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The map label for this gene is 153937612

Identifier: 153937612

GI number: 153937612

Start: 488170

End: 489936

Strand: Direct

Name: 153937612

Synonym: CLC_0487

Alternate gene names: NA

Gene position: 488170-489936 (Clockwise)

Preceding gene: 153936994

Following gene: 153936482

Centisome position: 12.98

GC content: 32.2

Gene sequence:

>1767_bases
ATGAAAAAAAATAGGGGAGTTTTATTAACTTTTTCATTTGTTTTAATGATCTTATTATTTAATAACATGTCAGTATTAGC
GGCAGATTTAGACCCAAAAGTTGTAGCAGAAAATGCTAGTAGATTGGGAATATGGACTATTTTACCGCCAGTAATAGCTA
TTGTATTAGCCTTTATTACAAAAAATGTAGTTATTTCTTTAGCACTAGGTGTTTTTAGTGGAAGCTTTTTATTACAGCTA
AATGGAAACAACATATTCGGTGCTAGTTTCAAAGCTTTTTTAGATTTTATAAATAGAATACTAAATTCCCTTGCAGATCC
TTGGAATGCAGGAATAATACTTCAATGTATGGTTATAGGTGGTCTTATAGCAGTAATTTCTAAAATGGGTGGGGCTAAAG
CTGTTGCAGAATCTTTAGCTAAAAAAGCTAGAACCCCAAAGAGTGCCCAAATTATAACTTGGTTTTTAGGTTTATTAGTT
TTCTTTGACGATTATGCTAATGCTCTTATAGTAGGACCTATAATGAGACCTGTTGCAGATAAAATGAAAATATCAAGGGA
AAAATTAGCCTTTATAATAGATGGTACAGCAGCACCAATAGCTGGTATAGCGGTTATATCTACATGGATAGGATATGAAA
TAAGTTTAATAAAAGATGCTTATGCAAGTATTGGTCAAAGTGTAAATGCTTATGGATTATTTTTATCAACTATACCTTAT
AGGTTTTATAATATATTAATATTAGCATTTATAGTTTTAATAGCTTTAATGGGAAGAGATTTTGGACCAATGCTTAAGGC
TGAAAGAAGAGCAAGAACTACAGGTAAGCTTTTATCTGATACAGCAAAGCCAATGGTTTCTGAAGAAAGTACAGAACTTG
AACCAAGGGAAGGGATAAAATTAAATATTTGGAATGCAATAATCCCAATAGCAATATTAATAATTGGAGCCTTTGCAGGT
TTTTATTATAACGGGTATCAAGCTATAATGGGTGGAGAAGATAAGGCTTTAATACAAATGCTACAAACTTCACCTGCATC
CTTTGATGCTTTAAGGGAAACTTTTAGTGCATCAGATGCTAGTGTAGTTTTATTTCAATCTGCGTTACTTGCAAGTATAG
TAGCAATAATAATGGGAGCTTCACAAAAGATTTTCAAAGTAGGAGAAGCTATAGATGTTTGGATTACAGGGATGAAATCT
TTAATTATAACAGCAGTTATACTGCTTCTTGCTTGGTCCTTAAGTGCAGTTATAAAAGAACTTGGAACGGCTACTTTTTT
AGTTTCAATTTTATCTAACTCTATACCAAAATTTTTATTACCAAGCATAATATTTATATTGGGATCTGTTATATCTTTTG
CTACAGGATCAGCTTACGGAACAATGGGTATACTAATGCCTTTAACAATTCCATTAGCTTATGCTATATCACCAGATCCA
ACTTATGTAGTAATAAGCGTAAGTGCTGTTCTGACAGGAGCAATATTTGGAGATCATTGTTCTCCAATATCAGACACAAC
TATAATGTCTTCTATGGGATCTGCTTGTGATCATTTGGATCATACCTCAACACAAATGGTATATGCTTTAACTGTAGCAG
CATGTACAATATTATTTGGGTACATTCCAGCAGGTTTAGGATTACCAATATATATAGTTTTACCATTATCAATAGGATTA
GTTGCATTATTAATTAGATTTGTAGGTAAGCCAAATGATATACCAGAAGAAGAAAGCTTAGAAGAAGTTTTAGAAATGGA
TGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGGCTTTTTTATTTTTGATGATGGTTTTCCTCCCCATATTCACTTAAATTTTAAAGCTTATAGGGCTTGAAATTTAT
AAATAGAGGAGGAGATTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAAGGAAAGTGCTTAGCACTTTCCTTATTGTTCTTCTCTAGGTTCTTCATCTCTATCTCTTCCATAGAATGAAATTGC
ATATAAACCTGCTATACCTA

Product: Na+/H+ antiporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 588; Mature: 588

Protein sequence:

>588_residues
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL
NGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKARTPKSAQIITWFLGLLV
FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPIAILIIGAFAG
FYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDASVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS
LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL
VALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA

Sequences:

>Translated_588_residues
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL
NGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKARTPKSAQIITWFLGLLV
FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPIAILIIGAFAG
FYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDASVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS
LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL
VALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA
>Mature_588_residues
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL
NGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKARTPKSAQIITWFLGLLV
FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPIAILIIGAFAG
FYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDASVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS
LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL
VALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62991; Mature: 62991

Theoretical pI: Translated: 5.87; Mature: 5.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFIT
CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNVVISLALGVFSGSFLLQLNGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIG
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
GLIAVISKMGGAKAVAESLAKKARTPKSAQIITWFLGLLVFFDDYANALIVGPIMRPVAD
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHH
KMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCE
LNIWNAIIPIAILIIGAFAGFYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDA
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCC
SVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKSLIITAVILLLAWSLSAVIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFG
CEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIPAGLGLPIYIVLPLSIGLVALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA
HHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFIT
CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNVVISLALGVFSGSFLLQLNGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIG
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
GLIAVISKMGGAKAVAESLAKKARTPKSAQIITWFLGLLVFFDDYANALIVGPIMRPVAD
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KMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCE
LNIWNAIIPIAILIIGAFAGFYYNGYQAIMGGEDKALIQMLQTSPASFDALRETFSASDA
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCC
SVVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKSLIITAVILLLAWSLSAVIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFG
CEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIPAGLGLPIYIVLPLSIGLVALLIRFVGKPNDIPEEESLEEVLEMDA
HHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]