| Definition | Methanococcus vannielii SB chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009634 |
| Length | 1,720,048 |
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The map label for this gene is 150399734
Identifier: 150399734
GI number: 150399734
Start: 1002295
End: 1004076
Strand: Reverse
Name: 150399734
Synonym: Mevan_0986
Alternate gene names: NA
Gene position: 1004076-1002295 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150399735
Following gene: 150399733
Centisome position: 58.37
GC content: 23.91
Gene sequence:
>1782_bases TTGGACATTTTTTATTTTTTAACAATTCTGGTACTTTTATACTTGGTAAATCCCCTAAAAAACGAAGAAAGATTACTGAC AACTCCGTTTTTAGCTGTATCTTATATTGTAATTTTATCATATTTAATGTCTGTTTTTGACATTAATTTAATTAAAATAT ATTATTTACTTCCCTTAATTTTTTTTAATATATTAAATTTTAAAAAAATTTCAGTTAAAAATTTAAAAATAAATAAAATT TCCGGCCTGTTCGTAATCTTAATTTCAATTTTTGCAATTTTTACTGGATTTATGATATTTCCAGAAAATCCTTTAAATAA AACAGATACGCAATTTCACAGCTATAAACTAAAAGCTATTTTTGAAGAAAAAAATATATTTTACGAAACTAAAGAAATTC CTTACTTAAATTATATTAATTACCCATCAGGATACCATTCATTTACGTATCTTTTTTTAACTCAAGTAAGCGACATTCCA AGCGCATTTAATTTTTTAATGTACTTTATGCTTATTTTAATGGTAACAGGTTTTTATTTAATTGGTGAGGCCATAAAAAA AGGATTAGGATACTTTACAGCACCTTTTGTAATATCTGGAAGTGTTTTTTACGGGATTATTTATGTACTCTATCCAAATT ATCTTGCTTACTCTTTATTTTTAATTTCAGTATTTTTTTTAATACGGTATCTTAATTCAAAAGAGACTACTTATCTATTC CTTTTTTCATTTGTACTTATGGCCACAGCTTATACGCACACTATACCATTTTTAATGATATTTTTATTCATTGTTTCAAT TTTAATACATGAAACCATATTTAAAAATTATACTTCGATAAAAAATTATTTAATATATTTTTTTGGTTCATCATTAATTT CATTCATACTGATTTCTAAAAAACTTTCAAAAGAAATAATTTCATACAGCAAAAGCTCAAATATTATTTCTGAACCATTA AATGTAATCATACATAACATTTTTGCAGGTTTTGGAATATTTTATTTATTTACAAAGCATCCAGTATATACAGTAGCTCT TGATAACGAACTTACGTTTTTAATTTCCATATTTTTAACTTATTTATTTTTAATTGGAATATATAGTCTACTAAAAAACA AACTTTATTATTTGGCTATATTTCCAGTATTACTACTTGCAATATTAATAAACAGTCATTTTATCCATTTTAATATTCCA TTTTTTAACACAATGTATGCATCAAACAGGATGATGTATAATATTCAGGCGATAATGCCTATATTTTACGGTTTTGGAGC ATATTCTATATTCAATATGCTTAAAAAAAATTTTTCAAAAGTATTATTTATTTTAATTAGTCTTTGTATAATATTCTCAT CAGCATACGCAAATTCGCAAATAATACCGGAATATTTAAAAGAACAATATGTAGTTTCCGGGGACGATTTAATGGCGTTT GATTGGATAAATAAAAATGAAATATTTAATGAAACATTTTTAAATTTTGGACAAGATGCAGGCCAATTTTTACCAATATA TACGAGTAATCAGCCTGCATTTTATTATACTAAGTTTTCAAGTGGTAATTTTTCAATAGGGGATACTACATTATATGAAA TTGCAAAATTTATAGATGAAAAAGACCACGATAACTACTCAAAAACCTGCAAAGAAAATAATATCAGATATGTATATGTT TCTGAAATTTTAGGGAAATATTGTACCGATTTTTTCAAAAATGAGGATTATTTTAAAATAAGATACCAAAAGAATAATGT ATATATTGTTGAAGTGATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ACAAGTACTTTAACGGATATTGCAGGAAAGGCAACAGGTAATTTAACTAATATTATTACCTTTACACCTTAAATATTCAT TTTTTACTTTTGGTGTTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAAATAACAAAATTATTTTTTGAAGTGAAAGAATGAAATTTTTAGAAAAACTTTTTTCAAATAAAGGTCAGGTTTCAA TGGAAATCGGTATCTTAGTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 593; Mature: 593
Protein sequence:
>593_residues MDIFYFLTILVLLYLVNPLKNEERLLTTPFLAVSYIVILSYLMSVFDINLIKIYYLLPLIFFNILNFKKISVKNLKINKI SGLFVILISIFAIFTGFMIFPENPLNKTDTQFHSYKLKAIFEEKNIFYETKEIPYLNYINYPSGYHSFTYLFLTQVSDIP SAFNFLMYFMLILMVTGFYLIGEAIKKGLGYFTAPFVISGSVFYGIIYVLYPNYLAYSLFLISVFFLIRYLNSKETTYLF LFSFVLMATAYTHTIPFLMIFLFIVSILIHETIFKNYTSIKNYLIYFFGSSLISFILISKKLSKEIISYSKSSNIISEPL NVIIHNIFAGFGIFYLFTKHPVYTVALDNELTFLISIFLTYLFLIGIYSLLKNKLYYLAIFPVLLLAILINSHFIHFNIP FFNTMYASNRMMYNIQAIMPIFYGFGAYSIFNMLKKNFSKVLFILISLCIIFSSAYANSQIIPEYLKEQYVVSGDDLMAF DWINKNEIFNETFLNFGQDAGQFLPIYTSNQPAFYYTKFSSGNFSIGDTTLYEIAKFIDEKDHDNYSKTCKENNIRYVYV SEILGKYCTDFFKNEDYFKIRYQKNNVYIVEVI
Sequences:
>Translated_593_residues MDIFYFLTILVLLYLVNPLKNEERLLTTPFLAVSYIVILSYLMSVFDINLIKIYYLLPLIFFNILNFKKISVKNLKINKI SGLFVILISIFAIFTGFMIFPENPLNKTDTQFHSYKLKAIFEEKNIFYETKEIPYLNYINYPSGYHSFTYLFLTQVSDIP SAFNFLMYFMLILMVTGFYLIGEAIKKGLGYFTAPFVISGSVFYGIIYVLYPNYLAYSLFLISVFFLIRYLNSKETTYLF LFSFVLMATAYTHTIPFLMIFLFIVSILIHETIFKNYTSIKNYLIYFFGSSLISFILISKKLSKEIISYSKSSNIISEPL NVIIHNIFAGFGIFYLFTKHPVYTVALDNELTFLISIFLTYLFLIGIYSLLKNKLYYLAIFPVLLLAILINSHFIHFNIP FFNTMYASNRMMYNIQAIMPIFYGFGAYSIFNMLKKNFSKVLFILISLCIIFSSAYANSQIIPEYLKEQYVVSGDDLMAF DWINKNEIFNETFLNFGQDAGQFLPIYTSNQPAFYYTKFSSGNFSIGDTTLYEIAKFIDEKDHDNYSKTCKENNIRYVYV SEILGKYCTDFFKNEDYFKIRYQKNNVYIVEVI >Mature_593_residues MDIFYFLTILVLLYLVNPLKNEERLLTTPFLAVSYIVILSYLMSVFDINLIKIYYLLPLIFFNILNFKKISVKNLKINKI SGLFVILISIFAIFTGFMIFPENPLNKTDTQFHSYKLKAIFEEKNIFYETKEIPYLNYINYPSGYHSFTYLFLTQVSDIP SAFNFLMYFMLILMVTGFYLIGEAIKKGLGYFTAPFVISGSVFYGIIYVLYPNYLAYSLFLISVFFLIRYLNSKETTYLF LFSFVLMATAYTHTIPFLMIFLFIVSILIHETIFKNYTSIKNYLIYFFGSSLISFILISKKLSKEIISYSKSSNIISEPL NVIIHNIFAGFGIFYLFTKHPVYTVALDNELTFLISIFLTYLFLIGIYSLLKNKLYYLAIFPVLLLAILINSHFIHFNIP FFNTMYASNRMMYNIQAIMPIFYGFGAYSIFNMLKKNFSKVLFILISLCIIFSSAYANSQIIPEYLKEQYVVSGDDLMAF DWINKNEIFNETFLNFGQDAGQFLPIYTSNQPAFYYTKFSSGNFSIGDTTLYEIAKFIDEKDHDNYSKTCKENNIRYVYV SEILGKYCTDFFKNEDYFKIRYQKNNVYIVEVI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69521; Mature: 69521
Theoretical pI: Translated: 8.75; Mature: 8.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDIFYFLTILVLLYLVNPLKNEERLLTTPFLAVSYIVILSYLMSVFDINLIKIYYLLPLI CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFNILNFKKISVKNLKINKISGLFVILISIFAIFTGFMIFPENPLNKTDTQFHSYKLKAI HHHHHCCCEEEEECEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHE FEEKNIFYETKEIPYLNYINYPSGYHSFTYLFLTQVSDIPSAFNFLMYFMLILMVTGFYL EECCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGEAIKKGLGYFTAPFVISGSVFYGIIYVLYPNYLAYSLFLISVFFLIRYLNSKETTYLF HHHHHHHCCCCEECHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH LFSFVLMATAYTHTIPFLMIFLFIVSILIHETIFKNYTSIKNYLIYFFGSSLISFILISK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLSKEIISYSKSSNIISEPLNVIIHNIFAGFGIFYLFTKHPVYTVALDNELTFLISIFLT HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHH YLFLIGIYSLLKNKLYYLAIFPVLLLAILINSHFIHFNIPFFNTMYASNRMMYNIQAIMP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHCCCEEEHHHHHHH IFYGFGAYSIFNMLKKNFSKVLFILISLCIIFSSAYANSQIIPEYLKEQYVVSGDDLMAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCEEECCCCEEEE DWINKNEIFNETFLNFGQDAGQFLPIYTSNQPAFYYTKFSSGNFSIGDTTLYEIAKFIDE ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC KDHDNYSKTCKENNIRYVYVSEILGKYCTDFFKNEDYFKIRYQKNNVYIVEVI CCCCCHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEEEEEC >Mature Secondary Structure MDIFYFLTILVLLYLVNPLKNEERLLTTPFLAVSYIVILSYLMSVFDINLIKIYYLLPLI CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFNILNFKKISVKNLKINKISGLFVILISIFAIFTGFMIFPENPLNKTDTQFHSYKLKAI HHHHHCCCEEEEECEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHE FEEKNIFYETKEIPYLNYINYPSGYHSFTYLFLTQVSDIPSAFNFLMYFMLILMVTGFYL EECCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGEAIKKGLGYFTAPFVISGSVFYGIIYVLYPNYLAYSLFLISVFFLIRYLNSKETTYLF HHHHHHHCCCCEECHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH LFSFVLMATAYTHTIPFLMIFLFIVSILIHETIFKNYTSIKNYLIYFFGSSLISFILISK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLSKEIISYSKSSNIISEPLNVIIHNIFAGFGIFYLFTKHPVYTVALDNELTFLISIFLT HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHH YLFLIGIYSLLKNKLYYLAIFPVLLLAILINSHFIHFNIPFFNTMYASNRMMYNIQAIMP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHCCCEEEHHHHHHH IFYGFGAYSIFNMLKKNFSKVLFILISLCIIFSSAYANSQIIPEYLKEQYVVSGDDLMAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCEEECCCCEEEE DWINKNEIFNETFLNFGQDAGQFLPIYTSNQPAFYYTKFSSGNFSIGDTTLYEIAKFIDE ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC KDHDNYSKTCKENNIRYVYVSEILGKYCTDFFKNEDYFKIRYQKNNVYIVEVI CCCCCHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA