| Definition | Rickettsia akari str. Hartford, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009881 |
| Length | 1,231,060 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is sca2 [H]
Identifier: 157825242
GI number: 157825242
Start: 101331
End: 106664
Strand: Reverse
Name: sca2 [H]
Synonym: A1C_00605
Alternate gene names: 157825242
Gene position: 106664-101331 (Counterclockwise)
Preceding gene: 157825243
Following gene: 157825238
Centisome position: 8.66
GC content: 33.41
Gene sequence:
>5334_bases ATGAGTATAACAGGCAAATTAAAATCAGTATTGTTGACATACTCTTTCATTATTAGTATATCAATAAATTTATTTACCAC CGGTTCAGAAGCAGCCGGCAATCCACCACCACCTCCACCACCACCACCTCTTCCTCCACCGGGATGGACATATCAAGCAG CGTCATCAAACAATACTGGTAGTGGAGGACAAACTACTCAACCAGAGTCATCAAAAAGCACTGGTAGCAGTAAAAAATCT TCCTCATCAACAAAAATACCAGAAGTGCATCCCCCTACTACAGAGCTAGGTAAAAGATACGCTAAATTAATTGATATACA TGATAGGAAACAAAATCTAATAATACAATTTCCAAAAGTAATAGCATATTTGATACGCCAAGAATTAACACTTCAGAACC TTGACACTAGTGTGCACAACATTATTACATTGTTTAATAAGAGAGAAGATTCAATCTTAGATAACGCAAAAAAAATATAC CAAGAGTTTATAAATGACCCTTATATAGCTCAGTTTACAAATAAAAACAAACAAACAGGAGATTTCTTAGATAATAAGCT CTTTGAGGAAAGTCATGAAGAGGCAATATTGCGTCTTTTATCATTAGAGCAACTCGATGCACAAAGGAAACAAGACATTT TAAGTCAACAAGGGAATATATTAGAGCAATTAAAATTTATAAAGGAAAATTCTGAAATTCTGGGGTCGTACGGTAAGACC GAATCAACAAATATATCAAAAAAACTACCTGAAGAATTACCTAAAATTTTAAGTCAACAGGGTGATATATTAGGACAATT AAGATTTATAAAGGAAAATTCTGAAATTCTAGGTGCGTACGGTAAGACTGTATCAACAGATATATCAAAAAAATTACCTA AAGAACTACCTAAAATTTTAAGTCAACAGGGTGATATATTAGGACAATTGAAATTTATAAATGACAATTCTGAAATTTTA TTATGCGGACACAGTAAGGCAATATTAAAAGATAAACTAAAAGAATTATCTAAGCAATTAGATACAATTTCAAGTAATCA ATTAGTAGGTTTTATACTCGATGAAAATAAGATCAACACAAACTTAAAAAATGTTCCTTTTTCAGCAAAAAAAGTAAGAG AGCAAGTAAATAACTTAAATAATGAAATCCTAGAGAAAATTTTTCTCCATGATGATGGTACGATAACTGAACAAGATTTA ACTAGAATATTACAAAAATATAAAGAAACAGATTTAATAAAGAATTTAACTAAAGCTATAATATATATTGATGGCAATGA AAGTAATGAAACTGTAAGTAAAACTTTAGCAAAAGGTTTAGAAAACACTACTCCAGAACAACGAGGATTGATCGTAGACG TATTGACTCATAATACCAGGATACGAAAAGCTCTTATAACCAAAATAGACAGAGAGCGAAGACAAGAACGAAATCAAAAA TTAAACAAAAATACAGAAGGTGATCCTTTCGTAGATGCACTAAAGAAGGCACTTGTACAAAGGAAATCAGATCCAGAAAC AATACAAAAAGAGCTAGAAAGAAGAAAGCACGAAACACCAAGAGATTTGAATGCGTGGGATCGGGTTAGACAGAATATGC ATAATCCAAATAACCAAAATGATAATCCAAACACACACGATGAGAATAATAAAGGATGGAAAGAGGATAATCAAAATGCA CAGGATGCAAATAATAACGATGTTGACAGAATAACAAAAGCAAAGAATGAGTTAGAGCAAGCAGTTAACGCTGCAACAAG AAAATTTAGTGAAATGAGCAGTCTCCTAAAAGACAATACAATAAAAAATGCAACAGCATGCCAAGGATATTTAAAAGGAG CTGAAGATCAACTGGCCTTAGCAAAAGAAAAAGGACAAGAACTAATAGAAAATTCAGTTCAAGCATTTAAAATAATACCT AAAAAATCTCAAGATAATATGGATGATAATTGGCAGAATTATTTATCACCGAAAGAAATAATAGCACTAAATGCACTAAG TGACGAAACTAATACACTAAAGAGCAAAAAAAATAAAGCTGGAAAATTCACATCAACTGCAGACGCATCACAATTTAAAG CAAAACAACAAAAATATCACACACTACTTTCAGAATTACAAAAAATCGGAATCGCAAAGCAACAAGAAAAACTTGTCAAA GACTACGTAGATGAAATGCTCACAAATGCTAAAAAGGCAGTAGGAAAAATAGAAACAACTTTAGAGTACTTAAACAAGAA GAAAGAAAATAAAAACGATAATGCAGAATCTAGTCCACTAATTTCTAAGGAAATATTCGAGGCTCGAGAGCAGCTTAAAA AAGCTGAACAAAAATTAGAACGTATTAAATTCAAGAATACAATTGCTAAACAGAGGAAGGCGGATAGTTCTGACGAAGAT TCTGATGATGAGTGGGATGATGATTATGATAAAAAGGCAACAAAACAAAAAGAAGAGTTAGCAAATAAACAAAAACAAGA GCTAGAAGATGCTCAAGAAGAGATAAAACAAGCTAAAAAAAACTTAGAGAATGCTGAGGTAAGAGATGCAGAGCGTAAAC AACAAGAAGCAGCAGCAAAGCGTCAAGAAGAACTGAAGCGTAAACAAGACGAAGTAAATCACAAAATAGTAGAAGATGAG GTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGATGCAATGTTTAAAAATGCAAAAGATGAAGC TGAACACAAAGAAAAAGCAAATCGTCAGCGTCAAGAAGAACTGAAGCGTAAACAAGACGAAGTAAATCGCAAAATAGTAG AAGATGAGGTAAAACGTAAAGCAGAAAATGTACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGATGCAGTGTTTAAAAATGCAAAA GATGAAGCTGAACACAAAGAAAAAGCAAACCGTCAGCGTCAAGAAGAACTGAAGCGTAAACAAGACGAAGTAAATCGCAA AATAGTAGAAGATGAGGTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGATGCAATGTTTAAAA ATGCAAAAGATGAAGCTGAATACAAAGAAAAAGCAAACCGTCAGCGTCAAGACGAAGTAAATCGCAAAATAGTAGAAGAT GAGGTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGATGCAATGTTTAAAAATGCAAAAGATGA AGCTGAACACAAAGAAAAAGCAAATCGTCAGCGTCAAGAAGAACTGAAGCGTAAACAAGACGAAGTAAATCACAAAATAG TAGAAGATGAGGTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGATGCAATGTTTAAAAATGCA AAAGATGAAGCTGAACACAAAGAAAAAGCAAATCGTCAGCGTCAAGAAGAACTGAAGCGTAAACAAGACGAAGTAAATCG CAAAATAGTAGAAGATGAGGTAAAACGTAAAGCAGAAAATGTACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGATGCAGTGTTTA AAAATGCAAAAGATGAAGCTGAACACAAAGAAAAAGCAAACCGTCAGCGTCAAGAAGAACTGAAGCGTAAACAAGACGAA GTAAATCGCAAAATAGTAGAAGATGAGGTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGCTGC AATGTTTAAAAATGCAAAAGATGAAGCTGAATACAAAGAAAAAGCAAACCGTCAGCGTCAAGACGAAGTAAATCGCAAAA TAGTAGAAGATGAGGTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCACAAGCAGAACGTCTAGAAGATATGGATGCAATGTTTAAAAAT GCAAAAGATGAAGCTGAACACAAAGAAAAAGCAAATCGTCAGCGTCAAGAAGAACTGAAGCGTAAACAAGACGAAGTAAA TTGCAAAATGGTAGAAGATGAGGTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCAGAGGATGAATATCTAGAAGATATGGCTGCAATGT TTAAAAATGCAGAAGATGAAGCTGAATACAAAGAAAAAGCAAACCGTCAGCGTCAAGACGAAGTAAATCGCAAAATGGTA GAAGATGAGGTAGAACGTAAAGCAGAAAATGCAGAAGATGAAGCTGAACACAAAGAAAATGAAAACCGTCAGCGTCAAGA AGAGCAGAACTGCCAAGAGCAAGAACGTAAACGTCTAGCAGCCGAAGAAGATGAACAAACAGAAAAGACCACACGTAAAC AAGAAGAAACCGAGGAAGAAAAATTAAAAAACGATATAGCTTTAGAAGGTGAAGATGAAGATATTGGTGTGTCATTCAAA ACTGAAGCAATCGTGGAACAAGATGAGGCAGCACAGAGACAACAAGTATCTGATGACACCAGTAGGAAAGTAGCAATATT AGTTAAGGCTACTTCAACTCTTCACAAACCTGTTCATCATAATATTTTAAGTGATAGATTAAAGGTTTCTGCAATAGCTA CCGGTGATGAAGAACCAACTATCGCAAGAGGAGTATGGATTAGCGGCTTATACGGTATGAACAAACAAGGAACTTGGAAG AATATTCCAAAATATCAAGGTCGTACCACCGGCATAACTATCGGAGCTGATATTGAATTTATCAATAGTCATGATGTGAT CGGAATAGCTTATAGCCGTTTAGAATCTAAAATTAAATATAATGAAAAACTAGGAAAAACAGCGGTTAACGTTCATCTTT TCAGCATTTACGGTCTAAAAGAACTCAATAAAGGTTTCTCATTACAGGCTATAACATCTTATGGTCATAATTATATTAAG AATAAATCTAAAAGTATTAATAATATCGTTGGAAAATATCAAAACAATAATTTCAGCTTCCAAACTTTATTAAATTATAA ATATCGTACAAAAGACGATTTACATTTTATTCCTAATATCGGTTTTAAATATGATTATTCAAGAGCTAGCAGCTATAAAG AGTATAATGTAGATATAGAAAACTTAGTGATTCAAAAGAAATCAAATCAATTATTTGAAAGTAGTATTGGCGGTAAAATA GTGTTTAAACCTATAGCAACCATAAGTAATGTAGTATTAACACCGAGTTTGTATGGTAATATTGAGCGTCACTTCAATCA TAAAAATACAAAAGTGAATGCAAAAGCAACTTTTAAAGGACAAATATTACAAGAAACAATTATTATACCGAAGCAACCTA AGCTTGGATATAATATAGGTAGTAATATGCTTATGAGCAGAAAAAATATAAATGTTCTACTTGAGTATAATTATTATACT CATAGAAAATATCAAAGCCATCAAGGACTTGTTAAGTTAAAAGTCAATTTGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAGGTTAAATTAAAAATAATGTTTTTCTTGATAAATATTATTAAATGTTATATAATGCTCCTCGTTTATATATCAAAAA ATAATCATTGAGGTTAAGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGATAAATACAGGATAGTTTTTTGAGAATCTTATCCTGATTTATCAAACCTCTTAATAGATAAGCGTATCAACCAAACTG CCAAATAGAATATCGGTGTA
Product: 190 kDa antigen precursor
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1777; Mature: 1776
Protein sequence:
>1777_residues MSITGKLKSVLLTYSFIISISINLFTTGSEAAGNPPPPPPPPPLPPPGWTYQAASSNNTGSGGQTTQPESSKSTGSSKKS SSSTKIPEVHPPTTELGKRYAKLIDIHDRKQNLIIQFPKVIAYLIRQELTLQNLDTSVHNIITLFNKREDSILDNAKKIY QEFINDPYIAQFTNKNKQTGDFLDNKLFEESHEEAILRLLSLEQLDAQRKQDILSQQGNILEQLKFIKENSEILGSYGKT ESTNISKKLPEELPKILSQQGDILGQLRFIKENSEILGAYGKTVSTDISKKLPKELPKILSQQGDILGQLKFINDNSEIL LCGHSKAILKDKLKELSKQLDTISSNQLVGFILDENKINTNLKNVPFSAKKVREQVNNLNNEILEKIFLHDDGTITEQDL TRILQKYKETDLIKNLTKAIIYIDGNESNETVSKTLAKGLENTTPEQRGLIVDVLTHNTRIRKALITKIDRERRQERNQK LNKNTEGDPFVDALKKALVQRKSDPETIQKELERRKHETPRDLNAWDRVRQNMHNPNNQNDNPNTHDENNKGWKEDNQNA QDANNNDVDRITKAKNELEQAVNAATRKFSEMSSLLKDNTIKNATACQGYLKGAEDQLALAKEKGQELIENSVQAFKIIP KKSQDNMDDNWQNYLSPKEIIALNALSDETNTLKSKKNKAGKFTSTADASQFKAKQQKYHTLLSELQKIGIAKQQEKLVK DYVDEMLTNAKKAVGKIETTLEYLNKKKENKNDNAESSPLISKEIFEAREQLKKAEQKLERIKFKNTIAKQRKADSSDED SDDEWDDDYDKKATKQKEELANKQKQELEDAQEEIKQAKKNLENAEVRDAERKQQEAAAKRQEELKRKQDEVNHKIVEDE VERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAK DEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVED EVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNHKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNA KDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDE VNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMAAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKN AKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNCKMVEDEVERKAENAEDEYLEDMAAMFKNAEDEAEYKEKANRQRQDEVNRKMV EDEVERKAENAEDEAEHKENENRQRQEEQNCQEQERKRLAAEEDEQTEKTTRKQEETEEEKLKNDIALEGEDEDIGVSFK TEAIVEQDEAAQRQQVSDDTSRKVAILVKATSTLHKPVHHNILSDRLKVSAIATGDEEPTIARGVWISGLYGMNKQGTWK NIPKYQGRTTGITIGADIEFINSHDVIGIAYSRLESKIKYNEKLGKTAVNVHLFSIYGLKELNKGFSLQAITSYGHNYIK NKSKSINNIVGKYQNNNFSFQTLLNYKYRTKDDLHFIPNIGFKYDYSRASSYKEYNVDIENLVIQKKSNQLFESSIGGKI VFKPIATISNVVLTPSLYGNIERHFNHKNTKVNAKATFKGQILQETIIIPKQPKLGYNIGSNMLMSRKNINVLLEYNYYT HRKYQSHQGLVKLKVNL
Sequences:
>Translated_1777_residues MSITGKLKSVLLTYSFIISISINLFTTGSEAAGNPPPPPPPPPLPPPGWTYQAASSNNTGSGGQTTQPESSKSTGSSKKS SSSTKIPEVHPPTTELGKRYAKLIDIHDRKQNLIIQFPKVIAYLIRQELTLQNLDTSVHNIITLFNKREDSILDNAKKIY QEFINDPYIAQFTNKNKQTGDFLDNKLFEESHEEAILRLLSLEQLDAQRKQDILSQQGNILEQLKFIKENSEILGSYGKT ESTNISKKLPEELPKILSQQGDILGQLRFIKENSEILGAYGKTVSTDISKKLPKELPKILSQQGDILGQLKFINDNSEIL LCGHSKAILKDKLKELSKQLDTISSNQLVGFILDENKINTNLKNVPFSAKKVREQVNNLNNEILEKIFLHDDGTITEQDL TRILQKYKETDLIKNLTKAIIYIDGNESNETVSKTLAKGLENTTPEQRGLIVDVLTHNTRIRKALITKIDRERRQERNQK LNKNTEGDPFVDALKKALVQRKSDPETIQKELERRKHETPRDLNAWDRVRQNMHNPNNQNDNPNTHDENNKGWKEDNQNA QDANNNDVDRITKAKNELEQAVNAATRKFSEMSSLLKDNTIKNATACQGYLKGAEDQLALAKEKGQELIENSVQAFKIIP KKSQDNMDDNWQNYLSPKEIIALNALSDETNTLKSKKNKAGKFTSTADASQFKAKQQKYHTLLSELQKIGIAKQQEKLVK DYVDEMLTNAKKAVGKIETTLEYLNKKKENKNDNAESSPLISKEIFEAREQLKKAEQKLERIKFKNTIAKQRKADSSDED SDDEWDDDYDKKATKQKEELANKQKQELEDAQEEIKQAKKNLENAEVRDAERKQQEAAAKRQEELKRKQDEVNHKIVEDE VERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAK DEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVED EVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNHKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNA KDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDE VNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMAAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKN AKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNCKMVEDEVERKAENAEDEYLEDMAAMFKNAEDEAEYKEKANRQRQDEVNRKMV EDEVERKAENAEDEAEHKENENRQRQEEQNCQEQERKRLAAEEDEQTEKTTRKQEETEEEKLKNDIALEGEDEDIGVSFK TEAIVEQDEAAQRQQVSDDTSRKVAILVKATSTLHKPVHHNILSDRLKVSAIATGDEEPTIARGVWISGLYGMNKQGTWK NIPKYQGRTTGITIGADIEFINSHDVIGIAYSRLESKIKYNEKLGKTAVNVHLFSIYGLKELNKGFSLQAITSYGHNYIK NKSKSINNIVGKYQNNNFSFQTLLNYKYRTKDDLHFIPNIGFKYDYSRASSYKEYNVDIENLVIQKKSNQLFESSIGGKI VFKPIATISNVVLTPSLYGNIERHFNHKNTKVNAKATFKGQILQETIIIPKQPKLGYNIGSNMLMSRKNINVLLEYNYYT HRKYQSHQGLVKLKVNL >Mature_1776_residues SITGKLKSVLLTYSFIISISINLFTTGSEAAGNPPPPPPPPPLPPPGWTYQAASSNNTGSGGQTTQPESSKSTGSSKKSS SSTKIPEVHPPTTELGKRYAKLIDIHDRKQNLIIQFPKVIAYLIRQELTLQNLDTSVHNIITLFNKREDSILDNAKKIYQ EFINDPYIAQFTNKNKQTGDFLDNKLFEESHEEAILRLLSLEQLDAQRKQDILSQQGNILEQLKFIKENSEILGSYGKTE STNISKKLPEELPKILSQQGDILGQLRFIKENSEILGAYGKTVSTDISKKLPKELPKILSQQGDILGQLKFINDNSEILL CGHSKAILKDKLKELSKQLDTISSNQLVGFILDENKINTNLKNVPFSAKKVREQVNNLNNEILEKIFLHDDGTITEQDLT RILQKYKETDLIKNLTKAIIYIDGNESNETVSKTLAKGLENTTPEQRGLIVDVLTHNTRIRKALITKIDRERRQERNQKL NKNTEGDPFVDALKKALVQRKSDPETIQKELERRKHETPRDLNAWDRVRQNMHNPNNQNDNPNTHDENNKGWKEDNQNAQ DANNNDVDRITKAKNELEQAVNAATRKFSEMSSLLKDNTIKNATACQGYLKGAEDQLALAKEKGQELIENSVQAFKIIPK KSQDNMDDNWQNYLSPKEIIALNALSDETNTLKSKKNKAGKFTSTADASQFKAKQQKYHTLLSELQKIGIAKQQEKLVKD YVDEMLTNAKKAVGKIETTLEYLNKKKENKNDNAESSPLISKEIFEAREQLKKAEQKLERIKFKNTIAKQRKADSSDEDS DDEWDDDYDKKATKQKEELANKQKQELEDAQEEIKQAKKNLENAEVRDAERKQQEAAAKRQEELKRKQDEVNHKIVEDEV ERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAKD EAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVEDE VERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNHKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAK DEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEV NRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMAAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNA KDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNCKMVEDEVERKAENAEDEYLEDMAAMFKNAEDEAEYKEKANRQRQDEVNRKMVE DEVERKAENAEDEAEHKENENRQRQEEQNCQEQERKRLAAEEDEQTEKTTRKQEETEEEKLKNDIALEGEDEDIGVSFKT EAIVEQDEAAQRQQVSDDTSRKVAILVKATSTLHKPVHHNILSDRLKVSAIATGDEEPTIARGVWISGLYGMNKQGTWKN IPKYQGRTTGITIGADIEFINSHDVIGIAYSRLESKIKYNEKLGKTAVNVHLFSIYGLKELNKGFSLQAITSYGHNYIKN KSKSINNIVGKYQNNNFSFQTLLNYKYRTKDDLHFIPNIGFKYDYSRASSYKEYNVDIENLVIQKKSNQLFESSIGGKIV FKPIATISNVVLTPSLYGNIERHFNHKNTKVNAKATFKGQILQETIIIPKQPKLGYNIGSNMLMSRKNINVLLEYNYYTH RKYQSHQGLVKLKVNL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell outer membrane [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 autotransporter (TC 1.B.12) domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005546 - InterPro: IPR006315 [H]
Pfam domain/function: PF03797 Autotransporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 205389; Mature: 205258
Theoretical pI: Translated: 6.24; Mature: 6.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSITGKLKSVLLTYSFIISISINLFTTGSEAAGNPPPPPPPPPLPPPGWTYQAASSNNTG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCC SGGQTTQPESSKSTGSSKKSSSSTKIPEVHPPTTELGKRYAKLIDIHDRKQNLIIQFPKV CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH IAYLIRQELTLQNLDTSVHNIITLFNKREDSILDNAKKIYQEFINDPYIAQFTNKNKQTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHCCCCCCCH DFLDNKLFEESHEEAILRLLSLEQLDAQRKQDILSQQGNILEQLKFIKENSEILGSYGKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC ESTNISKKLPEELPKILSQQGDILGQLRFIKENSEILGAYGKTVSTDISKKLPKELPKIL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQQGDILGQLKFINDNSEILLCGHSKAILKDKLKELSKQLDTISSNQLVGFILDENKINT HHCCCHHEEEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCC NLKNVPFSAKKVREQVNNLNNEILEKIFLHDDGTITEQDLTRILQKYKETDLIKNLTKAI CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE IYIDGNESNETVSKTLAKGLENTTPEQRGLIVDVLTHNTRIRKALITKIDRERRQERNQK EEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNKNTEGDPFVDALKKALVQRKSDPETIQKELERRKHETPRDLNAWDRVRQNMHNPNNQN HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC DNPNTHDENNKGWKEDNQNAQDANNNDVDRITKAKNELEQAVNAATRKFSEMSSLLKDNT CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC IKNATACQGYLKGAEDQLALAKEKGQELIENSVQAFKIIPKKSQDNMDDNWQNYLSPKEI CCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHH IALNALSDETNTLKSKKNKAGKFTSTADASQFKAKQQKYHTLLSELQKIGIAKQQEKLVK EEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH DYVDEMLTNAKKAVGKIETTLEYLNKKKENKNDNAESSPLISKEIFEAREQLKKAEQKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RIKFKNTIAKQRKADSSDEDSDDEWDDDYDKKATKQKEELANKQKQELEDAQEEIKQAKK HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLENAEVRDAERKQQEAAAKRQEELKRKQDEVNHKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMF CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAK HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH DEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YKEKANRQRQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELKRKQDEVNHKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMAAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVEDEVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNCKMVEDEVERKAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC NAEDEYLEDMAAMFKNAEDEAEYKEKANRQRQDEVNRKMVEDEVERKAENAEDEAEHKEN CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH ENRQRQEEQNCQEQERKRLAAEEDEQTEKTTRKQEETEEEKLKNDIALEGEDEDIGVSFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEH TEAIVEQDEAAQRQQVSDDTSRKVAILVKATSTLHKPVHHNILSDRLKVSAIATGDEEPT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC IARGVWISGLYGMNKQGTWKNIPKYQGRTTGITIGADIEFINSHDVIGIAYSRLESKIKY HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH NEKLGKTAVNVHLFSIYGLKELNKGFSLQAITSYGHNYIKNKSKSINNIVGKYQNNNFSF HHHHCCHHHEEEEHHHHCHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCH QTLLNYKYRTKDDLHFIPNIGFKYDYSRASSYKEYNVDIENLVIQKKSNQLFESSIGGKI HHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCEECCHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE VFKPIATISNVVLTPSLYGNIERHFNHKNTKVNAKATFKGQILQETIIIPKQPKLGYNIG EEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEECCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC SNMLMSRKNINVLLEYNYYTHRKYQSHQGLVKLKVNL CHHHEECCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCEEEEEECC >Mature Secondary Structure SITGKLKSVLLTYSFIISISINLFTTGSEAAGNPPPPPPPPPLPPPGWTYQAASSNNTG CCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCC SGGQTTQPESSKSTGSSKKSSSSTKIPEVHPPTTELGKRYAKLIDIHDRKQNLIIQFPKV CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH IAYLIRQELTLQNLDTSVHNIITLFNKREDSILDNAKKIYQEFINDPYIAQFTNKNKQTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHCCCCCCCH DFLDNKLFEESHEEAILRLLSLEQLDAQRKQDILSQQGNILEQLKFIKENSEILGSYGKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC ESTNISKKLPEELPKILSQQGDILGQLRFIKENSEILGAYGKTVSTDISKKLPKELPKIL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQQGDILGQLKFINDNSEILLCGHSKAILKDKLKELSKQLDTISSNQLVGFILDENKINT HHCCCHHEEEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCC NLKNVPFSAKKVREQVNNLNNEILEKIFLHDDGTITEQDLTRILQKYKETDLIKNLTKAI CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE IYIDGNESNETVSKTLAKGLENTTPEQRGLIVDVLTHNTRIRKALITKIDRERRQERNQK EEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNKNTEGDPFVDALKKALVQRKSDPETIQKELERRKHETPRDLNAWDRVRQNMHNPNNQN HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC DNPNTHDENNKGWKEDNQNAQDANNNDVDRITKAKNELEQAVNAATRKFSEMSSLLKDNT CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC IKNATACQGYLKGAEDQLALAKEKGQELIENSVQAFKIIPKKSQDNMDDNWQNYLSPKEI CCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHH IALNALSDETNTLKSKKNKAGKFTSTADASQFKAKQQKYHTLLSELQKIGIAKQQEKLVK EEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH DYVDEMLTNAKKAVGKIETTLEYLNKKKENKNDNAESSPLISKEIFEAREQLKKAEQKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RIKFKNTIAKQRKADSSDEDSDDEWDDDYDKKATKQKEELANKQKQELEDAQEEIKQAKK HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLENAEVRDAERKQQEAAAKRQEELKRKQDEVNHKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMF CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAK HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH DEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YKEKANRQRQDEVNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELKRKQDEVNHKIVEDEVERKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQDEVNRKIVEDEVKRKAENVQAERLEDMDAVFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNRKIVEDEVERKAENAQAERLEDMAAMFKNAKDEAEYKEKANRQRQDEVNRKIVEDEVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKAENAQAERLEDMDAMFKNAKDEAEHKEKANRQRQEELKRKQDEVNCKMVEDEVERKAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC NAEDEYLEDMAAMFKNAEDEAEYKEKANRQRQDEVNRKMVEDEVERKAENAEDEAEHKEN CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH ENRQRQEEQNCQEQERKRLAAEEDEQTEKTTRKQEETEEEKLKNDIALEGEDEDIGVSFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEH TEAIVEQDEAAQRQQVSDDTSRKVAILVKATSTLHKPVHHNILSDRLKVSAIATGDEEPT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC IARGVWISGLYGMNKQGTWKNIPKYQGRTTGITIGADIEFINSHDVIGIAYSRLESKIKY HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH NEKLGKTAVNVHLFSIYGLKELNKGFSLQAITSYGHNYIKNKSKSINNIVGKYQNNNFSF HHHHCCHHHEEEEHHHHCHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCH QTLLNYKYRTKDDLHFIPNIGFKYDYSRASSYKEYNVDIENLVIQKKSNQLFESSIGGKI HHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCEECCHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE VFKPIATISNVVLTPSLYGNIERHFNHKNTKVNAKATFKGQILQETIIIPKQPKLGYNIG EEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEECCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC SNMLMSRKNINVLLEYNYYTHRKYQSHQGLVKLKVNL CHHHEECCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCEEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA