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Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150401251

Identifier: 150401251

GI number: 150401251

Start: 851972

End: 853561

Strand: Reverse

Name: 150401251

Synonym: Maeo_0822

Alternate gene names: NA

Gene position: 853561-851972 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150401252

Following gene: 150401250

Centisome position: 54.38

GC content: 26.86

Gene sequence:

>1590_bases
ATGGTGAGCAGGTTTAAAAAATTTGAAAAATTTAAAATATTATTTTCATTATTATTGTTGCTATCACTGGGCATATTTAA
TTCGGCCAGTGCCATAAAATTTGAAAATTATGTCGTAGTTTGTGATATTGATTCAAACAATAAAATAAATACAACAATAA
ATTTAGAGATATATAATAATAATACGGAAGAAATCAAAGAAATTACCTACATAATACCACATAAAATAAATAATTTAAAT
GTTAAGTCAAGTAGTGAATTGGATACCTATTCAAGCATATTATCAGGGAGCTCCACAGAAGTAATAATTAAATTTAAAAA
TCCCATAAAAAAAGGTGAAAAAGGAAATCTAATTATTTCGTTTACTGGGGACTTGGTTTGGGATAAAGAAAATAAGAAAT
TACTTTCATTTAGTGTTCCTGCTGTGGATTCTGATTTTACAATGATTATAAAGCTTCCAATGGGTGCTTCGGTGGTGTCT
CCTGCTGAGGGTCTATTAAGTATCACTCCACAAGATTATACAATTGACACAGATGGAAAAAGGATATTTGTAAAATGGAA
TAAACAGCTTAGGAGCTCCGATAAGTTTTTTACTTCAACTGTATCCTATGCTATACTGGCTCCAAATACAAATAACAGCA
ACATAGTAGAAACTCAAAATGGAAGATTAGATACCATATATTATATGTTATGTGGTGTGCTCATATTGATTACACTGGGT
TCATTTTATGGAATATATTATGAAAAAAATAAAAATAGGCGGAAAAATAACACAATAAAGGAAATATTAAAAGAAAAAGA
AAAATTATTGGATGAAATAAATATTATTAAAGAAAAATATAATGACGAACAAATTAAATCAAATAATAAACTGAAAGAAC
TGGAAAAAGATTTGGAAAATAAATTAAACATTGCAACACATGAATTAAATCTCAAAGATGAATCAATATCTGAATTAAAT
AAGGAGTTAAATAATTTAAAAAATGAAAATAATAAATTAAATGTATTAATATCTGAATTAAAAACCAGTTTGGAGAAATC
AAATAATGATTTAAAAAATAAATTGAAAAATAAAGACGCATACATAGAAAAGATTGAAACGACCAATAAAACCTTAAATT
CAAAAATAAGTGAATTAACTCTAAAAATAGAGGAATTGAATAAAGCAATCAATGCAATGGAACAGGAACAGGAACAAAAA
TTGCAAAAAAAACAGGAACAGGAATTACAGAAAGAGCAAGAATATAAACAGCAAATTGATGGGCTAAATAAAGAATTACT
AAAATATCGGTCAGAGCTTAGGAAAAAAGAAAAAGAAATAATTGAATTTAAAAATCTGTTAGATAATTACGAAAAAACAA
AAGAACAGATGTTTATGAATATCTTGACAGAGGATGAAAAAATGATAATTAACTTAATAAAAAGTAAGGAAGAAATCACA
CAAAAGGAAATTGTGGAGATAACGGGATTAACTAAACCAAAGGTTTCAAGGATAGTGTCGGATTTGGTGGAGAGAGGGAT
AATTAGAAAGGTAAAAATCGGAAGGATAAATAAGCTAATAATATCTGACGAATTAAATGGGTGGTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAAAGTTCGAAGATTGGCTATATTTAAATATTATTTTGATTATATAAACATCCAGTTTTAAAATGTGTAGGGTATAG
GATATATAATCCGTGATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAAAAATCAAATATATTATATTATCATTTTTAATAATTTTAATTAATGGGACAAATGCAATCACAATAGGGGAAGAA
AAACCTTCCTTAGTAGATGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 529; Mature: 529

Protein sequence:

>529_residues
MVSRFKKFEKFKILFSLLLLLSLGIFNSASAIKFENYVVVCDIDSNNKINTTINLEIYNNNTEEIKEITYIIPHKINNLN
VKSSSELDTYSSILSGSSTEVIIKFKNPIKKGEKGNLIISFTGDLVWDKENKKLLSFSVPAVDSDFTMIIKLPMGASVVS
PAEGLLSITPQDYTIDTDGKRIFVKWNKQLRSSDKFFTSTVSYAILAPNTNNSNIVETQNGRLDTIYYMLCGVLILITLG
SFYGIYYEKNKNRRKNNTIKEILKEKEKLLDEINIIKEKYNDEQIKSNNKLKELEKDLENKLNIATHELNLKDESISELN
KELNNLKNENNKLNVLISELKTSLEKSNNDLKNKLKNKDAYIEKIETTNKTLNSKISELTLKIEELNKAINAMEQEQEQK
LQKKQEQELQKEQEYKQQIDGLNKELLKYRSELRKKEKEIIEFKNLLDNYEKTKEQMFMNILTEDEKMIINLIKSKEEIT
QKEIVEITGLTKPKVSRIVSDLVERGIIRKVKIGRINKLIISDELNGWL

Sequences:

>Translated_529_residues
MVSRFKKFEKFKILFSLLLLLSLGIFNSASAIKFENYVVVCDIDSNNKINTTINLEIYNNNTEEIKEITYIIPHKINNLN
VKSSSELDTYSSILSGSSTEVIIKFKNPIKKGEKGNLIISFTGDLVWDKENKKLLSFSVPAVDSDFTMIIKLPMGASVVS
PAEGLLSITPQDYTIDTDGKRIFVKWNKQLRSSDKFFTSTVSYAILAPNTNNSNIVETQNGRLDTIYYMLCGVLILITLG
SFYGIYYEKNKNRRKNNTIKEILKEKEKLLDEINIIKEKYNDEQIKSNNKLKELEKDLENKLNIATHELNLKDESISELN
KELNNLKNENNKLNVLISELKTSLEKSNNDLKNKLKNKDAYIEKIETTNKTLNSKISELTLKIEELNKAINAMEQEQEQK
LQKKQEQELQKEQEYKQQIDGLNKELLKYRSELRKKEKEIIEFKNLLDNYEKTKEQMFMNILTEDEKMIINLIKSKEEIT
QKEIVEITGLTKPKVSRIVSDLVERGIIRKVKIGRINKLIISDELNGWL
>Mature_529_residues
MVSRFKKFEKFKILFSLLLLLSLGIFNSASAIKFENYVVVCDIDSNNKINTTINLEIYNNNTEEIKEITYIIPHKINNLN
VKSSSELDTYSSILSGSSTEVIIKFKNPIKKGEKGNLIISFTGDLVWDKENKKLLSFSVPAVDSDFTMIIKLPMGASVVS
PAEGLLSITPQDYTIDTDGKRIFVKWNKQLRSSDKFFTSTVSYAILAPNTNNSNIVETQNGRLDTIYYMLCGVLILITLG
SFYGIYYEKNKNRRKNNTIKEILKEKEKLLDEINIIKEKYNDEQIKSNNKLKELEKDLENKLNIATHELNLKDESISELN
KELNNLKNENNKLNVLISELKTSLEKSNNDLKNKLKNKDAYIEKIETTNKTLNSKISELTLKIEELNKAINAMEQEQEQK
LQKKQEQELQKEQEYKQQIDGLNKELLKYRSELRKKEKEIIEFKNLLDNYEKTKEQMFMNILTEDEKMIINLIKSKEEIT
QKEIVEITGLTKPKVSRIVSDLVERGIIRKVKIGRINKLIISDELNGWL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002831
- InterPro:   IPR011991 [H]

Pfam domain/function: PF01978 TrmB [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61224; Mature: 61224

Theoretical pI: Translated: 9.19; Mature: 9.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVSRFKKFEKFKILFSLLLLLSLGIFNSASAIKFENYVVVCDIDSNNKINTTINLEIYNN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEECC
NTEEIKEITYIIPHKINNLNVKSSSELDTYSSILSGSSTEVIIKFKNPIKKGEKGNLIIS
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEE
FTGDLVWDKENKKLLSFSVPAVDSDFTMIIKLPMGASVVSPAEGLLSITPQDYTIDTDGK
EECCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCC
RIFVKWNKQLRSSDKFFTSTVSYAILAPNTNNSNIVETQNGRLDTIYYMLCGVLILITLG
EEEEEECHHHCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFYGIYYEKNKNRRKNNTIKEILKEKEKLLDEINIIKEKYNDEQIKSNNKLKELEKDLEN
HHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH
KLNIATHELNLKDESISELNKELNNLKNENNKLNVLISELKTSLEKSNNDLKNKLKNKDA
HCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH
YIEKIETTNKTLNSKISELTLKIEELNKAINAMEQEQEQKLQKKQEQELQKEQEYKQQID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLNKELLKYRSELRKKEKEIIEFKNLLDNYEKTKEQMFMNILTEDEKMIINLIKSKEEIT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
QKEIVEITGLTKPKVSRIVSDLVERGIIRKVKIGRINKLIISDELNGWL
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCEEEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVSRFKKFEKFKILFSLLLLLSLGIFNSASAIKFENYVVVCDIDSNNKINTTINLEIYNN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEECC
NTEEIKEITYIIPHKINNLNVKSSSELDTYSSILSGSSTEVIIKFKNPIKKGEKGNLIIS
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEE
FTGDLVWDKENKKLLSFSVPAVDSDFTMIIKLPMGASVVSPAEGLLSITPQDYTIDTDGK
EECCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCC
RIFVKWNKQLRSSDKFFTSTVSYAILAPNTNNSNIVETQNGRLDTIYYMLCGVLILITLG
EEEEEECHHHCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFYGIYYEKNKNRRKNNTIKEILKEKEKLLDEINIIKEKYNDEQIKSNNKLKELEKDLEN
HHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH
KLNIATHELNLKDESISELNKELNNLKNENNKLNVLISELKTSLEKSNNDLKNKLKNKDA
HCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH
YIEKIETTNKTLNSKISELTLKIEELNKAINAMEQEQEQKLQKKQEQELQKEQEYKQQID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLNKELLKYRSELRKKEKEIIEFKNLLDNYEKTKEQMFMNILTEDEKMIINLIKSKEEIT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
QKEIVEITGLTKPKVSRIVSDLVERGIIRKVKIGRINKLIISDELNGWL
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCEEEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]