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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 153935727

GI number: 153935727

Start: 2193841

End: 2195142

Strand: Direct

Name: mepA [H]

Synonym: CLC_2069

Alternate gene names: 153935727

Gene position: 2193841-2195142 (Clockwise)

Preceding gene: 153934589

Following gene: 153935670

Centisome position: 58.34

GC content: 29.72

Gene sequence:

>1302_bases
ATGAGTATAAAAAATACATTTATGCGCTATATCTTAACAAATGTTATAGGAATGATTGGTCTTTCATGCTATATCTTAGC
GGATACTTTTTTTGTATCTAAGGGATTAGGAGTAACGGGATTAACATCTCTAAATCTATCAATTTCCATTTACAGTTTTA
TTAATGCAACGGGACTTTTGATTGGAATTGGTGGTGCTACAAAATATTCTATTTATCAAGCACGAGATAAGCATAACAAA
GCAAATATTATTTTTACAAACTCTATTAAAATTGGAGTTATATGTGGGATAATTTTCTTATTAATTGGCTTATTGGGATC
TTCATCACTTAGCAATTTATTAGGAGCAGATAAAGACACCTTTGCCATGACAAACACCTATCTTAGAACGCTTTTATGTT
TTGCACCCTTTTTTATTCTTAATAATATTTTTATCGCTTTTATTAGAAATGATGGAGATCCTAAACTGTCAATGGCTGGA
ATGTTAATTGGAAGTTTAGCAAACATTATTTTAGACTATGTTTTTATTTTTCCCCTTCAGTGGGGAATGTTTGGAGCGGC
TTTTGCAACAGGGCTAGCGCCTATTATTAGTATTAGTATTCTAACAAGACACTGTATTAAAAAGAAAAACTGTTTCCATT
TTTATAAGTCAAAATTATCAATAAAGCAGGTAACTTATATTTGTAGCTTAGGGTTATCCTCTTTTATCACAGAAATTGCT
TCTGGCATTATTCTTATTGTATTTAATTTACTTATACTAAATATTGCTGGAAATATAGGTGTGGCTGCCTATGGTATTGT
GGCTAATTTGGCTTTGGTAGCAACTTCTATTTTTACAGGCGTTGCTCAAGGAACACAACCTTTATTGAGTGAAAACTTTG
GACAAGGTAATAATAAAAAAATTCTGCAATTATTTAAATATGCAATCTATACATCACTTGCAATTTCAGTTGTTTTATAT
TTTATTGTTGTTATTTTTAATAATCAATTGGTAGAAATGTTCAATAGAGATCATATTGAAATTCTCTCAAAAACTGCATC
TAATGGGTTGATTATTTATTTTGCTGGTTTCTTCTTTGCAGGAATTAATATTATTACCTCAGCTGTATTAAGTTCTATAA
ATGAACCAAAACATGCTTTCACCATTTCAATTTTACGTAGCGGTTGTATTATTGTTCCTGTAGCTTTATTTCTATCTTAC
TTCTTTAAAATGACTGGAATATGGCTAAGCTTTCCTTTGTCAGAAATAGTAATACTAATTTTAGGAGTATTTCTTGCTAA
AAAATCCTTAAAAAGATTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGTAGCTTATTTCATGATACTTAACCTTATTCCTTTAGGTCTTAGTAGGAATAAATGTTAGGTATTTTTTTATGTTTAT
TTTTAGGAGGAATCACGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAAACAGATAAGCTCAAAATCAAAATTATCAAAAATAGTAAAGATAATTTTATCATATTTGCCCTTTTATATATTGCAG
CATAAATCTCAATATAATAT

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 433; Mature: 432

Protein sequence:

>433_residues
MSIKNTFMRYILTNVIGMIGLSCYILADTFFVSKGLGVTGLTSLNLSISIYSFINATGLLIGIGGATKYSIYQARDKHNK
ANIIFTNSIKIGVICGIIFLLIGLLGSSSLSNLLGADKDTFAMTNTYLRTLLCFAPFFILNNIFIAFIRNDGDPKLSMAG
MLIGSLANIILDYVFIFPLQWGMFGAAFATGLAPIISISILTRHCIKKKNCFHFYKSKLSIKQVTYICSLGLSSFITEIA
SGIILIVFNLLILNIAGNIGVAAYGIVANLALVATSIFTGVAQGTQPLLSENFGQGNNKKILQLFKYAIYTSLAISVVLY
FIVVIFNNQLVEMFNRDHIEILSKTASNGLIIYFAGFFFAGINIITSAVLSSINEPKHAFTISILRSGCIIVPVALFLSY
FFKMTGIWLSFPLSEIVILILGVFLAKKSLKRL

Sequences:

>Translated_433_residues
MSIKNTFMRYILTNVIGMIGLSCYILADTFFVSKGLGVTGLTSLNLSISIYSFINATGLLIGIGGATKYSIYQARDKHNK
ANIIFTNSIKIGVICGIIFLLIGLLGSSSLSNLLGADKDTFAMTNTYLRTLLCFAPFFILNNIFIAFIRNDGDPKLSMAG
MLIGSLANIILDYVFIFPLQWGMFGAAFATGLAPIISISILTRHCIKKKNCFHFYKSKLSIKQVTYICSLGLSSFITEIA
SGIILIVFNLLILNIAGNIGVAAYGIVANLALVATSIFTGVAQGTQPLLSENFGQGNNKKILQLFKYAIYTSLAISVVLY
FIVVIFNNQLVEMFNRDHIEILSKTASNGLIIYFAGFFFAGINIITSAVLSSINEPKHAFTISILRSGCIIVPVALFLSY
FFKMTGIWLSFPLSEIVILILGVFLAKKSLKRL
>Mature_432_residues
SIKNTFMRYILTNVIGMIGLSCYILADTFFVSKGLGVTGLTSLNLSISIYSFINATGLLIGIGGATKYSIYQARDKHNKA
NIIFTNSIKIGVICGIIFLLIGLLGSSSLSNLLGADKDTFAMTNTYLRTLLCFAPFFILNNIFIAFIRNDGDPKLSMAGM
LIGSLANIILDYVFIFPLQWGMFGAAFATGLAPIISISILTRHCIKKKNCFHFYKSKLSIKQVTYICSLGLSSFITEIAS
GIILIVFNLLILNIAGNIGVAAYGIVANLALVATSIFTGVAQGTQPLLSENFGQGNNKKILQLFKYAIYTSLAISVVLYF
IVVIFNNQLVEMFNRDHIEILSKTASNGLIIYFAGFFFAGINIITSAVLSSINEPKHAFTISILRSGCIIVPVALFLSYF
FKMTGIWLSFPLSEIVILILGVFLAKKSLKRL

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47282; Mature: 47151

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSIKNTFMRYILTNVIGMIGLSCYILADTFFVSKGLGVTGLTSLNLSISIYSFINATGLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCEEE
IGIGGATKYSIYQARDKHNKANIIFTNSIKIGVICGIIFLLIGLLGSSSLSNLLGADKDT
EECCCCCEEHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCH
FAMTNTYLRTLLCFAPFFILNNIFIAFIRNDGDPKLSMAGMLIGSLANIILDYVFIFPLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WGMFGAAFATGLAPIISISILTRHCIKKKNCFHFYKSKLSIKQVTYICSLGLSSFITEIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIILIVFNLLILNIAGNIGVAAYGIVANLALVATSIFTGVAQGTQPLLSENFGQGNNKK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCHH
ILQLFKYAIYTSLAISVVLYFIVVIFNNQLVEMFNRDHIEILSKTASNGLIIYFAGFFFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHH
GINIITSAVLSSINEPKHAFTISILRSGCIIVPVALFLSYFFKMTGIWLSFPLSEIVILI
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LGVFLAKKSLKRL
HHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SIKNTFMRYILTNVIGMIGLSCYILADTFFVSKGLGVTGLTSLNLSISIYSFINATGLL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCEEE
IGIGGATKYSIYQARDKHNKANIIFTNSIKIGVICGIIFLLIGLLGSSSLSNLLGADKDT
EECCCCCEEHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCH
FAMTNTYLRTLLCFAPFFILNNIFIAFIRNDGDPKLSMAGMLIGSLANIILDYVFIFPLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WGMFGAAFATGLAPIISISILTRHCIKKKNCFHFYKSKLSIKQVTYICSLGLSSFITEIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIILIVFNLLILNIAGNIGVAAYGIVANLALVATSIFTGVAQGTQPLLSENFGQGNNKK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCHH
ILQLFKYAIYTSLAISVVLYFIVVIFNNQLVEMFNRDHIEILSKTASNGLIIYFAGFFFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHH
GINIITSAVLSSINEPKHAFTISILRSGCIIVPVALFLSYFFKMTGIWLSFPLSEIVILI
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LGVFLAKKSLKRL
HHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA