| Definition | Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009635 |
| Length | 1,569,500 |
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The map label for this gene is 150401253
Identifier: 150401253
GI number: 150401253
Start: 855171
End: 856373
Strand: Reverse
Name: 150401253
Synonym: Maeo_0824
Alternate gene names: NA
Gene position: 856373-855171 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150401254
Following gene: 150401252
Centisome position: 54.56
GC content: 28.18
Gene sequence:
>1203_bases ATGAATAATTTAACAGATATACCTTTTTTATTTATGGGTGGCATTTGCGGAATATTTACGGGTTTACTTCCCGGAATTCA CCCAAACACGATTCTACCTATTTCTTTTGTATTTTTGCCAATTATTCCAACAAATAGCTTTACTTCTTTTTTAATCGGTA TGGTTATAACCCATTATTTTATAAATTATATTCCCTCTGCATTCATCGGAGCTCCCGACGATGAGACCGCTGTATCCGTC ATACCTCTACATAATTTAACAAAAAATGGGGAAGGATATGAAGGCATAATTTTGTGCGGGATGGGAGGATTTATTGGAAT AATTTTCTCACTATGTTTTTTATTTCTGATATTATTATTAAATTTTGATTTAAATGGATTGTATGCATTATTTAAACCAT TTATTCCTTTTGTTTTATTGTTGTTGATAATTATTACGGTTATTTTTTCAAGTAATAAAATATGGAGTATAATTATAATG GTGCTTTCTGGCATTCTTGGTTTTGTTGTATTATATAATGGCCCACCAATAGAAAATATTTTAACACCCTTATTTACTGG AATGTTTGCCATTCCATTATTAATCGAAAACTTAAAAACTAGTAAATTAACTCACCAGATTATATCGTTTCCAGAATTTG ATTTATCTCATTTAAAATCTGCCATTGCTGGAACGGTCGGGGGATTTTTTAGGATTTTTTTACCGGCTATTGGGGGAGCC CAGATAAATTTCTTTTTAAGTAAAATTATAAAAGAAAATGACATTAAAAATTTTTTAGTATCTCAGGGCTCTATAACCTT ATCAAATGAAGTTTTTTCAGTTTTGGCATTATTATTGATTGGAACTGGGAGAAGTGGAACGGCAATTGCTATGAAAGATT TAAATATTAATTTAAATTATGATATTGCAATATATATGTTAATTATAGCAGGTTTTGGATTTTTTGCCCTATGTTTTGTG GCAAAATATTTTTTAAGATATATGAATAAGGTAGATTATGGAAAAATTTCATTTTATTTATTGATATTTTGTAGTGCAGT TATATTTGTATTGGGGTATTTTTCCAACTATTTAATATATTATTTAATTGTCTATATGGTGTCGGTGTTTTTAGGGATTT TATGTGTAAAAACAAAAGTAAATATGTCCTATATGATGTGTGTTTTAGTATTGCCAACAGTTTTATATTATTTAATTAGA TAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAATTATTTATTATTAATTATCGGTAGTTATTTAGTAGTTATATATTATTTGTATATTGTTATATATTATTGAATAAAAC TAAATAAACAGGATAAAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTGATGGAATATTTTATTTTATCTTATAATATGTGTTGCATTTGGTGAAAAAATGAAATCTGACCTTAAATTTAAAAT AATAGATAATGGAGTAGTTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 400; Mature: 400
Protein sequence:
>400_residues MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYFINYIPSAFIGAPDDETAVSV IPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLLNFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIM VLSGILGFVVLYNGPPIENILTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNYDIAIYMLIIAGFGFFALCFV AKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIYYLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR
Sequences:
>Translated_400_residues MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYFINYIPSAFIGAPDDETAVSV IPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLLNFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIM VLSGILGFVVLYNGPPIENILTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNYDIAIYMLIIAGFGFFALCFV AKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIYYLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR >Mature_400_residues MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYFINYIPSAFIGAPDDETAVSV IPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLLNFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIM VLSGILGFVVLYNGPPIENILTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNYDIAIYMLIIAGFGFFALCFV AKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIYYLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR
Specific function: Unknown
COG id: COG1784
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002823 [H]
Pfam domain/function: PF01970 DUF112 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44472; Mature: 44472
Theoretical pI: Translated: 8.02; Mature: 8.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 5.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYF CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH INYIPSAFIGAPDDETAVSVIPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLL HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIMVLSGILGFVVLYNGPPIENI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHCCCCCHHHH LTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNY HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCC DIAIYMLIIAGFGFFALCFVAKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYF CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH INYIPSAFIGAPDDETAVSVIPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLL HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIMVLSGILGFVVLYNGPPIENI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHCCCCCHHHH LTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNY HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCC DIAIYMLIIAGFGFFALCFVAKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]