| Definition | Bacillus cereus subsp. cytotoxis NVH 391-98, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009674 |
| Length | 4,087,024 |
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The map label for this gene is 152975898
Identifier: 152975898
GI number: 152975898
Start: 2255850
End: 2258018
Strand: Reverse
Name: 152975898
Synonym: Bcer98_2166
Alternate gene names: NA
Gene position: 2258018-2255850 (Counterclockwise)
Preceding gene: 152975899
Following gene: 152975897
Centisome position: 55.25
GC content: 24.16
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GCAGATAAAGGGAGTATAAAAATTCTTGGTTTATAATGTCTTTTTGCTCCCTTTTTTATTGATTTAGTAATTATCATTAA TTTAAAGAAAGAGAGTATAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTACATGAAAAAAGAAATAGAAATTAAATTAGAGAACATCATGAAAAAGTATGGGGATCAATATATTTTTAAAGATTTTA ATGTTAGTATTTATAATAAT
Product: bacteriocin-associated integral membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: Membrane-Spanning Protein; Membrane Spanning Protein
Number of amino acids: Translated: 722; Mature: 722
Protein sequence:
>722_residues MKRFLFLLYIVVFSFSSFIYFDLLSSKQEDSMKKAGKEDSFVVTINENSLKIDSEKFLSLLFKVSDDYNANVFKSVYSEK KSVEYVYFAHDTDSYFENFLLLDGVFPDNKSDEFNISTSKGKGVTGEIFSYKEDNNFSIKPLKMFPKDKSVAGDYIVSLN DNSKIDLFIDRLQRDLGMKINYFSYEYNSVIDTSFWLKIIPIILLYVLSLFMIIYYYFLEYKNSAIRLLNGYGPLDIWKR YFLQIFKLYFLALIISTTVVMIFITMKNSLFSLYWFKIMIDYLFYQFIIGMIVCFIMSLLFIRVGKISISASIKNKKPLK QIQIVNSLVKVIFSVIILYLLFVSYSAFSDSYRYYYKNANEWEQMKSYGVMPTKAPLPSGDDPKAILEMFDKKYKLFKYT NDRGAILARFSDAYRAKQMGMEVEGVSVYEEKTILINNNYLKLNPIYGLDDKLIDIKEDGDRLTVLVPEKYKKDEQELRR YFEEEYYLQKYKVKNTFLKDAGKKLPDKEDIVINIIWIKNNQSYFSFSNDIASDTNNRFYDGIAMILTNANGNEAAWYDT VVGNNGYFIKLLDKEIPYNNIKDQIENLGLQEFYPVLYNAYDRIEGIIQIHVERAYQFLVVLFVALLGYLFISMFTTLNY LEQYKLKHTIKIIHGYSYFKRHKLYLMFTNFVWFVSMLILCILEKFDFIYLVFCILLLENLFIYLLIKKSEQKKMVQVIK EG
Sequences:
>Translated_722_residues MKRFLFLLYIVVFSFSSFIYFDLLSSKQEDSMKKAGKEDSFVVTINENSLKIDSEKFLSLLFKVSDDYNANVFKSVYSEK KSVEYVYFAHDTDSYFENFLLLDGVFPDNKSDEFNISTSKGKGVTGEIFSYKEDNNFSIKPLKMFPKDKSVAGDYIVSLN DNSKIDLFIDRLQRDLGMKINYFSYEYNSVIDTSFWLKIIPIILLYVLSLFMIIYYYFLEYKNSAIRLLNGYGPLDIWKR YFLQIFKLYFLALIISTTVVMIFITMKNSLFSLYWFKIMIDYLFYQFIIGMIVCFIMSLLFIRVGKISISASIKNKKPLK QIQIVNSLVKVIFSVIILYLLFVSYSAFSDSYRYYYKNANEWEQMKSYGVMPTKAPLPSGDDPKAILEMFDKKYKLFKYT NDRGAILARFSDAYRAKQMGMEVEGVSVYEEKTILINNNYLKLNPIYGLDDKLIDIKEDGDRLTVLVPEKYKKDEQELRR YFEEEYYLQKYKVKNTFLKDAGKKLPDKEDIVINIIWIKNNQSYFSFSNDIASDTNNRFYDGIAMILTNANGNEAAWYDT VVGNNGYFIKLLDKEIPYNNIKDQIENLGLQEFYPVLYNAYDRIEGIIQIHVERAYQFLVVLFVALLGYLFISMFTTLNY LEQYKLKHTIKIIHGYSYFKRHKLYLMFTNFVWFVSMLILCILEKFDFIYLVFCILLLENLFIYLLIKKSEQKKMVQVIK EG >Mature_722_residues MKRFLFLLYIVVFSFSSFIYFDLLSSKQEDSMKKAGKEDSFVVTINENSLKIDSEKFLSLLFKVSDDYNANVFKSVYSEK KSVEYVYFAHDTDSYFENFLLLDGVFPDNKSDEFNISTSKGKGVTGEIFSYKEDNNFSIKPLKMFPKDKSVAGDYIVSLN DNSKIDLFIDRLQRDLGMKINYFSYEYNSVIDTSFWLKIIPIILLYVLSLFMIIYYYFLEYKNSAIRLLNGYGPLDIWKR YFLQIFKLYFLALIISTTVVMIFITMKNSLFSLYWFKIMIDYLFYQFIIGMIVCFIMSLLFIRVGKISISASIKNKKPLK QIQIVNSLVKVIFSVIILYLLFVSYSAFSDSYRYYYKNANEWEQMKSYGVMPTKAPLPSGDDPKAILEMFDKKYKLFKYT NDRGAILARFSDAYRAKQMGMEVEGVSVYEEKTILINNNYLKLNPIYGLDDKLIDIKEDGDRLTVLVPEKYKKDEQELRR YFEEEYYLQKYKVKNTFLKDAGKKLPDKEDIVINIIWIKNNQSYFSFSNDIASDTNNRFYDGIAMILTNANGNEAAWYDT VVGNNGYFIKLLDKEIPYNNIKDQIENLGLQEFYPVLYNAYDRIEGIIQIHVERAYQFLVVLFVALLGYLFISMFTTLNY LEQYKLKHTIKIIHGYSYFKRHKLYLMFTNFVWFVSMLILCILEKFDFIYLVFCILLLENLFIYLLIKKSEQKKMVQVIK EG
Specific function: Unknown
COG id: COG4652
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 85294; Mature: 85294
Theoretical pI: Translated: 8.79; Mature: 8.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRFLFLLYIVVFSFSSFIYFDLLSSKQEDSMKKAGKEDSFVVTINENSLKIDSEKFLSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEECHHHHHHH LFKVSDDYNANVFKSVYSEKKSVEYVYFAHDTDSYFENFLLLDGVFPDNKSDEFNISTSK HHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHCEEEEECCCCCCCCCCEEEECCC GKGVTGEIFSYKEDNNFSIKPLKMFPKDKSVAGDYIVSLNDNSKIDLFIDRLQRDLGMKI CCCCCCHHEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEE NYFSYEYNSVIDTSFWLKIIPIILLYVLSLFMIIYYYFLEYKNSAIRLLNGYGPLDIWKR EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHH YFLQIFKLYFLALIISTTVVMIFITMKNSLFSLYWFKIMIDYLFYQFIIGMIVCFIMSLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIRVGKISISASIKNKKPLKQIQIVNSLVKVIFSVIILYLLFVSYSAFSDSYRYYYKNAN HHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCC EWEQMKSYGVMPTKAPLPSGDDPKAILEMFDKKYKLFKYTNDRGAILARFSDAYRAKQMG HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHCC MEVEGVSVYEEKTILINNNYLKLNPIYGLDDKLIDIKEDGDRLTVLVPEKYKKDEQELRR CEECCEEEEECCEEEEECCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECHHHCCCHHHHHH YFEEEYYLQKYKVKNTFLKDAGKKLPDKEDIVINIIWIKNNQSYFSFSNDIASDTNNRFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCHH DGIAMILTNANGNEAAWYDTVVGNNGYFIKLLDKEIPYNNIKDQIENLGLQEFYPVLYNA CCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YDRIEGIIQIHVERAYQFLVVLFVALLGYLFISMFTTLNYLEQYKLKHTIKIIHGYSYFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHH RHKLYLMFTNFVWFVSMLILCILEKFDFIYLVFCILLLENLFIYLLIKKSEQKKMVQVIK HCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHH EG CC >Mature Secondary Structure MKRFLFLLYIVVFSFSSFIYFDLLSSKQEDSMKKAGKEDSFVVTINENSLKIDSEKFLSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEECHHHHHHH LFKVSDDYNANVFKSVYSEKKSVEYVYFAHDTDSYFENFLLLDGVFPDNKSDEFNISTSK HHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHCEEEEECCCCCCCCCCEEEECCC GKGVTGEIFSYKEDNNFSIKPLKMFPKDKSVAGDYIVSLNDNSKIDLFIDRLQRDLGMKI CCCCCCHHEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEE NYFSYEYNSVIDTSFWLKIIPIILLYVLSLFMIIYYYFLEYKNSAIRLLNGYGPLDIWKR EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHH YFLQIFKLYFLALIISTTVVMIFITMKNSLFSLYWFKIMIDYLFYQFIIGMIVCFIMSLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIRVGKISISASIKNKKPLKQIQIVNSLVKVIFSVIILYLLFVSYSAFSDSYRYYYKNAN HHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCC EWEQMKSYGVMPTKAPLPSGDDPKAILEMFDKKYKLFKYTNDRGAILARFSDAYRAKQMG HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHCC MEVEGVSVYEEKTILINNNYLKLNPIYGLDDKLIDIKEDGDRLTVLVPEKYKKDEQELRR CEECCEEEEECCEEEEECCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECHHHCCCHHHHHH YFEEEYYLQKYKVKNTFLKDAGKKLPDKEDIVINIIWIKNNQSYFSFSNDIASDTNNRFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCHH DGIAMILTNANGNEAAWYDTVVGNNGYFIKLLDKEIPYNNIKDQIENLGLQEFYPVLYNA CCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH YDRIEGIIQIHVERAYQFLVVLFVALLGYLFISMFTTLNYLEQYKLKHTIKIIHGYSYFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHH RHKLYLMFTNFVWFVSMLILCILEKFDFIYLVFCILLLENLFIYLLIKKSEQKKMVQVIK HCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHH EG CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA