| Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009901 |
| Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is 157960544
Identifier: 157960544
GI number: 157960544
Start: 881772
End: 885446
Strand: Direct
Name: 157960544
Synonym: Spea_0716
Alternate gene names: NA
Gene position: 881772-885446 (Clockwise)
Preceding gene: 157960543
Following gene: 157960545
Centisome position: 17.04
GC content: 50.69
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ACTAGACCTAACACTAGATCTAACATTAGACCTGACATTTTTAGCTTAATGTAAGCCCAATGCGCTTACCGTTACGGCTC TGTTTGGATTAAGGAATGCA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAGCCAAGTAACCGAAACCGCTATCGTAGGCACCAGTGCCTTAATCGAACGTTTGTTAAAAGGCCAGTTTATCTGCCGT ACTACCGATGAAGACGGCTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: SMC Domain-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 1224; Mature: 1223
Protein sequence:
>1224_residues MPSLNRIILIDTHLPGVVELALDGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYIK SDGLAYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELEDYIKTKQGDSIQCFTMAELGREMKRAGVAVTNLLNTREYRAIIQNDRAL LSTGSNRNELRNYARQFSLCEAEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETIKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL IQGFEQIRPEFEKLEQEFDQLLSTEQRLASLRRGYSKDETTEIERQEHHQDLSKALNAQLRQLDEEWKEQRDELNLDLSA AKGDVAKCEHELDSIEDQHASFQDADIEQAKSDLEQLPSWRGSLENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEGLNREL ENLHQEQDILRESRDKQREIGRSELAELEAQWRESTEKGQAQFSEQAYQLKVNAAELKVRVDSVTYSEDEKLALAVFDER ISRADEDQEACNAKVDRLTSEERKLRAKRDQANESLRVAGIRVTERQSELEELTHMLFPQSHTLLEFLRKEAAGWENTLG KVINSELLHRSDLHPSISSESLEALYGIALDLKAIDAPEYAASEQELRVKHAAAEEALSSAKELQAEAEDILVASNSELD KLLRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDDKRAEQEKINLALNERKAASQKQLARIDSDIKQLQGQQQEWLEEQKEQALEARME KNAYWQEVVGALDSQLNQVKSNIHSRREHAASEQKACEQWYKNELKSRGVDEAKIVALKAEIRTLESNISKAEQRRSEVL RYDDWYQHTWLKRKPKLQSELSKVKHDSLDLEQQLKSKANEVKAKRNELDGERKQSDAVQIEASENLTKLRSVMRKLSEL KLPASNDDAQGSLTERLRQGEDQLLKRDSLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLSETWERAREESSFVNDKGIRILDYRKL VPQLEQLLNVMVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVKIRSRISELEF WPELEQFVKAFKRWKADGFNDLPGEDYTNSMRRALDIIGRAALSGGIAKLLEIELRLKEGNSDLVIRTDRQLNESSSHGM AYLILCKFLLAFTRLLRGRAEVTIHWPIDELGTLHHGNVKKIFDACENNNISVLGAFPNPESEVLNLFANRYIINKQTKK LQVVKPQVNPIAEKLNQRRTQEAV
Sequences:
>Translated_1224_residues MPSLNRIILIDTHLPGVVELALDGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYIK SDGLAYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELEDYIKTKQGDSIQCFTMAELGREMKRAGVAVTNLLNTREYRAIIQNDRAL LSTGSNRNELRNYARQFSLCEAEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETIKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL IQGFEQIRPEFEKLEQEFDQLLSTEQRLASLRRGYSKDETTEIERQEHHQDLSKALNAQLRQLDEEWKEQRDELNLDLSA AKGDVAKCEHELDSIEDQHASFQDADIEQAKSDLEQLPSWRGSLENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEGLNREL ENLHQEQDILRESRDKQREIGRSELAELEAQWRESTEKGQAQFSEQAYQLKVNAAELKVRVDSVTYSEDEKLALAVFDER ISRADEDQEACNAKVDRLTSEERKLRAKRDQANESLRVAGIRVTERQSELEELTHMLFPQSHTLLEFLRKEAAGWENTLG KVINSELLHRSDLHPSISSESLEALYGIALDLKAIDAPEYAASEQELRVKHAAAEEALSSAKELQAEAEDILVASNSELD KLLRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDDKRAEQEKINLALNERKAASQKQLARIDSDIKQLQGQQQEWLEEQKEQALEARME KNAYWQEVVGALDSQLNQVKSNIHSRREHAASEQKACEQWYKNELKSRGVDEAKIVALKAEIRTLESNISKAEQRRSEVL RYDDWYQHTWLKRKPKLQSELSKVKHDSLDLEQQLKSKANEVKAKRNELDGERKQSDAVQIEASENLTKLRSVMRKLSEL KLPASNDDAQGSLTERLRQGEDQLLKRDSLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLSETWERAREESSFVNDKGIRILDYRKL VPQLEQLLNVMVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVKIRSRISELEF WPELEQFVKAFKRWKADGFNDLPGEDYTNSMRRALDIIGRAALSGGIAKLLEIELRLKEGNSDLVIRTDRQLNESSSHGM AYLILCKFLLAFTRLLRGRAEVTIHWPIDELGTLHHGNVKKIFDACENNNISVLGAFPNPESEVLNLFANRYIINKQTKK LQVVKPQVNPIAEKLNQRRTQEAV >Mature_1223_residues PSLNRIILIDTHLPGVVELALDGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYIKS DGLAYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELEDYIKTKQGDSIQCFTMAELGREMKRAGVAVTNLLNTREYRAIIQNDRALL STGSNRNELRNYARQFSLCEAEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETIKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQLI QGFEQIRPEFEKLEQEFDQLLSTEQRLASLRRGYSKDETTEIERQEHHQDLSKALNAQLRQLDEEWKEQRDELNLDLSAA KGDVAKCEHELDSIEDQHASFQDADIEQAKSDLEQLPSWRGSLENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEGLNRELE NLHQEQDILRESRDKQREIGRSELAELEAQWRESTEKGQAQFSEQAYQLKVNAAELKVRVDSVTYSEDEKLALAVFDERI SRADEDQEACNAKVDRLTSEERKLRAKRDQANESLRVAGIRVTERQSELEELTHMLFPQSHTLLEFLRKEAAGWENTLGK VINSELLHRSDLHPSISSESLEALYGIALDLKAIDAPEYAASEQELRVKHAAAEEALSSAKELQAEAEDILVASNSELDK LLRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDDKRAEQEKINLALNERKAASQKQLARIDSDIKQLQGQQQEWLEEQKEQALEARMEK NAYWQEVVGALDSQLNQVKSNIHSRREHAASEQKACEQWYKNELKSRGVDEAKIVALKAEIRTLESNISKAEQRRSEVLR YDDWYQHTWLKRKPKLQSELSKVKHDSLDLEQQLKSKANEVKAKRNELDGERKQSDAVQIEASENLTKLRSVMRKLSELK LPASNDDAQGSLTERLRQGEDQLLKRDSLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLSETWERAREESSFVNDKGIRILDYRKLV PQLEQLLNVMVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVKIRSRISELEFW PELEQFVKAFKRWKADGFNDLPGEDYTNSMRRALDIIGRAALSGGIAKLLEIELRLKEGNSDLVIRTDRQLNESSSHGMA YLILCKFLLAFTRLLRGRAEVTIHWPIDELGTLHHGNVKKIFDACENNNISVLGAFPNPESEVLNLFANRYIINKQTKKL QVVKPQVNPIAEKLNQRRTQEAV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 140104; Mature: 139973
Theoretical pI: Translated: 5.58; Mature: 5.58
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPSLNRIILIDTHLPGVVELALDGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRD CCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH SFERWYLPHDSSYIIYEYIKSDGLAYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELEDYIKTKQGD HHHHCCCCCCCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCC SIQCFTMAELGREMKRAGVAVTNLLNTREYRAIIQNDRALLSTGSNRNELRNYARQFSLC CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH EAEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETIKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH IQGFEQIRPEFEKLEQEFDQLLSTEQRLASLRRGYSKDETTEIERQEHHQDLSKALNAQL HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RQLDEEWKEQRDELNLDLSAAKGDVAKCEHELDSIEDQHASFQDADIEQAKSDLEQLPSW HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH RGSLENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEGLNRELENLHQEQDILRESRDKQREI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GRSELAELEAQWRESTEKGQAQFSEQAYQLKVNAAELKVRVDSVTYSEDEKLALAVFDER 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA