| Definition | Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009635 |
| Length | 1,569,500 |
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The map label for this gene is 150400440
Identifier: 150400440
GI number: 150400440
Start: 196
End: 1440
Strand: Direct
Name: 150400440
Synonym: Maeo_0001
Alternate gene names: NA
Gene position: 196-1440 (Clockwise)
Preceding gene: NA
Following gene: 150400441
Centisome position: 0.01
GC content: 25.06
Gene sequence:
>1245_bases ATGATTTCAACATTTAAAGAAATATTGGCTAAAAAAAATATAAAATATGATAATCCCGTAATTGTTATTTTATTAGGTTA TTTGGCAATATTTGTCCTTGCCATACCTTATTATTATAAGTTTAATTTATTTTCTCTATTAAATATATTTTTAGTTATTT TTTTACTTATTCTTTCCTTTGCCCTGCCATTTTTGTTAAATGTGGATATAGAGGGAAATAATAAAATCTCTAATTTTTAT AGACTTTACGGGTTATTATTATTTATTATTATATTTTATGGCGTATTTGTTGTTATGAATTCCATTTTATTTGCCGTTTT ATGCTCACTGTTTGTTATTGGAATATCAAATTTATATGTTAAATATAAACTATACGATAACGGACAGGATATAAAAAATA AACAACATGAAAAATATTGTAAATTCAAGGAATTGCTATTTAAAAATATGGATAATATAATATTTGCCATTGGAATTATG TCATTTATGGCGTTGGTGATTATTCATAATGCTATACCGTTGTTTAATTATCCTGTTAGGATGAGTTTATCTGCGGACCC ACTTAGATTAATATCTACGGGAGCTCTGGTATATGGAGGTATTAATAATATATTTTATTTTATAATTGCCTTTATTTTAC TAATATTATTGGGCTATAAAATGGGCGTATTAATCGTTTTTATAGCTTTTTTAGTATATAGATATCAAACAAAAAAAATA AAAATAAAATATATATTGTTGTCAATCATAGGATTAATTGGATTATTGGCTTTAATGTCAAAAGCAATACTATATACATC AAATCAAAATTGGAATATTGGTGTATTTGGCATATTATCATATAGGGCCTATTTTGATATAATGGTGCTGGAAAAAATAA TAAATTATCCATATATGTTGCTGGGGGCAATCTCTTTAAATCCTATTGGGGAAGGACTTATTGCAACCACTTTATTGGGG TATTCAAATCCACATAATATTACTTCAACAATGTTTGGACCCATATTATTGGATTTCGGATTATGGGGAGGATTATTATT TGCATTTTTATTGGGTCTAGCAAGTAAATTAATATATGGGGGAGATAGAAAACTATATGCAATATATGCATCAATATTAT TATCTATGTGTGAAGTTGGTATTAATTATGGTTTTTTAATTATTGTGTTTGTAATGTTATATGTGAATTCTAAATTATCG ATACTAAAAAATAAAAATAGAAATAAAAATAAAAATAGAACATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTTGTTTTAATAAATCTTTGATTTATCATAATTATGAAGGAATTTGACTTTTTGAACACACTATAAAAAACATAAAAA TAATATTTAACCGTGATTAC
Downstream 100 bases:
>100_bases GGAGCTCCACCATAAACACCATATAATGTGATATTATGGATTTTGAAAATAATAATGTTAATGATAATATTGAAGTTAAA AAACTTGAAAAGAATATAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 414; Mature: 414
Protein sequence:
>414_residues MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSFALPFLLNVDIEGNNKISNFY RLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYVKYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIM SFMALVIIHNAIPLFNYPVRMSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYMLLGAISLNPIGEGLIATTLLG YSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYGGDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLS ILKNKNRNKNKNRT
Sequences:
>Translated_414_residues MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSFALPFLLNVDIEGNNKISNFY RLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYVKYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIM SFMALVIIHNAIPLFNYPVRMSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYMLLGAISLNPIGEGLIATTLLG YSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYGGDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLS ILKNKNRNKNKNRT >Mature_414_residues MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSFALPFLLNVDIEGNNKISNFY RLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYVKYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIM SFMALVIIHNAIPLFNYPVRMSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYMLLGAISLNPIGEGLIATTLLG YSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYGGDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLS ILKNKNRNKNKNRT
Specific function: Unknown
COG id: COG1822
COG function: function code S; Predicted archaeal membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002760 [H]
Pfam domain/function: PF01901 DUF70 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47160; Mature: 47160
Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSF CCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALPFLLNVDIEGNNKISNFYRLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYV HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE KYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIMSFMALVIIHNAIPLFNYPVR EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE MSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI EECCCCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH LGAISLNPIGEGLIATTLLGYSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYG HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLSILKNKNRNKNKNRT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSF CCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALPFLLNVDIEGNNKISNFYRLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYV HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE KYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIMSFMALVIIHNAIPLFNYPVR EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE MSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI EECCCCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH LGAISLNPIGEGLIATTLLGYSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYG HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLSILKNKNRNKNKNRT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]