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The map label for this gene is 153952179

Identifier: 153952179

GI number: 153952179

Start: 7169

End: 8470

Strand: Direct

Name: 153952179

Synonym: JJD26997_0006

Alternate gene names: NA

Gene position: 7169-8470 (Clockwise)

Preceding gene: 153951349

Following gene: 153951980

Centisome position: 0.39

GC content: 31.8

Gene sequence:

>1302_bases
TTGATCTTACTTACAAATCCTATCATCATCAGTGTAGTTTTGATGACTTTACTTTGTTTGTTTCGTTTTAATGTACTTTT
GAGTCTTTTGATCTCAGCTCTTGTTGCAGGTGTATTTTCTCATCTTGAACTCGTAGATACTATGAATATACTTATAAGCG
GAATGAAAGAAAATTTAAAAACAGCTTTAAGCTATATACTCTTAGGGGCTATTGCCGCAACGATTTCAAAGACAAATTTA
ACTGCATACTTGATTAAGATAGTAAGTCATTTTATATCTCATAAAAAATATTTATTGCTTTTGTCTATAGCTTTGATTTC
TTGTTTTTCTCAAAATTTAATTCCTATTCATGTAGCTTTTATACCTTTGTTGATCCCACCTCTTTTAGGTCTTTTTAATA
AACTTAAAATCGATCGTAGGGCGGTTGTTTGTGCTTTAACTTTTGGACTTACTACGCCTTATATGGTTTTGCCAGTAGGT
TTTGGACTTACTTTTCAAGATCTTTTAAAAGATAATTTAAATGCAAATAATGTAAGCGTATCTTTAAACGATGTTACAAA
TACTATGTATTTTGCTGCTATTTGTATGATAACAGGACTTTTTCTAGCGCTTTTTGTGTTTTATCGTAAGCCAAGAGAGT
ATCAAGAAGTAGAAATTGCTAAAGTGGATTTAGAAAATCTTGAAATGACGCGTAAGGAATGGGGCGTTTTAGCTGGGCTT
GTTTTAACTTTAATTTTACAAATTTTGACTATGAATTTACCTTTATCAGGGCTTTTGGGTTTTATTTTAATGGTTATTTT
GGGTGGAGTTGAATTTTCGAAAGTCAATGAAGTTTTTGATGATGGACTTAAAATGATGGGTTTTATAGCTTTTGTTATCC
TTGTTGCTGCAGGATATGGAGAAGTTTTAAAAGAAAGTGGATCAGTAGTAGAGCTTGTAAATTCAGTCGTTCCTTGGATG
GAGCAAAGTAAATTTTTAGCAGTCTTTTTCATACTTTTAATAGGACTTATCATCACTATGGGTATAGGTACTTCTTTTGG
AACTATACCTATCATAGCTACGCTTTTTTGTCCTATTTGTTTGGAACTTGGTTTTAGTACAGCACTTATTATATTTATCT
TAGGAGTAGCAGGAGCTTTAGGAGATGCAGGAAGTCCAGCTAGTGAAACAACCATGGGAACTACTGTAGGATTAAATGCT
GATAAACAACACGATCACATTAAAGATACTTGTATACCAACTTTTATTTTCTACAATGGTCCATTATTGATTTTAGGTAG
TATTATTGCCATGTTTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATGTTACTGAAATTTACATATTAATCCACCAATAATTTTTATCTCATTTTAAAAAATTTTCTTTAAAATTAAGTTTTTA
TAAATTCATAAGGAAAAATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTGCAAATCTATTAAAATATTTTTTAATTTATTTATTTTTAAGATAAAAATTATATTGATTTTAAAAAAAATGTATG
CTACAATCCTTATAAAGCTA

Product: Na+/H+ antiporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF3 [H]

Number of amino acids: Translated: 433; Mature: 433

Protein sequence:

>433_residues
MILLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLKTALSYILLGAIAATISKTNL
TAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAFIPLLIPPLLGLFNKLKIDRRAVVCALTFGLTTPYMVLPVG
FGLTFQDLLKDNLNANNVSVSLNDVTNTMYFAAICMITGLFLALFVFYRKPREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFILMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYGEVLKESGSVVELVNSVVPWM
EQSKFLAVFFILLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPICLELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNA
DKQHDHIKDTCIPTFIFYNGPLLILGSIIAMFL

Sequences:

>Translated_433_residues
MILLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLKTALSYILLGAIAATISKTNL
TAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAFIPLLIPPLLGLFNKLKIDRRAVVCALTFGLTTPYMVLPVG
FGLTFQDLLKDNLNANNVSVSLNDVTNTMYFAAICMITGLFLALFVFYRKPREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFILMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYGEVLKESGSVVELVNSVVPWM
EQSKFLAVFFILLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPICLELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNA
DKQHDHIKDTCIPTFIFYNGPLLILGSIIAMFL
>Mature_433_residues
MILLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLKTALSYILLGAIAATISKTNL
TAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAFIPLLIPPLLGLFNKLKIDRRAVVCALTFGLTTPYMVLPVG
FGLTFQDLLKDNLNANNVSVSLNDVTNTMYFAAICMITGLFLALFVFYRKPREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFILMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYGEVLKESGSVVELVNSVVPWM
EQSKFLAVFFILLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPICLELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNA
DKQHDHIKDTCIPTFIFYNGPLLILGSIIAMFL

Specific function: Unknown

COG id: COG2056

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001991
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47140; Mature: 47140

Theoretical pI: Translated: 6.24; Mature: 6.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
5.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MILLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLK
CEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TALSYILLGAIAATISKTNLTAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
IPLLIPPLLGLFNKLKIDRRAVVCALTFGLTTPYMVLPVGFGLTFQDLLKDNLNANNVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEE
SLNDVTNTMYFAAICMITGLFLALFVFYRKPREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFILMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
EVLKESGSVVELVNSVVPWMEQSKFLAVFFILLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPIC
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNADKQHDHIKDTCIPTFIFYNG
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLLILGSIIAMFL
HHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MILLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLK
CEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TALSYILLGAIAATISKTNLTAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
IPLLIPPLLGLFNKLKIDRRAVVCALTFGLTTPYMVLPVGFGLTFQDLLKDNLNANNVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEE
SLNDVTNTMYFAAICMITGLFLALFVFYRKPREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFILMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
EVLKESGSVVELVNSVVPWMEQSKFLAVFFILLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPIC
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNADKQHDHIKDTCIPTFIFYNG
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLLILGSIIAMFL
HHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12620739; 8021208 [H]