| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 19397, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009697 |
| Length | 3,863,450 |
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The map label for this gene is 153931580
Identifier: 153931580
GI number: 153931580
Start: 2952606
End: 2955119
Strand: Reverse
Name: 153931580
Synonym: CLB_2803
Alternate gene names: NA
Gene position: 2955119-2952606 (Counterclockwise)
Preceding gene: 153933968
Following gene: 153932696
Centisome position: 76.49
GC content: 22.0
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TCTAATATAACTAAAAATATTTTACATTCTATAAGAAATATGGAAACTATATTGACTAAAAATACAGTGAAATTAATAAT TTATTAATTAGGATTAACAA
Product: RecF/RecN/SMC domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 837; Mature: 837
Protein sequence:
>837_residues MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGTIKRVYDDYMKRCSQKTEREL ENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGTNEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNI CSYDKNIELYKKGRTDIYSFFESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKTCIKLLKNKELTQRYLVEKNN IEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIKELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSN QKDLYDSNSPIIKAMRYIVDNQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEEEISGLQIENVKELDIIHLLL ELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNRATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSIS CEIKNINKDISNFEKELKAIKEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNVISLIDLLRFQFMQPKENRFI DQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY
Sequences:
>Translated_837_residues MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGTIKRVYDDYMKRCSQKTEREL ENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGTNEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNI CSYDKNIELYKKGRTDIYSFFESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKTCIKLLKNKELTQRYLVEKNN IEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIKELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSN QKDLYDSNSPIIKAMRYIVDNQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEEEISGLQIENVKELDIIHLLL ELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNRATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSIS CEIKNINKDISNFEKELKAIKEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNVISLIDLLRFQFMQPKENRFI DQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY >Mature_837_residues MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGTIKRVYDDYMKRCSQKTEREL ENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGTNEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNI CSYDKNIELYKKGRTDIYSFFESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKTCIKLLKNKELTQRYLVEKNN IEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIKELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSN QKDLYDSNSPIIKAMRYIVDNQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEEEISGLQIENVKELDIIHLLL ELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNRATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSIS CEIKNINKDISNFEKELKAIKEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNVISLIDLLRFQFMQPKENRFI DQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 98402; Mature: 98402
Theoretical pI: Translated: 7.29; Mature: 7.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGT CCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IKRVYDDYMKRCSQKTERELENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCC NEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNICSYDKNIELYKKGRTDIYSF CCCCCHHCCCCCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHH FESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKT CCCCCCCCEEEEEEEEECCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CIKLLKNKELTQRYLVEKNNIEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIK HHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEH ELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSNQKDLYDSNSPIIKAMRYIVD HHHCHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC NQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEE EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEHHHHHHH EISGLQIENVKELDIIHLLLELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNR HHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSISCEIKNINKDISNFEKELKAI CEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH KEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCC SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNV CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHCCHH ISLIDLLRFQFMQPKENRFIDQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCC >Mature Secondary Structure MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGT CCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IKRVYDDYMKRCSQKTERELENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCC NEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNICSYDKNIELYKKGRTDIYSF CCCCCHHCCCCCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHH FESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKT CCCCCCCCEEEEEEEEECCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CIKLLKNKELTQRYLVEKNNIEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIK HHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEH ELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSNQKDLYDSNSPIIKAMRYIVD HHHCHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC NQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEE EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEHHHHHHH EISGLQIENVKELDIIHLLLELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNR HHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSISCEIKNINKDISNFEKELKAI CEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH KEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCC SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNV CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHCCHH ISLIDLLRFQFMQPKENRFIDQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
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Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA