| Definition | Clostridium botulinum A str. Hall, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009698 |
| Length | 3,760,560 |
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The map label for this gene is 153937141
Identifier: 153937141
GI number: 153937141
Start: 125680
End: 129732
Strand: Direct
Name: 153937141
Synonym: CLC_0149
Alternate gene names: NA
Gene position: 125680-129732 (Clockwise)
Preceding gene: 153935392
Following gene: 153936480
Centisome position: 3.34
GC content: 23.86
Gene sequence:
>4053_bases ATGAAATGTTCAGAGAAGATAAAAAATATATTTTATTATCTTTTAAGAATAAAAAGAATGAATAAATGCTCAAGTGATGT TAGAACATATGAAGCCCTATATACTAAAAAAGATATACTTAACAATAGTTATTGTAATGTGAGTAGAGATAAGGAGGATA ATGTAACTATAAAAATATCCAAAGAAGCAGGGAAAATATATGATAAAATTTATAAACAATACCTAGATGGAGGGAATGAA AACGAAATAATATTAGGACAAGCTATCTTAGCATTGAGAAAAAATAAAAACATAATTCATCCTGTTATAACTTCAAAGGT TAAAGTAGATTTTATAGATAAGGAAAATGTATTGAGTCTAAAAATACCTAGTAATATAAAATTAGAAATAGAAGTTTGCG ATTGCCTAAATAAAACTTTGTTTAAAAAAATAATATCTCGAAAGAATGATTGGGAAAAAGAAAAAATAGACATAATGAAT TATGATAATATAAAAAATAAAATACAATTATTATTAAATAATGACTCAGAAATAGTATTTAAAGATATAGAAGATTTAAA TAAGATAGAAATAACAGAAGAGCCTGTTATATATAATTGTCCAATACTTGTAATTAGAAAAGCAGATAATAGCTTATGGA GTAAGGAATTTCAATCAATAGTAGAAGAAATAGACAATGGCTATGATATACCTAAAACCATTGAAGCTTTAGTAGAGGAA AAGGAAATAGAGGATGATTATATTCACAAAGATCAATGGAAGGAATGTAAGGAGGATATATTATTTCCTTTAGACGCAAA TGAGGAACAAATTTCTATAGTAAAGAAAATTTGTGAAAATGAAGCTATATTAGTTCAAGGACCACCAGGTACAGGGAAAA GTCATACTATAGCAAATCTTATATGCCATTTTTTAGCTCATGGTAAAAAGGTGTTGATTACTAGTGAAACTAGTAGGGCA TTAAGAGTATTAATAAATAAAATACCTAAAGATATAAAACCATTATGTGTAAATTTATTAGATGATAATAATGGAGAGTA TGAATTAGAACAATGCATTAAAAATATATCTGATAATTTATGTAAAAATCCAAGTGAGATAATAGATGATATATATATTT TAAATAATGAAAGGAAGGAATGTAAAAAAAATCAGCAGGTTTTATATAATAAATTAAAAGAAATTGAATTTATGGAAAAT AAAAAAATACATTGCAAGGGAAACTATTATAAATTAATTCATATAGGATCATGGCTAAATGAAAACGAATATAAATATGG TTGGATAAGAGATAATATAAGATATGAGGATATAAAACCAGTTAATGAAGACCAATTTAATAAATTAATAGAATTATTAA AGAATAACGGAAAAGAATATATAGGCAATATTAATGAACTGATCTTTATATGTAATAAGATACCTTCATATAATGAAGTA GAAAATAAATTAGATAGAATGATATATTTAGAAAGTAATTTAAATTTTTATAAAAATAAAATAAAGGGATGGTATATACC TGCAGAATGTAAATGTAATTATGACATTTTATCAGACTTTTTATACGATTGCATTGAAAAAATGAAAAGCATAATAGAAG AACCTATCCTAGGAAAAATGTTCGAATTATATTATTCAAGTGAAATTTTTAGAGATTCAATAAATAATTTTATGCTTAAT TTAAATAGTTCCAAAGAAAAGCTAATAAAAATAAGAGAAAATATAAATCAATATTCTATCGAGATAAAAGAAATAAAAGA TAAGGATATGTTTATAAAAGATTATGAAAAAGTATATTCAAAAATTAAGGGGAAAAAGAAAATTAGTAAAATATTTAAAG CTATTAATAGTAAATATGATTATATTTTTAAGAATTGTTATATAAATGGAGAAAATATAAAAAGCATCGAACAATTAAAT ATTATAAATGATTATATAGAAGAAAGAAAAATATATAATTTTTTAAATAGGCTGTGGGAAAATATAATAAATAGTTATAT ACAAGAAGATTCTAATTATAATATAGATAATTTAATTTCAATAGAACGTATAACTAATAATTTAGATACCATAATGAATT GGAATAGAGAGTATAGGGATAAAATAATAAAGCTATTAGGAAGAATAAGAATACCTATTAATATAAATTGGTATGAAATA AACACATATGAATATTTTATACAGTGTATAGAATGTATAAAAGCAATAAATGAGTATAATGATTTAAAAGCTTTTATGGA AATAATAAAAAAACAAGTTAGAAATTTTCAAAGTTTAAATTCCATAATAAAAGGTATAGATAAAGAAAATATAGACTATA TAAAAGAGGCTTATAGTTATATAGAAAAAATTATGTCAATGAAATCGGACATGGATGAAATAAATTATGTATATAAAAAG TTGGAAGAAAGTTGCCCTAGGACATTAGAATTTATATTAGAGAATTATAAAAAAAATTATAAATTTAATAGCTGGGAAAA TGCATGGAAATGGGCACAATATAATAATCTGTTTAAAAAATTGGAAAAGATAGATGAAAAAACATTACAAGGACAATTAA TAGAGGAAAAAAATAAAGAAAAGGAAATAATAAATCAAATAATTAGTAAAAAAGCATGGAAGAATATAATATTAAATATT AATGAAGAGGAAAAAAGAAGTTTATTTTCATGGGTACAAGCTGTAAAAAGAATTGGGAAAGGAAGAGGCAAGTTCGTACT ACAGTATAGCAATATAGCAAAAAAAGAAATGGAAAAATGTAAGTCTATAATTCCAGTTTGGATTATGCCTTTAGAAAAGG TAATAGAGAATATAAAACCATCTAAAGAGCAGTTTGACGTGGTAATATTTGATGAAAGTAGTCAGAGCAATATATTTGCA ATATCTGCATTAATGAGAGCTAAGAAGGCAATAATAGTTGGAGATGATAAACAGATTAGTCCTGAAATAGTAGGAATGGA TCAGGGGATGATAAGTAATTTTATTGACAAGTATCTTGATGGTATACCTCATAATCAATGGTTTGATTTACAGACAAGCT TATATGATACGGCTCTTAGAACTTTTAAAGATAGAATAATGCTTAAGGAGCATTTTCGATCTGTGCCAGAAATAGTTCAA TTTAGTAATAAACTTTGTTATGGAGATTTAATAGTACCTCTTAGATATCCCAAAATAAGAGAGGCATTTAATTCACCTAT TAAATGTATAAAAGTTGAAGATGGATATAGAGAAAAAACTAAGCAAATAAATATTAATGAGGCGGAAGCGCTAGTAAATA AGTTACTAGAATGTTGCAGAGATAGCAAATATAATGGAATGACAATGGGGGTCATATCTTTATTAGGAGATGCTCAGAGT GAATTTATAGAAAATTTATTAAAAAATAATTTAAGTAAAGAAGAAATAAAAAGAAGAAAATTGGTTTGTGGAGATGCCTA TTCTTTTCAAGGAGATGAAAGGGATATAATATTTTTATCTATGGTAGTTGGGGATAATATGAAATATACTGCATTGACAA AGGAAACAGACATAAAAAGATTTAATGTAGCAGTAAGTAGAGCTAGAAATCAAATATTTCTTTTTTATTCTATAGATTAC AAAAATATAAATAATGATTGTGTAAGATATAAGTTAATAGATTACTGCAATAATTATAAAAATTATAAAAGCAAATTACC CGATATAAATTATGTTATGGAAAGTAAATTTCAAAAGGATATATATAACAATATTAGGAATTTAAAGTGTGATATAAAAT CAAATATTAAATTAGGAAAATATATTATAGATTTTATACTAGAAGGAGAACATAATAGAATAGCTATAATATGTGATGAT GGAAATTTATATGAAAATAACAATGTAGAGAAGGTTCTAAATTTGGAAATGGATTTAACTAGATTAGGATGGGCTTTTTA TAAAATAAGAGGTAGTAAATTTTATAGAAATCCAGAAGTGGAAGTTGAAAAACTTCATAAATTCTTAATAGAAAGTGGAT TATATAAAGATGATTCTAAAGAAATATTAAAAAATAATTTGTTAGTAGTCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAATTTGTACTACGATTTTTTTGAATATATAGATAGTAAATGGTATAATTTAACATAAAAGTTAATATATTATTCTTTA AAATTAGTGGAGGTGTACAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATATAATCTTTTTTCACCAATGCTATATTTTATACATAATATATGAATATAGCATTATTGGGAGAGGATTCTGTGTTA TATGCATTAATACTTGCAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1350; Mature: 1350
Protein sequence:
>1350_residues MKCSEKIKNIFYYLLRIKRMNKCSSDVRTYEALYTKKDILNNSYCNVSRDKEDNVTIKISKEAGKIYDKIYKQYLDGGNE NEIILGQAILALRKNKNIIHPVITSKVKVDFIDKENVLSLKIPSNIKLEIEVCDCLNKTLFKKIISRKNDWEKEKIDIMN YDNIKNKIQLLLNNDSEIVFKDIEDLNKIEITEEPVIYNCPILVIRKADNSLWSKEFQSIVEEIDNGYDIPKTIEALVEE KEIEDDYIHKDQWKECKEDILFPLDANEEQISIVKKICENEAILVQGPPGTGKSHTIANLICHFLAHGKKVLITSETSRA LRVLINKIPKDIKPLCVNLLDDNNGEYELEQCIKNISDNLCKNPSEIIDDIYILNNERKECKKNQQVLYNKLKEIEFMEN KKIHCKGNYYKLIHIGSWLNENEYKYGWIRDNIRYEDIKPVNEDQFNKLIELLKNNGKEYIGNINELIFICNKIPSYNEV ENKLDRMIYLESNLNFYKNKIKGWYIPAECKCNYDILSDFLYDCIEKMKSIIEEPILGKMFELYYSSEIFRDSINNFMLN LNSSKEKLIKIRENINQYSIEIKEIKDKDMFIKDYEKVYSKIKGKKKISKIFKAINSKYDYIFKNCYINGENIKSIEQLN IINDYIEERKIYNFLNRLWENIINSYIQEDSNYNIDNLISIERITNNLDTIMNWNREYRDKIIKLLGRIRIPININWYEI NTYEYFIQCIECIKAINEYNDLKAFMEIIKKQVRNFQSLNSIIKGIDKENIDYIKEAYSYIEKIMSMKSDMDEINYVYKK LEESCPRTLEFILENYKKNYKFNSWENAWKWAQYNNLFKKLEKIDEKTLQGQLIEEKNKEKEIINQIISKKAWKNIILNI NEEEKRSLFSWVQAVKRIGKGRGKFVLQYSNIAKKEMEKCKSIIPVWIMPLEKVIENIKPSKEQFDVVIFDESSQSNIFA ISALMRAKKAIIVGDDKQISPEIVGMDQGMISNFIDKYLDGIPHNQWFDLQTSLYDTALRTFKDRIMLKEHFRSVPEIVQ FSNKLCYGDLIVPLRYPKIREAFNSPIKCIKVEDGYREKTKQININEAEALVNKLLECCRDSKYNGMTMGVISLLGDAQS EFIENLLKNNLSKEEIKRRKLVCGDAYSFQGDERDIIFLSMVVGDNMKYTALTKETDIKRFNVAVSRARNQIFLFYSIDY KNINNDCVRYKLIDYCNNYKNYKSKLPDINYVMESKFQKDIYNNIRNLKCDIKSNIKLGKYIIDFILEGEHNRIAIICDD GNLYENNNVEKVLNLEMDLTRLGWAFYKIRGSKFYRNPEVEVEKLHKFLIESGLYKDDSKEILKNNLLVV
Sequences:
>Translated_1350_residues MKCSEKIKNIFYYLLRIKRMNKCSSDVRTYEALYTKKDILNNSYCNVSRDKEDNVTIKISKEAGKIYDKIYKQYLDGGNE NEIILGQAILALRKNKNIIHPVITSKVKVDFIDKENVLSLKIPSNIKLEIEVCDCLNKTLFKKIISRKNDWEKEKIDIMN YDNIKNKIQLLLNNDSEIVFKDIEDLNKIEITEEPVIYNCPILVIRKADNSLWSKEFQSIVEEIDNGYDIPKTIEALVEE KEIEDDYIHKDQWKECKEDILFPLDANEEQISIVKKICENEAILVQGPPGTGKSHTIANLICHFLAHGKKVLITSETSRA LRVLINKIPKDIKPLCVNLLDDNNGEYELEQCIKNISDNLCKNPSEIIDDIYILNNERKECKKNQQVLYNKLKEIEFMEN KKIHCKGNYYKLIHIGSWLNENEYKYGWIRDNIRYEDIKPVNEDQFNKLIELLKNNGKEYIGNINELIFICNKIPSYNEV ENKLDRMIYLESNLNFYKNKIKGWYIPAECKCNYDILSDFLYDCIEKMKSIIEEPILGKMFELYYSSEIFRDSINNFMLN LNSSKEKLIKIRENINQYSIEIKEIKDKDMFIKDYEKVYSKIKGKKKISKIFKAINSKYDYIFKNCYINGENIKSIEQLN IINDYIEERKIYNFLNRLWENIINSYIQEDSNYNIDNLISIERITNNLDTIMNWNREYRDKIIKLLGRIRIPININWYEI NTYEYFIQCIECIKAINEYNDLKAFMEIIKKQVRNFQSLNSIIKGIDKENIDYIKEAYSYIEKIMSMKSDMDEINYVYKK LEESCPRTLEFILENYKKNYKFNSWENAWKWAQYNNLFKKLEKIDEKTLQGQLIEEKNKEKEIINQIISKKAWKNIILNI NEEEKRSLFSWVQAVKRIGKGRGKFVLQYSNIAKKEMEKCKSIIPVWIMPLEKVIENIKPSKEQFDVVIFDESSQSNIFA ISALMRAKKAIIVGDDKQISPEIVGMDQGMISNFIDKYLDGIPHNQWFDLQTSLYDTALRTFKDRIMLKEHFRSVPEIVQ FSNKLCYGDLIVPLRYPKIREAFNSPIKCIKVEDGYREKTKQININEAEALVNKLLECCRDSKYNGMTMGVISLLGDAQS EFIENLLKNNLSKEEIKRRKLVCGDAYSFQGDERDIIFLSMVVGDNMKYTALTKETDIKRFNVAVSRARNQIFLFYSIDY KNINNDCVRYKLIDYCNNYKNYKSKLPDINYVMESKFQKDIYNNIRNLKCDIKSNIKLGKYIIDFILEGEHNRIAIICDD GNLYENNNVEKVLNLEMDLTRLGWAFYKIRGSKFYRNPEVEVEKLHKFLIESGLYKDDSKEILKNNLLVV >Mature_1350_residues MKCSEKIKNIFYYLLRIKRMNKCSSDVRTYEALYTKKDILNNSYCNVSRDKEDNVTIKISKEAGKIYDKIYKQYLDGGNE NEIILGQAILALRKNKNIIHPVITSKVKVDFIDKENVLSLKIPSNIKLEIEVCDCLNKTLFKKIISRKNDWEKEKIDIMN YDNIKNKIQLLLNNDSEIVFKDIEDLNKIEITEEPVIYNCPILVIRKADNSLWSKEFQSIVEEIDNGYDIPKTIEALVEE KEIEDDYIHKDQWKECKEDILFPLDANEEQISIVKKICENEAILVQGPPGTGKSHTIANLICHFLAHGKKVLITSETSRA LRVLINKIPKDIKPLCVNLLDDNNGEYELEQCIKNISDNLCKNPSEIIDDIYILNNERKECKKNQQVLYNKLKEIEFMEN KKIHCKGNYYKLIHIGSWLNENEYKYGWIRDNIRYEDIKPVNEDQFNKLIELLKNNGKEYIGNINELIFICNKIPSYNEV ENKLDRMIYLESNLNFYKNKIKGWYIPAECKCNYDILSDFLYDCIEKMKSIIEEPILGKMFELYYSSEIFRDSINNFMLN LNSSKEKLIKIRENINQYSIEIKEIKDKDMFIKDYEKVYSKIKGKKKISKIFKAINSKYDYIFKNCYINGENIKSIEQLN IINDYIEERKIYNFLNRLWENIINSYIQEDSNYNIDNLISIERITNNLDTIMNWNREYRDKIIKLLGRIRIPININWYEI NTYEYFIQCIECIKAINEYNDLKAFMEIIKKQVRNFQSLNSIIKGIDKENIDYIKEAYSYIEKIMSMKSDMDEINYVYKK LEESCPRTLEFILENYKKNYKFNSWENAWKWAQYNNLFKKLEKIDEKTLQGQLIEEKNKEKEIINQIISKKAWKNIILNI NEEEKRSLFSWVQAVKRIGKGRGKFVLQYSNIAKKEMEKCKSIIPVWIMPLEKVIENIKPSKEQFDVVIFDESSQSNIFA ISALMRAKKAIIVGDDKQISPEIVGMDQGMISNFIDKYLDGIPHNQWFDLQTSLYDTALRTFKDRIMLKEHFRSVPEIVQ FSNKLCYGDLIVPLRYPKIREAFNSPIKCIKVEDGYREKTKQININEAEALVNKLLECCRDSKYNGMTMGVISLLGDAQS EFIENLLKNNLSKEEIKRRKLVCGDAYSFQGDERDIIFLSMVVGDNMKYTALTKETDIKRFNVAVSRARNQIFLFYSIDY KNINNDCVRYKLIDYCNNYKNYKSKLPDINYVMESKFQKDIYNNIRNLKCDIKSNIKLGKYIIDFILEGEHNRIAIICDD GNLYENNNVEKVLNLEMDLTRLGWAFYKIRGSKFYRNPEVEVEKLHKFLIESGLYKDDSKEILKNNLLVV
Specific function: Unknown
COG id: COG1112
COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the DNA2/NAM7 helicase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 159695; Mature: 159695
Theoretical pI: Translated: 7.91; Mature: 7.91
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.4 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 2.4 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKCSEKIKNIFYYLLRIKRMNKCSSDVRTYEALYTKKDILNNSYCNVSRDKEDNVTIKIS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE KEAGKIYDKIYKQYLDGGNENEIILGQAILALRKNKNIIHPVITSKVKVDFIDKENVLSL CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCEEEEEECCCCEEEE KIPSNIKLEIEVCDCLNKTLFKKIISRKNDWEKEKIDIMNYDNIKNKIQLLLNNDSEIVF ECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHEEEEECCCCCEEE KDIEDLNKIEITEEPVIYNCPILVIRKADNSLWSKEFQSIVEEIDNGYDIPKTIEALVEE HHHHCCCCEEECCCCEEEECCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH KEIEDDYIHKDQWKECKEDILFPLDANEEQISIVKKICENEAILVQGPPGTGKSHTIANL HCCCHHHCCHHHHHHHHHHCEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHH ICHFLAHGKKVLITSETSRALRVLINKIPKDIKPLCVNLLDDNNGEYELEQCIKNISDNL HHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH CKNPSEIIDDIYILNNERKECKKNQQVLYNKLKEIEFMENKKIHCKGNYYKLIHIGSWLN CCCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEEEECCCCC ENEYKYGWIRDNIRYEDIKPVNEDQFNKLIELLKNNGKEYIGNINELIFICNKIPSYNEV 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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE KEAGKIYDKIYKQYLDGGNENEIILGQAILALRKNKNIIHPVITSKVKVDFIDKENVLSL CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCEEEEEECCCCEEEE KIPSNIKLEIEVCDCLNKTLFKKIISRKNDWEKEKIDIMNYDNIKNKIQLLLNNDSEIVF ECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHEEEEECCCCCEEE KDIEDLNKIEITEEPVIYNCPILVIRKADNSLWSKEFQSIVEEIDNGYDIPKTIEALVEE HHHHCCCCEEECCCCEEEECCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH KEIEDDYIHKDQWKECKEDILFPLDANEEQISIVKKICENEAILVQGPPGTGKSHTIANL HCCCHHHCCHHHHHHHHHHCEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHH ICHFLAHGKKVLITSETSRALRVLINKIPKDIKPLCVNLLDDNNGEYELEQCIKNISDNL HHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH CKNPSEIIDDIYILNNERKECKKNQQVLYNKLKEIEFMENKKIHCKGNYYKLIHIGSWLN CCCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEEEECCCCC ENEYKYGWIRDNIRYEDIKPVNEDQFNKLIELLKNNGKEYIGNINELIFICNKIPSYNEV CCCCEEEEEECCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHH ENKLDRMIYLESNLNFYKNKIKGWYIPAECKCNYDILSDFLYDCIEKMKSIIEEPILGKM 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633 [H]