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The map label for this gene is yfbS [C]

Identifier: 157960493

GI number: 157960493

Start: 824369

End: 826093

Strand: Direct

Name: yfbS [C]

Synonym: Spea_0665

Alternate gene names: 157960493

Gene position: 824369-826093 (Clockwise)

Preceding gene: 157960492

Following gene: 157960494

Centisome position: 15.93

GC content: 49.68

Gene sequence:

>1725_bases
GTGCCTGAATTGTGGGTGTTATCGTGCATATTGTTTGCCTTAGTCATCGCCTTAATGGCGGGGCTATGGACACCTGCTGC
GCTGTTTTTTATCGCATCGTTAACCACTTACCTGCTTGGCATGGTGGAGCTTGAAACTGCGCTTTCAAGTTTTACCAATG
CCAGCTTAGTCACTTTAGTGCTGTTGATCATGTCGACAGCCGCGCTAGAGAAGACATCGCTCCTTGGCAAGTTGAGTCAA
GTGATAGGGCGAGGCTCATTGGCATCGACCATGGCAAAGCTTGGTATTTCAACCGCCTTGCTGTCATCGTTTACCAATAA
CACCGCGGTGGTGGCTTCGCTCATTGCTGTTGTGCGTAGAAACCAAGCCCATGCACCGGCTAAGTTGTTACTGCCACTGT
CTTACGCGGCGATTTTGGGGGGCACTTTGACCCTGATCGGCACCTCGACCAATTTGATTGTGAACTCCTTTGTCGAGAAC
GCGGGCTTGGTGCCTTTAGGCTTTTTTGAGTTTTCCATGATTGGCATAGTGATTGTCACCGCCGGCGTTGGTTTATTGGT
GCTATTAGCCAATTGGCTGCCCGATAGACGCGATGAGAGTCTGGATGAAGCCTTGCCCTATCTGCTCGAAGCCAGAGTGG
CGAAAGAGTCAAAGTTGATAGGCAAGAGCGTACAAGATAATCGCTTACGCGCGCTGAAAAAACTGTATCTGGTTGAGCTT
GAGCGCAGCGGCATTCGCATCTGCCCGGTGCCGCCTCACTTGGTACTGCAAAGCGAAGATATTTTACGCTTTAGTGGCGC
GGTGGAATCGGTTGAATTGCTGCATCAATTCGACGGCCTAGAGTGGTTTGGTAAACAGCAGGCAAAGGGACAGAACCTGA
TAGAAGCGGTACTAGCACCGAGTTCAACCTTAGTCGGTCGCTCATTAAAGCAGTCGACCTTTAGAGAGAAGTTTGATGGT
GCAGTACTCGCGATTCGTCGCGGTCATCAACCTTTAAAAGGTGGTCTTGGAGACATAGAGTTACAAGCGGGAGATGTGCT
ACTCGTCACCCCTGGAGATGGTTTTTGCAGTAACACTAAGTTGGCATCAGAGTTTGCCGCCGTAAGTGGTTTAGATTTGA
GTGTCAGGCTGGATCCTCGCCGCAGCCAATGGGTACTAGCTGGCTTTCTAGTGACGATTTTGGCCAGCCTCACAGGTGTC
CTCCCTTTGGTTAAGGGGCTTATTTTGCTCTTGATGAGCTATATCGCCATCGGGGCGGTGAGTTTATCTGAACTGAAAAG
GCGTTTTCCTTTCGAGCTGGTGGTCATAGTCGGCAGCGCTTTAAGCCTAGCTAATCTGATGCTCTCGACTGGACTTGCCG
ATGACATCGCCTCATTTATCTTGGGGGCGATTAATGGCTACGGAGTATTTGCAGCGTTTGTGGCCGTGTATTTTATGACG
CTGCTACTGACAGAGCTTATCACCAATAATGCCGCTGCGGCGCTAGCTTTTCCGGTCGCTTATGCCATCGCCCTGAGTTA
CGGCGTCGATACTCGCCCGTTTATTTTAGCAGTGGTATTTGGCGCCAGTGCTAGCTTTATTTCGCCCTATGGTTATCAGA
CCAACTTGATGGTCTATAACGCGGGCAACTATCGATTTAGTGATTTTGTACGTGTTGGACTGCCGTTGTCGTTGCTGTAC
TCGGCAATTGTATTGTTATTGGTACCCGTGTTTTTTCCATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCAGCAATACAGTGAATTTGAGCTAGAGCTTAATGCGTTAATTCGTAAGCAGTATCCTCACTGGAATGCGATCGACATC
AGTAAGGTCGAGGGTTAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTTCTCCATTTTGGGGAACGGATAGACGTCTGCTTGGATGGTGTGAGCGCATCTAGCTATTGTATAGATTATATTTTTG
GAGTTTTTTATGTCTGATAT

Product: TrkA domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 574; Mature: 573

Protein sequence:

>574_residues
MPELWVLSCILFALVIALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALSSFTNASLVTLVLLIMSTAALEKTSLLGKLSQ
VIGRGSLASTMAKLGISTALLSSFTNNTAVVASLIAVVRRNQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVEN
AGLVPLGFFEFSMIGIVIVTAGVGLLVLLANWLPDRRDESLDEALPYLLEARVAKESKLIGKSVQDNRLRALKKLYLVEL
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDILRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAPSSTLVGRSLKQSTFREKFDG
AVLAIRRGHQPLKGGLGDIELQAGDVLLVTPGDGFCSNTKLASEFAAVSGLDLSVRLDPRRSQWVLAGFLVTILASLTGV
LPLVKGLILLLMSYIAIGAVSLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYFMT
LLLTELITNNAAAALAFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYNAGNYRFSDFVRVGLPLSLLY
SAIVLLLVPVFFPF

Sequences:

>Translated_574_residues
MPELWVLSCILFALVIALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALSSFTNASLVTLVLLIMSTAALEKTSLLGKLSQ
VIGRGSLASTMAKLGISTALLSSFTNNTAVVASLIAVVRRNQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVEN
AGLVPLGFFEFSMIGIVIVTAGVGLLVLLANWLPDRRDESLDEALPYLLEARVAKESKLIGKSVQDNRLRALKKLYLVEL
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDILRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAPSSTLVGRSLKQSTFREKFDG
AVLAIRRGHQPLKGGLGDIELQAGDVLLVTPGDGFCSNTKLASEFAAVSGLDLSVRLDPRRSQWVLAGFLVTILASLTGV
LPLVKGLILLLMSYIAIGAVSLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYFMT
LLLTELITNNAAAALAFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYNAGNYRFSDFVRVGLPLSLLY
SAIVLLLVPVFFPF
>Mature_573_residues
PELWVLSCILFALVIALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALSSFTNASLVTLVLLIMSTAALEKTSLLGKLSQV
IGRGSLASTMAKLGISTALLSSFTNNTAVVASLIAVVRRNQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENA
GLVPLGFFEFSMIGIVIVTAGVGLLVLLANWLPDRRDESLDEALPYLLEARVAKESKLIGKSVQDNRLRALKKLYLVELE
RSGIRICPVPPHLVLQSEDILRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAPSSTLVGRSLKQSTFREKFDGA
VLAIRRGHQPLKGGLGDIELQAGDVLLVTPGDGFCSNTKLASEFAAVSGLDLSVRLDPRRSQWVLAGFLVTILASLTGVL
PLVKGLILLLMSYIAIGAVSLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYFMTL
LLTELITNNAAAALAFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYNAGNYRFSDFVRVGLPLSLLYS
AIVLLLVPVFFPF

Specific function: Unknown

COG id: COG0471

COG function: function code P; Di- and tricarboxylate transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 RCK C-terminal domains [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788629, Length=613, Percent_Identity=27.5693311582382, Blast_Score=150, Evalue=3e-37,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001898
- InterPro:   IPR006037 [H]

Pfam domain/function: PF00939 Na_sulph_symp; PF02080 TrkA_C [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61397; Mature: 61266

Theoretical pI: Translated: 8.03; Mature: 8.03

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPELWVLSCILFALVIALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALSSFTNASLVTLV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LLIMSTAALEKTSLLGKLSQVIGRGSLASTMAKLGISTALLSSFTNNTAVVASLIAVVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
NQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENAGLVPLGFFEFSMIGIVIVT
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
AGVGLLVLLANWLPDRRDESLDEALPYLLEARVAKESKLIGKSVQDNRLRALKKLYLVEL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDILRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAP
HCCCEEECCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHCCHHHHHHHHHCC
SSTLVGRSLKQSTFREKFDGAVLAIRRGHQPLKGGLGDIELQAGDVLLVTPGDGFCSNTK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEECCCCCCCCCH
LASEFAAVSGLDLSVRLDPRRSQWVLAGFLVTILASLTGVLPLVKGLILLLMSYIAIGAV
HHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYFMT
HHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LLLTELITNNAAAALAFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
AGNYRFSDFVRVGLPLSLLYSAIVLLLVPVFFPF
CCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
PELWVLSCILFALVIALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALSSFTNASLVTLV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LLIMSTAALEKTSLLGKLSQVIGRGSLASTMAKLGISTALLSSFTNNTAVVASLIAVVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
NQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENAGLVPLGFFEFSMIGIVIVT
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
AGVGLLVLLANWLPDRRDESLDEALPYLLEARVAKESKLIGKSVQDNRLRALKKLYLVEL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDILRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAP
HCCCEEECCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHCCHHHHHHHHHCC
SSTLVGRSLKQSTFREKFDGAVLAIRRGHQPLKGGLGDIELQAGDVLLVTPGDGFCSNTK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEECCCCCCCCCH
LASEFAAVSGLDLSVRLDPRRSQWVLAGFLVTILASLTGVLPLVKGLILLLMSYIAIGAV
HHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYFMT
HHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LLLTELITNNAAAALAFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
AGNYRFSDFVRVGLPLSLLYSAIVLLLVPVFFPF
CCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]