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Definition Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome, complete genome.
Accession NC_009925
Length 6,503,724

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The map label for this gene is 158335960

Identifier: 158335960

GI number: 158335960

Start: 2857640

End: 2859508

Strand: Reverse

Name: 158335960

Synonym: AM1_2818

Alternate gene names: NA

Gene position: 2859508-2857640 (Counterclockwise)

Preceding gene: 158335961

Following gene: 158335958

Centisome position: 43.97

GC content: 43.02

Gene sequence:

>1869_bases
ATGGTGGGGGTGAAATGGCCAAGCGAGGGAGAAGAGCAACAGTTGTTGCCCCCTGGTACGTGCTTACTGGATCGATTCGC
CAATTTAGGCAGTGGGGGAACGTTGCTGGTGCTGGGAAAACCGGGTGCCGGGAAAACGACGTTGCTGTTGGAGCTAGCGC
AAGATTTATTGAAAGCGACTGATTTTCGAGAACTAAAACAACCGATACCGATTGTGTTGAATTTGTCGGCTTGGGGCAGT
CAGCGGTTCCCTGCAGATGGAACGCTAGTCTTTACCAAGTGGCTGCTGGAAGAGCTATGGCAGCAATATCTAGTTCGCAT
AGAAGTGGGGAAAACTTGGCTGAGGCAAGAGAAATGGACCTTGCTGTTAGACGGTTTGGATGAAGTCAAACCCCAATATC
GTGATGCTTGTGTAGACGCATTAAATCAGTTTCGGCAAAAATTTGGCAATATCGAAATCGTGCTGTGCTGCCGAATTGCT
GACTATAAAGCACTGAACACAAGATTAAAAGGGTTTCAAGCAGCGGTGTATGTTCAACCTTTAAAAGACAAGCAGGTGAA
TGAGTATTTACAACAGGGAGGGGAAGCACTCGTTGGTTTAAAAAAGGCCAATTCTTCAAAGGTCAATTCTTCGCTGCGGG
ATTTAACCAATACGCCGCTTTTTCTGAGGATTTTGACTTTGGCCTATTGCAATCGCTCACCTCAGGAGTTACTTCATTTA
GATAAAGACCAGAAATTAAGCCTCCTGTTTGAACGCTATATTGAACGAATGTTTGCTCAGCGACCTTTGTCTTCTGAGAA
AGAACAGCAACAAATGTTGCGCTGGCTCCGAGGAATAGCCAAGAAAATGGGGACCGATAAAGAATTTTTGATTGAGCGAA
TGCAACCCAAAGATTGGTTAAAAACAGCAAGAGACAAATATCTTTATGGGCTGATTTATGGGCTAATTTCAGGATTGATT
TTTGGGCTAATTTTAGGGCTAATTGGAGGACTGATTTATGAGCTGACTGGAGATGTGATAAGAGGAGAGATTTTCGATTT
GATTTGCGATTCGACTATCGATGCGACTTGCAATTCGAATTTTAAGCCGATTTTTGAGCTGATTAGAGGGCTTAGATGGC
TACCCGAAGGGCTAATTTCTGGGCTAATTTTAGGGCTAATTTACGGGCTGATTGGAGGACTGATTGGAGGACTGATTGGA
GGGCAAAAACCTATTGTTCTTGTAGAAGCTTTAAAAATTTCAATGTCCCGAACAACGGGACGAGACATTTTGGCGTCGTT
GAGAAGAGAGCTAACTTATGGACTAAATAGAGGGCTAATTGTTGGGCTAATTGTTGGGCTAATTTTTGGGCTAATTGTTG
GGCTAACTAGAGGGCTAATTGGAGGGCTGATTTTCGGACTGATTGGAGGGCTGATTTTCGGACTGATTTTTGGGCTAATT
TTAGGGCTGATTGGAGGCTTAAAAGTCGATATTATAAAGCGGACTTTCCCAAATCAAGGTATTTGGGAATCTCTCAAAAC
TATGGTGATCACGGTTACAATATCGATTTTTTTTACGATTATTATTTATTTTTTCTTGAAAAATATTTTGCTTTCGTCCT
TAGACCCAAATTTAGTGAAACGCGTTATTCGATTAGTCATAGGGTTACCAATCATGGGAGCTTTTCTTGCAGGAGGAGGA
CTAACCTCTATTCAGCACTTTGCGATGCGTTTAGTCCTTTACCACACTAAGCAAATCCCCTGGAATTTTGTCACCTTTTT
TCAGCAAGCGGAAGATCGCCTTTTTATCTACCGCACAGGTGGTAGCTACGTCTTCGTTCACCGCTACCTCCAAGAACATT
TTGCCAACCTATCCTTCGACGAAACCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGATGGATAAGGTGCGGGTTACATGGATTGATGGGGGGTTGAAAAAATCTCTGAAGGAGCAGACTCGGATCTCGGTGA
GATTGGAGTAGAGGCCTAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCCTCAAGCATTCCGCGCCCGACAAAATAAATTTGGAAGCTGTCGCCGCAAAAACGTATAGCCAAAGGTAAACCAGTAAA
AGATATTGACCAACACCACC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 622; Mature: 622

Protein sequence:

>622_residues
MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKATDFRELKQPIPIVLNLSAWGS
QRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWTLLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIA
DYKALNTRLKGFQAAVYVQPLKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL
DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWLKTARDKYLYGLIYGLISGLI
FGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSNFKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIG
GQKPIVLVEALKISMSRTTGRDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI
LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVKRVIRLVIGLPIMGAFLAGGG
LTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTGGSYVFVHRYLQEHFANLSFDET

Sequences:

>Translated_622_residues
MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKATDFRELKQPIPIVLNLSAWGS
QRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWTLLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIA
DYKALNTRLKGFQAAVYVQPLKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL
DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWLKTARDKYLYGLIYGLISGLI
FGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSNFKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIG
GQKPIVLVEALKISMSRTTGRDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI
LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVKRVIRLVIGLPIMGAFLAGGG
LTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTGGSYVFVHRYLQEHFANLSFDET
>Mature_622_residues
MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKATDFRELKQPIPIVLNLSAWGS
QRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWTLLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIA
DYKALNTRLKGFQAAVYVQPLKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL
DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWLKTARDKYLYGLIYGLISGLI
FGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSNFKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIG
GQKPIVLVEALKISMSRTTGRDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI
LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVKRVIRLVIGLPIMGAFLAGGG
LTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTGGSYVFVHRYLQEHFANLSFDET

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69851; Mature: 69851

Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68

Prosite motif: PS50837 NACHT ; PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKAT
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
DFRELKQPIPIVLNLSAWGSQRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWT
CHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
LLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIADYKALNTRLKGFQAAVYVQP
HHCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC
LKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL
CCCHHHHHHHHCCCHHEEEHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCC
DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHH
KTARDKYLYGLIYGLISGLIFGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
FKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIGGQKPIVLVEALKISMSRTTG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCC
RDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVK
HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
RVIRLVIGLPIMGAFLAGGGLTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
GSYVFVHRYLQEHFANLSFDET
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVGVKWPSEGEEQQLLPPGTCLLDRFANLGSGGTLLVLGKPGAGKTTLLLELAQDLLKAT
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
DFRELKQPIPIVLNLSAWGSQRFPADGTLVFTKWLLEELWQQYLVRIEVGKTWLRQEKWT
CHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
LLLDGLDEVKPQYRDACVDALNQFRQKFGNIEIVLCCRIADYKALNTRLKGFQAAVYVQP
HHCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECC
LKDKQVNEYLQQGGEALVGLKKANSSKVNSSLRDLTNTPLFLRILTLAYCNRSPQELLHL
CCCHHHHHHHHCCCHHEEEHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCC
DKDQKLSLLFERYIERMFAQRPLSSEKEQQQMLRWLRGIAKKMGTDKEFLIERMQPKDWL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHH
KTARDKYLYGLIYGLISGLIFGLILGLIGGLIYELTGDVIRGEIFDLICDSTIDATCNSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
FKPIFELIRGLRWLPEGLISGLILGLIYGLIGGLIGGLIGGQKPIVLVEALKISMSRTTG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCC
RDILASLRRELTYGLNRGLIVGLIVGLIFGLIVGLTRGLIGGLIFGLIGGLIFGLIFGLI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGLIGGLKVDIIKRTFPNQGIWESLKTMVITVTISIFFTIIIYFFLKNILLSSLDPNLVK
HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
RVIRLVIGLPIMGAFLAGGGLTSIQHFAMRLVLYHTKQIPWNFVTFFQQAEDRLFIYRTG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
GSYVFVHRYLQEHFANLSFDET
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA