Definition Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome.
Accession NC_009615
Length 4,811,379

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 150007917

Identifier: 150007917

GI number: 150007917

Start: 1486208

End: 1488367

Strand: Direct

Name: 150007917

Synonym: BDI_1278

Alternate gene names: NA

Gene position: 1486208-1488367 (Clockwise)

Preceding gene: 150007916

Following gene: 150007918

Centisome position: 30.89

GC content: 36.06

Gene sequence:

>2160_bases
ATGGATATTACACTATACATATCCCGTTTTTTATATAGAATTCGTCACCAACTGATATTTGGAACGCTTATTGTAACAGC
ATTGGTTGCCTATTTCAGTCAATTCATGGAGAAAAAATACACCGTGACAACTTCGATCTACACAGGTATTACCTCCAACA
CGGGTTTAGATGAAGAGACAAAACCTGATTGGCAGGCAGTAAACAACACATATGATAACTTGGTTAATTTAACAAAATCA
AGAGGAACCCTAGAAAACGTATCACTAAAATTATTAGCATTAAACCTAACACAAGGAAATCCTGAAATAGATAATCTCTA
TATAACAGCTGACAATTACAAGAAATTAACAGCATCTATACCTGAAGAAATAATAAATTTAATAGACACGGCTTCTCTCG
ATAACACTATAAACAGATTTAAAGAATATAAAAACATTGATAGCCGCAATTATTTGCATGAATTGCTCAACGGAGGAGCT
GCATTCTATAGCTACGCAGCTTTATCCAGCATAATTATTAGACGCCAAGGTAATAGCGATTTGATAGAGATAGCCTACAC
TAGCTCAGATCCCGGAATCACATGGAATACGGTTAAGTTAGTCAGCGAAGAAATGAAATATTCTTACGATAATTTAAAAT
ATAAAACAGCAAATGATATCGTAAAATATTATGAGCAGGAATTGAATAAATTAAGGACAAAACTCAATCAACAAGAAAAT
GATCTTACAAATTATAACGTACAAAACAGCGTCATAAATTATACAGAACAAACAAAATCTATCGCAAACTCTTTTGCTGA
TTTTGAGAACCGTTACGAAGAAACACAACGAAGTTACGAGAGCTCAACCAAAATCATCAACGAGTTAGAGAAATATATGG
AAGTTCGTACTAAACTTGTCAAAACGAATGAAGAGTTTATCAACGCATTGGAAGATGTTTCCCGCATCAGTGGTAAAATC
ACCGAGATAGAGACTTTCACCTCTGAAAACGCATTAAACAAGGATACAGAATTAACACGATATCAAGATCAACTGAAAGA
TGTCGAGAAGAGAATAGCATTACTGACAGATAAAATTAATAGCTATAAAGAAAGTAAAGAAGGAATCGCTATTGACGGAT
TAGTACAAGAATGGTTGTCACAGACCTTGATACAAGTGAAATCCAAGGCAGACTTAGAGATTTTAAACAAAAGAAAGCAC
GATTTCGAGGAGCAGTATAAGAATTATTCTCCCATTGGGACTAAGATCAACCAGCAAGAACGAGAGATCAATGTCACTGA
ACAGTCTTATCTACAAGTTCTCCATGCCTTAAATATGGCTAAGATGAAACAGGTGAACTTACAATTAACCTCATCAAACT
TAACAACTATCTCAGAGGCCGCTTATCCATTGTTTAGTGACAAAGGTAAGCGCATGTTTTTAGTCATAGCCGCTTTTATC
GGTAGTTTAATTTTCATTATAGCCCTAAATTTGGTCATTGAATTACTAGACCGTACCCTCCGGGATGCAGAACGGGCTAA
ACGCCTCACAGGAATGAATATATTAGGAGCCTTCAACGGACGCAACTCCCAATTGAAATACAGGGGATTTGTAAAGACCT
GTAACCGAATATCAGCCGCATACGCTTGCAATCGGTTGGCTCCTTATTTGCAAAAAAATAAGACTCTATACATAAATATA
TTAAGTATAGAAGAAAGAGAAGGGAAGACATTCGTTGCCAAATATTTTCAAGAACGTTGGGAAGAGCTAGGTTTCCAAGT
ACGATATATAAGGATCGGAGAAGAGATAAACATTGAATCGTCACTATTCACCACAGAAAATATAGAAGAGTATATTAAAG
CCGAAAGTCAACCAGACATTGTATTAATCGAATATCCTTCCATTCAAGGAAACAGTGTGCCTCCACATTTGCTAAGCTCA
AGTCAAGTTAATATTCTAATAGCTAATGTACGCAGAGTATGGAAAAATAGCGATAAGGAATTTGTTAGTTATTTGCGTGA
GATAACTAAAAATACATCTTTGTATTTATACTTGAATAACGCCTCACGAGAAGCCGTAGAAGATTTCACCGGGCAATTGC
CCCCTCAGACCTCCATGCGCTCTTTCACGAACCGTATGATGTATATGGGGTTAACCGCAACCAATTCGGCCATAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGAGCCGTAATCTCTTATCAAGAGGGTAGAGCTACCTTACACAATGCGGTAACCCTATTAGAGATGCTTACAAATGTAA
AAATCATAAATCGATAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGAAGCTCATGGATACTTCAAGAGAGATAAAAGAGGATTCTTCTTTCAATATGACCCTATTAATCCTTGTCATAGGACTA
GTAGGAATAGGAGGAGCTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 719; Mature: 719

Protein sequence:

>719_residues
MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEETKPDWQAVNNTYDNLVNLTKS
RGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASIPEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGA
AFYSYAALSSIIIRRQGNSDLIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN
DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLVKTNEEFINALEDVSRISGKI
TEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKINSYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKH
DFEEQYKNYSPIGTKINQQEREINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI
GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAAYACNRLAPYLQKNKTLYINI
LSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIESSLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSS
SQVNILIANVRRVWKNSDKEFVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK

Sequences:

>Translated_719_residues
MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEETKPDWQAVNNTYDNLVNLTKS
RGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASIPEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGA
AFYSYAALSSIIIRRQGNSDLIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN
DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLVKTNEEFINALEDVSRISGKI
TEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKINSYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKH
DFEEQYKNYSPIGTKINQQEREINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI
GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAAYACNRLAPYLQKNKTLYINI
LSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIESSLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSS
SQVNILIANVRRVWKNSDKEFVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK
>Mature_719_residues
MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEETKPDWQAVNNTYDNLVNLTKS
RGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASIPEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGA
AFYSYAALSSIIIRRQGNSDLIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN
DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLVKTNEEFINALEDVSRISGKI
TEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKINSYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKH
DFEEQYKNYSPIGTKINQQEREINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI
GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAAYACNRLAPYLQKNKTLYINI
LSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIESSLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSS
SQVNILIANVRRVWKNSDKEFVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82900; Mature: 82900

Theoretical pI: Translated: 6.18; Mature: 6.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEET
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHEECCCCCCCCCCCC
KPDWQAVNNTYDNLVNLTKSRGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH
PEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGAAFYSYAALSSIIIRRQGNSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN
EEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTNEEFINALEDVSRISGKITEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKIN
HCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKHDFEEQYKNYSPIGTKINQQE
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHH
REINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHH
GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
YACNRLAPYLQKNKTLYINILSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIES
HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCH
SLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSSSQVNILIANVRRVWKNSDKE
HHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCHH
FVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK
HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEET
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHEECCCCCCCCCCCC
KPDWQAVNNTYDNLVNLTKSRGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH
PEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGAAFYSYAALSSIIIRRQGNSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN
EEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTNEEFINALEDVSRISGKITEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKIN
HCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKHDFEEQYKNYSPIGTKINQQE
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHH
REINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHH
GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
YACNRLAPYLQKNKTLYINILSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIES
HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCH
SLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSSSQVNILIANVRRVWKNSDKE
HHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCHH
FVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK
HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA