Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150400440

Identifier: 150400440

GI number: 150400440

Start: 196

End: 1440

Strand: Direct

Name: 150400440

Synonym: Maeo_0001

Alternate gene names: NA

Gene position: 196-1440 (Clockwise)

Preceding gene: NA

Following gene: 150400441

Centisome position: 0.01

GC content: 25.06

Gene sequence:

>1245_bases
ATGATTTCAACATTTAAAGAAATATTGGCTAAAAAAAATATAAAATATGATAATCCCGTAATTGTTATTTTATTAGGTTA
TTTGGCAATATTTGTCCTTGCCATACCTTATTATTATAAGTTTAATTTATTTTCTCTATTAAATATATTTTTAGTTATTT
TTTTACTTATTCTTTCCTTTGCCCTGCCATTTTTGTTAAATGTGGATATAGAGGGAAATAATAAAATCTCTAATTTTTAT
AGACTTTACGGGTTATTATTATTTATTATTATATTTTATGGCGTATTTGTTGTTATGAATTCCATTTTATTTGCCGTTTT
ATGCTCACTGTTTGTTATTGGAATATCAAATTTATATGTTAAATATAAACTATACGATAACGGACAGGATATAAAAAATA
AACAACATGAAAAATATTGTAAATTCAAGGAATTGCTATTTAAAAATATGGATAATATAATATTTGCCATTGGAATTATG
TCATTTATGGCGTTGGTGATTATTCATAATGCTATACCGTTGTTTAATTATCCTGTTAGGATGAGTTTATCTGCGGACCC
ACTTAGATTAATATCTACGGGAGCTCTGGTATATGGAGGTATTAATAATATATTTTATTTTATAATTGCCTTTATTTTAC
TAATATTATTGGGCTATAAAATGGGCGTATTAATCGTTTTTATAGCTTTTTTAGTATATAGATATCAAACAAAAAAAATA
AAAATAAAATATATATTGTTGTCAATCATAGGATTAATTGGATTATTGGCTTTAATGTCAAAAGCAATACTATATACATC
AAATCAAAATTGGAATATTGGTGTATTTGGCATATTATCATATAGGGCCTATTTTGATATAATGGTGCTGGAAAAAATAA
TAAATTATCCATATATGTTGCTGGGGGCAATCTCTTTAAATCCTATTGGGGAAGGACTTATTGCAACCACTTTATTGGGG
TATTCAAATCCACATAATATTACTTCAACAATGTTTGGACCCATATTATTGGATTTCGGATTATGGGGAGGATTATTATT
TGCATTTTTATTGGGTCTAGCAAGTAAATTAATATATGGGGGAGATAGAAAACTATATGCAATATATGCATCAATATTAT
TATCTATGTGTGAAGTTGGTATTAATTATGGTTTTTTAATTATTGTGTTTGTAATGTTATATGTGAATTCTAAATTATCG
ATACTAAAAAATAAAAATAGAAATAAAAATAAAAATAGAACATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTGTTTTAATAAATCTTTGATTTATCATAATTATGAAGGAATTTGACTTTTTGAACACACTATAAAAAACATAAAAA
TAATATTTAACCGTGATTAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGCTCCACCATAAACACCATATAATGTGATATTATGGATTTTGAAAATAATAATGTTAATGATAATATTGAAGTTAAA
AAACTTGAAAAGAATATAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 414; Mature: 414

Protein sequence:

>414_residues
MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSFALPFLLNVDIEGNNKISNFY
RLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYVKYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIM
SFMALVIIHNAIPLFNYPVRMSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI
KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYMLLGAISLNPIGEGLIATTLLG
YSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYGGDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLS
ILKNKNRNKNKNRT

Sequences:

>Translated_414_residues
MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSFALPFLLNVDIEGNNKISNFY
RLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYVKYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIM
SFMALVIIHNAIPLFNYPVRMSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI
KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYMLLGAISLNPIGEGLIATTLLG
YSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYGGDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLS
ILKNKNRNKNKNRT
>Mature_414_residues
MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSFALPFLLNVDIEGNNKISNFY
RLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYVKYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIM
SFMALVIIHNAIPLFNYPVRMSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI
KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYMLLGAISLNPIGEGLIATTLLG
YSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYGGDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLS
ILKNKNRNKNKNRT

Specific function: Unknown

COG id: COG1822

COG function: function code S; Predicted archaeal membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002760 [H]

Pfam domain/function: PF01901 DUF70 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47160; Mature: 47160

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSF
CCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALPFLLNVDIEGNNKISNFYRLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYV
HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE
KYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIMSFMALVIIHNAIPLFNYPVR
EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE
MSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI
EECCCCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LGAISLNPIGEGLIATTLLGYSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYG
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLSILKNKNRNKNKNRT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MISTFKEILAKKNIKYDNPVIVILLGYLAIFVLAIPYYYKFNLFSLLNIFLVIFLLILSF
CCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALPFLLNVDIEGNNKISNFYRLYGLLLFIIIFYGVFVVMNSILFAVLCSLFVIGISNLYV
HHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE
KYKLYDNGQDIKNKQHEKYCKFKELLFKNMDNIIFAIGIMSFMALVIIHNAIPLFNYPVR
EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE
MSLSADPLRLISTGALVYGGINNIFYFIIAFILLILLGYKMGVLIVFIAFLVYRYQTKKI
EECCCCCHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KIKYILLSIIGLIGLLALMSKAILYTSNQNWNIGVFGILSYRAYFDIMVLEKIINYPYML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LGAISLNPIGEGLIATTLLGYSNPHNITSTMFGPILLDFGLWGGLLFAFLLGLASKLIYG
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GDRKLYAIYASILLSMCEVGINYGFLIIVFVMLYVNSKLSILKNKNRNKNKNRT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]