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The map label for this gene is dtpT [H]

Identifier: 153935050

GI number: 153935050

Start: 2093479

End: 2094828

Strand: Reverse

Name: dtpT [H]

Synonym: CLC_1974

Alternate gene names: 153935050

Gene position: 2094828-2093479 (Counterclockwise)

Preceding gene: 153935824

Following gene: 153937735

Centisome position: 55.71

GC content: 33.19

Gene sequence:

>1350_bases
ATGGAAAACACAAAAAGACCTTTTGGGTTTTATGTATGCTCACTTGCGTTTACCATGGAAAGATTTTCATTTTATTCAGC
AAAATGGTTGATTGCCATGTTTGTATCTCATTCAATAATACAAGGAGGTCTTGGTCTTACTGCTGCAGATGCAGCAAAAA
TGTCTGCTAACTTAATTGCATGGACATATTTTGCACCACTTATTGGATCAGTTATATCTGACCGTAAAATAGGTGCTAGG
TACCTTATTCCAACGGGAATGATGATAATGGGAGCAGGCTACTTAGTAGGATGGAAGGCTACAAGTGCTGGTATGGTTAA
TGCAATGATTATATTAGTTGCAATTGGTACAGGTTTATTTAAATCACAATTAAGTGGTATTACAGGTAGACTTTTTGACA
ATCAAAAGGATTTGGACAGTGCATTTTCTACACAATATTCTTTTGTTAATATTGGTTCTTTTATTGGAACAACAGTTTTA
GGACTAATTGGAGAATCTATAGGATACTCATTTTGTTTTTTAATTTGTGCAATTGTTATGTTTATTAATACTGCTTGGTT
TGTATTTGGATGGAAGTTCTTAGGGGATGCAGGTAAAAAACCATTTAAAATTGATGAACATAAAGAAGTAAAAGAAACAA
AACAAGAAGAAAAGAAACCTCTTACAACAATAGAAAAGAAAAGAGTGGGAGCTATTATATTAATATCTTTCTTCTCTATA
ATTTTCTGGATATTCTGGCAACTAGCATATATGCCTGTATATTTCTATTGGGCTGGAGATAATGGACTAGCTAATTGGAT
GATAGGTAGCTTTAAGGTTCCAACAGCGTGGTTTGATTCATTAAATGCATTATGCTGTATTGTATTAGGACCAATTCTTG
GTAAATTATGGTCAAAATTAGCTAAGAGACCTCAAGGTGATATGAGTATGTTTAAGAAAACTGCTTTAGGTATGTTGCTT
CTAGGTTTATCTTATGTAATATTTGCAATGGCAGATGTTTTAAGAGGAGACAATCTTCTACCTCTTGCTTGGCTCGTTGT
ATTTGGTATCGTATTAGCTCTTGGTGAAATGGTATTCTCACCACTTGGAAACTCATTTATAAGTAAATTCTCTCCAGGTA
AATTATTAACAGGTATGATGAGTGTTTGGGTGTTTGCTAGTTTTATTGCAGGACAATCCTATGGATATGTATATGAATTT
ACACTAAAATTTAAATTTGCACCAACATATTTTGTAATAGCAGCAATTGCTATTGTGTGTGGTATTATTCTTTGGGCATT
AGACGGAAAGTTGAACAGTTTAGTTATAGACGAGGAAGTTGTGGAAGATAATTCTGTAAGTTTAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTGGTGTTTAAAACTATTGTGCATTATCTTGAAAAAGATGGAGGTATATGGTTTTTCAAATACACATCTAATATTAAT
TTTTTAAGGGGGAATAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTCCACTTGCATACTTTACAATTGTAGATATTATTATTGTAAATGGTATCATTATTTAATCATTATATGAAATTTAAG
GGCAGTCATTTGACTGCCTT

Product: amino acid/peptide transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 449; Mature: 449

Protein sequence:

>449_residues
MENTKRPFGFYVCSLAFTMERFSFYSAKWLIAMFVSHSIIQGGLGLTAADAAKMSANLIAWTYFAPLIGSVISDRKIGAR
YLIPTGMMIMGAGYLVGWKATSAGMVNAMIILVAIGTGLFKSQLSGITGRLFDNQKDLDSAFSTQYSFVNIGSFIGTTVL
GLIGESIGYSFCFLICAIVMFINTAWFVFGWKFLGDAGKKPFKIDEHKEVKETKQEEKKPLTTIEKKRVGAIILISFFSI
IFWIFWQLAYMPVYFYWAGDNGLANWMIGSFKVPTAWFDSLNALCCIVLGPILGKLWSKLAKRPQGDMSMFKKTALGMLL
LGLSYVIFAMADVLRGDNLLPLAWLVVFGIVLALGEMVFSPLGNSFISKFSPGKLLTGMMSVWVFASFIAGQSYGYVYEF
TLKFKFAPTYFVIAAIAIVCGIILWALDGKLNSLVIDEEVVEDNSVSLN

Sequences:

>Translated_449_residues
MENTKRPFGFYVCSLAFTMERFSFYSAKWLIAMFVSHSIIQGGLGLTAADAAKMSANLIAWTYFAPLIGSVISDRKIGAR
YLIPTGMMIMGAGYLVGWKATSAGMVNAMIILVAIGTGLFKSQLSGITGRLFDNQKDLDSAFSTQYSFVNIGSFIGTTVL
GLIGESIGYSFCFLICAIVMFINTAWFVFGWKFLGDAGKKPFKIDEHKEVKETKQEEKKPLTTIEKKRVGAIILISFFSI
IFWIFWQLAYMPVYFYWAGDNGLANWMIGSFKVPTAWFDSLNALCCIVLGPILGKLWSKLAKRPQGDMSMFKKTALGMLL
LGLSYVIFAMADVLRGDNLLPLAWLVVFGIVLALGEMVFSPLGNSFISKFSPGKLLTGMMSVWVFASFIAGQSYGYVYEF
TLKFKFAPTYFVIAAIAIVCGIILWALDGKLNSLVIDEEVVEDNSVSLN
>Mature_449_residues
MENTKRPFGFYVCSLAFTMERFSFYSAKWLIAMFVSHSIIQGGLGLTAADAAKMSANLIAWTYFAPLIGSVISDRKIGAR
YLIPTGMMIMGAGYLVGWKATSAGMVNAMIILVAIGTGLFKSQLSGITGRLFDNQKDLDSAFSTQYSFVNIGSFIGTTVL
GLIGESIGYSFCFLICAIVMFINTAWFVFGWKFLGDAGKKPFKIDEHKEVKETKQEEKKPLTTIEKKRVGAIILISFFSI
IFWIFWQLAYMPVYFYWAGDNGLANWMIGSFKVPTAWFDSLNALCCIVLGPILGKLWSKLAKRPQGDMSMFKKTALGMLL
LGLSYVIFAMADVLRGDNLLPLAWLVVFGIVLALGEMVFSPLGNSFISKFSPGKLLTGMMSVWVFASFIAGQSYGYVYEF
TLKFKFAPTYFVIAAIAIVCGIILWALDGKLNSLVIDEEVVEDNSVSLN

Specific function: Proton-dependent uptake of di- or tri-peptides [H]

COG id: COG3104

COG function: function code E; Dipeptide/tripeptide permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the PTR2/POT transporter (TC 2.A.17) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787922, Length=433, Percent_Identity=23.3256351039261, Blast_Score=104, Evalue=1e-23,
Organism=Escherichia coli, GI1790572, Length=450, Percent_Identity=22.2222222222222, Blast_Score=92, Evalue=9e-20,
Organism=Escherichia coli, GI1789911, Length=451, Percent_Identity=23.5033259423503, Blast_Score=91, Evalue=2e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR000109
- InterPro:   IPR005279
- InterPro:   IPR018456 [H]

Pfam domain/function: PF00854 PTR2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49633; Mature: 49633

Theoretical pI: Translated: 9.17; Mature: 9.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHCCCCCCEEECHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHCCCCCCEEECHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11337471 [H]