Definition Bacteroides vulgatus ATCC 8482 chromosome, complete genome.
Accession NC_009614
Length 5,163,189

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The map label for this gene is 150006512

Identifier: 150006512

GI number: 150006512

Start: 4963792

End: 4965321

Strand: Reverse

Name: 150006512

Synonym: BVU_4032

Alternate gene names: NA

Gene position: 4965321-4963792 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150006513

Following gene: 150006511

Centisome position: 96.17

GC content: 32.55

Gene sequence:

>1530_bases
ATGAGCATATCATATCGCGGAAAATATTTTAGGATTTACATTTGGCAAGGATTATCCATAATTTTAGGTTTTCTTTCGCT
TTTTATTGTGATGCCTTCACTTTCTGGAAATAAAACACTCTTTGGTATTTACAGTGTTTGTACGTCTCTGACTATATTCT
TTTCGTATGCTGATTTAGGTTTTATTTCATCGGGATTGAAATATGCAGCGGAATATTATATTCGTGGTGACCGAAAGAAT
GAAATTCGTACGATAGGTTTTACTGCATTTATTATGCTTAGCATGTTTATGCTGATAGCTTTGCTATTTGGAATAATCAG
CATATTCCCTCAAATTCTCATGCCTGAATTGGAACCAGATAGTGAAAATTTTTATACGGCACGTTATTTGCTGATTCTGT
TGTCTGTTTCCTGTCCGGTAATCATTGGCCAACGAATTCTTAATATGATTTATTCCATACGTGTAGAAGATTATAAATTA
CAGCGTATCTCTGCGGTAGGCAGTATTCTGAAGATTTTATCAGTTTTCTTTTTTTTTGGAAGTGAAAATTATTTGTTGGT
ACCTTATTTTGCATTCGTGCAGTTTATCAACCTATCCGTAGTATTGATGGCAGCTTTTCAGGTCCGAAAGTATCAATATT
CATTTGTGGAATTTCTTAAAGCTATCCGTTTTGACCGTATTATCTTTGATAAAGAAAAGGGCTTGACGGGAGCTTCATTT
ATATCTATACTTTCTTGGGTGTTGTTCTATGAATTTGATCAAATCGCGATTTCAAATTTTGTTGGTCTGGAGGCAGTAGC
AGTTTATGGCATAGCTTTTTCTGCATTGACCTTTGTACGAACCTTTGTGTCATTACTTTATTCACCTTATTCATCGCGAT
ATAATCATTTGATTGGTGAAAATGACAGGGTAGGACTGATGAAATTTGTGAATCGGATGTTATTAATGCTCTCGCCAATG
GTAGTTCTGCCCATTGTTGGATTGTCTATGCTGAGTGAACCATTTATTATAAGTTGGGTTGGATTCAATTATGAGGAATC
CAGTTCTATTTTATCACTTTTGGTGTTTTGTTTCTTTCCTTGCTTTCTCTCAAACCCTAGTTCTTCTTATTTTATTGCAA
TTGAAAAAACTACTTTACTTAATAGGTTTAATATATTTCAACCTATACTATACTGGTTATTAATTTTTTTTACTGTTGGT
AAATGGGGCGTATTTTCGTTCGCTATATCTAAAGGATTGATTCCTATATTTTTGGGTATTCTTTATTGGTATTCATTATA
CAGAGATTTTGCAAAGAATGCTGGTCAGATAGTTTCACTATTCCTAATTTTGAAAACTTTGTTTTTACCTTTAATTGTAC
TATTAGTATTAAGTACTCTTGTAAAGCCTTATATGGCTTATGAATATAATAAGATTTCCCTTTGTTATAATTTATTGGTT
ATGGGATTGATTGTTTTAATATCAATTCTAGTATCAGTGTGTTGTAATAGAGAAATGTATTCATTGGTGAAGTCAATTAT
TAGACGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATATTGAGGATGCAATGACCGAGGGCTATCGGTTGAGAAACTATTTCTTTACCAAACTAGAGCCTCAGTTAATTTTC
CAACTTTTCACTTGATACCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAGAAAGGAATTATGGAAAACGAAACCATTTAGAGATTATGATAATATCAAAAATGAAAAAAATGTTTAGACTATTGTT
TACGTCTGAAATCAGTAGCT

Product: putative lipopolysaccharide biosynthesis related polysaccharide transporter/flippase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 509; Mature: 508

Protein sequence:

>509_residues
MSISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLGFISSGLKYAAEYYIRGDRKN
EIRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPDSENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKL
QRISAVGSILKILSVFFFFGSENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASF
ISILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGENDRVGLMKFVNRMLLMLSPM
VVLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFPCFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVG
KWGVFSFAISKGLIPIFLGILYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLV
MGLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR

Sequences:

>Translated_509_residues
MSISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLGFISSGLKYAAEYYIRGDRKN
EIRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPDSENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKL
QRISAVGSILKILSVFFFFGSENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASF
ISILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGENDRVGLMKFVNRMLLMLSPM
VVLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFPCFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVG
KWGVFSFAISKGLIPIFLGILYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLV
MGLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR
>Mature_508_residues
SISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLGFISSGLKYAAEYYIRGDRKNE
IRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPDSENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKLQ
RISAVGSILKILSVFFFFGSENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASFI
SILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGENDRVGLMKFVNRMLLMLSPMV
VLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFPCFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVGK
WGVFSFAISKGLIPIFLGILYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLVM
GLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58466; Mature: 58335

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLG
CCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FISSGLKYAAEYYIRGDRKNEIRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
SENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKLQRISAVGSILKILSVFFFFG
CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASF
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHH
ISILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NDRVGLMKFVNRMLLMLSPMVVLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
CFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVGKWGVFSFAISKGLIPIFLGI
HHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLV
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
MGLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLG
CCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA