| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159898652
Identifier: 159898652
GI number: 159898652
Start: 2673973
End: 2676378
Strand: Reverse
Name: 159898652
Synonym: Haur_2131
Alternate gene names: NA
Gene position: 2676378-2673973 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159898653
Following gene: 159898651
Centisome position: 42.17
GC content: 45.05
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGATTGATTCAAACATTGATGAATGCATATTAACCATCACTCCCAGTTAGTTGTCGATCACCATCTCATGAATGTTGT TTGCGGAGAGGGTCATTACG
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGAGGATCGCTATGCAGCCTGATTATTATCTGCGTCGCCCACCATTGCCAAGTGAACCAGCCTTAATCGCTCAATTTGA GGCGTTGTGGGCTGAAATTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 801; Mature: 801
Protein sequence:
>801_residues MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPERQVLAWARVIKYAEPQVQLQL LQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPIYQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMT IFAMPQYEQLYQLMLLVQSAKRAGYNSLCERIIQSLYVPHEAPTFNSAIQELAKAYAAYGDFAVAHQAIQLIKQPRSFIH AARQVAVIACEKQIHTHTASLLQAAHERVKQLEDIDEHIYLLGQLAIPARQAGLIELAQTLMDEAFHKLIGVQHQYPPVA TRLLIQSYQSQHALADALAIIPFLDNPQAHDYVLGNIIECYLNDNDLTNAHLLLKLFKPHEQTYVAAASNLLIKAGAQGL IELVWRLYWDVMAISKAINDHVNHRNYFVYVACNLATEASTHGLTVLTPRLYSEAIQACTTVDHGYTRLRYLKDLVLAQM KHGLVASFPNLLASLRLGATQLEINTALNEFLCPIAVVYAEQGNYSAFDDWFNYAHTQLKNSTQTDHKALVSGYRTLIKT YRTSASDWMNSAFLAAVLPRLQVIANTTHLASAKNLLINIYADYASEGHPAFLAQAYEMAITIEPIADRLNALKSLAKVY AKVNDGPHLRAIIAEMIELELDDLEFESIALVCAKQGDFAYAQELLARQEPAPWKDEVLWYLIAKLIQTNQVATACQLIP SLSEGYKQEREFQKIITYYLERQQLAEIGQIVQDVWRNCMSDTELWQLSTIIVPLIPHYPWLGIAVLDSVPWVEQQLARL K
Sequences:
>Translated_801_residues MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPERQVLAWARVIKYAEPQVQLQL LQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPIYQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMT IFAMPQYEQLYQLMLLVQSAKRAGYNSLCERIIQSLYVPHEAPTFNSAIQELAKAYAAYGDFAVAHQAIQLIKQPRSFIH AARQVAVIACEKQIHTHTASLLQAAHERVKQLEDIDEHIYLLGQLAIPARQAGLIELAQTLMDEAFHKLIGVQHQYPPVA TRLLIQSYQSQHALADALAIIPFLDNPQAHDYVLGNIIECYLNDNDLTNAHLLLKLFKPHEQTYVAAASNLLIKAGAQGL IELVWRLYWDVMAISKAINDHVNHRNYFVYVACNLATEASTHGLTVLTPRLYSEAIQACTTVDHGYTRLRYLKDLVLAQM KHGLVASFPNLLASLRLGATQLEINTALNEFLCPIAVVYAEQGNYSAFDDWFNYAHTQLKNSTQTDHKALVSGYRTLIKT YRTSASDWMNSAFLAAVLPRLQVIANTTHLASAKNLLINIYADYASEGHPAFLAQAYEMAITIEPIADRLNALKSLAKVY AKVNDGPHLRAIIAEMIELELDDLEFESIALVCAKQGDFAYAQELLARQEPAPWKDEVLWYLIAKLIQTNQVATACQLIP SLSEGYKQEREFQKIITYYLERQQLAEIGQIVQDVWRNCMSDTELWQLSTIIVPLIPHYPWLGIAVLDSVPWVEQQLARL K >Mature_801_residues MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPERQVLAWARVIKYAEPQVQLQL LQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPIYQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMT IFAMPQYEQLYQLMLLVQSAKRAGYNSLCERIIQSLYVPHEAPTFNSAIQELAKAYAAYGDFAVAHQAIQLIKQPRSFIH AARQVAVIACEKQIHTHTASLLQAAHERVKQLEDIDEHIYLLGQLAIPARQAGLIELAQTLMDEAFHKLIGVQHQYPPVA TRLLIQSYQSQHALADALAIIPFLDNPQAHDYVLGNIIECYLNDNDLTNAHLLLKLFKPHEQTYVAAASNLLIKAGAQGL IELVWRLYWDVMAISKAINDHVNHRNYFVYVACNLATEASTHGLTVLTPRLYSEAIQACTTVDHGYTRLRYLKDLVLAQM KHGLVASFPNLLASLRLGATQLEINTALNEFLCPIAVVYAEQGNYSAFDDWFNYAHTQLKNSTQTDHKALVSGYRTLIKT YRTSASDWMNSAFLAAVLPRLQVIANTTHLASAKNLLINIYADYASEGHPAFLAQAYEMAITIEPIADRLNALKSLAKVY AKVNDGPHLRAIIAEMIELELDDLEFESIALVCAKQGDFAYAQELLARQEPAPWKDEVLWYLIAKLIQTNQVATACQLIP SLSEGYKQEREFQKIITYYLERQQLAEIGQIVQDVWRNCMSDTELWQLSTIIVPLIPHYPWLGIAVLDSVPWVEQQLARL K
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 90553; Mature: 90553
Theoretical pI: Translated: 6.04; Mature: 6.04
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPER CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH QVLAWARVIKYAEPQVQLQLLQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPI HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH YQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMTIFAMPQYEQLYQLMLLVQSA HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH KRAGYNSLCERIIQSLYVPHEAPTFNSAIQELAKAYAAYGDFAVAHQAIQLIKQPRSFIH HHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AARQVAVIACEKQIHTHTASLLQAAHERVKQLEDIDEHIYLLGQLAIPARQAGLIELAQT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH LMDEAFHKLIGVQHQYPPVATRLLIQSYQSQHALADALAIIPFLDNPQAHDYVLGNIIEC HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHE YLNDNDLTNAHLLLKLFKPHEQTYVAAASNLLIKAGAQGLIELVWRLYWDVMAISKAIND EECCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HVNHRNYFVYVACNLATEASTHGLTVLTPRLYSEAIQACTTVDHGYTRLRYLKDLVLAQM HCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHGLVASFPNLLASLRLGATQLEINTALNEFLCPIAVVYAEQGNYSAFDDWFNYAHTQLK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHC NSTQTDHKALVSGYRTLIKTYRTSASDWMNSAFLAAVLPRLQVIANTTHLASAKNLLINI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE YADYASEGHPAFLAQAYEMAITIEPIADRLNALKSLAKVYAKVNDGPHLRAIIAEMIELE EEHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH LDDLEFESIALVCAKQGDFAYAQELLARQEPAPWKDEVLWYLIAKLIQTNQVATACQLIP HCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLSEGYKQEREFQKIITYYLERQQLAEIGQIVQDVWRNCMSDTELWQLSTIIVPLIPHYP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC WLGIAVLDSVPWVEQQLARLK CHHHHHHCCCCHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MDTIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADRWPDELYVMLAIIGRLPEALAQINVCAYPER CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH QVLAWARVIKYAEPQVQLQLLQRIEHSIRSIRDPEDQTFALSCLGLAYAEAGIPNATYPI HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH YQVIDRPNLTVQGLLLQANRLASQGLSDQAYLLFDELFMTIFAMPQYEQLYQLMLLVQSA HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH KRAGYNSLCERIIQSLYVPHEAPTFNSAIQELAKAYAAYGDFAVAHQAIQLIKQPRSFIH HHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AARQVAVIACEKQIHTHTASLLQAAHERVKQLEDIDEHIYLLGQLAIPARQAGLIELAQT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH LMDEAFHKLIGVQHQYPPVATRLLIQSYQSQHALADALAIIPFLDNPQAHDYVLGNIIEC HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHE YLNDNDLTNAHLLLKLFKPHEQTYVAAASNLLIKAGAQGLIELVWRLYWDVMAISKAIND EECCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HVNHRNYFVYVACNLATEASTHGLTVLTPRLYSEAIQACTTVDHGYTRLRYLKDLVLAQM HCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHGLVASFPNLLASLRLGATQLEINTALNEFLCPIAVVYAEQGNYSAFDDWFNYAHTQLK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHC NSTQTDHKALVSGYRTLIKTYRTSASDWMNSAFLAAVLPRLQVIANTTHLASAKNLLINI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE YADYASEGHPAFLAQAYEMAITIEPIADRLNALKSLAKVYAKVNDGPHLRAIIAEMIELE EEHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH LDDLEFESIALVCAKQGDFAYAQELLARQEPAPWKDEVLWYLIAKLIQTNQVATACQLIP HCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLSEGYKQEREFQKIITYYLERQQLAEIGQIVQDVWRNCMSDTELWQLSTIIVPLIPHYP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC WLGIAVLDSVPWVEQQLARLK CHHHHHHCCCCHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA