| Definition | Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009925 |
| Length | 6,503,724 |
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The map label for this gene is 158335960
Identifier: 158335960
GI number: 158335960
Start: 2857640
End: 2859508
Strand: Reverse
Name: 158335960
Synonym: AM1_2818
Alternate gene names: NA
Gene position: 2859508-2857640 (Counterclockwise)
Preceding gene: 158335961
Following gene: 158335958
Centisome position: 43.97
GC content: 43.02
Gene sequence:
>1869_bases ATGGTGGGGGTGAAATGGCCAAGCGAGGGAGAAGAGCAACAGTTGTTGCCCCCTGGTACGTGCTTACTGGATCGATTCGC CAATTTAGGCAGTGGGGGAACGTTGCTGGTGCTGGGAAAACCGGGTGCCGGGAAAACGACGTTGCTGTTGGAGCTAGCGC AAGATTTATTGAAAGCGACTGATTTTCGAGAACTAAAACAACCGATACCGATTGTGTTGAATTTGTCGGCTTGGGGCAGT CAGCGGTTCCCTGCAGATGGAACGCTAGTCTTTACCAAGTGGCTGCTGGAAGAGCTATGGCAGCAATATCTAGTTCGCAT AGAAGTGGGGAAAACTTGGCTGAGGCAAGAGAAATGGACCTTGCTGTTAGACGGTTTGGATGAAGTCAAACCCCAATATC GTGATGCTTGTGTAGACGCATTAAATCAGTTTCGGCAAAAATTTGGCAATATCGAAATCGTGCTGTGCTGCCGAATTGCT GACTATAAAGCACTGAACACAAGATTAAAAGGGTTTCAAGCAGCGGTGTATGTTCAACCTTTAAAAGACAAGCAGGTGAA TGAGTATTTACAACAGGGAGGGGAAGCACTCGTTGGTTTAAAAAAGGCCAATTCTTCAAAGGTCAATTCTTCGCTGCGGG ATTTAACCAATACGCCGCTTTTTCTGAGGATTTTGACTTTGGCCTATTGCAATCGCTCACCTCAGGAGTTACTTCATTTA GATAAAGACCAGAAATTAAGCCTCCTGTTTGAACGCTATATTGAACGAATGTTTGCTCAGCGACCTTTGTCTTCTGAGAA AGAACAGCAACAAATGTTGCGCTGGCTCCGAGGAATAGCCAAGAAAATGGGGACCGATAAAGAATTTTTGATTGAGCGAA TGCAACCCAAAGATTGGTTAAAAACAGCAAGAGACAAATATCTTTATGGGCTGATTTATGGGCTAATTTCAGGATTGATT TTTGGGCTAATTTTAGGGCTAATTGGAGGACTGATTTATGAGCTGACTGGAGATGTGATAAGAGGAGAGATTTTCGATTT GATTTGCGATTCGACTATCGATGCGACTTGCAATTCGAATTTTAAGCCGATTTTTGAGCTGATTAGAGGGCTTAGATGGC TACCCGAAGGGCTAATTTCTGGGCTAATTTTAGGGCTAATTTACGGGCTGATTGGAGGACTGATTGGAGGACTGATTGGA GGGCAAAAACCTATTGTTCTTGTAGAAGCTTTAAAAATTTCAATGTCCCGAACAACGGGACGAGACATTTTGGCGTCGTT GAGAAGAGAGCTAACTTATGGACTAAATAGAGGGCTAATTGTTGGGCTAATTGTTGGGCTAATTTTTGGGCTAATTGTTG GGCTAACTAGAGGGCTAATTGGAGGGCTGATTTTCGGACTGATTGGAGGGCTGATTTTCGGACTGATTTTTGGGCTAATT TTAGGGCTGATTGGAGGCTTAAAAGTCGATATTATAAAGCGGACTTTCCCAAATCAAGGTATTTGGGAATCTCTCAAAAC TATGGTGATCACGGTTACAATATCGATTTTTTTTACGATTATTATTTATTTTTTCTTGAAAAATATTTTGCTTTCGTCCT TAGACCCAAATTTAGTGAAACGCGTTATTCGATTAGTCATAGGGTTACCAATCATGGGAGCTTTTCTTGCAGGAGGAGGA CTAACCTCTATTCAGCACTTTGCGATGCGTTTAGTCCTTTACCACACTAAGCAAATCCCCTGGAATTTTGTCACCTTTTT TCAGCAAGCGGAAGATCGCCTTTTTATCTACCGCACAGGTGGTAGCTACGTCTTCGTTCACCGCTACCTCCAAGAACATT TTGCCAACCTATCCTTCGACGAAACCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGATGGATAAGGTGCGGGTTACATGGATTGATGGGGGGTTGAAAAAATCTCTGAAGGAGCAGACTCGGATCTCGGTGA GATTGGAGTAGAGGCCTAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases CCCTCAAGCATTCCGCGCCCGACAAAATAAATTTGGAAGCTGTCGCCGCAAAAACGTATAGCCAAAGGTAAACCAGTAAA AGATATTGACCAACACCACC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 622; Mature: 622
Protein sequence:
>622_residues MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKATDFRELKQPIPIVLNLSAWGS QRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWTLLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIA DYKALNTRLKGFQAAVYVQPLKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWLKTARDKYLYGLIYGLISGLI FGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSNFKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIG GQKPIVLVEALKISMSRTTGRDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVKRVIRLVIGLPIMGAFLAGGG LTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTGGSYVFVHRYLQEHFANLSFDET
Sequences:
>Translated_622_residues MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKATDFRELKQPIPIVLNLSAWGS QRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWTLLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIA DYKALNTRLKGFQAAVYVQPLKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWLKTARDKYLYGLIYGLISGLI FGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSNFKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIG GQKPIVLVEALKISMSRTTGRDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVKRVIRLVIGLPIMGAFLAGGG LTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTGGSYVFVHRYLQEHFANLSFDET >Mature_622_residues MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKATDFRELKQPIPIVLNLSAWGS QRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWTLLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIA DYKALNTRLKGFQAAVYVQPLKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWLKTARDKYLYGLIYGLISGLI FGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSNFKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIG GQKPIVLVEALKISMSRTTGRDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVKRVIRLVIGLPIMGAFLAGGG LTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTGGSYVFVHRYLQEHFANLSFDET
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69851; Mature: 69851
Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68
Prosite motif: PS50837 NACHT ; PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKAT CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC DFRELKQPIPIVLNLSAWGSQRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWT CHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH LLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIADYKALNTRLKGFQAAVYVQP HHCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC LKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL CCCHHHHHHHHCCCHHEEEHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCC DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHH KTARDKYLYGLIYGLISGLIFGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC FKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIGGQKPIVLVEALKISMSRTTG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCC RDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVK HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH RVIRLVIGLPIMGAFLAGGGLTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC GSYVFVHRYLQEHFANLSFDET CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKAT CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC DFRELKQPIPIVLNLSAWGSQRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWT CHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH LLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIADYKALNTRLKGFQAAVYVQP HHCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC LKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL CCCHHHHHHHHCCCHHEEEHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCC DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHH KTARDKYLYGLIYGLISGLIFGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC FKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIGGQKPIVLVEALKISMSRTTG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCC RDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVK HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH RVIRLVIGLPIMGAFLAGGGLTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC GSYVFVHRYLQEHFANLSFDET CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA