Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159898454

Identifier: 159898454

GI number: 159898454

Start: 2336727

End: 2339702

Strand: Direct

Name: 159898454

Synonym: Haur_1930

Alternate gene names: NA

Gene position: 2336727-2339702 (Clockwise)

Preceding gene: 159898451

Following gene: 159898455

Centisome position: 36.82

GC content: 52.92

Gene sequence:

>2976_bases
ATGCAGTTTTGCTTTTTTGGCCTTGTGCGTGCCACATTCAACGATCAACCGCTGCAATTTCGCTCGAATAAAGTTCGGGC
ACTTTTGGCGATTATCTGGCTTGATCCGCGTCGCCAGTGGGCACGAGATGAGCTGGCAAGCTTGCTTTGGGAAGATTATT
CGAGCAGCAAAGCTCGCACTAATTTGCGCGTAACCTTTTCGCAACTACAACAAAGCCTGCATCCGTTGTATCAGGCCTTG
CCTGCGCGTGCGCCGTTGTTGGTCGCTGATCGGGCACGGATTGCGCTGCAAGCCGAAGCATGGCCCGAATTGCAGGTTGA
TGTCTGGCGGTTTGATCAAGCAATTGCCGCCTACCACACTCATAACCATGAGCATGGAGTGATATGTGCTGCTTGTCTTG
AACAATTAACGAGCGCAGTTGAGTTGTATCAGGGCGATTTGTTGACTCCCTTTGCGATTGAGGCGAGTAGTGGCTTTGAT
GCGTGGCTGGAACGCCAGCGCGAGGCACGACATCAACAACTGCTGCTGGCCTACGATGTTTTAGCCGAGCATGCCCTGCG
AATGCGCGATTTTCATGAAGTTCAGCGGCTTTCAACCGCCCAATTGCTGCATTTACCTTGGCATGAGCAGGCTCATCGGC
GCTTGATGATTAGTTTTGCCGAGTTGGGCCATCAGAGTATGCTGCGCGAACAGTATTTGCTCTGCCAACGAACGCTTGAG
CGCGAACTGGGGATTGGCCCTGATGCGGAGACCCAAGCCCTTTACCAGCGTTTAGTCACAACTTCGACCACGCTGCCCCT
GCCTAATCCAACTCTAAAAACCTTGCCTGAACTAAGCAAACCATTGATTGGCCGAACCCATGAATTAGCGCTCTTGCACA
GCTTGATTGAGCAAAAACAGCAACGTTTGGTGACCTTGCTCGGCTTGGGTGGCATCGGCAAAACAAGCTTAGCCTTGGCC
TATGCTCATGCTGCCCAAGCGGCTTTCGATGCTGTGTGGTTTGTGAGTTTTGCGGGTAGTGCTGGCGAATCACTCGCATC
CGACCACCATCGGCTTAGCGCAACCATCGCGACGACACTGGGGTTGTCGCAACAACTGCACACGCCCCAAGCAGCCTTGC
TACATTACCTTGGGCAGCGCTCGGTCTTGTTGGTTTTGGATAATCTTGAGCATTTGGTGCACGAGGCGCTGCATGTGCAA
GCAATTCTGGATGCTTGCCCGCATGTGGTGGTGCTGGTAACTTCACGCGAACCACTCAATATTCAAGCTGAGCAGCGGGT
GCAACTGCATGGTTTGGCTTTGGCAAATGCTGATCAAGCGTTCGCAGCCAGTGCTCAATTATTTCTGGCACATGGAACCA
ACGCTACCAGCCAAACCTTGGCCGATCCTGCCAGCATGGAATGGATCGATCGGATTTGTCGCATGCTTGATGGTAATCCA
TTGGCAATTGAATTGGCCGCCCGTTGGGTGCACTATCTTGGGTTGGATGAAATTGCCACGGCGATTGAGCAGGATATGGA
TTTTCTACAAACTAGCGTGCGTGATTTGCCCGACCGTCATCGCAGTATGCGAGCGGTGTTTGATGGCTCGTGGCGCTTGC
TTTCGCGTCATGAACAGCGCGTGCTCAGTCAGGCTAGTTTGTTTCGGGGCAGTTGGTCGCTCACGGCGATGCGCAGTATT
TGCACGGTGTCGCGGCTGACCATTCGCGAGCTGATCGATAAAAGTTGGCTAACTCAGCATGCAGGCCGCGCGATGATCCA
TCGTTTGATTCAACGCTATGCCCATGAACAATTGCAACGCATGCCGACTACCGCTGCAACGACTGCAAAACGCCATAGTA
TTTACTACTTGGCCATGCTTCGGCGGCATACTCCCGCACTCAGTGGCTCGCAACCACAAGCGAGCGTTCGACTGTTACGC
GACGATCTTGATAATATTCGTCAAGCTTGGCTTTGGGCGGTAGATCATGGCGCAACCCATTTGGTGCATGCAAGTCTGGC
TGGTTTATCGCAACTCTACGATCTTTTAGGCTTGTATCACGAGGCGATTCGCGTGCTGCAAACCAGCATCACCCAGATTC
AACGCCAACCAACCAGCCTACAGCAACAACGCCTGCTGATGCGCTTGACGATTGCGCTCGCCAGCCATTTCAATGCAGCG
GCAGATTATCGGACTGCCGCACAGGTTGGGCAACAGGCCTTGGATTTAGCTCAGACCCTTGATGTTCCGCAGCAGATAGC
CGCCTGTTTGTTGCAAATTGGTATTGCCCAACGCAATTATGGTTTGTTTGCTGACGCCGAACAAAGCCTTCAGCGCTCGA
TCGCGATTGCCCAAGCGTTGCCGTTGAAGCAGGTCTATGCCCATGCGCTGCGTAGTTTGGGCTTTTTGGCCTATCTCCAA
GGCAATTATCCCGTGGCGTTGCGCTACCACGAGCAGGCGTTGGCGTTTTATCGGTTGCTTCACGATCAACGGAGTATTAA
TTTGGCCCAAAATACCTTGGGCTTAATTGCGCTTGCTCAGGGCGATCTTCAGCAGGCGTGGGACCAATTGGCGGTAGTAT
TGACGCGTTGTCAAACGCTTGAAGATGGTTGGGGCGAGGCTTTGACCCTGAATAATCTGGGAGCTGTGGTGCAGGCTCAG
GGTGATCCAGCTCGCGCGATCGATTATTATCAAAAGGCATTAAGCATTCGCCAACGGATTGGCGATCGTTGGGGCGAGGG
CATTAGTCTGAGCAATCTGGCGGCGGCATGGCACGAGCAGGCAGATTACCAAACTGCCTATCAAAGCGCAATGCAAGCCA
TTCAGCATACCACTGCAATTCATGATTTGCCGACCAAAGCCTATGCCTTGACCACCCTTAGCCAGATTCTGCGGGTACTG
GGCGATCAGGCTGGGTCAATCGCCGCCCGATCAGAGGCCACAACATTGCGCACCCAGCTTGGACAAGATCATTTAATTAG
TCAAACCATTGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCCGTGGGAGAGGGGTTGGGGTGAGGGAACACCAGATCAACTGAGAATGTAGTTTAGCGTCCGAGCGTAGTCAATCCGTA
ATCACTGAAGGACAGGGATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGAACCCTGCGATCAGCCTGCAATTGTGTTTACGATCCGATTACGGGCGCGAGTTAGACTGGCGCGAGTTAGCTGGCTC
CATGATTAAAGGATGCACTA

Product: transcriptional activator domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 991; Mature: 991

Protein sequence:

>991_residues
MQFCFFGLVRATFNDQPLQFRSNKVRALLAIIWLDPRRQWARDELASLLWEDYSSSKARTNLRVTFSQLQQSLHPLYQAL
PARAPLLVADRARIALQAEAWPELQVDVWRFDQAIAAYHTHNHEHGVICAACLEQLTSAVELYQGDLLTPFAIEASSGFD
AWLERQREARHQQLLLAYDVLAEHALRMRDFHEVQRLSTAQLLHLPWHEQAHRRLMISFAELGHQSMLREQYLLCQRTLE
RELGIGPDAETQALYQRLVTTSTTLPLPNPTLKTLPELSKPLIGRTHELALLHSLIEQKQQRLVTLLGLGGIGKTSLALA
YAHAAQAAFDAVWFVSFAGSAGESLASDHHRLSATIATTLGLSQQLHTPQAALLHYLGQRSVLLVLDNLEHLVHEALHVQ
AILDACPHVVVLVTSREPLNIQAEQRVQLHGLALANADQAFAASAQLFLAHGTNATSQTLADPASMEWIDRICRMLDGNP
LAIELAARWVHYLGLDEIATAIEQDMDFLQTSVRDLPDRHRSMRAVFDGSWRLLSRHEQRVLSQASLFRGSWSLTAMRSI
CTVSRLTIRELIDKSWLTQHAGRAMIHRLIQRYAHEQLQRMPTTAATTAKRHSIYYLAMLRRHTPALSGSQPQASVRLLR
DDLDNIRQAWLWAVDHGATHLVHASLAGLSQLYDLLGLYHEAIRVLQTSITQIQRQPTSLQQQRLLMRLTIALASHFNAA
ADYRTAAQVGQQALDLAQTLDVPQQIAACLLQIGIAQRNYGLFADAEQSLQRSIAIAQALPLKQVYAHALRSLGFLAYLQ
GNYPVALRYHEQALAFYRLLHDQRSINLAQNTLGLIALAQGDLQQAWDQLAVVLTRCQTLEDGWGEALTLNNLGAVVQAQ
GDPARAIDYYQKALSIRQRIGDRWGEGISLSNLAAAWHEQADYQTAYQSAMQAIQHTTAIHDLPTKAYALTTLSQILRVL
GDQAGSIAARSEATTLRTQLGQDHLISQTID

Sequences:

>Translated_991_residues
MQFCFFGLVRATFNDQPLQFRSNKVRALLAIIWLDPRRQWARDELASLLWEDYSSSKARTNLRVTFSQLQQSLHPLYQAL
PARAPLLVADRARIALQAEAWPELQVDVWRFDQAIAAYHTHNHEHGVICAACLEQLTSAVELYQGDLLTPFAIEASSGFD
AWLERQREARHQQLLLAYDVLAEHALRMRDFHEVQRLSTAQLLHLPWHEQAHRRLMISFAELGHQSMLREQYLLCQRTLE
RELGIGPDAETQALYQRLVTTSTTLPLPNPTLKTLPELSKPLIGRTHELALLHSLIEQKQQRLVTLLGLGGIGKTSLALA
YAHAAQAAFDAVWFVSFAGSAGESLASDHHRLSATIATTLGLSQQLHTPQAALLHYLGQRSVLLVLDNLEHLVHEALHVQ
AILDACPHVVVLVTSREPLNIQAEQRVQLHGLALANADQAFAASAQLFLAHGTNATSQTLADPASMEWIDRICRMLDGNP
LAIELAARWVHYLGLDEIATAIEQDMDFLQTSVRDLPDRHRSMRAVFDGSWRLLSRHEQRVLSQASLFRGSWSLTAMRSI
CTVSRLTIRELIDKSWLTQHAGRAMIHRLIQRYAHEQLQRMPTTAATTAKRHSIYYLAMLRRHTPALSGSQPQASVRLLR
DDLDNIRQAWLWAVDHGATHLVHASLAGLSQLYDLLGLYHEAIRVLQTSITQIQRQPTSLQQQRLLMRLTIALASHFNAA
ADYRTAAQVGQQALDLAQTLDVPQQIAACLLQIGIAQRNYGLFADAEQSLQRSIAIAQALPLKQVYAHALRSLGFLAYLQ
GNYPVALRYHEQALAFYRLLHDQRSINLAQNTLGLIALAQGDLQQAWDQLAVVLTRCQTLEDGWGEALTLNNLGAVVQAQ
GDPARAIDYYQKALSIRQRIGDRWGEGISLSNLAAAWHEQADYQTAYQSAMQAIQHTTAIHDLPTKAYALTTLSQILRVL
GDQAGSIAARSEATTLRTQLGQDHLISQTID
>Mature_991_residues
MQFCFFGLVRATFNDQPLQFRSNKVRALLAIIWLDPRRQWARDELASLLWEDYSSSKARTNLRVTFSQLQQSLHPLYQAL
PARAPLLVADRARIALQAEAWPELQVDVWRFDQAIAAYHTHNHEHGVICAACLEQLTSAVELYQGDLLTPFAIEASSGFD
AWLERQREARHQQLLLAYDVLAEHALRMRDFHEVQRLSTAQLLHLPWHEQAHRRLMISFAELGHQSMLREQYLLCQRTLE
RELGIGPDAETQALYQRLVTTSTTLPLPNPTLKTLPELSKPLIGRTHELALLHSLIEQKQQRLVTLLGLGGIGKTSLALA
YAHAAQAAFDAVWFVSFAGSAGESLASDHHRLSATIATTLGLSQQLHTPQAALLHYLGQRSVLLVLDNLEHLVHEALHVQ
AILDACPHVVVLVTSREPLNIQAEQRVQLHGLALANADQAFAASAQLFLAHGTNATSQTLADPASMEWIDRICRMLDGNP
LAIELAARWVHYLGLDEIATAIEQDMDFLQTSVRDLPDRHRSMRAVFDGSWRLLSRHEQRVLSQASLFRGSWSLTAMRSI
CTVSRLTIRELIDKSWLTQHAGRAMIHRLIQRYAHEQLQRMPTTAATTAKRHSIYYLAMLRRHTPALSGSQPQASVRLLR
DDLDNIRQAWLWAVDHGATHLVHASLAGLSQLYDLLGLYHEAIRVLQTSITQIQRQPTSLQQQRLLMRLTIALASHFNAA
ADYRTAAQVGQQALDLAQTLDVPQQIAACLLQIGIAQRNYGLFADAEQSLQRSIAIAQALPLKQVYAHALRSLGFLAYLQ
GNYPVALRYHEQALAFYRLLHDQRSINLAQNTLGLIALAQGDLQQAWDQLAVVLTRCQTLEDGWGEALTLNNLGAVVQAQ
GDPARAIDYYQKALSIRQRIGDRWGEGISLSNLAAAWHEQADYQTAYQSAMQAIQHTTAIHDLPTKAYALTTLSQILRVL
GDQAGSIAARSEATTLRTQLGQDHLISQTID

Specific function: Unknown

COG id: COG3903

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 HTH luxR-type DNA-binding domain [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI224028289, Length=326, Percent_Identity=24.8466257668712, Blast_Score=75, Evalue=2e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR016032
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR000792
- InterPro:   IPR011991 [H]

Pfam domain/function: PF00196 GerE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 110974; Mature: 110974

Theoretical pI: Translated: 7.34; Mature: 7.34

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQFCFFGLVRATFNDQPLQFRSNKVRALLAIIWLDPRRQWARDELASLLWEDYSSSKART
CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
NLRVTFSQLQQSLHPLYQALPARAPLLVADRARIALQAEAWPELQVDVWRFDQAIAAYHT
HHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
HNHEHGVICAACLEQLTSAVELYQGDLLTPFAIEASSGFDAWLERQREARHQQLLLAYDV
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAEHALRMRDFHEVQRLSTAQLLHLPWHEQAHRRLMISFAELGHQSMLREQYLLCQRTLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RELGIGPDAETQALYQRLVTTSTTLPLPNPTLKTLPELSKPLIGRTHELALLHSLIEQKQ
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
QRLVTLLGLGGIGKTSLALAYAHAAQAAFDAVWFVSFAGSAGESLASDHHRLSATIATTL
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLSQQLHTPQAALLHYLGQRSVLLVLDNLEHLVHEALHVQAILDACPHVVVLVTSREPLN
CCHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCC
IQAEQRVQLHGLALANADQAFAASAQLFLAHGTNATSQTLADPASMEWIDRICRMLDGNP
CCHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
LAIELAARWVHYLGLDEIATAIEQDMDFLQTSVRDLPDRHRSMRAVFDGSWRLLSRHEQR
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VLSQASLFRGSWSLTAMRSICTVSRLTIRELIDKSWLTQHAGRAMIHRLIQRYAHEQLQR
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MPTTAATTAKRHSIYYLAMLRRHTPALSGSQPQASVRLLRDDLDNIRQAWLWAVDHGATH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LVHASLAGLSQLYDLLGLYHEAIRVLQTSITQIQRQPTSLQQQRLLMRLTIALASHFNAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
ADYRTAAQVGQQALDLAQTLDVPQQIAACLLQIGIAQRNYGLFADAEQSLQRSIAIAQAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
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CHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEECC
GDLQQAWDQLAVVLTRCQTLEDGWGEALTLNNLGAVVQAQGDPARAIDYYQKALSIRQRI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GDRWGEGISLSNLAAAWHEQADYQTAYQSAMQAIQHTTAIHDLPTKAYALTTLSQILRVL
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GDQAGSIAARSEATTLRTQLGQDHLISQTID
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MQFCFFGLVRATFNDQPLQFRSNKVRALLAIIWLDPRRQWARDELASLLWEDYSSSKART
CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
NLRVTFSQLQQSLHPLYQALPARAPLLVADRARIALQAEAWPELQVDVWRFDQAIAAYHT
HHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
HNHEHGVICAACLEQLTSAVELYQGDLLTPFAIEASSGFDAWLERQREARHQQLLLAYDV
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MPTTAATTAKRHSIYYLAMLRRHTPALSGSQPQASVRLLRDDLDNIRQAWLWAVDHGATH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
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CHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEECC
GDLQQAWDQLAVVLTRCQTLEDGWGEALTLNNLGAVVQAQGDPARAIDYYQKALSIRQRI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GDRWGEGISLSNLAAAWHEQADYQTAYQSAMQAIQHTTAIHDLPTKAYALTTLSQILRVL
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GDQAGSIAARSEATTLRTQLGQDHLISQTID
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]