| Definition | Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009707 |
| Length | 1,845,106 |
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The map label for this gene is pglB
Identifier: 153951707
GI number: 153951707
Start: 537371
End: 539512
Strand: Direct
Name: pglB
Synonym: JJD26997_0595
Alternate gene names: NA
Gene position: 537371-539512 (Clockwise)
Preceding gene: 153952440
Following gene: 153950979
Centisome position: 29.12
GC content: 29.32
Gene sequence:
>2142_bases ATGTTGAAAAAAGAGTATTTAAAAAACCCTTATTTAGTTTTGTTTGCGATGATTATATTAGCTTATGTTTTTAGTGTATT TTGTAGGTTTTATTGGGTTTGGTGGGCAAGTGAGTTTAACGAGTATTTTTTCAATAATCAATTAATGATCATTTCAAACG ATGGCTATGCTTTTGCTGAGGGTACAAGAGATATGATAGCAGGTTTTCATCAGCCTAATGATTTGAGTTATTATGGATCT TCTTTATCTACGCTTACTTATTGGCTTTATAAAATCACGCCTTTTTCTTTTGAAAGTATCATTTTATATATGAGTACTTT TTTATCTTCTTTGCTGGTGATTCCTATTATTTTACTAGCTAATGAATACAAATGTCCTTTAATGGGCTTTGTAGCTGCTC TCTTAGCAAGTATAGCAAACAGTTATTATAATCGCACTATGAGCGGGTATTATGATACGGATATGCTAGTGATTGTTTTA CCTATGTTTATTTTATTTTTTATGGTAAGAATGATTTTAAAAAAAGACTTTTTTTCATTGATTGCTTTACCGTTATTTAT AGGAATTTATCTTTGGTGGTATCCTTCAAGCTATACTTTAAATGTAGCTTTAATCGGACTTTTTTTAATTTATACGCTTA TTTTTCATAGAAAAGAAAAGATTTTTTATATAGCTGTGATTTTGTCTTCTCTTACTCTTTCAAATATAGCATGGTTTTAT CAAAGTGCCATTATAGTAATACTTTTTGCTTTGTTTGCCCTAGAGCAAAAACGCTTAAATTTTATGATTATAGGGATTTT GGGTAGCGCAACTTTGATATTTTTGATTTTAAGTGGTGGGGTTGATCCTATACTTTATCAGCTTAAATTTTATATTTTTA GGAGTGATGAAAGTGCGAATTTAACACAGGGATTTATGTATTTTAATGTCAATCAAACCATACAAGAAGTTGAAAATGTA GATCTTAGCGAATTTATGCGAAGAATTAGTGGTAGTGAAATTGTTTTTTTGTTTTCTTTGTTTGGTTTTGTATGGCTTTT GAGAAAACATAAAAGTATGATTATAGCTTTACCTATATTGGTGCTTGGGTTTTTAGCCTTAAAAGGGGGGCTTAGATTTA CTATTTATTCTGTGCCTGTAATGGCTTTAGGATTTGGTTTTTTATTGAGCGAGTTTAAGGCTATATTGGCTAAAAAATAT AGCCAATTAACTTCAAATATTTGTATTGTTTTTACAACTGTTTTGACTTTAACTCCAGTATTTATCCATATTTACAATTA CAAAGCACCAACAGTTTTTTCTCAAAATGAAGCATCATTATTAAATCAATTAAAAAATATAGCCAATAGAGAAGACTATG TGGTAACTTGGTGGGATTATGGTTATCCTGTGCGTTATTATAGCGATGTGAAAACTTTAGTAGATGGTGGAAAGCATTTA GGCAAGGATAATTTTTTCCCTTCTTTTGCTTTAAGCAAAGATGAACAAGCTGCAGCTAATATGGCAAGACTTAGTGTAGA ATATACAGAAAAAAGCTTTTATGCTCCGCAAAATGATATTTTAAAAACAGATATTTTGCAAGCCATGATGAAAGATTACA ATCAAAGCAATGTGGATTTGTTTTTAGTTTCATTATCAAAACCTGATTTTAAAATCGATACACTAAAAACTCGTGATATT TATCTTTATATGCCCGCTAGAATGTCTTTGATTTTTTCTACTGTGGCTAGTTTTTCTTTTATTAATTTAGATACAGGGGT TTTGGACAAACCTTTTACCTTTAGCACAGCTTATCCACTTGATGTTAAAAATGGAGAAATTTATCTTAGCAACGGAGTGG TTTTAAGCGATGATTTTAGAAGTTTTAAAATAGGTGATAATGTGGTTTCTGTAAATAGTATCGTAGAGATTAATTCTATT AAGCAAGGTGAATACAAAATCACTCCAATCGATGATAAGGCTCAGTTTTATATTTTTTATTTAAAGGATAGTGCTATTCC TTATGCACAATTTATTTTAATGAATAAAACCATGTTTAATAGTGCTTATGTGCAAATGTTTTTTTTAGGAAATTATGATA AGAATTTATTTGACTTGGTGATTAATTCTAGAGATGCTAAAGTTTTTAAACTTAAAATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTAAGAAAAGCGTATAAAAATAAGGCTAAAACTAGGGCTAAGGCCTTTGATAAAGTAAAAATTGCACGCGATGCTTTGA AATATTTATTAGGATAAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases GGGTTTGAAAATGAGAATAGGATTTTTATCACATGCAGGAGTAAGTATTTATCATTTTAGAATGCCTATTATTAAAGCAT TAAAAGATAGAAAAGATGAA
Product: general glycosylation pathway protein
Products: NA
Alternate protein names: General Glycosylation Pathway Protein; Oligosaccharide Transferase; Oligosaccharyl Transferase Stt3 Subunit; Oligosaccharyl Transferase PglB; Acetyltransferase; Oligosaccharide Transferase N-Glycosylate Proteins; Iron Chelatin ABC Transporter Permease Protein; Oligosaccharyltransferase; Hydroxylamine Reductase (Hybrid-Cluster Protein
Number of amino acids: Translated: 713; Mature: 713
Protein sequence:
>713_residues MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVFCRFYWVWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGTRDMIAGFHQPNDLSYYGS SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLLVIPIILLANEYKCPLMGFVAALLASIANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRSDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV DLSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIIALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILAKKY SQLTSNICIVFTTVLTLTPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKTDILQAMMKDYNQSNVDLFLVSLSKPDFKIDTLKTRDI YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMNKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI
Sequences:
>Translated_713_residues MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVFCRFYWVWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGTRDMIAGFHQPNDLSYYGS SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLLVIPIILLANEYKCPLMGFVAALLASIANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRSDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV DLSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIIALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILAKKY SQLTSNICIVFTTVLTLTPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKTDILQAMMKDYNQSNVDLFLVSLSKPDFKIDTLKTRDI YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMNKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI >Mature_713_residues MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVFCRFYWVWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGTRDMIAGFHQPNDLSYYGS SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLLVIPIILLANEYKCPLMGFVAALLASIANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRSDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV DLSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIIALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILAKKY SQLTSNICIVFTTVLTLTPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKTDILQAMMKDYNQSNVDLFLVSLSKPDFKIDTLKTRDI YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMNKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI
Specific function: Unknown
COG id: COG1287
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82242; Mature: 82242
Theoretical pI: Translated: 8.45; Mature: 8.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVFCRFYWVWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAE CCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCEEEEC GTRDMIAGFHQPNDLSYYGSSLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLLVIPIILLA CCHHHHHCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NEYKCPLMGFVAALLASIANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVLPMFILFFMVRMILKKDFFSL CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRSDESAN HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEEEEEECCCCCC LTQGFMYFNVNQTIQEVENVDLSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIIALPIL CEECEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH VLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILAKKYSQLTSNICIVFTTVLTLTPV HHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH FIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL HHEEECCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHC GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKTDILQAMMKDYNQSNVDL CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEECHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE FLVSLSKPDFKIDTLKTRDIYLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPL EEEEECCCCEEEEEEEECEEEEEECHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEECCCCCE DVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSIKQGEYKITPIDDKAQFYIFY EECCCEEEEECCEEEECCCCCEECCCCEEEECCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEE LKDSAIPYAQFILMNKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHHHEECCCCCEEEEEEC >Mature Secondary Structure MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVFCRFYWVWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAE CCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCEEEEC GTRDMIAGFHQPNDLSYYGSSLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLLVIPIILLA CCHHHHHCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NEYKCPLMGFVAALLASIANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVLPMFILFFMVRMILKKDFFSL CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRSDESAN HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEEEEEECCCCCC LTQGFMYFNVNQTIQEVENVDLSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIIALPIL CEECEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH VLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILAKKYSQLTSNICIVFTTVLTLTPV HHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH FIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL HHEEECCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHC GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKTDILQAMMKDYNQSNVDL CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEECHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE FLVSLSKPDFKIDTLKTRDIYLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPL EEEEECCCCEEEEEEEECEEEEEECHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEECCCCCE DVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSIKQGEYKITPIDDKAQFYIFY EECCCEEEEECCEEEECCCCCEECCCCEEEECCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEE LKDSAIPYAQFILMNKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHHHEECCCCCEEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA