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The map label for this gene is yueF [H]

Identifier: 153936965

GI number: 153936965

Start: 1229288

End: 1230388

Strand: Direct

Name: yueF [H]

Synonym: CLC_1192

Alternate gene names: 153936965

Gene position: 1229288-1230388 (Clockwise)

Preceding gene: 153935565

Following gene: 153937096

Centisome position: 32.69

GC content: 24.7

Gene sequence:

>1101_bases
TTGATTAAAGATAAAAAAATTAAGTATCTAGATATAATAATACCTATAGTTTCTTCTTTAGTAATATCTTTTATATTAAT
TCAAATATTTAAAAATTATAATAATGTTTTTTCAGGAATAGGAAAAGTTTTTAAAATATTATCTCCATTCATTATTGCTT
TTATAATAGCATATATATTAAATCCATTAGTTAAGCTTTTTGAAAGAAGGTTTAAAATTAAAAGGAACCTAAGCATACTT
ATATGTTATGTTATAACCTTGGGGATTGTAGCTCTAGTTTTAAGTATGATTGTACCTAAAGTTTTTCAAAGCATAATGGA
TATATTTCAAAATATCCCTTACTTTACAAATAAGGGATATGAAATGGTAAATAATTTATTGGCTAATGAGGAGATTTCTA
ATATAATAAATTCTTCTAATGTTTTTAAAGGGAATTATAAGGATTTAATAGACAAAATTGCTGGTTTTACTAGTGTGGGA
TTAAACACTATTTTAAATCAGACTATATCCTTTACTACCTTCATGGTTAATTTAGTTTTTGGGTTAATTATAGCTATATA
TGTTTTAAATGATAGAGAAAAATTTGCATTTAATGGTAAAAGAGTTGTTTTTTTAATATTCAGAGAAAAGTATGGTGAAA
AAATCATAGAGTTTTTTAGAACTGTAAATTCAATGATAAAGTTATATATAGGTATAAAAGCATTAGATTCTTTAATAATA
GGGCTTTTAGCTTTAATAGGGTTAATAATATTAAAATCACCTTATGCTCTTTTAATAGCTTTAATAGTTTGTGTAACAAA
TATGATACCTTACTTTGGACCATTTATAGGAATGATTCCAGCGGTGGTAATAAATTTATTTTATGTACCAGTTAAGGCTT
TATGGGTACTAATATTTTTATTTTTACTGCAACAATTTGATGCATGGTATTTAGAACCCAAATTAGTTGGAGATAAGGTA
GGACTAAGTCCATTTTTAATAATTTTAGGAATAACCATAGGTGGAAGTTTATTTGGTGTGTGGGGAATGCTTTTGGCATC
ACCAGCTATGGCAGTAATTAAAATATATACTAAAAAATTAGCAGAAAAATATAATATATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATTAACAAAAAGTTTATAAACATAAATATAAAACCATGATAAAATTTAATATATTGTAATGAACAATAATTATTTTAGT
ATATTTAGGAGGCAAAATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATATTATTGAATTAAAAACAAAACGTAAAGTTAATAAAAAATATATCCTAGGAAATATAATTAATTTATGGGATATA
TTTTTTTATTCACTAATATT

Product: putative transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 366; Mature: 366

Protein sequence:

>366_residues
MIKDKKIKYLDIIIPIVSSLVISFILIQIFKNYNNVFSGIGKVFKILSPFIIAFIIAYILNPLVKLFERRFKIKRNLSIL
ICYVITLGIVALVLSMIVPKVFQSIMDIFQNIPYFTNKGYEMVNNLLANEEISNIINSSNVFKGNYKDLIDKIAGFTSVG
LNTILNQTISFTTFMVNLVFGLIIAIYVLNDREKFAFNGKRVVFLIFREKYGEKIIEFFRTVNSMIKLYIGIKALDSLII
GLLALIGLIILKSPYALLIALIVCVTNMIPYFGPFIGMIPAVVINLFYVPVKALWVLIFLFLLQQFDAWYLEPKLVGDKV
GLSPFLIILGITIGGSLFGVWGMLLASPAMAVIKIYTKKLAEKYNI

Sequences:

>Translated_366_residues
MIKDKKIKYLDIIIPIVSSLVISFILIQIFKNYNNVFSGIGKVFKILSPFIIAFIIAYILNPLVKLFERRFKIKRNLSIL
ICYVITLGIVALVLSMIVPKVFQSIMDIFQNIPYFTNKGYEMVNNLLANEEISNIINSSNVFKGNYKDLIDKIAGFTSVG
LNTILNQTISFTTFMVNLVFGLIIAIYVLNDREKFAFNGKRVVFLIFREKYGEKIIEFFRTVNSMIKLYIGIKALDSLII
GLLALIGLIILKSPYALLIALIVCVTNMIPYFGPFIGMIPAVVINLFYVPVKALWVLIFLFLLQQFDAWYLEPKLVGDKV
GLSPFLIILGITIGGSLFGVWGMLLASPAMAVIKIYTKKLAEKYNI
>Mature_366_residues
MIKDKKIKYLDIIIPIVSSLVISFILIQIFKNYNNVFSGIGKVFKILSPFIIAFIIAYILNPLVKLFERRFKIKRNLSIL
ICYVITLGIVALVLSMIVPKVFQSIMDIFQNIPYFTNKGYEMVNNLLANEEISNIINSSNVFKGNYKDLIDKIAGFTSVG
LNTILNQTISFTTFMVNLVFGLIIAIYVLNDREKFAFNGKRVVFLIFREKYGEKIIEFFRTVNSMIKLYIGIKALDSLII
GLLALIGLIILKSPYALLIALIVCVTNMIPYFGPFIGMIPAVVINLFYVPVKALWVLIFLFLLQQFDAWYLEPKLVGDKV
GLSPFLIILGITIGGSLFGVWGMLLASPAMAVIKIYTKKLAEKYNI

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=323, Percent_Identity=25.6965944272446, Blast_Score=92, Evalue=6e-20,
Organism=Escherichia coli, GI87082271, Length=335, Percent_Identity=25.6716417910448, Blast_Score=75, Evalue=6e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41411; Mature: 41411

Theoretical pI: Translated: 10.16; Mature: 10.16

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKDKKIKYLDIIIPIVSSLVISFILIQIFKNYNNVFSGIGKVFKILSPFIIAFIIAYIL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NPLVKLFERRFKIKRNLSILICYVITLGIVALVLSMIVPKVFQSIMDIFQNIPYFTNKGY
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
EMVNNLLANEEISNIINSSNVFKGNYKDLIDKIAGFTSVGLNTILNQTISFTTFMVNLVF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLIIAIYVLNDREKFAFNGKRVVFLIFREKYGEKIIEFFRTVNSMIKLYIGIKALDSLII
HHHHHHHHHCCCHHHEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLALIGLIILKSPYALLIALIVCVTNMIPYFGPFIGMIPAVVINLFYVPVKALWVLIFL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLLQQFDAWYLEPKLVGDKVGLSPFLIILGITIGGSLFGVWGMLLASPAMAVIKIYTKKL
HHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEKYNI
HHHCCC
>Mature Secondary Structure
MIKDKKIKYLDIIIPIVSSLVISFILIQIFKNYNNVFSGIGKVFKILSPFIIAFIIAYIL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NPLVKLFERRFKIKRNLSILICYVITLGIVALVLSMIVPKVFQSIMDIFQNIPYFTNKGY
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
EMVNNLLANEEISNIINSSNVFKGNYKDLIDKIAGFTSVGLNTILNQTISFTTFMVNLVF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLIIAIYVLNDREKFAFNGKRVVFLIFREKYGEKIIEFFRTVNSMIKLYIGIKALDSLII
HHHHHHHHHCCCHHHEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLALIGLIILKSPYALLIALIVCVTNMIPYFGPFIGMIPAVVINLFYVPVKALWVLIFL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLLQQFDAWYLEPKLVGDKVGLSPFLIILGITIGGSLFGVWGMLLASPAMAVIKIYTKKL
HHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEKYNI
HHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]