| Definition | Methanococcus vannielii SB chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009634 |
| Length | 1,720,048 |
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The map label for this gene is 150400391
Identifier: 150400391
GI number: 150400391
Start: 1671157
End: 1672806
Strand: Reverse
Name: 150400391
Synonym: Mevan_1654
Alternate gene names: NA
Gene position: 1672806-1671157 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150400392
Following gene: 150400389
Centisome position: 97.25
GC content: 24.91
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTTTACTTTTTTTCCCACATTTTCAAAAAACCCAATTCGAAAATTTAATATCTTAGTCGCTTTAAATTAAATTTAATT ATATTTATCGAGGGGAGTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTCCTTAAAGCCACGTAAAATCCATACCCCCACCAAAAACAACTAATTTTTACTCCCCAACCAAACACTTAAATATAT TAATTACAATCTCTTTTTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 549; Mature: 548
Protein sequence:
>549_residues MGGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIITQIQAGFLGILIPFILILLQT ILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLMSNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFL LISFILVAISSIDIYSFSKYVVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFKKIQDRNFVLSDNELDEFIDL FHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSLKNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMS RINYLTLNLKETVEKRDLNLIINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILKKLKENQSKE
Sequences:
>Translated_549_residues MGGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIITQIQAGFLGILIPFILILLQT ILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLMSNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFL LISFILVAISSIDIYSFSKYVVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFKKIQDRNFVLSDNELDEFIDL FHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSLKNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMS RINYLTLNLKETVEKRDLNLIINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILKKLKENQSKE >Mature_548_residues GGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIITQIQAGFLGILIPFILILLQTI LSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLMSNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFLL ISFILVAISSIDIYSFSKYVVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYSE IENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFKKIQDRNFVLSDNELDEFIDLF HKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSLKNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMSR INYLTLNLKETVEKRDLNLIINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNLD DNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILKKLKENQSKE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 64492; Mature: 64361
Theoretical pI: Translated: 8.86; Mature: 8.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIIT CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH QIQAGFLGILIPFILILLQTILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFLLISFILVAISSIDIYSFSKY CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH VVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHH EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFK HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KIQDRNFVLSDNELDEFIDLFHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSL HHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCC KNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMSRINYLTLNLKETVEKRDLNL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHCCCEEEEEHHHHHHHCCCEE IINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL EEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCC DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILK CHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KLKENQSKE HHHHCCCCC >Mature Secondary Structure GGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIIT CCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH QIQAGFLGILIPFILILLQTILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFLLISFILVAISSIDIYSFSKY CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH VVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHH EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFK HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KIQDRNFVLSDNELDEFIDLFHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSL HHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCC KNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMSRINYLTLNLKETVEKRDLNL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHCCCEEEEEHHHHHHHCCCEE IINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL EEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCC DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILK CHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KLKENQSKE HHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA