| Definition | Bacillus cereus subsp. cytotoxis NVH 391-98, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009674 |
| Length | 4,087,024 |
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The map label for this gene is ygcB [C]
Identifier: 152975774
GI number: 152975774
Start: 2128413
End: 2130638
Strand: Reverse
Name: ygcB [C]
Synonym: Bcer98_2024
Alternate gene names: 152975774
Gene position: 2130638-2128413 (Counterclockwise)
Preceding gene: 152975775
Following gene: 152975773
Centisome position: 52.13
GC content: 32.61
Gene sequence:
>2226_bases ATGTTTTTAGCGAAATCTAATCCGAAAGAAACATTACGCGAACATACAGATGAATTACGCTCACGCTATAAAAAGTTAAA AGAATCATATGGTCATTATTTTGATGAACGTATTTGGGAGTTACTTCTTTATGCTGTTGATTATCATGATGCTGGTAAAG CTCATGAGCCATTTCAATTAAACATAAGGCGTGCTCTTGGAGAAGGAGTAAAGTTGCAAAGGAATTTAGAAGTTCCACAC AACTATTTATCTCCTTTCTTATTGCCAGAATCGATTTTTTCATTACCGAAAAAAGACTATCAAGCCCTTATTCAAGCAAT TGCATATCATCATGAACGGGATATCGAACCTAATGATACATTAATTAGACAAGCTCTTTGGCAGGACCTTTGGCCGAAAA TGGATGAAATTAATAAACATTTAAATATTAATGGCGCAAATTTAGAAAAGAAATTTAATCGTATTTTAGCTCAACTACAT AGGCGAATTAAGTATAGTGATAATAAAGAAAATTATGTAGATTATGTTATTCTGAAAGGTTTGCTTCATCGTATTGATCA TGCAGCTTCTGCTCATGTAGATATTGAAATTGATGCAAAACAAGATTTTAAGAAACTTGTGGATGCTGGATTTCAAAAAA TTGCAGAGAAAAAGAGAGTGCCAGTTGAAGAAGTATATCGCGATTTACAAAAACATGCACATAAACATCGTAAAGAAAAT TTAATCATTGTAGCACAAACGGGTATGGGGAAAACGGAAGCTGCTCTTCTTTGGGCTAGTGACAGCAAAACATTCTTCAC ACTACCGTTAAGGGTTAGTATTAATGCACTATTTCATAGAGTGTATGAAAAAATGAACTATAAAAATGTTGGTTTGTTGC ATTCATCATCAATGGATTATTTAACAGAGAATCTTGAAGAAGACTGGGAAGTAATTGCAGAACAATCTAAGCATTTTTCA AGTAAATTGCTGTTTACTACGATTGATCAAATATTGAAATTCCCGTTTCTTTATCGTGGTTACGAAAAAGAACTTGCAAC AATGGCATATTCTTCGGTTGTCATTGATGAAATTCAAGCATATGATCCGAAAATTGCAGCTGTATTGGTTCGTGCGTTAG AAATGATTTATCTAGTAGGTGGGAAATTTCTACTCATGACAGCGACACTTCCTAGCATCTATTTAGAAACCTTGAATGAG AGCGACATTATCTCTAGCGATGGATTTCGAGTAGATACATTTATAGATGATTGCGTTATACGACATTGTATTGAGGTTGT AGAAAAGCCAATAGTAGATGATTTTGAGAAAATTGTAGATTTAGGGAAGCAAAAAAAAATATTGGTTATCGCTAATACAG TAAAACGTGCAATGGAGTTGTATAACAAAATCAAGGAATATAGTGACAATGTTCATGTCTTTCATTCTATGTATATTCAA AAACATAGAACTCTAATTGAAAAAGAATTACTTCTCTTTGATGAAAATAAAGAAGCAACTGGAATTTGGATCACAACACA GCTTGTCGAAGCATCTATCGATATTGATTTTGATGTTTTATTTACTGAAGCTGCAACATTAGATAGCTTATGTCAGCGAT TTGGACGTTGTTATCGAAGAAGACAATATATGATGCATCAAGAGCCAAATGTGTTTATATATGCAGTTGATATGAGTGGT GTGAAATATGTATATGATGAAGAAATTCTAATGAAATCATTAGATATTTTACGACCCTTTAATCGAAAAATATTACTTGA ATCTCAAAAGATTGAACTTGTGTCTCAATTGTATAGCAGGGAAAATTTAAAAGGAACGGAATTTCTTAAAACATTCGACG ATGCTCTAGAGCAATTGCAAACATTTGAGGATTATACATTATCTTCGAAGGATGCTCAAAAGTTACTTCGCGATATTCAG GCTGAACTTGTAATTCCTAGAAATATTTATGATGAAAACGAGCATTTATTTGAACAGCTTAAAATAGTGAATAAAGAAGA ACGAGCAAGATTGTATCGTGAAATTGCAAAGTTAACAGTTAGTTTGCGGAAAAATAGAGTCAGAGGGAAAACATCTAGAA TACCTCATGAACGTATACAAAGTAACGGAAAAAAATATAACTTGCTACCATGGATTAAAATTTTAGAACTACAGTACGAT TTTGATGAGAAAAGTAAAACAGGTACAGGTGTATTACTAGATCAGGAACTAGATAATTTTATTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTATTTCATACAGATGGAGAGCATATCGTTCTTTGGAATGAATAAAAAGGGTTCGTATTCTTTTTGAAGAATACGAAC TTATTTTTGAGGTGATGATG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTATAAGTTTATTGAACCGGAGTGGGATGTTACATAACAAATTTAAAATGAGGTGGTAAGGTGAAAGGGACTTACATT CATTACTATTTTGTTTGTCA
Product: CRISPR-associated helicase Cas3
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 741; Mature: 741
Protein sequence:
>741_residues MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLNIRRALGEGVKLQRNLEVPH NYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLH RRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKEN LIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFS SKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNE SDIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEYSDNVHVFHSMYIQ KHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMHQEPNVFIYAVDMSG VKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQ AELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYD FDEKSKTGTGVLLDQELDNFI
Sequences:
>Translated_741_residues MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLNIRRALGEGVKLQRNLEVPH NYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLH RRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKEN LIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFS SKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNE SDIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEYSDNVHVFHSMYIQ KHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMHQEPNVFIYAVDMSG VKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQ AELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYD FDEKSKTGTGVLLDQELDNFI >Mature_741_residues MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQLNIRRALGEGVKLQRNLEVPH NYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDTLIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLH RRIKYSDNKENYVDYVILKGLLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKEN LIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDYLTENLEEDWEVIAEQSKHFS SKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQAYDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNE SDIISSDGFRVDTFIDDCVIRHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEYSDNVHVFHSMYIQ KHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRRRQYMMHQEPNVFIYAVDMSG VKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSRENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQ AELVIPRNIYDENEHLFEQLKIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYD FDEKSKTGTGVLLDQELDNFI
Specific function: Unknown
COG id: COG1203
COG function: function code R; Predicted helicases
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 helicase C-terminal domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR014001 - InterPro: IPR011545 - InterPro: IPR001650 - InterPro: IPR006474 - InterPro: IPR014021 [H]
Pfam domain/function: PF00270 DEAD [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 87051; Mature: 87051
Theoretical pI: Translated: 6.83; Mature: 6.83
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEE NIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDT HHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHCCHHCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH LIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKG HHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH LLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKEN HHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDY EEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHH LTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESDIISSDGFRVDTFIDDCVI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHH RHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEYSDNVHVFHSMYIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH KHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRR HHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RQYMMHQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSR HHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHH ENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHH KIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYD HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEECCHHHHHEEEEEC FDEKSKTGTGVLLDQELDNFI CCCCCCCCCCEEECCHHHCCC >Mature Secondary Structure MFLAKSNPKETLREHTDELRSRYKKLKESYGHYFDERIWELLLYAVDYHDAGKAHEPFQL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEE NIRRALGEGVKLQRNLEVPHNYLSPFLLPESIFSLPKKDYQALIQAIAYHHERDIEPNDT HHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHCCHHCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH LIRQALWQDLWPKMDEINKHLNINGANLEKKFNRILAQLHRRIKYSDNKENYVDYVILKG HHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH LLHRIDHAASAHVDIEIDAKQDFKKLVDAGFQKIAEKKRVPVEEVYRDLQKHAHKHRKEN HHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LIIVAQTGMGKTEAALLWASDSKTFFTLPLRVSINALFHRVYEKMNYKNVGLLHSSSMDY EEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHH LTENLEEDWEVIAEQSKHFSSKLLFTTIDQILKFPFLYRGYEKELATMAYSSVVIDEIQA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YDPKIAAVLVRALEMIYLVGGKFLLMTATLPSIYLETLNESDIISSDGFRVDTFIDDCVI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHH RHCIEVVEKPIVDDFEKIVDLGKQKKILVIANTVKRAMELYNKIKEYSDNVHVFHSMYIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH KHRTLIEKELLLFDENKEATGIWITTQLVEASIDIDFDVLFTEAATLDSLCQRFGRCYRR HHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RQYMMHQEPNVFIYAVDMSGVKYVYDEEILMKSLDILRPFNRKILLESQKIELVSQLYSR HHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHH ENLKGTEFLKTFDDALEQLQTFEDYTLSSKDAQKLLRDIQAELVIPRNIYDENEHLFEQL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHH KIVNKEERARLYREIAKLTVSLRKNRVRGKTSRIPHERIQSNGKKYNLLPWIKILELQYD HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEECCHHHHHEEEEEC FDEKSKTGTGVLLDQELDNFI CCCCCCCCCCEEECCHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]