| Definition | Bacteroides vulgatus ATCC 8482 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009614 |
| Length | 5,163,189 |
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The map label for this gene is 150006237
Identifier: 150006237
GI number: 150006237
Start: 4628195
End: 4630843
Strand: Reverse
Name: 150006237
Synonym: BVU_3748
Alternate gene names: NA
Gene position: 4630843-4628195 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150006238
Following gene: 150006236
Centisome position: 89.69
GC content: 31.67
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAAATAAGGAGGAAATGTCCGAATTATTCAATACTATAAATGAAAAACTTACAATAGAAGAGATAAAACAACTTTTTG ACTAATAAATCTATAATATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTATGGGAAAATTTTACAAAGAATTTGCTTTAAAGAAAGTCCTTGAGTGTGAAGGTCTAGAGTTTTTGAAAAATGTCAA AGTAGGAACAGAAGTTTACT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 882; Mature: 882
Protein sequence:
>882_residues MEHLSNALKAVFKEQDGDEVLFCADMLQKDNQYNRGEMPRPDTEMKESQIQYLLRKVNAYNTLDQESIVGQVVVSEWMKP LKSHKELKSFDLSVFNMLLHFACKTIYFKNNDPVCHYSKLLRWHNVSNLFGEDTFTTVFAASLDIVNKSKRKYFDWPAYI DHNNKEINALFKNKMADLHMHLKGSSYNFDISWLSIMNNITSMENVFTEVYNLRKTYGWDKDLYAKMYRACAIRLYLASR TGLLSENAQITSAQLSNIIDDKINNANDAIAKSAIDESVKRQLLESHSLEFLLSKAKETSKHFEDKSDYQDLDYIRIPRY NKDNVRSILSSERELMYSVFRLLLEGCDDYKDISSLFYSYLCYKVKFRNAIIQLNSTVGFHNFTLYEEIKDKFIAKRHKK FLYKAAIESFLINGKDRYLETRIVPDTTAEGIAEKIKEIAESVDEKYKERFSIILHFIKSRDERKDKEYRHKELREDIKK RAFAIHKFRNNAEYLGVGSEDYPLSGYVVGIDTANTELMCRPEVFAQAFRFLRYHNIKNNGRQRPNDLNITYHVGEDFYD IADGLRAVEEAMIYFNLKNGDRLGHCLVLGTDVRKYYSMRYNTICCTKQVLLDNMAWLHHKCKRLFGYTSLCYYLEGIFN QYFYDVYQGQIYQDGKINYELLDDPDVNNNINDYYQSWVLRGNNPKFASDMEESDDELEQEWDNCAENHEYGIEIAKFNI NALELFDQYHKDEIVERGSEAVAFTIKESYVEDFYKLLEAIQEQLLKEIESKRISIECNPTSNYKIGEMSNYDEHPILKF YNSGLNTPYNKHDIAVSINTDDQGVFSTSLEREYSLIALAIERHQTEGFKNSPRQIIDWLDKIRQMSVEQQFDNDIFNYK KN
Sequences:
>Translated_882_residues MEHLSNALKAVFKEQDGDEVLFCADMLQKDNQYNRGEMPRPDTEMKESQIQYLLRKVNAYNTLDQESIVGQVVVSEWMKP LKSHKELKSFDLSVFNMLLHFACKTIYFKNNDPVCHYSKLLRWHNVSNLFGEDTFTTVFAASLDIVNKSKRKYFDWPAYI DHNNKEINALFKNKMADLHMHLKGSSYNFDISWLSIMNNITSMENVFTEVYNLRKTYGWDKDLYAKMYRACAIRLYLASR TGLLSENAQITSAQLSNIIDDKINNANDAIAKSAIDESVKRQLLESHSLEFLLSKAKETSKHFEDKSDYQDLDYIRIPRY NKDNVRSILSSERELMYSVFRLLLEGCDDYKDISSLFYSYLCYKVKFRNAIIQLNSTVGFHNFTLYEEIKDKFIAKRHKK FLYKAAIESFLINGKDRYLETRIVPDTTAEGIAEKIKEIAESVDEKYKERFSIILHFIKSRDERKDKEYRHKELREDIKK RAFAIHKFRNNAEYLGVGSEDYPLSGYVVGIDTANTELMCRPEVFAQAFRFLRYHNIKNNGRQRPNDLNITYHVGEDFYD IADGLRAVEEAMIYFNLKNGDRLGHCLVLGTDVRKYYSMRYNTICCTKQVLLDNMAWLHHKCKRLFGYTSLCYYLEGIFN QYFYDVYQGQIYQDGKINYELLDDPDVNNNINDYYQSWVLRGNNPKFASDMEESDDELEQEWDNCAENHEYGIEIAKFNI NALELFDQYHKDEIVERGSEAVAFTIKESYVEDFYKLLEAIQEQLLKEIESKRISIECNPTSNYKIGEMSNYDEHPILKF YNSGLNTPYNKHDIAVSINTDDQGVFSTSLEREYSLIALAIERHQTEGFKNSPRQIIDWLDKIRQMSVEQQFDNDIFNYK KN >Mature_882_residues MEHLSNALKAVFKEQDGDEVLFCADMLQKDNQYNRGEMPRPDTEMKESQIQYLLRKVNAYNTLDQESIVGQVVVSEWMKP LKSHKELKSFDLSVFNMLLHFACKTIYFKNNDPVCHYSKLLRWHNVSNLFGEDTFTTVFAASLDIVNKSKRKYFDWPAYI DHNNKEINALFKNKMADLHMHLKGSSYNFDISWLSIMNNITSMENVFTEVYNLRKTYGWDKDLYAKMYRACAIRLYLASR TGLLSENAQITSAQLSNIIDDKINNANDAIAKSAIDESVKRQLLESHSLEFLLSKAKETSKHFEDKSDYQDLDYIRIPRY NKDNVRSILSSERELMYSVFRLLLEGCDDYKDISSLFYSYLCYKVKFRNAIIQLNSTVGFHNFTLYEEIKDKFIAKRHKK FLYKAAIESFLINGKDRYLETRIVPDTTAEGIAEKIKEIAESVDEKYKERFSIILHFIKSRDERKDKEYRHKELREDIKK RAFAIHKFRNNAEYLGVGSEDYPLSGYVVGIDTANTELMCRPEVFAQAFRFLRYHNIKNNGRQRPNDLNITYHVGEDFYD IADGLRAVEEAMIYFNLKNGDRLGHCLVLGTDVRKYYSMRYNTICCTKQVLLDNMAWLHHKCKRLFGYTSLCYYLEGIFN QYFYDVYQGQIYQDGKINYELLDDPDVNNNINDYYQSWVLRGNNPKFASDMEESDDELEQEWDNCAENHEYGIEIAKFNI NALELFDQYHKDEIVERGSEAVAFTIKESYVEDFYKLLEAIQEQLLKEIESKRISIECNPTSNYKIGEMSNYDEHPILKF YNSGLNTPYNKHDIAVSINTDDQGVFSTSLEREYSLIALAIERHQTEGFKNSPRQIIDWLDKIRQMSVEQQFDNDIFNYK KN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103798; Mature: 103798
Theoretical pI: Translated: 5.95; Mature: 5.95
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEHLSNALKAVFKEQDGDEVLFCADMLQKDNQYNRGEMPRPDTEMKESQIQYLLRKVNAY CHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC NTLDQESIVGQVVVSEWMKPLKSHKELKSFDLSVFNMLLHFACKTIYFKNNDPVCHYSKL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHH LRWHNVSNLFGEDTFTTVFAASLDIVNKSKRKYFDWPAYIDHNNKEINALFKNKMADLHM HHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEE HLKGSSYNFDISWLSIMNNITSMENVFTEVYNLRKTYGWDKDLYAKMYRACAIRLYLASR EEECCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGLLSENAQITSAQLSNIIDDKINNANDAIAKSAIDESVKRQLLESHSLEFLLSKAKETS CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHFEDKSDYQDLDYIRIPRYNKDNVRSILSSERELMYSVFRLLLEGCDDYKDISSLFYSY HHCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LCYKVKFRNAIIQLNSTVGFHNFTLYEEIKDKFIAKRHKKFLYKAAIESFLINGKDRYLE HHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEE TRIVPDTTAEGIAEKIKEIAESVDEKYKERFSIILHFIKSRDERKDKEYRHKELREDIKK EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAFAIHKFRNNAEYLGVGSEDYPLSGYVVGIDTANTELMCRPEVFAQAFRFLRYHNIKNN HHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCC GRQRPNDLNITYHVGEDFYDIADGLRAVEEAMIYFNLKNGDRLGHCLVLGTDVRKYYSMR CCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHH YNTICCTKQVLLDNMAWLHHKCKRLFGYTSLCYYLEGIFNQYFYDVYQGQIYQDGKINYE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEEE LLDDPDVNNNINDYYQSWVLRGNNPKFASDMEESDDELEQEWDNCAENHEYGIEIAKFNI ECCCCCCCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECC NALELFDQYHKDEIVERGSEAVAFTIKESYVEDFYKLLEAIQEQLLKEIESKRISIECNP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECC TSNYKIGEMSNYDEHPILKFYNSGLNTPYNKHDIAVSINTDDQGVFSTSLEREYSLIALA CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IERHQTEGFKNSPRQIIDWLDKIRQMSVEQQFDNDIFNYKKN HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MEHLSNALKAVFKEQDGDEVLFCADMLQKDNQYNRGEMPRPDTEMKESQIQYLLRKVNAY CHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC NTLDQESIVGQVVVSEWMKPLKSHKELKSFDLSVFNMLLHFACKTIYFKNNDPVCHYSKL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHH LRWHNVSNLFGEDTFTTVFAASLDIVNKSKRKYFDWPAYIDHNNKEINALFKNKMADLHM HHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEE HLKGSSYNFDISWLSIMNNITSMENVFTEVYNLRKTYGWDKDLYAKMYRACAIRLYLASR EEECCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGLLSENAQITSAQLSNIIDDKINNANDAIAKSAIDESVKRQLLESHSLEFLLSKAKETS CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHFEDKSDYQDLDYIRIPRYNKDNVRSILSSERELMYSVFRLLLEGCDDYKDISSLFYSY HHCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LCYKVKFRNAIIQLNSTVGFHNFTLYEEIKDKFIAKRHKKFLYKAAIESFLINGKDRYLE HHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEE TRIVPDTTAEGIAEKIKEIAESVDEKYKERFSIILHFIKSRDERKDKEYRHKELREDIKK EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAFAIHKFRNNAEYLGVGSEDYPLSGYVVGIDTANTELMCRPEVFAQAFRFLRYHNIKNN HHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCC GRQRPNDLNITYHVGEDFYDIADGLRAVEEAMIYFNLKNGDRLGHCLVLGTDVRKYYSMR CCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHH YNTICCTKQVLLDNMAWLHHKCKRLFGYTSLCYYLEGIFNQYFYDVYQGQIYQDGKINYE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEEE LLDDPDVNNNINDYYQSWVLRGNNPKFASDMEESDDELEQEWDNCAENHEYGIEIAKFNI ECCCCCCCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECC NALELFDQYHKDEIVERGSEAVAFTIKESYVEDFYKLLEAIQEQLLKEIESKRISIECNP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECC TSNYKIGEMSNYDEHPILKFYNSGLNTPYNKHDIAVSINTDDQGVFSTSLEREYSLIALA CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IERHQTEGFKNSPRQIIDWLDKIRQMSVEQQFDNDIFNYKKN HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA