| Definition | Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009925 |
| Length | 6,503,724 |
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The map label for this gene is 158333582
Identifier: 158333582
GI number: 158333582
Start: 351995
End: 353557
Strand: Reverse
Name: 158333582
Synonym: AM1_0383
Alternate gene names: NA
Gene position: 353557-351995 (Counterclockwise)
Preceding gene: 158333583
Following gene: 158333581
Centisome position: 5.44
GC content: 29.88
Gene sequence:
>1563_bases ATGTCATTAATCAGATCTAATTATTTTTTTAGTAAAACTCGTCCATTCGTATTGGCTTTACCATGGATAGGTTTGTTTAC TCAGATAGCTATTAATACTGAAACATCTAATGCAAACTATTCATTTATAGCTGCAGCTGTTAGTAATTTGTTTATTCTTT ATCTTTATCAACCCTACCAATGGTATAAGTTTCCAATTTCCTCTCTAGCCTTAACTGGGTATTGCATCCTTTATGCTCTA GGACCTTTGTTGCTAACTGCATTAGAGCAGCGCCCAATTATCTATGATCTAGAAGTTCCTGAAGATCTATTTCTTCATAT TGTTTTATGTACTGGAACATTAATTTTTTCTCATTTTATATATACTCAAACTAATCTATTCCAAATAATAAGACAAAAAA TTACCCTCTATCTTGATAGAAATTTAAATATTTTCCAAAAGTTAGATACTTTTAGCATAGCTATATTAAGTTTCTTTGGA TTGATCTCTATGATTTTAGTCTACTGGTTGAATAGAGGAAATGATGTAGCCATCATTAAACTTATACAAGGTTTTATTAA TTTTGCTTATTTCCCTTTAACTGCATTATTAATTCAATTGTGTAATGAGAGCAAAAAAGTTACTAAAGTAGATTGGTTGC TCAACTTTCTGTTTTTGGTATTGATTTTTATTGTTGCTTTAGGAAGAAATTCTCGTGCTACTTTTGCAATACCCATCGCA ACCTATGGAATTGGTGTTTTTCTTTTATGGATATATCAATACATAAAAATTAGATTTAAAGTTATTGTTTCAATTCTAAT TCTCATTATTTTTATAGTGCCACTAGCTTCTAATCTAGCTACTTCAATGGTTATGGTAAGAGCCTTGCGCAGAGATATTC CATCAGAGGAATTGTTAGTTAAAACAATAGATCAGTTATCAGATATAGAAAGCATTGAACAATATAGGGTTAAAACAGAT GTTGATCGCCTAAGTGGCTATGATGAAAAATATCTTAGCAATCCATTCTTGCGCCGTTTTGTAAATTTAAAGTTTGCAGA TATATCATTGAAATTAGGGAATCAATTAGATCATGCATCTCGGATTGAATTTAGAGAATTTTCAATTAATCGACTGCTCT CTATTTTTCCAGCTCCATTTCTTAGTTTTTTAGGTTTTTCTTCAGAGTTTAAAAAACAAGCGCTGAGTGTAAGTTGGGGT GATCAGCTTTTTTTCTTGATTACAAGAAATAAATATTTCTTAGGTAGGTTTTGGATTGGTCATTTCTTTGGAACTAGCCT AGCGGCGTTTGGATTTTTATATTTATTTTTTCTAGGTATATTGTCAATAATAATTTTTATACTCTTGGATGCACTTGTAA TAACTAATGTTAGTTGCTCTCAAAACCCAATATTTTCACCAGTTGCAATAATAAATATTTATTCATTTTTTACCATTTTT AATGTAGGATCAATAGTCGATTTATCAATATTTATTTTTAGAGAATGGATGCAGGTAATATTTCTGTACCTTATTTTTTG TAAAATGCTCGTTGCAGTCAGTAGAAGTTTAAAATTAGCCTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATTATGAGTAAAATTTGGTATTTTGGAGATAGTAATTTTAATTCAAATTCTTACCGACGATATCTTACTTTACTCAG GCTTGGCAATTCAGTGAGTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 520; Mature: 519
Protein sequence:
>520_residues MSLIRSNYFFSKTRPFVLALPWIGLFTQIAINTETSNANYSFIAAAVSNLFILYLYQPYQWYKFPISSLALTGYCILYAL GPLLLTALEQRPIIYDLEVPEDLFLHIVLCTGTLIFSHFIYTQTNLFQIIRQKITLYLDRNLNIFQKLDTFSIAILSFFG LISMILVYWLNRGNDVAIIKLIQGFINFAYFPLTALLIQLCNESKKVTKVDWLLNFLFLVLIFIVALGRNSRATFAIPIA TYGIGVFLLWIYQYIKIRFKVIVSILILIIFIVPLASNLATSMVMVRALRRDIPSEELLVKTIDQLSDIESIEQYRVKTD VDRLSGYDEKYLSNPFLRRFVNLKFADISLKLGNQLDHASRIEFREFSINRLLSIFPAPFLSFLGFSSEFKKQALSVSWG DQLFFLITRNKYFLGRFWIGHFFGTSLAAFGFLYLFFLGILSIIIFILLDALVITNVSCSQNPIFSPVAIINIYSFFTIF NVGSIVDLSIFIFREWMQVIFLYLIFCKMLVAVSRSLKLA
Sequences:
>Translated_520_residues MSLIRSNYFFSKTRPFVLALPWIGLFTQIAINTETSNANYSFIAAAVSNLFILYLYQPYQWYKFPISSLALTGYCILYAL GPLLLTALEQRPIIYDLEVPEDLFLHIVLCTGTLIFSHFIYTQTNLFQIIRQKITLYLDRNLNIFQKLDTFSIAILSFFG LISMILVYWLNRGNDVAIIKLIQGFINFAYFPLTALLIQLCNESKKVTKVDWLLNFLFLVLIFIVALGRNSRATFAIPIA TYGIGVFLLWIYQYIKIRFKVIVSILILIIFIVPLASNLATSMVMVRALRRDIPSEELLVKTIDQLSDIESIEQYRVKTD VDRLSGYDEKYLSNPFLRRFVNLKFADISLKLGNQLDHASRIEFREFSINRLLSIFPAPFLSFLGFSSEFKKQALSVSWG DQLFFLITRNKYFLGRFWIGHFFGTSLAAFGFLYLFFLGILSIIIFILLDALVITNVSCSQNPIFSPVAIINIYSFFTIF NVGSIVDLSIFIFREWMQVIFLYLIFCKMLVAVSRSLKLA >Mature_519_residues SLIRSNYFFSKTRPFVLALPWIGLFTQIAINTETSNANYSFIAAAVSNLFILYLYQPYQWYKFPISSLALTGYCILYALG PLLLTALEQRPIIYDLEVPEDLFLHIVLCTGTLIFSHFIYTQTNLFQIIRQKITLYLDRNLNIFQKLDTFSIAILSFFGL ISMILVYWLNRGNDVAIIKLIQGFINFAYFPLTALLIQLCNESKKVTKVDWLLNFLFLVLIFIVALGRNSRATFAIPIAT YGIGVFLLWIYQYIKIRFKVIVSILILIIFIVPLASNLATSMVMVRALRRDIPSEELLVKTIDQLSDIESIEQYRVKTDV DRLSGYDEKYLSNPFLRRFVNLKFADISLKLGNQLDHASRIEFREFSINRLLSIFPAPFLSFLGFSSEFKKQALSVSWGD QLFFLITRNKYFLGRFWIGHFFGTSLAAFGFLYLFFLGILSIIIFILLDALVITNVSCSQNPIFSPVAIINIYSFFTIFN VGSIVDLSIFIFREWMQVIFLYLIFCKMLVAVSRSLKLA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60031; Mature: 59900
Theoretical pI: Translated: 9.58; Mature: 9.58
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSLIRSNYFFSKTRPFVLALPWIGLFTQIAINTETSNANYSFIAAAVSNLFILYLYQPYQ CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCH WYKFPISSLALTGYCILYALGPLLLTALEQRPIIYDLEVPEDLFLHIVLCTGTLIFSHFI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTQTNLFQIIRQKITLYLDRNLNIFQKLDTFSIAILSFFGLISMILVYWLNRGNDVAIIK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH LIQGFINFAYFPLTALLIQLCNESKKVTKVDWLLNFLFLVLIFIVALGRNSRATFAIPIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHH TYGIGVFLLWIYQYIKIRFKVIVSILILIIFIVPLASNLATSMVMVRALRRDIPSEELLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH KTIDQLSDIESIEQYRVKTDVDRLSGYDEKYLSNPFLRRFVNLKFADISLKLGNQLDHAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHH RIEFREFSINRLLSIFPAPFLSFLGFSSEFKKQALSVSWGDQLFFLITRNKYFLGRFWIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHH HFFGTSLAAFGFLYLFFLGILSIIIFILLDALVITNVSCSQNPIFSPVAIINIYSFFTIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH NVGSIVDLSIFIFREWMQVIFLYLIFCKMLVAVSRSLKLA HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure SLIRSNYFFSKTRPFVLALPWIGLFTQIAINTETSNANYSFIAAAVSNLFILYLYQPYQ CCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCH WYKFPISSLALTGYCILYALGPLLLTALEQRPIIYDLEVPEDLFLHIVLCTGTLIFSHFI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTQTNLFQIIRQKITLYLDRNLNIFQKLDTFSIAILSFFGLISMILVYWLNRGNDVAIIK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH LIQGFINFAYFPLTALLIQLCNESKKVTKVDWLLNFLFLVLIFIVALGRNSRATFAIPIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHH TYGIGVFLLWIYQYIKIRFKVIVSILILIIFIVPLASNLATSMVMVRALRRDIPSEELLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH KTIDQLSDIESIEQYRVKTDVDRLSGYDEKYLSNPFLRRFVNLKFADISLKLGNQLDHAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHH RIEFREFSINRLLSIFPAPFLSFLGFSSEFKKQALSVSWGDQLFFLITRNKYFLGRFWIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHH HFFGTSLAAFGFLYLFFLGILSIIIFILLDALVITNVSCSQNPIFSPVAIINIYSFFTIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH NVGSIVDLSIFIFREWMQVIFLYLIFCKMLVAVSRSLKLA HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA