Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is lolE [C]

Identifier: 153935638

GI number: 153935638

Start: 656268

End: 658736

Strand: Direct

Name: lolE [C]

Synonym: CLC_0642

Alternate gene names: 153935638

Gene position: 656268-658736 (Clockwise)

Preceding gene: 153935044

Following gene: 153934488

Centisome position: 17.45

GC content: 24.26

Gene sequence:

>2469_bases
ATGAGGTTGTTTTTTAAAGTTGCATTTAACAGTATAAGAAAAAATAAGATTAGATATATGTTATTAACTTGTACCTTAAT
TTTATCTACAATTATTATGTTATCTACATCTATAATAAAAGATTCTGCAATTAAAATCAGAGAAGATCAGCTAAGAAAAA
CAACTTTAAATAGCCAATTGGTGATAACAACTGCAGATGAAGAAAATCCTTTTTTCAATCCTAAAGGTATTATAAATTCT
ATCAAGGATATAGATGGAATAAGTCATATTGTACCTAGAATAGGAGGTATGGCAAAAGATGTTAAAACTTTAAAAGATGT
AAATATTATTGGGGTTGATCTTAATAAACAGAAAGCAGCATTCCCAATAGAGTTGATAGATAAATATAAGGTTAAAGATA
AAGAAAATGAGATTATAATTAATGAAAGGTATGCAAAGGAAAATTCTTTAAAAGTAGGAGCTAAGATAAAACTACTAATT
GGAACTAAGAATAAAGAGTTTATTATAAGTGGAATATCAAAAAATACAGGGGTATTTGATCCTAGTATGAATACTGCAAT
GATTAGTATTGATAATGCCCAGTACCTTTTAGACCAAAAGGATAATGCTTATTCAATTGGAATAACAATAAAAAATTTAG
ATCATATAAATAATATGATTGAGAAAATAAAGCCTAAAGTATCATCAAAATTTATAATCCAACAACGATATGATATGGAT
TATTTTAAATCCTATGTAGGAACCATAGATATGGCATTAAAGATAATTGGTGTGTTGTCTATATTTATAACATTGTTTCT
AACCTATTCAACATTTTCACTTATAATTTATGAAAGGTTGCATCAAATTGGTATATTGAGAAGCTTAGGTATATCAAAGA
AGGATATTAAAGTAAGTGTTATAGTAGAAAACTTACTTATAGTATTAAGTTCAATAGTTATAGGGAGTATATTAACTATT
CCTTTCGTAAGGCTAATTTTAAACTATATAGTGCAGGATGGATATTTTACTTTAGATTTGAGAAAATTTTTATTCATTGA
TTTAATAATTGTGATTTTTAGTGTACTAGTAATATTAGTTTCTTTAAGGAAGATATTAAATATGTCTGTCATAAATCTTT
TAAAAGGCATTGGGAAAAAATATTATACAAATAAAATAGGAAAAATATTTAAATCTTCTTTTGGAGTTCTGTTATTAATT
GTATCCATAGCTATTTTAATTAGTGAATATAAAAGAGAAAATGGAACATTCGCATTAATTTTAGGGGCTCTTTTCTTTAT
TATTTCTTTTGTATTTTTAGCAAAATTACTACTTATAATGTTTAATTGGATTTACCAAAAAATATTTTCTATATTTAAAG
GTTCAGTTAGGATTCTGTTTAAAGAACTTGTGATGCAATTTTCTAATATAGTAGATATAGTAATAATTACATCAATAATT
ATTTGTTCAATTTATGTAAGTGTTACACTTAAAGATATGATAAACAATGGAGTAATGAATGTATATAGTAATGCAGATTT
AATGCTAAGTATTGATGGTACAGTAGAGGAAGATTTTACAGATAAAATAAAGAATATAAAATATATTAAAAATTCTCTAC
TGCAATCAAGAACAACAGAGGTCATAAAAGATACAAAGGTGGATATTGCAGGAATAGATGGATCCCAGTATAAGAAAGAT
TTTTCAACAGAAATTATTAAAAAAGGTGAAAAGAATATATTTGATAAGCTTGATGATGGAAAAAACATTATAATAACAAC
AACATTTAGTAAGAATACTGGCATTAATTTAAATGATTCATTAAAAATTAATGAAGTGAATTACAAGGTAATTGGAGTTG
TTAGTAGTTTTGAAAATATGGGAAAAGTATTATTCCTATCCAAAGATAACTTCAATAAGGACATAAAGGTAAAGGATAAG
GATTTATGTCTTATAAAAGTTAATAATAAACAAATAAAGTCTACAACAAATGAAATAGAAAAATTGTTTAAAGACAAATA
TGAAAATAAATATTCTATACAAGAATTAACTGTTCTTAATGAAGAAAACAATAATAATAACAAAAAAACATTTACTATAG
TAAATGTCTTAATATGTATCTCAACAATTATATGCATAATTAGTATGAGCAACAATGTTACTATAAATCTTTTATCTAGA
AAAAAGGTATATGCAACTAAAGGAGCTTTAGGCATATCTAAAGGTTATTTGAGTAAATGTATTTTATTCGAAGCTATAGT
CTTAGGTTCTTATAGTGGAATATTTGGATTAGGTTTAGGAGTTACATTAAGTAATTATATTAATAAAATCTTATCTTATT
ATATTGGAGATATGGTGTTTATTAAGGATTACAAAATAATGGTGATTTTAGTTCTGATTTCTATAGGTATTACTGTTATT
AGCTATATTTATCCTATGAGAAAAATATATAGGATAAATATAATAGATGAAATAAAGTCAGATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTATATAATTTCGGATGCTTTTGAACATAATGAGAGAATAGTTAAATTTTTAAGGAGAGTAGGAGTATCTAAATATAAA
ACACGAATGGTGAGAAAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGGTGATTGATTATGAGTATATTAAAAGGTATTAATATTAAAAAGAAAATTAATATAGGAGATAATTCCTATGATATA
TTAAAGGGTATTAATTTAGG

Product: putative ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein

Number of amino acids: Translated: 822; Mature: 822

Protein sequence:

>822_residues
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEENPFFNPKGIINS
IKDIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLI
GTKNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLSSIVIGSILTI
PFVRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLI
VSIAILISEYKRENGTFALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
ICSIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGSQYKKD
FSTEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDK
DLCLIKVNNKQIKSTTNEIEKLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVI
SYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE

Sequences:

>Translated_822_residues
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEENPFFNPKGIINS
IKDIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLI
GTKNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLSSIVIGSILTI
PFVRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLI
VSIAILISEYKRENGTFALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
ICSIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGSQYKKD
FSTEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDK
DLCLIKVNNKQIKSTTNEIEKLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVI
SYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
>Mature_822_residues
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEENPFFNPKGIINS
IKDIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLI
GTKNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLSSIVIGSILTI
PFVRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLI
VSIAILISEYKRENGTFALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
ICSIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGSQYKKD
FSTEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDK
DLCLIKVNNKQIKSTTNEIEKLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVI
SYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE

Specific function: Part Of An ATP-Dependent Transport System Lolcde Responsible For The Release Of Lipoproteins Targeted To The Outer Membrane From The Inner Membrane. Such A Release Is Dependent Of The Sorting-Signal (Absence Of An Asp At Position 2 Of The Mature Lipoprot

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93199; Mature: 93199

Theoretical pI: Translated: 9.98; Mature: 9.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQL
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE
VITTADEENPFFNPKGIINSIKDIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAA
EEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCC
FPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLIGTKNKEFIISGISKNTGVFD
CCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEECCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
PSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
CCCCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHH
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHH
IVENLLIVLSSIVIGSILTIPFVRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLIVSIAILISEYKRENGTFALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICSIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIKDTKVDIAGIDGSQYKKDFSTEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDS
HHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCC
LKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDKDLCLIKVNNKQIKSTTNEIE
EEEEECCEEEEEEHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCEEEEEECCCHHHHHHHHHH
KLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
HHHHHHCCCCCCHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECC
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVF
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
IKDYKIMVILVLISIGITVISYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRLFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQL
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE
VITTADEENPFFNPKGIINSIKDIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAA
EEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCC
FPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLIGTKNKEFIISGISKNTGVFD
CCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEECCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
PSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMD
CCCCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHH
YFKSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHH
IVENLLIVLSSIVIGSILTIPFVRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLIVSIAILISEYKRENGTFALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICSIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIKDTKVDIAGIDGSQYKKDFSTEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDS
HHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCC
LKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDKDLCLIKVNNKQIKSTTNEIE
EEEEECCEEEEEEHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCEEEEEECCCHHHHHHHHHH
KLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSR
HHHHHHCCCCCCHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECC
KKVYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVF
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
IKDYKIMVILVLISIGITVISYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA