Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 159040887

Identifier: 159040887

GI number: 159040887

Start: 339691

End: 341835

Strand: Reverse

Name: 159040887

Synonym: Cmaq_0301

Alternate gene names: NA

Gene position: 341835-339691 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159040888

Following gene: 159040885

Centisome position: 16.45

GC content: 38.09

Gene sequence:

>2145_bases
TTGAGAATCAGAGGCATTAATTCCCTATTAATTAACCTACCCCTACTTGGGGGGAAGTCGTGGTTAATCGCCGCCTTATT
AATAATCATGCTGCCTTACGTTACCCATGTTGTTGAGGCCGATGCATCATTATCAGTAACATACACTGTTAATTACATTA
ACTACTACACTAGTAGTGGTGTTAAATCCTACATTAATTATGGTGTTAACCTGATTAATGAAAACTCAACGGCATTAAAC
GTTATCGTGGGTTTCAGACTACCACCCTACTCATCCATACTATATGCCTCAAGTGGATATGTATTGAAGGGTGATGAGAT
TTACTGGAACATTACGATTAATTCCTTTGAGACTATGTCGCTTAACGTTGAGTTCCAGAACCCATTAGTGAATAATTATA
TAATGAACTTTAAGTACCTCATTAATGACTCAACAACCCCCAGTCAAGTGATAAACGGTAGTTCAGGTGTTAAATTAATA
ATGCTTGTTAATGCATCAAATGCACTAGGCCTACCACTAACCTATAATGCATATATACCGCTTCAGAATGGTATTAATTA
CTACTACTCCACGCCACCCACTGGTGTTGCTGGTATTGGTACTGGGAATTACATGTACTGGTCCGGTGAATTACCTAATA
ATGGTTCCGTTGACTTAAACGTAACATTCATTGTGGCTAATTCAGGTAATTGGAGTGCAATAGACTTGGGTTCATTAATA
TTCACATCATCAATAGACTTATACTACTACTTGAATTACCTTAAGTTAACCATAGGTCAATTAAACAACACGCTTACGGA
ATTCAATAATATTCCCTACGTAAGGCCTATAAGCAGTAACGCCACGATACTCTTAAACGACTTATACCAGTTATCTTACT
TACTAAACACCACAGCTGCCTTGTATAGGCAGTCAGCGTACTACATGAATTCCACCAGGGTTATTGAGAGTCTACTACTG
CTTCAGGTATATGAGGTTGATTACGCCCTGAGGGCTGAGTACGGTGTTTTAAGTAAGCTTAACTCCACTATCCCAATGGT
GTCCTACTCCCTTAAGCAAATAATGAGTAATTTAACGCAGTTGAATAATGAGATAATTAATCTTCAATACCAGGTTATTT
CAGATGTGGTGTATGCTTATGGGGAGATTGAGCAGTACAACGTTACGTTAATGGAGATAATACCAATATTAAACGCTACT
AACACTACGCTAGCCGAATACTACCAATACTTGGGTTATGTTCAAGATAATTTAACTAAACTGTATAATGATGTTAATTC
ACTTAACATTAATGGTGGAGTTAAATCCAGTATACTTGGTGAATTAAGTAGGTTAATTAAGGATGTGGAGGTGATGAGGG
CTACGGTGCTTAGACTTGAGGGTTATGTTAATGGTGCCGAGATGGGTGTTTTAACGGCTAGTAGGCAATTAAGCGAGTTA
GCGTATCAATTAAACACCAGGGGTACTGCATTAGTAATTGCCTTAACCAACATAAGCAATACACTTGTTAAGACTAATCA
AAGCGTATACTCACTTTACATAGCCCTCAATTACCTGAGTAATACACTTAACTCAACGACGAGTACGCTTAACGTAACGT
TAGGTAGGCTTAACTTAGCGTTAGCGGTACCCACATCACTGTACGGTAACTTAACTAACATTACCAGTGGTCTAATTCAA
ACTAGTTCCCAGCTTCAGAATGCATCAGCTAGGTTAATGAGCATGTACTTTAACTTAACGGGCCAATACCTACTCTTCAG
CCTAGCCATTAATCAAAGTATTGAGTATCAGAGGGCTAACCTGGTTAATGAATTAAACACCTATGAAGCATACTATGGTA
TTGCCAAGGGTACTTATGATCAATACTTAAGTAGCTTGATCATTAATTCTTCATCACCGTATGTGGTTGATATAGTGGTT
GAGCAGACTAGTGAGGTGAATTTACCCATAGTACTGAACATGAGGTATATTTCCTCAGTGTTATCCAACATCACTATTAT
TAATACGGATAATGGTAAGGGTGGTTCAATGAGGGGGATAAGTAAGGGTACCTACGGGTTATTGATTATAGTTCTTGCAC
TTACCCTTGGCCTTATCCTCAATAAGCGTAAGTACGTCATTAACAACATTATTAATCACCCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTGAGGGGCTTAAAATAGATTTATTAGCCAGGAGACGCAGTAGATTAGCTGATGATGTTGGTAGAATTGAGGAGGAGAT
TTCACGACTTGAGGAGGTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGCATCAATAACAGGGTAATTACGCTCCCTAGCCCTCCTAAGGTAAACCTCCTGGACGCTCCTAAGGAAGTCAGTATTCC
TCTCAAAGTACTCAAGCATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 714; Mature: 714

Protein sequence:

>714_residues
MRIRGINSLLINLPLLGGKSWLIAALLIIMLPYVTHVVEADASLSVTYTVNYINYYTSSGVKSYINYGVNLINENSTALN
VIVGFRLPPYSSILYASSGYVLKGDEIYWNITINSFETMSLNVEFQNPLVNNYIMNFKYLINDSTTPSQVINGSSGVKLI
MLVNASNALGLPLTYNAYIPLQNGINYYYSTPPTGVAGIGTGNYMYWSGELPNNGSVDLNVTFIVANSGNWSAIDLGSLI
FTSSIDLYYYLNYLKLTIGQLNNTLTEFNNIPYVRPISSNATILLNDLYQLSYLLNTTAALYRQSAYYMNSTRVIESLLL
LQVYEVDYALRAEYGVLSKLNSTIPMVSYSLKQIMSNLTQLNNEIINLQYQVISDVVYAYGEIEQYNVTLMEIIPILNAT
NTTLAEYYQYLGYVQDNLTKLYNDVNSLNINGGVKSSILGELSRLIKDVEVMRATVLRLEGYVNGAEMGVLTASRQLSEL
AYQLNTRGTALVIALTNISNTLVKTNQSVYSLYIALNYLSNTLNSTTSTLNVTLGRLNLALAVPTSLYGNLTNITSGLIQ
TSSQLQNASARLMSMYFNLTGQYLLFSLAINQSIEYQRANLVNELNTYEAYYGIAKGTYDQYLSSLIINSSSPYVVDIVV
EQTSEVNLPIVLNMRYISSVLSNITIINTDNGKGGSMRGISKGTYGLLIIVLALTLGLILNKRKYVINNIINHP

Sequences:

>Translated_714_residues
MRIRGINSLLINLPLLGGKSWLIAALLIIMLPYVTHVVEADASLSVTYTVNYINYYTSSGVKSYINYGVNLINENSTALN
VIVGFRLPPYSSILYASSGYVLKGDEIYWNITINSFETMSLNVEFQNPLVNNYIMNFKYLINDSTTPSQVINGSSGVKLI
MLVNASNALGLPLTYNAYIPLQNGINYYYSTPPTGVAGIGTGNYMYWSGELPNNGSVDLNVTFIVANSGNWSAIDLGSLI
FTSSIDLYYYLNYLKLTIGQLNNTLTEFNNIPYVRPISSNATILLNDLYQLSYLLNTTAALYRQSAYYMNSTRVIESLLL
LQVYEVDYALRAEYGVLSKLNSTIPMVSYSLKQIMSNLTQLNNEIINLQYQVISDVVYAYGEIEQYNVTLMEIIPILNAT
NTTLAEYYQYLGYVQDNLTKLYNDVNSLNINGGVKSSILGELSRLIKDVEVMRATVLRLEGYVNGAEMGVLTASRQLSEL
AYQLNTRGTALVIALTNISNTLVKTNQSVYSLYIALNYLSNTLNSTTSTLNVTLGRLNLALAVPTSLYGNLTNITSGLIQ
TSSQLQNASARLMSMYFNLTGQYLLFSLAINQSIEYQRANLVNELNTYEAYYGIAKGTYDQYLSSLIINSSSPYVVDIVV
EQTSEVNLPIVLNMRYISSVLSNITIINTDNGKGGSMRGISKGTYGLLIIVLALTLGLILNKRKYVINNIINHP
>Mature_714_residues
MRIRGINSLLINLPLLGGKSWLIAALLIIMLPYVTHVVEADASLSVTYTVNYINYYTSSGVKSYINYGVNLINENSTALN
VIVGFRLPPYSSILYASSGYVLKGDEIYWNITINSFETMSLNVEFQNPLVNNYIMNFKYLINDSTTPSQVINGSSGVKLI
MLVNASNALGLPLTYNAYIPLQNGINYYYSTPPTGVAGIGTGNYMYWSGELPNNGSVDLNVTFIVANSGNWSAIDLGSLI
FTSSIDLYYYLNYLKLTIGQLNNTLTEFNNIPYVRPISSNATILLNDLYQLSYLLNTTAALYRQSAYYMNSTRVIESLLL
LQVYEVDYALRAEYGVLSKLNSTIPMVSYSLKQIMSNLTQLNNEIINLQYQVISDVVYAYGEIEQYNVTLMEIIPILNAT
NTTLAEYYQYLGYVQDNLTKLYNDVNSLNINGGVKSSILGELSRLIKDVEVMRATVLRLEGYVNGAEMGVLTASRQLSEL
AYQLNTRGTALVIALTNISNTLVKTNQSVYSLYIALNYLSNTLNSTTSTLNVTLGRLNLALAVPTSLYGNLTNITSGLIQ
TSSQLQNASARLMSMYFNLTGQYLLFSLAINQSIEYQRANLVNELNTYEAYYGIAKGTYDQYLSSLIINSSSPYVVDIVV
EQTSEVNLPIVLNMRYISSVLSNITIINTDNGKGGSMRGISKGTYGLLIIVLALTLGLILNKRKYVINNIINHP

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 79183; Mature: 79183

Theoretical pI: Translated: 5.12; Mature: 5.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRIRGINSLLINLPLLGGKSWLIAALLIIMLPYVTHVVEADASLSVTYTVNYINYYTSSG
CCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEEECCCH
VKSYINYGVNLINENSTALNVIVGFRLPPYSSILYASSGYVLKGDEIYWNITINSFETMS
HHHHHHCCCEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCEEEECCEEEEEEEECCEEEEE
LNVEFQNPLVNNYIMNFKYLINDSTTPSQVINGSSGVKLIMLVNASNALGLPLTYNAYIP
EEEEECCCCHHHHEEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEE
LQNGINYYYSTPPTGVAGIGTGNYMYWSGELPNNGSVDLNVTFIVANSGNWSAIDLGSLI
ECCCCCEEECCCCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCEEECCHHH
FTSSIDLYYYLNYLKLTIGQLNNTLTEFNNIPYVRPISSNATILLNDLYQLSYLLNTTAA
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
LYRQSAYYMNSTRVIESLLLLQVYEVDYALRAEYGVLSKLNSTIPMVSYSLKQIMSNLTQ
HHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LNNEIINLQYQVISDVVYAYGEIEQYNVTLMEIIPILNATNTTLAEYYQYLGYVQDNLTK
HCHHHEEEHHHHHHHHHHHHCCCEECCEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYNDVNSLNINGGVKSSILGELSRLIKDVEVMRATVLRLEGYVNGAEMGVLTASRQLSEL
HHCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
AYQLNTRGTALVIALTNISNTLVKTNQSVYSLYIALNYLSNTLNSTTSTLNVTLGRLNLA
HHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEE
LAVPTSLYGNLTNITSGLIQTSSQLQNASARLMSMYFNLTGQYLLFSLAINQSIEYQRAN
EEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHCCCCHHHHHH
LVNELNTYEAYYGIAKGTYDQYLSSLIINSSSPYVVDIVVEQTSEVNLPIVLNMRYISSV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHH
LSNITIINTDNGKGGSMRGISKGTYGLLIIVLALTLGLILNKRKYVINNIINHP
HCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MRIRGINSLLINLPLLGGKSWLIAALLIIMLPYVTHVVEADASLSVTYTVNYINYYTSSG
CCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEEECCCH
VKSYINYGVNLINENSTALNVIVGFRLPPYSSILYASSGYVLKGDEIYWNITINSFETMS
HHHHHHCCCEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCEEEECCEEEEEEEECCEEEEE
LNVEFQNPLVNNYIMNFKYLINDSTTPSQVINGSSGVKLIMLVNASNALGLPLTYNAYIP
EEEEECCCCHHHHEEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEE
LQNGINYYYSTPPTGVAGIGTGNYMYWSGELPNNGSVDLNVTFIVANSGNWSAIDLGSLI
ECCCCCEEECCCCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCEEECCHHH
FTSSIDLYYYLNYLKLTIGQLNNTLTEFNNIPYVRPISSNATILLNDLYQLSYLLNTTAA
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
LYRQSAYYMNSTRVIESLLLLQVYEVDYALRAEYGVLSKLNSTIPMVSYSLKQIMSNLTQ
HHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LNNEIINLQYQVISDVVYAYGEIEQYNVTLMEIIPILNATNTTLAEYYQYLGYVQDNLTK
HCHHHEEEHHHHHHHHHHHHCCCEECCEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYNDVNSLNINGGVKSSILGELSRLIKDVEVMRATVLRLEGYVNGAEMGVLTASRQLSEL
HHCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
AYQLNTRGTALVIALTNISNTLVKTNQSVYSLYIALNYLSNTLNSTTSTLNVTLGRLNLA
HHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEE
LAVPTSLYGNLTNITSGLIQTSSQLQNASARLMSMYFNLTGQYLLFSLAINQSIEYQRAN
EEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHCCCCHHHHHH
LVNELNTYEAYYGIAKGTYDQYLSSLIINSSSPYVVDIVVEQTSEVNLPIVLNMRYISSV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHH
LSNITIINTDNGKGGSMRGISKGTYGLLIIVLALTLGLILNKRKYVINNIINHP
HCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA