| Definition | Haemophilus influenzae PittGG chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009567 |
| Length | 1,887,192 |
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The map label for this gene is 148827753
Identifier: 148827753
GI number: 148827753
Start: 1105208
End: 1107196
Strand: Reverse
Name: 148827753
Synonym: CGSHiGG_06080
Alternate gene names: NA
Gene position: 1107196-1105208 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148827755
Following gene: 148827752
Centisome position: 58.67
GC content: 40.67
Gene sequence:
>1989_bases ATGTATAACGAAAACTTAAAAGAATTGACCGTTCGAGGAATTATTCTCGGTGCATTGATTACGGTAATTTTCACTGCATC CAATGTGTATCTCGGTCTAAAAGTGGGGGTGACATTTGCGTCATCTATTCCAGCAGCCGTCATTTCTATGGCAGTACTCA AATTTTTCAAAGATTCTAGCATTCTTGAAAATAATATGGTGCAAACTCAAGCATCTTCAGCAGGTACGCTTTCTTCTGTG ATCTTCGTCTTGCCTGGTTTATTAATGATGGGCTACTGGCAAGATTTCCCATTCTGGCAAACGATGTTGATTTGTGCAGC TGGTGGTACATTGGGTGTGTTATTCACTATTCCATTACGCCGTGCAATGGTGGTAAATAGTAATTTACCTTATCCTGAAG GGGTAGCCGCTGCAGAAATTTTGAAAGCAGGTAATCATGCAGATGGCGACAGCGGTGTGAAAGATATTGCTTACGGTGGT ATTTTAGCGGGATTAGTGGCATTTTTAACTAACGGTTTACGCGTGATGGCTGATGGTGCAAGTGCTTGGATTCAAACAGG AAAAGCGGCGTTCCAATTACCAATGGGCTTTTCACTTGCCTTACTCGGTGCTGGTTATTTAATTGGCATCGTGGGCGGTA TCGCAATGTTGATCGGTGTTATTTTGACTTGGGGTGTGGCAGTGCCATATTTCACAATGTCAGAAGATATTGCCGCGGAT GCAAGTTTAATTGATTCTGCGATGACTGTTTGGAAAACCAAAGTGCGTTATATTGGTGTGGGTACAATTGGCATTGCTGC GATTTGGACATTGCTGATTTTAATGAAACCAATGATTGAAGGAATGGTTCATTCTTTCCGTATGCTGAAAGGTGGGCAAG AGGCATCAGAACATCGTATTGATATTGACCTTTCTCCAAAAACAATGATTTATATCTTAATTGCGACGGTTGCGTTAATT GTTATTTCATTACATCACTTTATTGCGGCGGCACCAATTTCGCCTGAGCTTTCCATTTTATTAGTGGTAGTTTGTACTTT CTTAGCGGTATTTATCGGCTTCTTTGTGGCAGCGGCTTCTGGTTATATGGCAGGTTTAGTGGGTTCATCTTCAAGCCCAA TTTCTGGTATCGGAATTATTTCTGTTATCGTGATTTCATTAGTATTGGTGTCAATCGGTAACGCCTCGGGCTTATTTGAA ACTGTAGATGGTCAGAAATTTTTAACCGCACTTACATTGTTTACGGCATCTATCGTAATCACTACAGCTTGTATTTCTAA TGATAATCTACAAGATTTAAAAACGGGTTTATTAGTTGAAGCAACACCTTGGCGACAACAAGTTGCATTAATTATCGGCT GCTTTGTCGGTGCACTTGTTATCGCGCCAGTATTAGAAATCTTATATCATGCGTATGGTTTCAGCGGTGCGTTGCCACGT CCAGATATGGATCCTTCACAAGCCTTATCTGCACCACAAGCAACGTTAATGACCGCCATTTCTCAAGGTATTTTCACAAA TAAATTGGAATGGACTTACATCTTAACTGGTGTGGGTTTAGGTGCTGTGTTAATTACGATTGATGCATTTTTGAAAAAAG TCAGCAACAAAGTCTTTAGCTTGCCAGTTATTGCTGTGGGGATTGGTATTTACTTACCACCATCAATTAATACGCCTGTG ATTGTTGGTGCATTCCTAGCGTGGATTATGGCTCGCCATATTGCAAAACTTGGTAACAAAGAAGTGTCAGCTAAAGCAGA ACGTTTCGGTACGCTTTTCTCTGCAGGTTTAATTGTAGGCGAAAGTTTAATGGGGGTAATTTTAGCATTCATTATTGCGG CTTCTGTTACCACTGGCGGTTCTGAAGCACCATTATCCTTAAATCTTGAAAATTGGGATACAATTGGCGAGTGGTTAGGT TTAATCGTATTTATCGTGGGCATTGTGATTTTTGCATCTCGCGTATTACGTGCGAAAAAATCTGATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTTCAATAAAACAAATTTTATGTTAAAAAAACTTGAAAAATAGTCAAATTTTTGACAAGGTTGAGCGGTTTTCTTTTT TTAAGCTCAAGGAACAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCTTAAATTTATTTTAGAATAGGTTATCTTCTGGATAACCTATTTTTCACTATGAAATCTTACTTAAAAACACTTATTT TTTTCCCTCTGATTTTACAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 662; Mature: 662
Protein sequence:
>662_residues MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSV IFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGG ILAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALI VISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFE TVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPV IVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLG LIVFIVGIVIFASRVLRAKKSD
Sequences:
>Translated_662_residues MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSV IFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGG ILAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALI VISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFE TVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPV IVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLG LIVFIVGIVIFASRVLRAKKSD >Mature_662_residues MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSV IFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGG ILAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALI VISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFE TVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPV IVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLG LIVFIVGIVIFASRVLRAKKSD
Specific function: Unknown
COG id: COG1297
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004814 - InterPro: IPR004813 [H]
Pfam domain/function: PF03169 OPT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69731; Mature: 69731
Theoretical pI: Translated: 6.63; Mature: 6.63
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH ILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLR HHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHH RAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGGILAGLVAFLTNGLRVMADGA HHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCH SAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD HHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHH ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRI HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE DIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAAS EEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVI CHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR HHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFS CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVG CHHHHHHHCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLGLIVFIVGIVIFASRVLRAKK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SD CC >Mature Secondary Structure MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH ILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLR HHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHH RAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGGILAGLVAFLTNGLRVMADGA HHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCH SAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD HHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHH ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRI HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE DIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAAS EEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVI CHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR HHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFS CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVG CHHHHHHHCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLGLIVFIVGIVIFASRVLRAKK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SD CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]