Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 153951029

Identifier: 153951029

GI number: 153951029

Start: 198126

End: 200120

Strand: Direct

Name: 153951029

Synonym: JJD26997_0214

Alternate gene names: NA

Gene position: 198126-200120 (Clockwise)

Preceding gene: 153951633

Following gene: 153952618

Centisome position: 10.74

GC content: 32.98

Gene sequence:

>1995_bases
ATGTACAAAAAACAAAATTTACCAGAACTTACCTTAAGGGGTTTGATTTTGGGAAGTATTTTAACTATTATTTTTACAGC
TTCAAATGTATATTTGGGGTTAAAAGTGGGACTTACTTTTTCATCATCAATTCCAGCTGTGATCATCTCCATGGCGGTTT
TGAGTCTTTTTAAGACTTCAAATATTTTAGAAAATAATATGGTTCAAACTCAAGCTTCAGCAGCAGGAACTTTATCATCA
GTTATTTTTGTTATCCCAGGGCTTTTTATGTGTGGGTATTGGAGTGAATTTCCACTTTGGCAAACTTTTATGATATGTCT
TTGTGGTGGCGGACTTGGAGTGCTTTTTACCATACCATTAAGAAGGGCTATGGTGGTTGAAAGTAAACTTGCTTATCCTG
AAGGTAGAGCCGCAGCTGAAATTTTAAAAGTAGCCAATAAAGATCAGAGTAATAAAAAAGGAAAACAAGGTATTAAAGAA
ATAGCATTAGGCTCTTTTATAGCTGCTATTTTTAGTTTATTGAGCAATGGTTTTAAACTCGCTGCAAGTGAGAGTAATTT
TGCTTTTATTTGGAATAAAATGGCTTTTGGTTTTTCTATGGGATATTCTTTGGCACTTTTAGGGGCGGGTTATTTAGTCG
GTTTAGCAGGTGCTATAGCTCTTTTTGTAGGTATGTTTTTAGCTTGGGGTATTTTTACTCCCTATCTTTCAAATTTTGAA
TTCGATAGTACAAAAAATGCCGTAGATTTAGCTTCTAGTGTATGGAGTTCTAAAGTAAGACTTATAGGAACAGGAGCTAT
TGCTATAGCAGCGCTTTGGACTTTAATAGAACTTTTAAAACCCGTTATTGAAGGTATTAAAGAAATTGTTAAAAATGTTA
AAATTACTAATCAAGAAAAAAATGAAAGAACAAATATAGATCTTTCTTTAAAAAGTATTTTTATACTTTTTGTTTTAATG
GTTGTGGGTTTATTTATTACTTTTTATAGTTTTGTTGAAGATGCTAACTTAAGTATTTATTATCAAATGCTATTTTCATT
TGTTGGAACTTTAGTTTCTGTTTTAATAGGTTTTTTTGTTGCAGCAGCTTGCGGATATATGGCAGGACTTGTAGGATCTT
CTTCTAGTCCTATTTCTGGAATTGGACTTATTGGTGTTATTATTTCTTCTATTGTTTTTTTGGTTTTAGGTGTGGAACTT
TTTCAAGATCCTATGCTTTCTAAATTTGCAGTAGCATTAGCTATTTTTACTACTGGTGTTATTTTGGCTACAGCTGCTAT
TTCGAATGATAATTTACAAGATTTAAAGACAGGACATTTAGTCGGAGCTACTCCTTGGAAGCAACAGGTTGTTTTACTTG
TAGGCTGTGTTTTTGGTGCTTTGGCTATAGTTCCTGTTTTAAATTTGCTTTATCAAGCCTATGGTTTTGTCGGAGCAATG
CCAAGAGAAGGTATGGATGCTTCATCGGCTTTAGCAGCACCGCAAGCAAATTTAATGAGTACTATCGCTCAAGGAATTTT
TCATCACAATATAGAGTGGGGTTATATGGCTTTTGGTGTATTTGTAGGAATTTTAATGATTATTATAGATAAAATTTTAA
GAAGAACACAGAAAATGTCTCTGCCGCCTTTAGCCGTTGGAATAGGTATTTACCTTCCGCCTGCTGTAAACATACCTTTA
GTTATAGGCGGAATTTTAAAATATATTGTAATGCAATACTTGACTAAAAAATATGCAAAAAATTCTCATAAAGAAGAAAA
ACTTGCAAGTTGTGAGCAAAGAGGCACGCTTTTTGCTTCAGGGCTTATAGTGGGTGAAAGTATTTTTGGGGTAATTATCG
CAGGAATTACTGTATTTTCAGTAAGTATGGGTGGTAGTGAAAATCCTTTAGCTTTAAATTTAACAAATTTTCATGATAGT
GAGCTTTTCGCACTTATCTTTTTTGTGGGAGTTGTATTATATTTCATTAAGCGCATTGTTAAAAAAGACGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTTTTGTATTATTTTATTTTGCTTTAGAGAAAAATTATAAATTTAAACTTATAAGAATATTTTTTAAGTTGAAAGTA
AATTTTAAAACGGAGAAATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTGGGGTTAAAACCCCATTTAATCCATTTTGATATAATTTTTCTTTTGCAATTATCATTCAAGGATTAAAATGGGAA
ATTTATATGCTTTAATACTT

Product: OPT family oligopeptide transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 664; Mature: 664

Protein sequence:

>664_residues
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVIISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS
VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRAMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSNKKGKQGIKE
IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
FDSTKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM
VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL
FQDPMLSKFAVALAIFTTGVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVVLLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMAFGVFVGILMIIIDKILRRTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL
VIGGILKYIVMQYLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLTNFHDS
ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA

Sequences:

>Translated_664_residues
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVIISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS
VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRAMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSNKKGKQGIKE
IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
FDSTKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM
VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL
FQDPMLSKFAVALAIFTTGVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVVLLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMAFGVFVGILMIIIDKILRRTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL
VIGGILKYIVMQYLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLTNFHDS
ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA
>Mature_664_residues
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVIISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS
VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRAMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSNKKGKQGIKE
IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
FDSTKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM
VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL
FQDPMLSKFAVALAIFTTGVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVVLLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMAFGVFVGILMIIIDKILRRTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL
VIGGILKYIVMQYLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLTNFHDS
ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA

Specific function: Unknown

COG id: COG1297

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family [H]

Homologues:

Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6321324, Length=742, Percent_Identity=21.9676549865229, Blast_Score=84, Evalue=8e-17,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004814
- InterPro:   IPR004813 [H]

Pfam domain/function: PF03169 OPT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71469; Mature: 71469

Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVIISMAVLSLFKTS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NILENNMVQTQASAAGTLSSVIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
RRAMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSNKKGKQGIKEIALGSFIAAIFSLLSNGFKL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
AASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
FDSTKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEK
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
NERTNIDLSLKSIFILFVLMVVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVELFQDPMLSKFAVALAIFTTGV
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVVLLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
HHHHHHCCCCCHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMAFGVFVGILMIIIDKILRRTQKMS
CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LPPLAVGIGIYLPPAVNIPLVIGGILKYIVMQYLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFAS
CCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
GLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLTNFHDSELFALIFFVGVVLYFIKRIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKDA
HCCC
>Mature Secondary Structure
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVIISMAVLSLFKTS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NILENNMVQTQASAAGTLSSVIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
RRAMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSNKKGKQGIKEIALGSFIAAIFSLLSNGFKL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
AASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
FDSTKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEK
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
NERTNIDLSLKSIFILFVLMVVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVELFQDPMLSKFAVALAIFTTGV
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVVLLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
HHHHHHCCCCCHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMAFGVFVGILMIIIDKILRRTQKMS
CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LPPLAVGIGIYLPPAVNIPLVIGGILKYIVMQYLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFAS
CCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
GLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLTNFHDSELFALIFFVGVVLYFIKRIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKDA
HCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]