| Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 31758, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009708 |
| Length | 4,723,306 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 153950864
Identifier: 153950864
GI number: 153950864
Start: 1906884
End: 1909748
Strand: Direct
Name: 153950864
Synonym: YpsIP31758_1640
Alternate gene names: NA
Gene position: 1906884-1909748 (Clockwise)
Preceding gene: 153950253
Following gene: 153946836
Centisome position: 40.37
GC content: 51.27
Gene sequence:
>2865_bases ATGGAGTATTGGCTGTTAATTTTTTTACTTATCTTCTTGTTTGTCATCTATATGCAAATAAGTGCGTTATCCAACTCGGT AAAATATATACGAGAAGAGATAGGCAGGCTGCGCAATGAGCTTGCTCCACGCTTGCCTGAACCTACCGTGGCCACTGTTG AGGAAGAGAACACGCCAACGCATTTGGCAGATGAAGTGGCCGTGTCCAAGGTATGGACCCCTGATTACGCAACCTATCAG AATTATCTACTCACCAAAAAGCAAAGCCAGATTAAAGAGAAGGCTCTTGCCGATTCAGTAAAAAAAGAACCCGCCCGGCC AATAGAATATAGGATTGCTGACCGTCTGGTGGTGCTTAAGCCACAGGATGAGGCCCCTCAAGAATCGCCGAAAATGGATG CAGGCCCTGCCAGTGGTCATCCACAGAAACCAGACGTGTGGACAAAATTGGAAAATGTCCTGTTTTCCTTAAAATCACCG GAGAGTTTCTGGAAACGCCTCGAGCAAGAGTTTGCCGCACGTTGGATGGTGTGGATCGGCGGTGTGATCATGGCACTGGG TGTGATTTTCCTGCTGAAAGCAGGCAGCGAACAGGGTCTGTTCGGGCCAACCTTGCGGATTGGTACCGCCATTGTGCTGA GTGTGCTGATGGTTGTTGGGGGGGAGTGGCTCAGGCGTTCACGTTTTCAGTTGCCCTTGGTCAATGCCGGTTATATCCCG GCGGCGCTGAGTGGGGCCGGTATTCTCGGTCTGTTTGCCTCAATGCTGGCGGCTAAATATCTCTACGACATGTTCCCGAT GCCCGTTCTCATGCTATTGCTCAGCCTGATTTCTCTGTTGGCGATGGTGCTGGCATTGTGGCAGGGGCCATTTATGGCGG CCTTGGGGCTGCTTGGCGCCTATACCGTCCCGTTATTTGTTTCGACGGGCAGCGGTAATGTCACCGGGCTGTTGGCCTAC CTGTTCCTGGTTAGTTTGGCGTCTATCGGCCTGATGAGCCGTGTCTATCGGCACTGGCTATGGCTGGGGGCGATGGTCGG AAACTATCTATGGCTTTTGGTTTCTTTATTCATAGCAACGTCCGAACACCAGTTAGCGCGTTCACTATTCCTGCTAGCAA CCACATACGGCTTCCTAGCCTGGCCACATCTGGGGTGGGCGCTAAAAAGCAAAATACGTTTTCGCCATAATGACTGGAAA AACTGGCCCCCGGCTTTGCTGGATCCGTTATTAACTGGGTTGATTGCCGGGCTTTCGCTATTAGCCTTAACGTTAAGCGC AAATCATTCGATCCTGGTCTGGAGCACGTTGGTATTCTCCTGTATTAGCCTGTTACTGATTGCCAGACGCTCACCTTCAT TGGATTTATTTGTTCCACTGGCCGCGATATTAGCCATTTCTCCCTTTATTAATGCAGGAACGCTGTTTGAGCCAGAAACC GTCTGGACGAGTCTGCTTGCGCTCAGCACATTAGCGCTATTCTGCGGGATATATGGTAGCTACCAGGTCACCCGGCCGGT TTACCGCAAGCTGTGGTGGGCGTTATTGTCGGTGCTGGTGCCAATGTATCTCGTTGTAAGTACCTATTATGCCTGTCGCG ATAATTTTGAGCTGGCTCCAGTTAAATACACACTGCTGGCGGTTTGTCTGGCTATGTATATCGCGTGGAATGCATTCAGT GATGGGTATCGCCGTGGCTCAGCGCTGTTGCGGACGATCTATCAGGTCGCCGCCCAACTGACGTTGACCTTTGCATTATT TATGGCTTTCAGCCAGGTTACGCTAACCCTGCTGCTCGCGGGTCAGCTTTTAGTTTTGGTACTCTGGCAACGTTGGCGAC AGGTTTCGTTACTGTCTTGGATTTTGAAACTGCATGCGATCATACTGCTGGTTCGCCTGTCAATGAACCCGTATATCCTT GGATATTCCTCGCCGTTGCACATTGGTTCGGTCGTTATTCCTTGGACGCTATACGGTTTTGGGATTCCGATTCTCTGCCT GTGGCTGAGTTCACGCTGGTTACCTGCGCGTCGCGGTGAGCAGACCGCCAATTGGTTAGCGGCCAATGCTATTTATCTGT TGGCCTTGTGGATCAACGTTGAATTACGTCACCTGCTGCATGGCAGCTATCATCTGTCGCTGGATTTCGCTTCTCTTACC GATTGTGCGTTGCATGGGGTGACCTTCGGGCTGATGGCGCTGGCCTACGGCTATCGTGAACAGTTTGCAGATTCGCTACA ACGGATATACCGCCTGGCGGCTAAAACCAGTGCCATTCTGATGCTCACCCTAACGTTGCTCTGCCTGGTTGTCTTTAACC CCATCTGGTCAGCACAACAGGTTGGCGGCCTACCGCTGCTGAATATGGTGACCGTTGCCTATGCGATCCCGATGGTGTTC ATGGTGGTAGCACTAAGATACTGGCCAGATCACTGGCTAGATATCCGTCTGAAGCCCTACGTTATCGGTGCGATTGCGCT ACTGGGAATGGTGTTCATTACCTTGACGGTCCGCCAGCTCTGGCATGGTGACCGGTTGGATAATGATATCGTGTACAGCG GCGAACAATACTCTTACTCCTTAGCGTGGATGTTAACTGCCATTGGCATGATGTACAGCGCAATACACTGGCCTAACTAT AAAGTGCGCCGCGCCTCCCTGGGGTTGTTGGCGCTCACGATCGTCAAACTGTTCCTGTGGGATATGTCTGGTCTTGAAGG GCTATATCGTTCGGTCTCATTCCTCGGTCTGGGGCTGTGTCTGGTAGCGATTGGTTGGTTCTACCAGAAGTTTGTCGTTA TGAAGGAAGTCATTGAGCAAAACAAGGATCAGCCGACAGCGGACGTGGTACAAAGCGGGCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGAAAAATACCTGTCAGATACTGTTTCATGCTATCCGATGAATGGATAGGGTTATCTCATAGAGAATTTTTTACTTAATA AACGCTGAGTTGGATACATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCGCCATTTGTCTTACCGGAGCGTGCATCGACTGATGTGGGAAAATCAATATACAGCAAGGAGTCAGTGTGATTAATTTT GTGAAGTTAATGTGTAATGT
Product: integral membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: MSF Permease
Number of amino acids: Translated: 954; Mature: 954
Protein sequence:
>954_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
Sequences:
>Translated_954_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ >Mature_954_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
Specific function: Unknown
COG id: COG5373
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107185; Mature: 107185
Theoretical pI: Translated: 9.44; Mature: 9.44
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCC HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCEEEEEC PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGA HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH GIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH VGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQL HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCC HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCEEEEEC PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGA HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH GIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH VGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQL HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA