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The map label for this gene is 157962985

Identifier: 157962985

GI number: 157962985

Start: 3879732

End: 3881903

Strand: Reverse

Name: 157962985

Synonym: Spea_3168

Alternate gene names: NA

Gene position: 3881903-3879732 (Counterclockwise)

Preceding gene: 157962986

Following gene: 157962983

Centisome position: 75.02

GC content: 44.29

Gene sequence:

>2172_bases
GTGCGCACCATCTGGCATATTCAGCGATATCCAATAATCATGTTTATGGTTATCGCTGCCGCGTTACTTATTTCGCTGAT
GGGGTTTCATCGGCTCAATCTTGATGTGGATTTTAGCGATTACTTTGCCCCTTCTGATCCACGATTTGTGGCGTTTAACA
GCATGATGGAAAAGTTTGAACGTCATGATCAGCTTTGGTTGCTGCTAGAGACTCAACAAGATTGGCGCGACAAGGAGCCA
CAAGCCCAGTTAATTAACTTCATAGATAAGCTTAAAGCCAGTCAAGATATTGTGAGTATTCAGGGCTATAACCAGTTTGT
ACAAGGCACAGCTAAAGAAGATAAGATCTTAAATTATAAAGCTCATCCTCGGCTGGCTTCGGTGCTGTCGGCAAATGGCC
AAGGGCTCTTGCTGCAGTTGCGCTTGAGTAATCATAGAGTCCAAGACTTTAAAACTCAGAGTCTGTGGTTAGATGATGTA
TTGCAAAGAATGGATAGTGATAGTAGCGAATATTGGCAGCCTTTAGGGGTCAATACATACTTTAATGGTACCCACGCGCT
GAATTGGCAATATGCTAGAGTACTCAGCCATGACTTGAGTTGGTTTGCCCCAGCCTTATTAGGCATCATCTTGTTGATGG
CGGTGCTGTTTATAAGGCAAAAGCTATGGGTTTTAGCGCTCTGTATCAACTGCGGCATTACTTTAGTATTAAGTATGGGG
CTTGCCGCTTGGTTAAAGCTGACTCTGACGGCGATTACAGCTTTTGTGCCAGTGATTATCGTCACCCTTGGCTTAGCTTA
TGCGTCTCACCTTTATTTTGGCTGGCGTGGTGAGATTAATCGTGGTCAAACGAATGAGCAAGCCTTGCGCCACGCGGTTA
AGATCAATCAGGCGCCGCTATTTTACTCTAGCATCACCACGATATTTGGCTTTAGTCTGTTAATGTTTAGCCCATCCCCT
CCTATTCAAAGCTTTGGTTTGCTGGTGGCGTTTGCAGTGCTGTGCAATTATCTATTGACTCTAACAATTCTGCTTTTTTT
CGCTCGTCACTCGAAGCCATCAATGACTAAAGGGCTAGACTTTTCCGGGGTGGTAGCCATTGCTAAATGGAATGCTGGAC
AACCTATGGCTGTGATGACGGGCATAGTGTTGATAAGCGCCTTTGCACTGGTTAGTGTGTCTAAGCTGACGTTAAATGAT
GACCCATTAAGTTACTTTGAATCATCAAACCCTTTTAGTCTTTCAAGCGAAAAAATGACCCAATATTTCTCGGGAATTAA
TTTACAGCATTATGTGGTGTCGAGTGCTGCCAATGAGCAGCTTGCTAAGGCCGAGATTAGTTTTATCTATAAATTTAGTC
GTTTCTTAAAGCGCCAGCCACAGGTGGTCAAGGTACAGCATATCGGTGATTGGATTAAGAGTGCTGGAGTGGGCCAGAAT
CAGTTTAAACAGATCTTGGCCAACAACTCTGTTACTGATCTTGGGCTTGCCGGAGAGCTGTCGGCAGATAAACAATCGAG
TTTAGTGACGCTATATTTGCAGCCGATGACTGCGATGGAGTTAATCGCCTTCGAGCACAAGGTAGGTGATTGGCTCGCTG
AGCATTCTACCAAGGTTATGGTGAGTGCCCCCATAGCCAGTAACTTAATGTTTGCTCATCTCAGCGTTGAAAATGCTAAT
AATATGCTGCTGTCATTCGCCGTGGCGCTGATTGTTTTGGCGATTTTACTGTGTGTATTGAAGCGTTCAATCATCTTTGG
GGTTATGGGGTTATTATTGAATTTTTTACCTCTGCTATGGGTTTTTGCTCTTTGGCAACTAAATGGCGGCTTTATTAGTT
TAGGAACTGCTGTAGTACTAGGTATGATGCTAGGGATTATCGTCGATGATACTCTGCATTTGATGTTAAAGCTGCCCGAT
AGCAAGGTGTTAAGCGAGCGTGCGATATGGCTGAGTCTGTACAAGGTGTTGCCGGTTATTAGCTTTACCACCCTGACTAT
CGCGCTGGGGTTTTCAATTGGTTTGCTATCGGCGTTTGCTCCTATCGTTCATTTGAGCTTACTGTCTTGTTTAGTGGTGA
TTTTTGCTTGGGGCTTCGATGTGTTGATGTTGCCAGTGCTCTATCGACGTTGGATTTCTTCAAGGCTTTATAAGGAGGGT
AACTCTAGCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTCGACGCAGTGATGTGGAAGGCGACTTTGCTAGGCTTTATAGACTACTCATTGCTAACAGCTAATTGAAATACCGGGA
GAGATTGATTGGGTTACCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGGTATAAATAGCTTACGACTGCGCGCGGTAACAAGATCCGTCGAAAATTGAATAAAAAAATAAAGGCCTCAAAAAGAG
GCCTTTATTTATTGTAAAAC

Product: exporter of the RND superfamily protein-like protein

Products: NA

Alternate protein names: Exporter Of RND Superfamily; RND Superfamily Exporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Integral Membrane Protein; RND Family Efflux Transporter; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Patched Family Protein

Number of amino acids: Translated: 723; Mature: 723

Protein sequence:

>723_residues
MRTIWHIQRYPIIMFMVIAAALLISLMGFHRLNLDVDFSDYFAPSDPRFVAFNSMMEKFERHDQLWLLLETQQDWRDKEP
QAQLINFIDKLKASQDIVSIQGYNQFVQGTAKEDKILNYKAHPRLASVLSANGQGLLLQLRLSNHRVQDFKTQSLWLDDV
LQRMDSDSSEYWQPLGVNTYFNGTHALNWQYARVLSHDLSWFAPALLGIILLMAVLFIRQKLWVLALCINCGITLVLSMG
LAAWLKLTLTAITAFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRGEINRGQTNEQALRHAVKINQAPLFYSSITTIFGFSLLMFSPSP
PIQSFGLLVAFAVLCNYLLTLTILLFFARHSKPSMTKGLDFSGVVAIAKWNAGQPMAVMTGIVLISAFALVSVSKLTLND
DPLSYFESSNPFSLSSEKMTQYFSGINLQHYVVSSAANEQLAKAEISFIYKFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSAGVGQN
QFKQILANNSVTDLGLAGELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEHKVGDWLAEHSTKVMVSAPIASNLMFAHLSVENAN
NMLLSFAVALIVLAILLCVLKRSIIFGVMGLLLNFLPLLWVFALWQLNGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPD
SKVLSERAIWLSLYKVLPVISFTTLTIALGFSIGLLSAFAPIVHLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWISSRLYKEG
NSS

Sequences:

>Translated_723_residues
MRTIWHIQRYPIIMFMVIAAALLISLMGFHRLNLDVDFSDYFAPSDPRFVAFNSMMEKFERHDQLWLLLETQQDWRDKEP
QAQLINFIDKLKASQDIVSIQGYNQFVQGTAKEDKILNYKAHPRLASVLSANGQGLLLQLRLSNHRVQDFKTQSLWLDDV
LQRMDSDSSEYWQPLGVNTYFNGTHALNWQYARVLSHDLSWFAPALLGIILLMAVLFIRQKLWVLALCINCGITLVLSMG
LAAWLKLTLTAITAFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRGEINRGQTNEQALRHAVKINQAPLFYSSITTIFGFSLLMFSPSP
PIQSFGLLVAFAVLCNYLLTLTILLFFARHSKPSMTKGLDFSGVVAIAKWNAGQPMAVMTGIVLISAFALVSVSKLTLND
DPLSYFESSNPFSLSSEKMTQYFSGINLQHYVVSSAANEQLAKAEISFIYKFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSAGVGQN
QFKQILANNSVTDLGLAGELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEHKVGDWLAEHSTKVMVSAPIASNLMFAHLSVENAN
NMLLSFAVALIVLAILLCVLKRSIIFGVMGLLLNFLPLLWVFALWQLNGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPD
SKVLSERAIWLSLYKVLPVISFTTLTIALGFSIGLLSAFAPIVHLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWISSRLYKEG
NSS
>Mature_723_residues
MRTIWHIQRYPIIMFMVIAAALLISLMGFHRLNLDVDFSDYFAPSDPRFVAFNSMMEKFERHDQLWLLLETQQDWRDKEP
QAQLINFIDKLKASQDIVSIQGYNQFVQGTAKEDKILNYKAHPRLASVLSANGQGLLLQLRLSNHRVQDFKTQSLWLDDV
LQRMDSDSSEYWQPLGVNTYFNGTHALNWQYARVLSHDLSWFAPALLGIILLMAVLFIRQKLWVLALCINCGITLVLSMG
LAAWLKLTLTAITAFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRGEINRGQTNEQALRHAVKINQAPLFYSSITTIFGFSLLMFSPSP
PIQSFGLLVAFAVLCNYLLTLTILLFFARHSKPSMTKGLDFSGVVAIAKWNAGQPMAVMTGIVLISAFALVSVSKLTLND
DPLSYFESSNPFSLSSEKMTQYFSGINLQHYVVSSAANEQLAKAEISFIYKFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSAGVGQN
QFKQILANNSVTDLGLAGELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEHKVGDWLAEHSTKVMVSAPIASNLMFAHLSVENAN
NMLLSFAVALIVLAILLCVLKRSIIFGVMGLLLNFLPLLWVFALWQLNGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPD
SKVLSERAIWLSLYKVLPVISFTTLTIALGFSIGLLSAFAPIVHLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWISSRLYKEG
NSS

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80929; Mature: 80929

Theoretical pI: Translated: 9.09; Mature: 9.09

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRTIWHIQRYPIIMFMVIAAALLISLMGFHRLNLDVDFSDYFAPSDPRFVAFNSMMEKFE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
RHDQLWLLLETQQDWRDKEPQAQLINFIDKLKASQDIVSIQGYNQFVQGTAKEDKILNYK
CCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHCCCCCCCCEECCC
AHPRLASVLSANGQGLLLQLRLSNHRVQDFKTQSLWLDDVLQRMDSDSSEYWQPLGVNTY
CCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCEE
FNGTHALNWQYARVLSHDLSWFAPALLGIILLMAVLFIRQKLWVLALCINCGITLVLSMG
ECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAAWLKLTLTAITAFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRGEINRGQTNEQALRHAVKINQAPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCH
FYSSITTIFGFSLLMFSPSPPIQSFGLLVAFAVLCNYLLTLTILLFFARHSKPSMTKGLD
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
FSGVVAIAKWNAGQPMAVMTGIVLISAFALVSVSKLTLNDDPLSYFESSNPFSLSSEKMT
CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHH
QYFSGINLQHYVVSSAANEQLAKAEISFIYKFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSAGVGQN
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHH
QFKQILANNSVTDLGLAGELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEHKVGDWLAEHSTKVM
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
VSAPIASNLMFAHLSVENANNMLLSFAVALIVLAILLCVLKRSIIFGVMGLLLNFLPLLW
EECCHHHCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFALWQLNGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPDSKVLSERAIWLSLYKVLPVI
HHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFTTLTIALGFSIGLLSAFAPIVHLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWISSRLYKEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NSS
CCC
>Mature Secondary Structure
MRTIWHIQRYPIIMFMVIAAALLISLMGFHRLNLDVDFSDYFAPSDPRFVAFNSMMEKFE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
RHDQLWLLLETQQDWRDKEPQAQLINFIDKLKASQDIVSIQGYNQFVQGTAKEDKILNYK
CCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHCCCCCCCCEECCC
AHPRLASVLSANGQGLLLQLRLSNHRVQDFKTQSLWLDDVLQRMDSDSSEYWQPLGVNTY
CCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCEE
FNGTHALNWQYARVLSHDLSWFAPALLGIILLMAVLFIRQKLWVLALCINCGITLVLSMG
ECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAAWLKLTLTAITAFVPVIIVTLGLAYASHLYFGWRGEINRGQTNEQALRHAVKINQAPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCH
FYSSITTIFGFSLLMFSPSPPIQSFGLLVAFAVLCNYLLTLTILLFFARHSKPSMTKGLD
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
FSGVVAIAKWNAGQPMAVMTGIVLISAFALVSVSKLTLNDDPLSYFESSNPFSLSSEKMT
CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHH
QYFSGINLQHYVVSSAANEQLAKAEISFIYKFSRFLKRQPQVVKVQHIGDWIKSAGVGQN
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHH
QFKQILANNSVTDLGLAGELSADKQSSLVTLYLQPMTAMELIAFEHKVGDWLAEHSTKVM
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
VSAPIASNLMFAHLSVENANNMLLSFAVALIVLAILLCVLKRSIIFGVMGLLLNFLPLLW
EECCHHHCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFALWQLNGGFISLGTAVVLGMMLGIIVDDTLHLMLKLPDSKVLSERAIWLSLYKVLPVI
HHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFTTLTIALGFSIGLLSAFAPIVHLSLLSCLVVIFAWGFDVLMLPVLYRRWISSRLYKEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NSS
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA