| Definition | Rickettsia akari str. Hartford, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009881 |
| Length | 1,231,060 |
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The map label for this gene is sca2 [H]
Identifier: 157825243
GI number: 157825243
Start: 107146
End: 112578
Strand: Reverse
Name: sca2 [H]
Synonym: A1C_00610
Alternate gene names: 157825243
Gene position: 112578-107146 (Counterclockwise)
Preceding gene: 157825247
Following gene: 157825242
Centisome position: 9.14
GC content: 30.74
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: 190 kD antigen precursor
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1810; Mature: 1809
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell outer membrane [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 autotransporter (TC 1.B.12) domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005546 - InterPro: IPR006315 [H]
Pfam domain/function: PF03797 Autotransporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 204900; Mature: 204769
Theoretical pI: Translated: 7.97; Mature: 7.97
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSTCLFTSSFLSTSTRAASFKDLVSKTPTWQKHNAKQQQNIWKDFTPNEKIKKWQEANLI CCCEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCC PSFTQAQDDLGIQYKETDLSSFLDNTRHKARQARAEILLYIQRIKQQDFDTKKQEYIKQG CCHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHC IVPTYMEAATILGISYDPSKIYDNVEKDQNVRRAEKDKKALIDLYISSIKRDIKYRHYVN CCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NHIIPEIKEVKTALNMDKDDAESFVLSIRTEIMENAKEQYIADRHIPTEKELKNRFGISR CCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCC DDNRDAYIKSIRLKVMDKEKPQYIAANSIPTEKELEQKFGCDKGEATNYIASIATQKMLN CCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC KKAYYIDNNIIPAVEELKQEFRIGKIKANSYIQQITDGINANQLLNNNNTTKPSTVGSTK CCCEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC KIETKSDNWYMSNQGINTTETSSVVTTGRKEKQSYYFDPISTFKAHFNNKENNGNLTQPQ EEEECCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHCCCEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH HNINRIIQQEENIEEFKNLIKTDPIAALNLTVDSSYKKEAVTSILSDFNDDTIQRVLFSD 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