| Definition | Clostridium botulinum A str. Hall, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009698 |
| Length | 3,760,560 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 153937754
GI number: 153937754
Start: 1063104
End: 1065263
Strand: Direct
Name: yhgE [H]
Synonym: CLC_1045
Alternate gene names: 153937754
Gene position: 1063104-1065263 (Clockwise)
Preceding gene: 153936699
Following gene: 153936985
Centisome position: 28.27
GC content: 27.41
Gene sequence:
>2160_bases ATGAAAAAGGTATTTAGAATATTTTCAAGAGATTTAAAAAATATAGTTAAACATCCTGCAGCCATTATAGTAGTATTAGG ATTATGCTTTATCCCTTCTTTGTATGCATGGATTAATATAGAGGCTTGTTGGGATCCCTATGCTAATACGGGAAATTTGC CTATAGCCATAGTTAATAAGGATGAAGGTATGATGATTAGGGGGAAATATACAAATGTAGGAAATGGCATTATTGAAAGT TTAAAGGGAAATAAAAAAATGGGCTGGGTTTTTGTAGATGAGTGGCAAGCAAATTATGGACTTAATGAAGGTAAATATTA TGCTCTTATAGAAATACCTTCTAATTTTACTAGTGGACTAGCAAGTTTAAAAACTACAGATCCCCAAAAGCCTAATATTA TATATAGAGTTAATGAAAAATCAAATGCCATAGCAACTAAAATAACCAATGCAGCAAAAGGAAGTTTGGCTAAAGAAATT CAAACCAATTTTGTTTATACAGTAAACAAAGAAGCTTTTAAGTTATTAAATAATACAGGTGGTCAATTAGAAAAGAATAA ATCTAAGATACTTGGCATAAAATCTACTTTAGAGCTTGGAAATAAAAGTATTGGAGAAGTAAAAAATATAATAGATGATG CTAGTAAAGATTCAGAAAGCTTAAAGCAGTATTTTAACGATACAAAGGACAAGCTACCACTTATAACAGATCAAATAAAT AATCTACAGAAGGCAACAGAAGCTAGCAAAAATCTAGTAAATGAAACGGAACGAGATTTAAATGGCATAGCAAAAAATAT TAATAATGATATGATATATAGAGAAAGCACAAATAGTAAAATTAATAGCATATTAACAAATTTAAAAGAGTATAACAATG TTAGTAATAATTCAGAAATGGTTAAACTTGTAGATGAAGCATCAAAATTATGTGATTCTATAAATAGTAATATAGATGGG ACTATAAAATCATTAGAAATAGTAAATATTTTAAAACCTAATAAAATAATTGAGGAATTAATAAATAGTTTAAAAAATTT ACAAGAAAAAGTTAATGGTGAAAAAAATAAATTAACTGAACTAAAGAATAAGATTTCTACTTCAAACAATAATAAACAAA ATATAAATCAGGTTGTAGAATCTATATTGCTATTAAATGATGAGATAAATAAAAATATGAAAAATACATCTAATATTTTT TATAATCAAACAACTATGATAATAGAAAATACTGCTAAAGGATTAAACAATAGATTAGATACAGCTAATGACATATTAGA TACTACCAAATTAGTAATACCTCAATTAAAGGCTTTGGGGGATTTTGGAGTAGGAACTAGTGATGCAGCTTTAAAAGATG GAAAAAAAATAAATAATAAATTAGCAGAATTTAAAAAAACAATAAATAAACTAGAGGAAAAAACGTCTTCTTTAACTGAG GATAATTTAGATAAAATAATAAATTTAACTCAAAAAAATCCAGAACAAATGGCTTCATTTATATCTTCTCCAATAAATAT TAAAGAAGAGGAGATATATAATACAGGAATATTTGGAGTAGGATTAACTCCATTTTATACAGTTTTAGCTATATGGGTAG GAGTTCTATTAATGAGTTCATTGATATCTGTAGAAGCAGAAGAATTTGAGGGAGAGAAAAAGCTTACTCATCTTCAAGTA TATTTTGGAAAATTGCTTTTATTTTTATCAATAGCTATAATACAAGGAATTATTGTAACCTTAGGTGATGTATTTATTTT GGGAATTAAACCAGCAAGTATGGGATTGTTGATGGTATTTACTATAGTAACAGCTATAACTTTCACTTTTATAATATATA CCCTAGTATCTATTTTCGGAAACCTTGGAAAGGCTATTGCAGTAGTTATAATGGTATTCCAAATAGCTGGTGCAGGGGGA ATATATCCAATACAAACTAATCCTAAAATATTTGGTGTATTGCAGCCTTTATGGCCTTTTACTTATGCTATAGCAGGATT TAGAGAAGCTATAGCAGGGCCTGTACGAGCCGCTGTAATTAAAAATTTAGGAGCTTTATTTATATTTTCTATAGGCTCAT TATTATTAGTTGTTCTTAAAAAGCCGTTACATAAGGTTACTGAATATATGAACGATAAATTTATAGAAACAGGATTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCTTAAAATCTCCGTTACATCATAAAATTAGTAAGTTTGACGAAGACTTTAAGGCTTCAGGAATATCAGAATAAATAGA GAAAATAAAGAGGTGAGCAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GGAAATTACAACTTCAGCCTTTAAAGGTTGAAAATTAAAACAAGAAATACTTTTAGTCAATAGATAGCTATAAAAATAAA GAATACTAATATTAGTTCAC
Product: putative phage infection protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 719; Mature: 719
Protein sequence:
>719_residues MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNKDEGMMIRGKYTNVGNGIIES LKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGLASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEI QTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMVKLVDEASKLCDSINSNIDG TIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMKNTSNIF YNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQV YFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGG IYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL
Sequences:
>Translated_719_residues MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNKDEGMMIRGKYTNVGNGIIES LKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGLASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEI QTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMVKLVDEASKLCDSINSNIDG TIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMKNTSNIF YNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQV YFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGG IYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL >Mature_719_residues MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNKDEGMMIRGKYTNVGNGIIES LKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGLASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEI QTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMVKLVDEASKLCDSINSNIDG TIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMKNTSNIF YNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQV YFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGG IYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 79667; Mature: 79667
Theoretical pI: Translated: 9.37; Mature: 9.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNK CHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEC DEGMMIRGKYTNVGNGIIESLKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGL CCCEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHH ASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTG HHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHCCC GQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN CCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHH NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH VKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTE HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH LKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMKNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLD HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCEEEEEEHHHHHHHHCCC TANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSS HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVF HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHH TIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH TYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNK CHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEC DEGMMIRGKYTNVGNGIIESLKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGL CCCEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHH ASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTG HHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHCCC GQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN CCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHH NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH VKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTE HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH LKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMKNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLD HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCEEEEEEHHHHHHHHCCC TANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSS HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVF HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHH TIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH TYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]