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The map label for this gene is 159041182

Identifier: 159041182

GI number: 159041182

Start: 635494

End: 636663

Strand: Reverse

Name: 159041182

Synonym: Cmaq_0603

Alternate gene names: NA

Gene position: 636663-635494 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159041183

Following gene: 159041180

Centisome position: 30.64

GC content: 37.01

Gene sequence:

>1170_bases
ATGATTAGGGGGCATTACTTAGGATTAGCGCAGGCATTATTAATAATAGTACCCTTAACAATAGTGGTTAGGGCATCTAA
TAATATGTTAATGACTACAATACCCTTACTAGCTAGGTATGGCTTTCACTTCAGTAATACACTTATTGGCTTATTATCAG
CCTTAACAGCATTAATGACATTCCTAAGTAGTGGTTTAATTAACTCAAGGTTAAGGTCATGTAATAGGAGATTAGCATTC
ATAGCGTCTTCAGTAATATATGCTGTGGCTTATCCATTATTCTGGTTATCAACACCATTAACCATATGGCTGCTTTCAGC
CATTGCTGGATTCACCCTAGGCTTCCTAATGCCTAACATAATAACCTCAGCAAGCCTACTACCTGATAGGAGGACTAGGG
AGAGATTACTCAATATTTACACGTTGTCATTAAGCATAAGCCTAATACTAGGTCCAGCTATTGAATCATTGATACTTAAA
TACTATAGCCTAAGGGAATCCTTCCTATTCTTCACAGTATTCCCAATACTTGCCTTAGCCATAGCCCCATTCATTAAATT
CCCTGAAGAGACAAGTAATGATTCATTAATTGCCGTGAGCAATGTATTATCTAACCCTGGATTCTTAACAGCCGTCTTAA
ACATAGCAACATATAACGTGGTCTTCTCCTTCCTAATGGCCTTCGGTGGTATTTATGCTAGGAATTCCTTTGGATTAAGT
TACTCAACGGTTGAGACTTTGTTCTCATTATTCTTCGTAACATCATTCCTAGGTAGGCTTTACTTATCAATTAAACCCGC
TGAGAGACTTTGGCCACTTATGAGTAGTGCAGTTTTATTGACTGTAATTGGTATTGCATTGATAGGTTTAATTAATAATT
TATTGATATACATTATTGCATTGCTATTACTGGGTATACCACATGGTACCACTTATCCATTATCAGTGGTTGCCATATCA
AGAGCGTTTAAACCACAGCATAGGAATATGGCTAATAGCCTATTCTTCTCATTCATGATGCTCATAGGTATAGTAACACC
AACAATAACAGGCTATGTAGCGGATTTAATAGGCATAAGGAACACATTTATAGTACTAATACTGCCTGTGATTATTATCT
TACTGTTCCTGAGAAGGTACGTGAATGCTGTTGATAAGCCACTTGGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTTCATTGAGAATATTCTCAGGAGGGTTAAATACGGCATATATGATCCTGGCGACTACGTTAGTTTTATTAATGTTGTT
AAAAGGTATAGTGAGGCTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTCAACTTAACTCCTCTTCACCACTATGGTTAAATATGACCTTGGCTTAACACTTACCTTTAATTCACCGTTAGTGAAT
TCACCAAGTTCCTCAATGGG

Product: major facilitator transporter

Products: NA

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Protein; Multidrug Efflux Permease; Multidrug Resistance Protein

Number of amino acids: Translated: 389; Mature: 389

Protein sequence:

>389_residues
MIRGHYLGLAQALLIIVPLTIVVRASNNMLMTTIPLLARYGFHFSNTLIGLLSALTALMTFLSSGLINSRLRSCNRRLAF
IASSVIYAVAYPLFWLSTPLTIWLLSAIAGFTLGFLMPNIITSASLLPDRRTRERLLNIYTLSLSISLILGPAIESLILK
YYSLRESFLFFTVFPILALAIAPFIKFPEETSNDSLIAVSNVLSNPGFLTAVLNIATYNVVFSFLMAFGGIYARNSFGLS
YSTVETLFSLFFVTSFLGRLYLSIKPAERLWPLMSSAVLLTVIGIALIGLINNLLIYIIALLLLGIPHGTTYPLSVVAIS
RAFKPQHRNMANSLFFSFMMLIGIVTPTITGYVADLIGIRNTFIVLILPVIIILLFLRRYVNAVDKPLG

Sequences:

>Translated_389_residues
MIRGHYLGLAQALLIIVPLTIVVRASNNMLMTTIPLLARYGFHFSNTLIGLLSALTALMTFLSSGLINSRLRSCNRRLAF
IASSVIYAVAYPLFWLSTPLTIWLLSAIAGFTLGFLMPNIITSASLLPDRRTRERLLNIYTLSLSISLILGPAIESLILK
YYSLRESFLFFTVFPILALAIAPFIKFPEETSNDSLIAVSNVLSNPGFLTAVLNIATYNVVFSFLMAFGGIYARNSFGLS
YSTVETLFSLFFVTSFLGRLYLSIKPAERLWPLMSSAVLLTVIGIALIGLINNLLIYIIALLLLGIPHGTTYPLSVVAIS
RAFKPQHRNMANSLFFSFMMLIGIVTPTITGYVADLIGIRNTFIVLILPVIIILLFLRRYVNAVDKPLG
>Mature_389_residues
MIRGHYLGLAQALLIIVPLTIVVRASNNMLMTTIPLLARYGFHFSNTLIGLLSALTALMTFLSSGLINSRLRSCNRRLAF
IASSVIYAVAYPLFWLSTPLTIWLLSAIAGFTLGFLMPNIITSASLLPDRRTRERLLNIYTLSLSISLILGPAIESLILK
YYSLRESFLFFTVFPILALAIAPFIKFPEETSNDSLIAVSNVLSNPGFLTAVLNIATYNVVFSFLMAFGGIYARNSFGLS
YSTVETLFSLFFVTSFLGRLYLSIKPAERLWPLMSSAVLLTVIGIALIGLINNLLIYIIALLLLGIPHGTTYPLSVVAIS
RAFKPQHRNMANSLFFSFMMLIGIVTPTITGYVADLIGIRNTFIVLILPVIIILLFLRRYVNAVDKPLG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42966; Mature: 42966

Theoretical pI: Translated: 10.44; Mature: 10.44

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIRGHYLGLAQALLIIVPLTIVVRASNNMLMTTIPLLARYGFHFSNTLIGLLSALTALMT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSSGLINSRLRSCNRRLAFIASSVIYAVAYPLFWLSTPLTIWLLSAIAGFTLGFLMPNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITSASLLPDRRTRERLLNIYTLSLSISLILGPAIESLILKYYSLRESFLFFTVFPILALA
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAPFIKFPEETSNDSLIAVSNVLSNPGFLTAVLNIATYNVVFSFLMAFGGIYARNSFGLS
HHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCH
YSTVETLFSLFFVTSFLGRLYLSIKPAERLWPLMSSAVLLTVIGIALIGLINNLLIYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLGIPHGTTYPLSVVAISRAFKPQHRNMANSLFFSFMMLIGIVTPTITGYVADLIGIR
HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTFIVLILPVIIILLFLRRYVNAVDKPLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIRGHYLGLAQALLIIVPLTIVVRASNNMLMTTIPLLARYGFHFSNTLIGLLSALTALMT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSSGLINSRLRSCNRRLAFIASSVIYAVAYPLFWLSTPLTIWLLSAIAGFTLGFLMPNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITSASLLPDRRTRERLLNIYTLSLSISLILGPAIESLILKYYSLRESFLFFTVFPILALA
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAPFIKFPEETSNDSLIAVSNVLSNPGFLTAVLNIATYNVVFSFLMAFGGIYARNSFGLS
HHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCH
YSTVETLFSLFFVTSFLGRLYLSIKPAERLWPLMSSAVLLTVIGIALIGLINNLLIYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLGIPHGTTYPLSVVAISRAFKPQHRNMANSLFFSFMMLIGIVTPTITGYVADLIGIR
HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTFIVLILPVIIILLFLRRYVNAVDKPLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA