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The map label for this gene is 153935601

Identifier: 153935601

GI number: 153935601

Start: 3155817

End: 3157049

Strand: Reverse

Name: 153935601

Synonym: CLC_3000

Alternate gene names: NA

Gene position: 3157049-3155817 (Counterclockwise)

Preceding gene: 153934593

Following gene: 153934751

Centisome position: 83.95

GC content: 24.41

Gene sequence:

>1233_bases
ATGGAAAGTTTAAGTAATATTATTACATATTTAATTTGTTCTTATATATTTATTTTGCCTATTTTACCAAGTAAGTATAA
ATATAAGAATATTCCTTTTAATGGGGATATTGTGTTGCTATTAATTATAATTTTGTTTATTATATTTATATTTATAAATG
GTGAATGGAGAAAAAATTTTTTTAACGGTATAAGAGATTTTTTTTGTAAAGCAAATACTATATTTATTTTTATGTGGGTA
GGCATGATGGTTGTATCCATTTCTTATTCACCTGATAAGAAATTAGCTTTACAAGAAACCATAAGAACTAGTACGTATAT
AGTATTATTTTTTATAATAAAATATGAAGTTTATAAAAAGAAATATTTAGATAAAATTATTTATTCATATATATTTACTT
CAATTATTGTAGGATTTATAGGAATATACGAATATTTAAAAGGGATTGGATTGACTCATAAAGGTGAGTTTAGTACAGTA
GTAAGATGCGTATCTACCTTAGAGAATTCTAATAATTTGGGAGGGTTTTTTATAATGATAGTATTTCCTATGATGGTACT
ATCATTTAAAGAAAAACAAAAATGCAAAAGAAATGTATATATTCTATGCTCAATTATAGCTATTATAAATATAATAATAT
CTTTTTCACGAAATGCTTGGTTAGCATTTGTAATAGGATATATGGTATTAATAATTGTATTTAATTTTAAGCTAATATAT
GGAGCTATATTGGGAGCTGGAGTGTCCTTATTTATACCTAAAATATCTAATAGATTAAGAGAAATTGGAGATGTAAGTCA
GAATTTATCTAGAATTAGTTTATGGAAAATAGCTTGGGAAATGGTAAAAGACAAGCCATTATTAGGTGTAGGAAATGGGA
ATTATAGAACCTTATACCCGCAATACTATAAAAAAGTTAAATATTTAGGATATACAGCTCAAGCAAAATTTCATCCACAT
AATGCTTATTTAAAAGCTCAATGTGAATTAGGGATAATAGGATTAATATCGTTGCTTGGTATTTTTGTAAGTTCCGTATG
GAAGGTAAATGAATTATCTAAGAAATCAAATAATACATTTTATAAATATTTTTACAAAGGTTTTATTGCTTCTTTAATAG
CTTTTATGTTCATGAATTTTATAGATAATTTCTTTTCAGCACCTAAAGTTATAGCCTTTTTTTGGATAAGTTTAGCTGTA
GCTGATTCTTTTGAGTATAATTGTAAAAGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTAAAATTAAAGAATAGTTAATACCTCTATATAAATAGATTGAATATAATTGTTCACTATTGTTATTTCTATAATCTT
TAGTTTAAGGGGACATACTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTGTAAAAAGGAGTTATAAAAACTCCTTTTTTAATGTAATAGGTGAGTCGGTACAAGCAAAAGATTATTTGGTTATT
AATTAAGATTTTATGGCTGA

Product: exopolysaccharide biosynthesis family protein

Products: NA

Alternate protein names: ExoQ Family Exopolysaccharide Biosynthesis Membrane Protein; Exopolysaccharide Biosynthesis Family Protein

Number of amino acids: Translated: 410; Mature: 410

Protein sequence:

>410_residues
MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDIVLLLIIILFIIFIFINGEWRKNFFNGIRDFFCKANTIFIFMWV
GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIIGLISLLGIFVSSVWKVNELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKS

Sequences:

>Translated_410_residues
MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDIVLLLIIILFIIFIFINGEWRKNFFNGIRDFFCKANTIFIFMWV
GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIIGLISLLGIFVSSVWKVNELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKS
>Mature_410_residues
MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDIVLLLIIILFIIFIFINGEWRKNFFNGIRDFFCKANTIFIFMWV
GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIIGLISLLGIFVSSVWKVNELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKS

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47452; Mature: 47452

Theoretical pI: Translated: 9.98; Mature: 9.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA