| Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009901 |
| Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is lplT [H]
Identifier: 157959989
GI number: 157959989
Start: 173066
End: 174748
Strand: Direct
Name: lplT [H]
Synonym: Spea_0159
Alternate gene names: 157959989
Gene position: 173066-174748 (Clockwise)
Preceding gene: 157959988
Following gene: 157959993
Centisome position: 3.34
GC content: 44.21
Gene sequence:
>1683_bases ATGTTATTTAGCCGGCGTTTCTTACCCTATTTTGTGACTCTATGCCTTGGTGCACTGAACGACAATGTATTTAAAAATGT ACTGCTGCTGTTAGTGACCTATTCACAGGTTGAGCTGCTACCGATCGATATTAACCTCTTTGTTAATCTGGCCGCAGGCC TATTTATTCTGCCTTTTTTGCTGTTTTCAGCTCACGCGGGGCAGGTGGCGGACAGTGTTGATAAAGCGCTGCTAATTCGA ATACTTAAGCTACTCGAACTCATCATCATGTCGGTGGCCATTTTCGCAATTATGAGTAATAGCTATCTGGTTATGCTGCT ATTACTGTTTCTTACTGGGGTGCAGTCCGCGTATTTTGGTCCGGTAAAATACTCACTATTACCAAGAGTGCTACACGAAA GCGAACTCGTCTCGGGTAATGCCTGGGTTGAGATGGGCACCTTCTTAGCCATTCTGATTGGAACAATTTCGGCAGGAATG ATTGTTGCCAGTGACATGGCGACATACTGGGCTGCAGCCACGGTATTTATCCTAGCTTTAATTGGTATGGCTGCGAGTTG GTTTATCCCGAGTATTCCAGCCCACTCCGATGTTAAACCTCGATTTTCTATTATCTCTGCCACCATGGATAACCTTAACA AGGCGCGTAACAACAAGGCCATTTGGACTGCTATTTTAGCTATCAGTTGGTTTTGGTTTGTGGGGGCGACTTATCTTACT CAGTTCCCTAATTTTGCTCGAATAACCTTAAATGCCGACCCGACGGTGGTATCACTACTCCTATTGCTGTTTTCGGTGGG CATTGGTGCTGGTTCATTTTTTTGTGAGCGGCTTTCTTGTCGGCGGGTTGAGCTTGGGATTATGCCTTTAGGCTTGCTGT TACTCGCTTGCTTCGGAATCGATCTCTATTTTGCTATACCCAATAAAACGACATTAGTTGGGCTTTATCAATTAGATAGC TTTATTGCAGAGTCTGGGCATTATCGTCTGATGTTTGATCTGTTTATGATTGGCGTCGGAGGTGGCTTATTTATCGTGCC GCTTTATACCTTTATTCAGGTGCGAGCCAAAGAGGGCGAGTGCGCACAGGCGATTGCGAGTAACAATATCCTCAATGCAT TATTTATGGTGAGTTCGGCTATATTTGCCATGCTGGCCTTGAATGTATTGCAGTGGCCGATAGAGTTGCTCTTTTTGGTC TTAGCTGTGGTAAATATCTTGGTGCTACTGTATTTATTTTGGCGCTGGCCAGAACTCTTACTCAGCTGCGAGAGTTACTT TTATCGCAGGGTTTTACATAAAACCCAAGTGCTAGATCTAGAGTCTTTGCATAAATCGTCTAAATTATTGCTGGTTACCG AGCAAGCATCTTGGCGAGAGTTAATGGTGATATTTGGCAGCTTTAACCATCCGATTTTGTTTGCAAACTTAAATCAGCAG ACTTGGCCTAATCGCTTTATTGGGTACGCATTATCTCGATTGAGTTGGTATCCGCATCAACAAATGGAAGTCGATAGCGT TGTTTGCGTGAATAAGGCCTCACTTGGTGAGTTTAAAGCCCGCGCCGAATTTGCAGACTTCACTGTTGTGTCAGTTAAAT TTACTGCTATTGAGGGAAGAGTACTGAAGTTAGAAATAACCCCATTAGCTGCCGGTAACAGCGAGCTAATGGGATGGGCT TAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GACACGGGTTTACAGAATACGGCTTTGAGTCCGACTATTTTGGTGAGAGTGAACCAAGAGTTGTAATGCGTTATGTGAAA TCGGCTCCTTCGTAATACAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AGCAAAGTCGGTGCTTAATGGTCATCTAGCCACTGATGCATAGCTTGATGGTCGCCTTTAAATAAAATACGTTCGGCTTT CTTATCGATTTGATATTGAT
Product: major facilitator transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 560; Mature: 560
Protein sequence:
>560_residues MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFLLFSAHAGQVADSVDKALLIR ILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFGPVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGM IVASDMATYWAAATVFILALIGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGIDLYFAIPNKTTLVGLYQLDS FIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGECAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLV LAVVNILVLLYLFWRWPELLLSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGRVLKLEITPLAAGNSELMGWA
Sequences:
>Translated_560_residues MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFLLFSAHAGQVADSVDKALLIR ILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFGPVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGM IVASDMATYWAAATVFILALIGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGIDLYFAIPNKTTLVGLYQLDS FIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGECAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLV LAVVNILVLLYLFWRWPELLLSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGRVLKLEITPLAAGNSELMGWA >Mature_560_residues MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFLLFSAHAGQVADSVDKALLIR ILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFGPVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGM IVASDMATYWAAATVFILALIGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGIDLYFAIPNKTTLVGLYQLDS FIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGECAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLV LAVVNILVLLYLFWRWPELLLSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGRVLKLEITPLAAGNSELMGWA
Specific function: Catalyzes the facilitated diffusion of 2-acyl-glycero-3- phosphoethanolamine (2-acyl-GPE) into the cell [H]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. LplT (TC 2.A.1.42) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789200, Length=326, Percent_Identity=27.9141104294479, Blast_Score=74, Evalue=4e-14,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62481; Mature: 62481
Theoretical pI: Translated: 7.49; Mature: 7.49
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH LFSAHAGQVADSVDKALLIRILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFG HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGMIVASDMATYWAAATVFILAL CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGI HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCC DLYFAIPNKTTLVGLYQLDSFIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGE EEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCH CAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLVLAVVNILVLLYLFWRWPELL HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEECCCCCEEEEECCCC TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGR CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCE VLKLEITPLAAGNSELMGWA EEEEEEEEECCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH LFSAHAGQVADSVDKALLIRILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFG HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGMIVASDMATYWAAATVFILAL CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGI HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCC DLYFAIPNKTTLVGLYQLDSFIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGE EEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCH CAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLVLAVVNILVLLYLFWRWPELL HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEECCCCCEEEEECCCC TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGR CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCE VLKLEITPLAAGNSELMGWA EEEEEEEEECCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA