGGCT
TAATCGAGCTGGCCCAAACCTTGATGGATGAAGCTTTTCATAAACTAATTGGTGTGCAGCACCAATATCCGCCTGTAGCT
ACTAGACTGCTTATTCAGAGTTATCAATCTCAACATGCCTTGGCTGATGCCTTAGCGATCATACCATTCCTTGATAATCC
CCAAGCCCATGATTACGTGCTTGGTAACATTATTGAGTGCTATTTGAATGATAATGATCTTACGAATGCTCATCTGCTGT
TGAAATTATTTAAACCCCATGAACAGACATATGTAGCTGCCGCTAGTAACCTATTGATTAAGGCTGGTGCGCAGGGATTA
ATCGAACTCGTTTGGCGGCTTTATTGGGATGTCATGGCTATATCTAAAGCGATTAATGATCATGTTAATCATCGTAATTA
TTTTGTCTACGTTGCCTGTAATCTTGCGACTGAGGCGAGCACGCATGGGTTAACCGTGCTAACGCCGCGATTGTATAGCG
AGGCGATTCAGGCATGTACCACAGTTGATCATGGATATACTCGGCTGCGGTATCTCAAGGATTTAGTGCTTGCTCAGATG
AAACATGGTTTGGTTGCGAGTTTCCCCAATTTGTTAGCTAGTTTACGCCTAGGAGCTACCCAATTAGAGATTAATACTGC
ATTGAATGAATTTCTTTGCCCAATCGCGGTGGTTTATGCTGAACAGGGGAATTATTCGGCATTTGATGATTGGTTCAATT
ATGCCCATACCCAATTGAAAAATAGCACCCAAACTGATCATAAAGCGCTTGTGTCGGGCTATCGAACGCTGATTAAGACC
TATCGTACATCTGCTTCTGATTGGATGAATTCAGCATTTTTAGCAGCGGTGTTGCCAAGGTTGCAGGTGATCGCCAACAC
AACACATTTGGCTAGTGCTAAAAATCTATTGATAAACATTTATGCGGATTATGCGAGTGAAGGGCATCCAGCCTTTCTCG
CTCAAGCATATGAGATGGCGATTACAATTGAACCGATAGCTGATCGGCTCAATGCGCTTAAATCACTTGCCAAGGTCTAT
GCGAAAGTAAATGATGGGCCGCATTTACGGGCAATTATTGCTGAGATGATTGAGCTTGAGCTTGATGATTTAGAGTTTGA
GTCGATTGCCTTGGTCTGCGCTAAACAGGGAGATTTTGCCTATGCCCAAGAATTGCTGGCACGCCAAGAGCCAGCCCCAT
GGAAAGATGAAGTTTTATGGTATTTGATTGCCAAGCTGATTCAAACCAATCAAGTGGCTACTGCATGTCAGTTAATTCCA
AGCCTAAGTGAAGGCTACAAACAAGAACGCGAGTTTCAAAAAATCATTACCTACTATCTTGAACGTCAACAATTGGCTGA
AATTGGGCAAATTGTTCAAGATGTTTGGCGTAACTGTATGAGCGATACTGAATTATGGCAATTAAGTACAATCATTGTGC
CGTTGATTCCCCACTACCCATGGCTTGGCATTGCCGTGCTTGATAGCGTGCCATGGGTTGAACAGCAGTTAGCTCGCTTG
AAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGATTGATTCAAACATTGATGAATGCATATTAACCATCACTCCCAGTTAGTTGTCGATCACCATCTCATGAATGTTGT
TTGCGGAGAGGGTCATTACG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAGGATCGCTATGCAGCCTGATTATTATCTGCGTCGCCCACCATTGCCAAGTGAACCAGCCTTAATCGCTCAATTTGA
GGCGTTGTGGGCTGAAATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 801; Mature: 801

Protein sequence:

>801_residues
MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPERQVLAWARVIKYAEPQVQLQL
LQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPIYQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMT
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SLSEGYKQEREFQKIITYYLERQQLAEIGQIVQDVWRNCMSDTELWQLSTIIVPLIPHYPWLGIAVLDSVPWVEQQLARL
K

Sequences:

>Translated_801_residues
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LQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPIYQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMT
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TRLLIQSYQSQHALADALAIIPFLDNPQAHDYVLGNIIECYLNDNDLTNAHLLLKLFKPHEQTYVAAASNLLIKAGAQGL
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K
>Mature_801_residues
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LQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPIYQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMT
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SLSEGYKQEREFQKIITYYLERQQLAEIGQIVQDVWRNCMSDTELWQLSTIIVPLIPHYPWLGIAVLDSVPWVEQQLARL
K

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90553; Mature: 90553

Theoretical pI: Translated: 6.04; Mature: 6.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPER
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
QVLAWARVIKYAEPQVQLQLLQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPI
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH
YQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMTIFAMPQYEQLYQLMLLVQSA
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KRAGYNSLCERIIQSLYVPHEAPTFNSAIQELAKAYAAYGDFAVAHQAIQLIKQPRSFIH
HHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AARQVAVIACEKQIHTHTASLLQAAHERVKQLEDIDEHIYLLGQLAIPARQAGLIELAQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LMDEAFHKLIGVQHQYPPVATRLLIQSYQSQHALADALAIIPFLDNPQAHDYVLGNIIEC
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHE
YLNDNDLTNAHLLLKLFKPHEQTYVAAASNLLIKAGAQGLIELVWRLYWDVMAISKAIND
EECCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHC
NSTQTDHKALVSGYRTLIKTYRTSASDWMNSAFLAAVLPRLQVIANTTHLASAKNLLINI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
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EEHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
WLGIAVLDSVPWVEQQLARLK
CHHHHHHCCCCHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPER
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
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WLGIAVLDSVPWVEQQLARLK
CHHHHHHCCCCHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA