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The map label for this gene is flaJ [H]

Identifier: 150400703

GI number: 150400703

Start: 292748

End: 294424

Strand: Direct

Name: flaJ [H]

Synonym: Maeo_0268

Alternate gene names: 150400703

Gene position: 292748-294424 (Clockwise)

Preceding gene: 150400702

Following gene: 150400704

Centisome position: 18.65

GC content: 31.07

Gene sequence:

>1677_bases
ATGGTGTTAAATATTTTGCCGCGAATAGGATTAAGGCCCAGAGATTATTTATTAAAATATGTTTTTCCTTCGACAATAAT
ATCAATTATTATACTTGCCATAGGTTTAAATTATTTTTCGGGCTACACTTTATTAACTACATTAACAATTCCAATCGTTA
TTATGGGCGGTGCTTTGGGTTATCCATTTATAAAATTACATGATCAGAAAACTAAAATAAATGAAAAACTTCATGTATTT
ATATCTAAATTTGGAGTACTTTCAATAACAGATTTAGATAGAAAGGAACTTATACATTTGCTTGCATTAGAAAAAGATGA
ATTGGGACAGTTGGCAGATGAATCAAACAAAATATATGTATTGTTGAATAGATGGAATCAATCACTTGCTGAATCTTGTA
GATTTTTATCGCGCAGGACTCCAAGTGATGAATTTTCAGATTTTTTAGATAGAATGTCGTATTCAGTAGATAGTGGTGAG
GACCTTAAATCATTTTTGATTAAAGAACAGGATATTGTTCTAAATGATTATATAGAATTTTATAGGCGATCCTTGTATAT
GTTGGACATATTCAAAGAAATATATGTTAGTGCAATCACGGCACTTTCATTTCTTATAACTTTTGCAATTATCACCCCAT
ATATAGCTCCGTATGATTTTATATCTATGGTAATTATGTCACTTATTGCTTTTGTTGTATTGGAAATCCTGTTAGTACAG
ATAATAATAAATCAAATGCCAAGAGATAAATTATGGCATCAAGCCGATAGGCCCACACAAATCGATCTGAGCATTAGAAA
ATATTTAATAATTTCTATCATATTGTCGGTAATTACTATGTCTGCCCTAATCTGGGGAAAATATATTGCAGAAATTCCAA
AATTGGTGTTAATTCCATATCAAATGGTGTTTGCTATTGGTATTACTCCCCTATTAATTGGTGGGTTCAAGGCAAAAAGA
GAAGAAGATTTGACCATAAGAAGAGAATATAATTTTCCAGATTTTTTAAGGTCCTTGGGCGATTCAGTATCTGCAAAAGG
AGGGGGGATGAAAGACTCTTTGGAATATCTTTCATATCATGATTTTGGTCCATTAACTAAAAATATAAAGCATCTTTACA
AAAGAATGGTATTAAACATCGATAGTAATAAAACATGGAAATTGTTTGGAGTTGAAACAAGTAGTTATTTAATACAATTA
TTTTCGGAAATGTTTGAAAGATGTACATATTTGGGAGGTAATCCTGGATTAGCATCAGATATAATCGGAAATAATTTTCG
TAAAATAATACATTTAAGGAAATCAAAATATCAAAGTGTTAAGCAATTCTCTGGTACCATGTATGGATTGGCTGGGGGCA
TGGCTTTAACATTATTCACAGTTCATGGAGTAACCAATATGATAAATAAATTATATGCAGGACTTAATATGGGACAGGTT
ATGAATCTTATACATGTTGTGCCATCCGAGGACATGAATATTGTAGCATATCTAATGTATGCAAGTTTAATACTTTATTC
TATGTTTTCGGCATATTTAATAAAAATGATGGATGGAGGTCATCCACAAGTCGTTTTGGTGCATTTTGTTATAATGGTAT
GGGTAGTATCTATTGTAGCATGTGTAACAGGATATGTGCTGGATATAGTATTGGGAACCACTATTTCAATAGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTTTTGGATATGATGAAGTAGTAAAAATAATATGGGATTTCTATAAAGAAGGTTTGGACGGCCTTCCATTCCCGATCT
AAAATAATTGGGGTAATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATATTTGCCCTTTATGTTATATATTGTGGGGAGGAAGATCACTATGGTAACTTATATTTTTGGATTAATCGGATTA
TTGGTAGCGTCTATACAAGA

Product: flagellar assembly protein J

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 558; Mature: 558

Protein sequence:

>558_residues
MVLNILPRIGLRPRDYLLKYVFPSTIISIIILAIGLNYFSGYTLLTTLTIPIVIMGGALGYPFIKLHDQKTKINEKLHVF
ISKFGVLSITDLDRKELIHLLALEKDELGQLADESNKIYVLLNRWNQSLAESCRFLSRRTPSDEFSDFLDRMSYSVDSGE
DLKSFLIKEQDIVLNDYIEFYRRSLYMLDIFKEIYVSAITALSFLITFAIITPYIAPYDFISMVIMSLIAFVVLEILLVQ
IIINQMPRDKLWHQADRPTQIDLSIRKYLIISIILSVITMSALIWGKYIAEIPKLVLIPYQMVFAIGITPLLIGGFKAKR
EEDLTIRREYNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMKDSLEYLSYHDFGPLTKNIKHLYKRMVLNIDSNKTWKLFGVETSSYLIQL
FSEMFERCTYLGGNPGLASDIIGNNFRKIIHLRKSKYQSVKQFSGTMYGLAGGMALTLFTVHGVTNMINKLYAGLNMGQV
MNLIHVVPSEDMNIVAYLMYASLILYSMFSAYLIKMMDGGHPQVVLVHFVIMVWVVSIVACVTGYVLDIVLGTTISIA

Sequences:

>Translated_558_residues
MVLNILPRIGLRPRDYLLKYVFPSTIISIIILAIGLNYFSGYTLLTTLTIPIVIMGGALGYPFIKLHDQKTKINEKLHVF
ISKFGVLSITDLDRKELIHLLALEKDELGQLADESNKIYVLLNRWNQSLAESCRFLSRRTPSDEFSDFLDRMSYSVDSGE
DLKSFLIKEQDIVLNDYIEFYRRSLYMLDIFKEIYVSAITALSFLITFAIITPYIAPYDFISMVIMSLIAFVVLEILLVQ
IIINQMPRDKLWHQADRPTQIDLSIRKYLIISIILSVITMSALIWGKYIAEIPKLVLIPYQMVFAIGITPLLIGGFKAKR
EEDLTIRREYNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMKDSLEYLSYHDFGPLTKNIKHLYKRMVLNIDSNKTWKLFGVETSSYLIQL
FSEMFERCTYLGGNPGLASDIIGNNFRKIIHLRKSKYQSVKQFSGTMYGLAGGMALTLFTVHGVTNMINKLYAGLNMGQV
MNLIHVVPSEDMNIVAYLMYASLILYSMFSAYLIKMMDGGHPQVVLVHFVIMVWVVSIVACVTGYVLDIVLGTTISIA
>Mature_558_residues
MVLNILPRIGLRPRDYLLKYVFPSTIISIIILAIGLNYFSGYTLLTTLTIPIVIMGGALGYPFIKLHDQKTKINEKLHVF
ISKFGVLSITDLDRKELIHLLALEKDELGQLADESNKIYVLLNRWNQSLAESCRFLSRRTPSDEFSDFLDRMSYSVDSGE
DLKSFLIKEQDIVLNDYIEFYRRSLYMLDIFKEIYVSAITALSFLITFAIITPYIAPYDFISMVIMSLIAFVVLEILLVQ
IIINQMPRDKLWHQADRPTQIDLSIRKYLIISIILSVITMSALIWGKYIAEIPKLVLIPYQMVFAIGITPLLIGGFKAKR
EEDLTIRREYNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMKDSLEYLSYHDFGPLTKNIKHLYKRMVLNIDSNKTWKLFGVETSSYLIQL
FSEMFERCTYLGGNPGLASDIIGNNFRKIIHLRKSKYQSVKQFSGTMYGLAGGMALTLFTVHGVTNMINKLYAGLNMGQV
MNLIHVVPSEDMNIVAYLMYASLILYSMFSAYLIKMMDGGHPQVVLVHFVIMVWVVSIVACVTGYVLDIVLGTTISIA

Specific function: Unknown

COG id: COG1955

COG function: function code NU; Archaeal flagella assembly protein J

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Archaeal flagellum (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.jannaschii flaJ [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018076 [H]

Pfam domain/function: PF00482 GSPII_F [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63456; Mature: 63456

Theoretical pI: Translated: 8.75; Mature: 8.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVLNILPRIGLRPRDYLLKYVFPSTIISIIILAIGLNYFSGYTLLTTLTIPIVIMGGALG
CCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
YPFIKLHDQKTKINEKLHVFISKFGVLSITDLDRKELIHLLALEKDELGQLADESNKIYV
CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEE
LLNRWNQSLAESCRFLSRRTPSDEFSDFLDRMSYSVDSGEDLKSFLIKEQDIVLNDYIEF
EEEHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
YRRSLYMLDIFKEIYVSAITALSFLITFAIITPYIAPYDFISMVIMSLIAFVVLEILLVQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIINQMPRDKLWHQADRPTQIDLSIRKYLIISIILSVITMSALIWGKYIAEIPKLVLIPY
HHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QMVFAIGITPLLIGGFKAKREEDLTIRREYNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMKDSLEYLSYH
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC
DFGPLTKNIKHLYKRMVLNIDSNKTWKLFGVETSSYLIQLFSEMFERCTYLGGNPGLASD
CCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
IIGNNFRKIIHLRKSKYQSVKQFSGTMYGLAGGMALTLFTVHGVTNMINKLYAGLNMGQV
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
MNLIHVVPSEDMNIVAYLMYASLILYSMFSAYLIKMMDGGHPQVVLVHFVIMVWVVSIVA
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CVTGYVLDIVLGTTISIA
HHHHHHHHHHHHCHHCCC
>Mature Secondary Structure
MVLNILPRIGLRPRDYLLKYVFPSTIISIIILAIGLNYFSGYTLLTTLTIPIVIMGGALG
CCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
YPFIKLHDQKTKINEKLHVFISKFGVLSITDLDRKELIHLLALEKDELGQLADESNKIYV
CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEE
LLNRWNQSLAESCRFLSRRTPSDEFSDFLDRMSYSVDSGEDLKSFLIKEQDIVLNDYIEF
EEEHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
YRRSLYMLDIFKEIYVSAITALSFLITFAIITPYIAPYDFISMVIMSLIAFVVLEILLVQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIINQMPRDKLWHQADRPTQIDLSIRKYLIISIILSVITMSALIWGKYIAEIPKLVLIPY
HHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QMVFAIGITPLLIGGFKAKREEDLTIRREYNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMKDSLEYLSYH
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC
DFGPLTKNIKHLYKRMVLNIDSNKTWKLFGVETSSYLIQLFSEMFERCTYLGGNPGLASD
CCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
IIGNNFRKIIHLRKSKYQSVKQFSGTMYGLAGGMALTLFTVHGVTNMINKLYAGLNMGQV
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
MNLIHVVPSEDMNIVAYLMYASLILYSMFSAYLIKMMDGGHPQVVLVHFVIMVWVVSIVA
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CVTGYVLDIVLGTTISIA
HHHHHHHHHHHHCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA