| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159898567
Identifier: 159898567
GI number: 159898567
Start: 2550200
End: 2554693
Strand: Direct
Name: 159898567
Synonym: Haur_2043
Alternate gene names: NA
Gene position: 2550200-2554693 (Clockwise)
Preceding gene: 159898563
Following gene: 159898568
Centisome position: 40.18
GC content: 50.69
Gene sequence:
>4494_bases ATGGATGATCGCGCCCTGCGTCTTGCCCTTGAATCCCTGCTGGATGAACCCACCCTCAAATCAGCGCATCGTGCGTCACT TGAGCGTGGCCTTGCCGATCTCAGAGCGCAGCGCCTCACCTCCGATGAGCGTGACTATCTTTGCTATCTCATCGAGCACT ATGGGCAGTCAAACCCATCCCCTGATCCCGTGGCCGCCTTAATCGCCGCGTTCCAAGACAAGCTACCAACCTACGATCCC GCAGCCGTGGCCACGGCAGTTCACCATGCCCTCGCCCAGCAACCCGCCACGCTCAACGGCGCTCCGGTCACAATCACGAT GAACGGCGATACCTATGCGCACCAGGCAAACTTGGCCATTGGGAATCAGGTGGGCGGCAATCTCGTCCAGGTCACGGTCA CGATTCCGATTCCTGATGTCCGCTTTGATGCCCTCTTGGCCACCGCCCTCAGAACCCATGAGCACGAAAAAACACGCGAA CGCCTGATCAACGCCGCCCAACAAATCGAAAGTGATCGGCTCCTGAATCTCCGGCTCAAAGGCTTCGTCGGTCGCGTCAC CGAACTGGCGGCGATCCGCGAGCATATTGAGACCATGCGCTCCACGGGTGGCTATGTGTTGATCAAGGCAGCGGCAGGTG AAGGCAAGAGCAGTAGCATTGCCAAGCTGATTCAGGAAGCGGGGATTGCGCAAACACCCCATCACTTTATTGCCCTGACG ACGGGTCGTGAATATCAATTAGGGTTGTTGCGGGCGGTGGCGGCCCAATTGATTTTGAAACACAATCTTACCGTTTCGTA CTTCCCCGAAGAAAGCTATCCAGCGATGAAGGGTGAGTTTGTGCGGATTCTTGACGAGCTTTCCAAGCAAGGCATTGAGG AAACGATCTATCTGGATGGCCTTGATCAACTCCAACCAGAGATTGATGGATCACGCGATTTATCATTCCTCCCGCCGCAA CCACCCCCAGGCATCGTGATGGTGCTTGGTTCGAGACCGGATGAAACCTTAAAACCGCTCGAGATTCTGCATCGGGTCGA TTATGACCTGCCGCCACTCAGTGAAGCCGATGCGCTGGCATTGTGGCGATCCGTCCAGCCTGCTGTGGCGGATGGCCTCC TGCATGACCTCTATGCCGCACTGAAGGGCAATGCGTTGTTCGTCCACTTGGCTGCCAATACCATGCGTGATCAATCAGTG GTCGATGCGACCAGCCTGATTCGCCAGATCGAGCAGAATCCCAGCAATCTCTTTGGGATTACGCTCGATCGGATTAAGGG TCGATCACGGTCGCAATGGGATGTGGTCTGGAAGCCAATGCTGGTGCTCTTGCTCGTGGCCCAAGAACCATTGCGGCTGG ATGTGGTAGGCGATTTGCTGGAACATGATCACGACACGATGCAGGATGCCGTGAGAGTTTTAGGTGGCTTGGTGAGTCAA GGGATTGATCAACGAGTCGCGCTGCATCACCTACTGTTTCGCGATTATTTGGCAGCAGTGGTCTTTAATGCCCGTGAGGT GAAACGTTGGCAGCAACGGCTAGCAGACTGGTGTTCCGTTGATTTGGAGATGATTTGGGGTGATCATTCCGATCCTATTG AACAAGCACGACGGGTCTATGCGCGGTATCATTACATCACGCATCTTTCATTGGCGGAAAATTGGCCAACGCTGTGGCAA GTTTTGGATGCGGGTGACTATGGCGAACAGAAAACCCGCTTCGATCCGAGTACCCGACTCTATGCCTTGGATTTGGATCG CGGGCGTGAGAGTGCCATCAACGCGGGACAATCGACCGAGGAACATCTTCAGAACCTGCCACGCCTGTGGAAGTATAGTT TGCTGCGAACAAGTTTAACCAGTCGCGTTGATCAGTGGCCGGATGATCTGTTTGTGGTCTTAGTGATGCTTGGACGCACA CAGGAGGCTTTAGATCGGATTGATTTATGTACTGATCATGGGCGGCAAATACAGCTTTGGAAGAAGATTTTGGTATTGTG CGAACCACAATACCAAAGTACGATTATTATACTTATGCATCAGGTAGCCAGTCACCTTTCAGGCATCGAGAAATTTCGAC TCCTCGGATTAATTGCGACAACGATTGCAACTCTTGGCGCTATCGACCAAGCCCATCAAATTGCCCAATCCATTACCGAT CTAACCCATCGTTTCGGTGCATTCAGGGATATCGCCATAACGGCTGACAAACTTGGCAATAGGGAACAAGCGTTAGAGAT ACTCAATCATGCACTTATCATTGCCCAATCCATTGACGATCCTAAGTCACGAGCTGAACCTCTCTACGCAATTGCGACAA CGATTGCAACCCTTGGCGCTATCGACCAAGCCCACCAAATTACTTGCCAAATTGATCTTCCTGAGTTGCGTGATGATGCT CTCGCTGTTGTTGTAACGGTCACTGCCACCTTTGGTGATATCGACCGTGCTTTAGCCATGGCCCAACCCATTGAGGGTCT ATGGCAACAAGCCCATGCCCTCAGATCTATTGCGATAACCACCACCCATGGTAGTATTAGCCGTGCTCTCGTCATTGCCC AATCTATTAATGACCCTATTTTCCGTGCTGATGCATTCGGAACTATTGCGACAATCGTTGCCACCCTTGGCGATATCAAC CAAGCCCTCGCCATTGCCCAATCTATTGATAGTTGGTCTCACCGCGTTGATGCACTCGGAACTATTGCGACAACCGTTGC CACCCTTGGCGATATCAACCAAGCCCTCGCCATTGCCCAATCTATTGATAGTTGGTCTCACCGCAGTCATGTCTTCAGGA CCATTGCGGCAACCACCAATATCCTTGGCAATAGGGCAAAAGCAATAAGTATACTCGACCATGCCCGCCAACTTGCCCAA TCCATTAACGATCGATGGCAAAAGGCCGATGCCCTCAAGGCCATTGCAACAACGGCTGCTACCTTTAATGACCAGGAACA AGCGATAAGGATACTAGACCAAGCCCTCGCCATTGCCCAATCTATCAAAAGTCTTCGTCAGCGTGCCGATACCCTCAGGG ATATTGCGATAATCGCCGCCACGATTGGCAGTATCGATCAAGCCTTTGCCATTGCCCAATCTATTGACCATCCTAAACAA TGTGTTGATACTCTTGGTGTCATCACTATAACGGCTACGGCTGCTTATGGTAATGGCCAACCTGCAATAACAATTTTTAA CAAGACCAGATCCATTATCCAATCCATTAACTATCCTGAACAACGAGCCGATGCCCTTGGTGTTATTGCAACCACAACTG CCACCTTCGGCGAAATCAACCGTGCGCTAGCCATTGCTCAATCCATTGATGATTCTGAACGACATGCCGATACACTGAGG GCTATTGCGACAACTATCGCCACCTTCGGCGAAATCAACCGTGCGCTAGCCATCGCCCAATCCATTAACAATCGATGGCA ACGTGCTGATGCCCTCAAGGCCATTGCAACAACGGCTGCAGCCTTTGGGGATATCGACCATGCACTTGTTATTACTAAAT TCATTAATGAATTTTTCCAGCAGACCAATGCCCTAAGGTCTATTGCAATAACCACCGCCACCTTCGGTGATATCAACCGT GCGCTAACCATCGCTCAATCTATTAATGACCTTGGTCAACAGGCTGACACGCTCAAGGTTATTGCAACCATCACTTCAAC CCTTGGTGATACTAACCGTGCACTAGCCATCGCTCAATCTATTAATGATCTTGTGCATCGTGTGGATGTTCTCTGTTTCC TCGCGTTAATCGCCACTAAACTCGGCAACAGAGAAAAAGGCACAGATCTACTCAATTATGCTATTGTTATTGCTCAATCC ATTGTTCGCCCCGAGCGATGTGCCGATGCATTCAAAGTTATTGCGATAACCACCGCTACTCTTGGCGATATCAGTCAAGC CCTTGCGATTGCTCAATCCATTGTTCGCCCTGAGCGGCGTGCCGATGCATTCAAAGTTATTGCGATAACCACCGCTACTC TTGGCGATATCAGTCAAGCCCTTGCGATTGCCCAATCCATTACCCAGCCCGAGCAATGTGTTGATGCACTCGGAACTATT GCTGCGAGGGCTGCCGATACTTACGGTAACGATCAACTTCCAATGGCAATTCTCGAGAAGGCTCACCAAATTGCCCAATC TATTGCCCAGCCTGAGCGACGTGCCGATGCGCTCGGGACTATTGCGACAACCACCGCTACCCTTGGCGATATCGATCGTG CCATTGCCATTGTCCAATCCATTGTCAGTCCTGATAAACATGACCATTCTCTTAGGATGATTGTAAAAACAGTACGATCA ATAACAAGAATTCTCGCTATCATTCAGAGAATATGGTTTCATAGCAAAACATCCGGTAGCATATGGGGAATGACCCCAAT TATCGCTCCACTATTAAATGACTATCCATGGCTTGGAACAGCAATTCTGAAGGAAGAGGCATGGGTCAATGAGCAACTCA AACGACTGGGGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATCAACGCATCACGAACAAACCGTGAGCAATTGCTTGCATCGGAACCATTGCTTTGCTAGGATAGTGGAACACACCTGC CAGCTCTGAAGGATCGTGCT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAGAGGAGTACCAACTTTGCTGTTTCAAGTCAAGTATTAACCCCAAGGGCCAACTTGGTTGCAGTGTCAGTTTTATG CGCCTGCGACGATCCCGCGT
Product: tetratricopeptide domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1497; Mature: 1497
Protein sequence:
>1497_residues MDDRALRLALESLLDEPTLKSAHRASLERGLADLRAQRLTSDERDYLCYLIEHYGQSNPSPDPVAALIAAFQDKLPTYDP AAVATAVHHALAQQPATLNGAPVTITMNGDTYAHQANLAIGNQVGGNLVQVTVTIPIPDVRFDALLATALRTHEHEKTRE RLINAAQQIESDRLLNLRLKGFVGRVTELAAIREHIETMRSTGGYVLIKAAAGEGKSSSIAKLIQEAGIAQTPHHFIALT TGREYQLGLLRAVAAQLILKHNLTVSYFPEESYPAMKGEFVRILDELSKQGIEETIYLDGLDQLQPEIDGSRDLSFLPPQ PPPGIVMVLGSRPDETLKPLEILHRVDYDLPPLSEADALALWRSVQPAVADGLLHDLYAALKGNALFVHLAANTMRDQSV VDATSLIRQIEQNPSNLFGITLDRIKGRSRSQWDVVWKPMLVLLLVAQEPLRLDVVGDLLEHDHDTMQDAVRVLGGLVSQ GIDQRVALHHLLFRDYLAAVVFNAREVKRWQQRLADWCSVDLEMIWGDHSDPIEQARRVYARYHYITHLSLAENWPTLWQ VLDAGDYGEQKTRFDPSTRLYALDLDRGRESAINAGQSTEEHLQNLPRLWKYSLLRTSLTSRVDQWPDDLFVVLVMLGRT QEALDRIDLCTDHGRQIQLWKKILVLCEPQYQSTIIILMHQVASHLSGIEKFRLLGLIATTIATLGAIDQAHQIAQSITD LTHRFGAFRDIAITADKLGNREQALEILNHALIIAQSIDDPKSRAEPLYAIATTIATLGAIDQAHQITCQIDLPELRDDA LAVVVTVTATFGDIDRALAMAQPIEGLWQQAHALRSIAITTTHGSISRALVIAQSINDPIFRADAFGTIATIVATLGDIN QALAIAQSIDSWSHRVDALGTIATTVATLGDINQALAIAQSIDSWSHRSHVFRTIAATTNILGNRAKAISILDHARQLAQ SINDRWQKADALKAIATTAATFNDQEQAIRILDQALAIAQSIKSLRQRADTLRDIAIIAATIGSIDQAFAIAQSIDHPKQ CVDTLGVITITATAAYGNGQPAITIFNKTRSIIQSINYPEQRADALGVIATTTATFGEINRALAIAQSIDDSERHADTLR AIATTIATFGEINRALAIAQSINNRWQRADALKAIATTAAAFGDIDHALVITKFINEFFQQTNALRSIAITTATFGDINR ALTIAQSINDLGQQADTLKVIATITSTLGDTNRALAIAQSINDLVHRVDVLCFLALIATKLGNREKGTDLLNYAIVIAQS IVRPERCADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSIVRPERRADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSITQPEQCVDALGTI AARAADTYGNDQLPMAILEKAHQIAQSIAQPERRADALGTIATTTATLGDIDRAIAIVQSIVSPDKHDHSLRMIVKTVRS ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG
Sequences:
>Translated_1497_residues MDDRALRLALESLLDEPTLKSAHRASLERGLADLRAQRLTSDERDYLCYLIEHYGQSNPSPDPVAALIAAFQDKLPTYDP AAVATAVHHALAQQPATLNGAPVTITMNGDTYAHQANLAIGNQVGGNLVQVTVTIPIPDVRFDALLATALRTHEHEKTRE RLINAAQQIESDRLLNLRLKGFVGRVTELAAIREHIETMRSTGGYVLIKAAAGEGKSSSIAKLIQEAGIAQTPHHFIALT TGREYQLGLLRAVAAQLILKHNLTVSYFPEESYPAMKGEFVRILDELSKQGIEETIYLDGLDQLQPEIDGSRDLSFLPPQ PPPGIVMVLGSRPDETLKPLEILHRVDYDLPPLSEADALALWRSVQPAVADGLLHDLYAALKGNALFVHLAANTMRDQSV VDATSLIRQIEQNPSNLFGITLDRIKGRSRSQWDVVWKPMLVLLLVAQEPLRLDVVGDLLEHDHDTMQDAVRVLGGLVSQ GIDQRVALHHLLFRDYLAAVVFNAREVKRWQQRLADWCSVDLEMIWGDHSDPIEQARRVYARYHYITHLSLAENWPTLWQ VLDAGDYGEQKTRFDPSTRLYALDLDRGRESAINAGQSTEEHLQNLPRLWKYSLLRTSLTSRVDQWPDDLFVVLVMLGRT QEALDRIDLCTDHGRQIQLWKKILVLCEPQYQSTIIILMHQVASHLSGIEKFRLLGLIATTIATLGAIDQAHQIAQSITD LTHRFGAFRDIAITADKLGNREQALEILNHALIIAQSIDDPKSRAEPLYAIATTIATLGAIDQAHQITCQIDLPELRDDA LAVVVTVTATFGDIDRALAMAQPIEGLWQQAHALRSIAITTTHGSISRALVIAQSINDPIFRADAFGTIATIVATLGDIN QALAIAQSIDSWSHRVDALGTIATTVATLGDINQALAIAQSIDSWSHRSHVFRTIAATTNILGNRAKAISILDHARQLAQ SINDRWQKADALKAIATTAATFNDQEQAIRILDQALAIAQSIKSLRQRADTLRDIAIIAATIGSIDQAFAIAQSIDHPKQ CVDTLGVITITATAAYGNGQPAITIFNKTRSIIQSINYPEQRADALGVIATTTATFGEINRALAIAQSIDDSERHADTLR AIATTIATFGEINRALAIAQSINNRWQRADALKAIATTAAAFGDIDHALVITKFINEFFQQTNALRSIAITTATFGDINR ALTIAQSINDLGQQADTLKVIATITSTLGDTNRALAIAQSINDLVHRVDVLCFLALIATKLGNREKGTDLLNYAIVIAQS IVRPERCADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSIVRPERRADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSITQPEQCVDALGTI AARAADTYGNDQLPMAILEKAHQIAQSIAQPERRADALGTIATTTATLGDIDRAIAIVQSIVSPDKHDHSLRMIVKTVRS ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG >Mature_1497_residues MDDRALRLALESLLDEPTLKSAHRASLERGLADLRAQRLTSDERDYLCYLIEHYGQSNPSPDPVAALIAAFQDKLPTYDP AAVATAVHHALAQQPATLNGAPVTITMNGDTYAHQANLAIGNQVGGNLVQVTVTIPIPDVRFDALLATALRTHEHEKTRE RLINAAQQIESDRLLNLRLKGFVGRVTELAAIREHIETMRSTGGYVLIKAAAGEGKSSSIAKLIQEAGIAQTPHHFIALT TGREYQLGLLRAVAAQLILKHNLTVSYFPEESYPAMKGEFVRILDELSKQGIEETIYLDGLDQLQPEIDGSRDLSFLPPQ PPPGIVMVLGSRPDETLKPLEILHRVDYDLPPLSEADALALWRSVQPAVADGLLHDLYAALKGNALFVHLAANTMRDQSV VDATSLIRQIEQNPSNLFGITLDRIKGRSRSQWDVVWKPMLVLLLVAQEPLRLDVVGDLLEHDHDTMQDAVRVLGGLVSQ GIDQRVALHHLLFRDYLAAVVFNAREVKRWQQRLADWCSVDLEMIWGDHSDPIEQARRVYARYHYITHLSLAENWPTLWQ VLDAGDYGEQKTRFDPSTRLYALDLDRGRESAINAGQSTEEHLQNLPRLWKYSLLRTSLTSRVDQWPDDLFVVLVMLGRT QEALDRIDLCTDHGRQIQLWKKILVLCEPQYQSTIIILMHQVASHLSGIEKFRLLGLIATTIATLGAIDQAHQIAQSITD LTHRFGAFRDIAITADKLGNREQALEILNHALIIAQSIDDPKSRAEPLYAIATTIATLGAIDQAHQITCQIDLPELRDDA LAVVVTVTATFGDIDRALAMAQPIEGLWQQAHALRSIAITTTHGSISRALVIAQSINDPIFRADAFGTIATIVATLGDIN QALAIAQSIDSWSHRVDALGTIATTVATLGDINQALAIAQSIDSWSHRSHVFRTIAATTNILGNRAKAISILDHARQLAQ SINDRWQKADALKAIATTAATFNDQEQAIRILDQALAIAQSIKSLRQRADTLRDIAIIAATIGSIDQAFAIAQSIDHPKQ CVDTLGVITITATAAYGNGQPAITIFNKTRSIIQSINYPEQRADALGVIATTTATFGEINRALAIAQSIDDSERHADTLR AIATTIATFGEINRALAIAQSINNRWQRADALKAIATTAAAFGDIDHALVITKFINEFFQQTNALRSIAITTATFGDINR ALTIAQSINDLGQQADTLKVIATITSTLGDTNRALAIAQSINDLVHRVDVLCFLALIATKLGNREKGTDLLNYAIVIAQS IVRPERCADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSIVRPERRADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSITQPEQCVDALGTI AARAADTYGNDQLPMAILEKAHQIAQSIAQPERRADALGTIATTTATLGDIDRAIAIVQSIVSPDKHDHSLRMIVKTVRS ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI224028289, Length=717, Percent_Identity=20.6415620641562, Blast_Score=81, Evalue=7e-15,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 163880; Mature: 163880
Theoretical pI: Translated: 6.22; Mature: 6.22
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDDRALRLALESLLDEPTLKSAHRASLERGLADLRAQRLTSDERDYLCYLIEHYGQSNPS CCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC PDPVAALIAAFQDKLPTYDPAAVATAVHHALAQQPATLNGAPVTITMNGDTYAHQANLAI CCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCEE GNQVGGNLVQVTVTIPIPDVRFDALLATALRTHEHEKTRERLINAAQQIESDRLLNLRLK CCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH GFVGRVTELAAIREHIETMRSTGGYVLIKAAAGEGKSSSIAKLIQEAGIAQTPHHFIALT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE TGREYQLGLLRAVAAQLILKHNLTVSYFPEESYPAMKGEFVRILDELSKQGIEETIYLDG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECC LDQLQPEIDGSRDLSFLPPQPPPGIVMVLGSRPDETLKPLEILHRVDYDLPPLSEADALA HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH LWRSVQPAVADGLLHDLYAALKGNALFVHLAANTMRDQSVVDATSLIRQIEQNPSNLFGI HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE TLDRIKGRSRSQWDVVWKPMLVLLLVAQEPLRLDVVGDLLEHDHDTMQDAVRVLGGLVSQ 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CCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH AHQIAQSIAQPERRADALGTIATTTATLGDIDRAIAIVQSIVSPDKHDHSLRMIVKTVRS HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
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Metal ions: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
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References: NA