| Definition | Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009635 |
| Length | 1,569,500 |
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The map label for this gene is 150401251
Identifier: 150401251
GI number: 150401251
Start: 851972
End: 853561
Strand: Reverse
Name: 150401251
Synonym: Maeo_0822
Alternate gene names: NA
Gene position: 853561-851972 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150401252
Following gene: 150401250
Centisome position: 54.38
GC content: 26.86
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 529; Mature: 529
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002831 - InterPro: IPR011991 [H]
Pfam domain/function: PF01978 TrmB [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61224; Mature: 61224
Theoretical pI: Translated: 9.19; Mature: 9.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVSRFKKFEKFKILFSLLLLLSLGIFNSASAIKFENYVVVCDIDSNNKINTTINLEIYNN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEECC NTEEIKEITYIIPHKINNLNVKSSSELDTYSSILSGSSTEVIIKFKNPIKKGEKGNLIIS CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEE FTGDLVWDKENKKLLSFSVPAVDSDFTMIIKLPMGASVVSPAEGLLSITPQDYTIDTDGK EECCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCC RIFVKWNKQLRSSDKFFTSTVSYAILAPNTNNSNIVETQNGRLDTIYYMLCGVLILITLG EEEEEECHHHCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFYGIYYEKNKNRRKNNTIKEILKEKEKLLDEINIIKEKYNDEQIKSNNKLKELEKDLEN HHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH KLNIATHELNLKDESISELNKELNNLKNENNKLNVLISELKTSLEKSNNDLKNKLKNKDA HCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH YIEKIETTNKTLNSKISELTLKIEELNKAINAMEQEQEQKLQKKQEQELQKEQEYKQQID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLNKELLKYRSELRKKEKEIIEFKNLLDNYEKTKEQMFMNILTEDEKMIINLIKSKEEIT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH QKEIVEITGLTKPKVSRIVSDLVERGIIRKVKIGRINKLIISDELNGWL HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCEEEEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure MVSRFKKFEKFKILFSLLLLLSLGIFNSASAIKFENYVVVCDIDSNNKINTTINLEIYNN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEECC NTEEIKEITYIIPHKINNLNVKSSSELDTYSSILSGSSTEVIIKFKNPIKKGEKGNLIIS CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEE FTGDLVWDKENKKLLSFSVPAVDSDFTMIIKLPMGASVVSPAEGLLSITPQDYTIDTDGK EECCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCC RIFVKWNKQLRSSDKFFTSTVSYAILAPNTNNSNIVETQNGRLDTIYYMLCGVLILITLG EEEEEECHHHCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFYGIYYEKNKNRRKNNTIKEILKEKEKLLDEINIIKEKYNDEQIKSNNKLKELEKDLEN HHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH KLNIATHELNLKDESISELNKELNNLKNENNKLNVLISELKTSLEKSNNDLKNKLKNKDA HCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHH YIEKIETTNKTLNSKISELTLKIEELNKAINAMEQEQEQKLQKKQEQELQKEQEYKQQID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLNKELLKYRSELRKKEKEIIEFKNLLDNYEKTKEQMFMNILTEDEKMIINLIKSKEEIT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH QKEIVEITGLTKPKVSRIVSDLVERGIIRKVKIGRINKLIISDELNGWL HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCEEEEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]