| Definition | Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009615 |
| Length | 4,811,379 |
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The map label for this gene is yjbB [H]
Identifier: 150009739
GI number: 150009739
Start: 3813310
End: 3814995
Strand: Reverse
Name: yjbB [H]
Synonym: BDI_3154
Alternate gene names: 150009739
Gene position: 3814995-3813310 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150009763
Following gene: 150009738
Centisome position: 79.29
GC content: 45.73
Gene sequence:
>1686_bases ATGGACTATTCTTTTTTTGATTTTCTCCGGCTGATCGGCTCCTTGGCGCTGTTCTTGTACGGAATGAAGATCATGAGTGA AGGGTTACAAAAATTTGCGGGTGACAGTTTACGTCGAATACTAACCGCGATGACCACAAACAGAGTGACCGGTGTGCTCA CCGGCGTGTTAATAACGGCTCTCATCCAATCCTCATCGGCTACGACGGTTATGGTCGTGAGTTTCGTGAATGCCGGACTC TTGACATTGACCCAATCCATCGGAGTCATTATGGGTGCCAACATCGGAACCACGGTAACGGCATGGCTTATCTCCGCCCT CGGTTTCAAGGTCGATATCGCCGCATTCGCCCTTCCCCTTTTAGCTTTCGCTCTCCCACTCTTCTTCTCAGGAAAAAGCT CTCGTAAATCAATTGGTGAATTTGTCTTTGGTTTCGCGTTCCTGTTCATGGGGCTTCAAAGCTTAAAGGCAAACGCCCCG GACCTCGGAGCGAATCCGGAGATGCTGGCTTTCGTGCAGAATTATACGGATATGGGATTTTTCTCCATCATCTTGTTCTT ATTTATCGGAGCGATCTTAACCATGATCGTACAAGCCTCCGCTGCCACGATGGCTATTACATTGATTATGTGCGCCAACG GCTGGATCGATTATCATTTGGGAGTCGCTTTGGTATTAGGCGAGAATATCGGAACCACGATTACGGCCAACTTAGCCGCA TTAACCGGAAACACACAAGCACGACGAGCCGCGTTAGCGCACCTTGTTTTCAACGTTTTCGGTGTCATGTGGGTTTTGGT GCTCTTCTACCCTTTCACGAATGCCGTCTCATGGTTTGTTACCCATGTAATGAAGGTCAGTGATCCGGCTGTGGCGGTAT CCTTTAAACTGGCAGCGTTCCACACAGCATTCAATATCAGTAATACTTTCATTATGATCTGGTTCGTAAGCTTGATCGAA AAGACCGTATGTACGCTTATCAAGCCCAAGGTGGAAGACGAGGAATACCGCCTTCGCTATATCACGGGAGGTATGTTATC CACCGCCGAGCTTTCTATCCTGCAAGCGCATAAAGAAATCTCATTATTCGCCGAGCGTACGGCTAGGATGTTTAATATGG TGAAAGAATTATTCTACGAGAAGAATGAGGAGACCTTCCTCAAGACTTATAGCCGCATCGAGAAATACGAGAATATCAGC GACCGCATGGAGATCGAGATCGCAAATTACTTGACTGAAGTATCGGAAGGCCGTTTGAGTTCTGAAAGTAAGGAAGAAAT CCGTATCATGCTACGTGCCGTCTCGGAAATCGAGAGTATAGCGGATTCTTGTAATAACCTTGCCCGAAGTATCAAACGCA GAAACGAGTTCAAATCCGAATTCACGGAGGAGCAAAACAAGCACTTGGATCATATGTTCGAGCTGGTATCCGGGGCGTTA AATCGCATGAACCTAATTTTGCATAAACCGGAACTCGTACATGATGATATCAATCCTTCTTATAACATAGAGAACGAGAT CAACAACTACCGTAACCAGTTGAAGAGCCGGAATATCGAAGATATCAACAATAAGCTGTACCAATATCAAGATGGCGTTT ATTACATGGACATGGTTAGTGAAAGTGAAAAGCTGGGCGATTATGTATTAAATGTTGTTCAAGCGGTTATCGAGAAGAAA ATATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTATTGTCTCAGACATACTATCTCAGTTATTATTTGTAAATTCGCCCCCTAAAGTTAGGAATATTAATCGGATATACAA TCCACTTAAACGTAATTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CGTATATTTGTCCTTAACAATATCAACAGCCCTTTTCCGTTATTGAGAGAAGGGCTGTTTTTAATATATATCCACTATGA ATTATAAGTATTATACGATC
Product: putative Na+-dependent phosphate transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 561; Mature: 561
Protein sequence:
>561_residues MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITALIQSSSATTVMVVSFVNAGL LTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPLLAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAP DLGANPEMLAFVQNYTDMGFFSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAFHTAFNISNTFIMIWFVSLIE KTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEISLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENIS DRMEIEIANYLTEVSEGRLSSESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVSESEKLGDYVLNVVQAVIEKK I
Sequences:
>Translated_561_residues MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITALIQSSSATTVMVVSFVNAGL LTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPLLAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAP DLGANPEMLAFVQNYTDMGFFSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAFHTAFNISNTFIMIWFVSLIE KTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEISLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENIS DRMEIEIANYLTEVSEGRLSSESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVSESEKLGDYVLNVVQAVIEKK I >Mature_561_residues MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITALIQSSSATTVMVVSFVNAGL LTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPLLAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAP DLGANPEMLAFVQNYTDMGFFSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAFHTAFNISNTFIMIWFVSLIE KTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEISLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENIS DRMEIEIANYLTEVSEGRLSSESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVSESEKLGDYVLNVVQAVIEKK I
Specific function: Unknown
COG id: COG1283
COG function: function code P; Na+/phosphate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To B.subtilis yqeW [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=572, Percent_Identity=22.9020979020979, Blast_Score=122, Evalue=7e-29,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003841 - InterPro: IPR004633 [H]
Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62941; Mature: 62941
Theoretical pI: Translated: 5.89; Mature: 5.89
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 4.3 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 4.3 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIQSSSATTVMVVSFVNAGLLTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPL HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAPDLGANPEMLAFVQNYTDMGF HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHH FSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEHHHH LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEHHHHH HTAFNISNTFIMIWFVSLIEKTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH SLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENISDRMEIEIANYLTEVSEGRLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVS HHHHHHEECCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH ESEKLGDYVLNVVQAVIEKKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIQSSSATTVMVVSFVNAGLLTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPL HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAPDLGANPEMLAFVQNYTDMGF HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHH FSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEHHHH LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEHHHHH HTAFNISNTFIMIWFVSLIEKTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH SLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENISDRMEIEIANYLTEVSEGRLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVS HHHHHHEECCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH ESEKLGDYVLNVVQAVIEKKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11206551; 11258796 [H]